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1、第1 节通用分类单元和命名微生物分类鉴定微生物的多层次分类单元 界Kingdom(Regnum)门Phylum 或Division(Phylum 或Divisio)纲Class(Classis)目Order(Ordo)科Family(Familia)属Genus(Genus)种Species(Species)亚种 subspecies,subsp.,变种 variety,var.型 form菌株/品系/毒株 strain 种（species）的定义 一个基本分类单元 是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他物种有着明显差异的菌株的总称。Type strain 典型菌株 Type
2、 species 模式种 在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株作为它的具体代表，故此典型菌株就成了该种的模式种。亚种（subspecies)亚种是对种进一步细分时所用的分类单元，指有一明显而稳定的特征与模式种不同，其余鉴定特征与模式种相同。金黄色葡萄球菌厌氧亚种Staphylococcus aureus subsp.anaerobius 型（type)同一细菌种内显示很小的生物化学与生物学差异的菌株，常用于细菌中紧密相关菌株的区分。血清型 致病型 形态型 生物型 溶菌型菌株（strain）任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的遗传上纯的群体及其后代为菌株。同种微生物不同来源的纯培养，不具
3、有分类学上的意义。一种微生物的每一不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。同一种微生物的菌株数量可以是无数的；菌株强调的是遗传型纯的谱系；某一菌株发生稳定变异的后代需要重新命名。同一种菌的不同菌株间，主要性状相同，但一些生理生化性状、代谢产物(抗生素、酶、有机酸等)产量性状等可存在差异；菌株的名称可用字母、编号等表示Escherichia coli K12 Escherichia coli CFT073E.coli O-157:H7 Escherichia coli S21学名：某一菌种的科学名称，是按国际命名法规进行命名并受国际学术界公认的通用正式名称 双名法 用于微生物种命名 三名法
4、用于微生物种以下的亚种命名学名命名 双名法属名在前，斜体，词首字母大写种名在后，斜体，全部小写学名=属名+种名加词+（首次定名人）+现定名人+现定名年份排斜体排正体，一般省略Escherichia coli(Migula)Castellani et Chalmers 1919Escherichia coliBacillus subtilis(Ehrenberg)Cohn 1872Bacillus subtilis 三名法学名=属名+种名加词+（subsp.或var.）+亚种或变种加词排斜体排斜体，不可省略 排正体，可省略Bacillus thuringiensis(subsp.)galleri
5、aBacillus thuringiensis subsp.galleriaBacillus thuringiensis galleria 有关学名的其他知识u若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用sp.或spp.表示,书写时应正体 Bacillus sp.表示“一株尚未鉴定到种名的芽孢杆菌”Bacillus spp.表示“一批尚未鉴定到种名的芽孢杆菌”或“若干种芽孢杆菌”u当文献资料中多次出现某一菌学名时，可将后面再次出现的属名用前1-3个字母缩写 Bacillus subtilis 缩写为B.subtilis Escherichia coli 缩写为 E.coli 权威性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物。新种表达方式 学名+spnov.Bacillus aciditolerans sp.nov.YN-1Bacillus acidinfaciens sp.nov.3-2-2 新种(species nova,sp.nov.)