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1、蛋白质相对分子质量的测定SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法一、实验目的1、学会SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法原理。2、掌握用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质相对分子质量的操作技术。二、实验原理SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)是对蛋白质进行量化,比拟及特性鉴定的一种经 济、快速、而且可重复的方法。该法主要依据蛋白质的分子量对其进行别离。SDS与蛋白质 的疏水局部相结合,破坏其折叠结构,并使其稳定地存在于一个广泛均一的溶液中。SDS- 蛋白质复合物的长度与其分子量成正比。由于在样品介质和聚丙烯酰胺凝胶中加入离子去污 剂和强还原剂后,蛋白质亚基的电泳迁移率主要取决于亚基分子量的大小,而电
2、荷因素可以 被忽略。SDS-PAGE因易于操作和广泛的用途,使它成为许多研究领域中一种重要的分析技 术。Acr和bis单独存在或混合在一起时是稳定的,但在具有自由基团体系时就能聚合。引 发自由基的方法有化学法和光化学法两种。化学法的引发剂是过硫酸锈(Ap),催化剂十 四甲基乙二胺(TEMED);光化学法是以光敏感物核黄素来代替过硫酸镂,在紫外光照射下 引发自由基团。采用不同浓度的acr、bis、Ap、TEMED使之聚合,产生不同孔径的凝胶。因 此可按别离物质的大小、形状来选择凝胶浓度。SDS是十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate)的简称,它是一种阴离子外表活性剂, 加入
3、到电泳系统中能使蛋白质的氢键和疏水键翻开,并结合到蛋白质分子上(在一定条件下, 大多数蛋白质与SDS的结合比为1.4gSDS/lg蛋白质),使各种蛋白质-SDS复合物都带上相 同密度的负电荷,其数量远远超过了蛋白质分子原有的电荷量,从而掩盖了不同种类蛋白质 间原有的电荷差异。这样就使电泳迁移率只取决于分子大小这一因素,于是根据标准蛋白质 分子量的对数和迁移率所作的标准曲线,可求得未知物的分子量。三、实验器材及数据30%别离胶储存液、10%浓缩胶储存液、别离胶缓冲液、浓缩胶缓冲液、电泳缓冲液、样品 溶解液、染色液、脱色液;标准蛋白,样品蛋白;电泳槽,移液管1ml,烧杯100ml四、考前须知1、a
4、cr和bis均为神经毒剂,对皮肤有刺激作用,操作时应戴口罩和手套,纯化应在通风处 内进行。2、玻璃板外表应光滑洁净,否那么在电泳时会在凝胶板与玻璃板之间产生气泡3、因SDS可吸附考马斯亮蓝燃料,染色前先用脱色液浸泡凝胶,洗去SDS。这可使染色及 脱色时间缩短,并使蛋白带染色而背景不染色五、实验步骤1、安装垂直板电泳槽(1)将密封用硅胶框放在平玻璃板上,然后将凹型玻璃与平玻璃重叠。(2)用手将两块玻璃板夹住住放入电泳槽内,玻璃室凹面朝外,插入斜插板。(3)用蒸储水试验封口处是否漏水。2、制备凝胶板别离胶制I备:30%Air-Bis溶液2.5ml, Tris-HCL缓冲液(pH值为8.9) 1.5
5、ml,去离子水2ml,10%AP 60 U I, TEMED 10 U I,置于小烧杯中混匀。用移液枪吸取混合后的凝胶溶液,加至长、 短玻璃板间的窄缝内,加胶高度距样品模板梳齿下缘约1cm。用吸管在凝胶外表沿短玻璃板 边缘轻轻加一层重蒸储水(约34cm),用于隔绝空气,使胶面平整。别离胶凝固后,可看 到水与凝固的胶面有折射率不同的界限。倒掉重蒸储水,用滤纸吸去多余的水。浓缩胶的制备:取Air-Bis溶液400UI, Tris-HCL缓冲液(pH值为6.7) 750 ul,去离子 水0.9ml, 10%AP 30 U I, TEMED 7.5 U I置于小烧杯中混匀。用移液枪吸取混合后的凝胶溶液
6、, 加至长、短玻璃板间的窄缝内(及别离胶上方),距短玻璃上缘0.5cm处,轻轻加入样品槽 模板。待浓缩胶凝固后,轻轻取出样品模槽板,用手夹住两块玻璃板,上提斜插板,使其松 开,然后取下玻璃胶室,去掉密封用胶框,用1%电泳缓冲液琼脂胶密封底部,再将玻璃胶 室凹面朝里置入电泳槽。插入斜插板,将电泳缓冲液加置内槽玻璃凹口以上,外槽缓冲液加 到距平玻璃上沿3mm处。3、加样用移液枪将一份2 口 I标准蛋白和3份5 u I样品蛋白分别加入凝胶凹型样品槽底部,带 所有凹型样品槽内都加了样品,即可开始电泳。4、电泳将直流稳压电泳仪开关翻开,开始时将电压调至80V。待样品进入别离胶时,将电压调 至120V。当
7、标准蛋白带别离得较清晰时,将电压跳回到零,关闭电源。拔掉固定板,取出 玻璃板,用刀片轻轻将一块玻璃撬开移去,在玻璃板一端切除一角以作为标记,将胶板移至 大培养皿中染色。5、染色及脱色将染色液倒入培养皿中,用微波炉加热20s,在摇床上放置2min,倒掉染色液,加入脱 色液,在摇床上放置至能看清蛋白质带。六、数据处理与记录七、思考题1、用SDS凝胶电泳法测定蛋白质相对分子质量时为什么要用筑基乙醺?答:保持蛋白质的二级结构.蛋白中如果有二硫键存在的话,会容易被氧化断开,使用筑基 乙醇就可以免除这一隐患2、是否所有的蛋白质都能用SDS-凝胶电泳法测定其相对分子量?为什么?答:SDS凝胶电泳法测定的分子
8、量是相对分子量,而且如果分子量如果太小或者200Kd, 一般都不会用PAGE来测定。SDS-PAGE别离范围一般在15200Kd,超过这个范围,蛋白条 带都挤在一起了,无法进行准确比拟。八、思考与总结每次做实验都会犯一些很傻的错误啊TAT而且这次实验居然还预习错实验了到实 验室之后一脸懵逼地看着不认识的试剂。第一次配好别离胶,把胶加到玻璃板缝里之后发现 是漏的因为检漏的方法是错的,而且玻璃板没有固定好二_=| |所以大家在等别离胶凝固 的时候我们才开始重新配溶液。虽然有这样的小错误,但不影响之后的实验进程哦老师在 讲解怎么使用电泳槽的时候,同组的另一个同学在已经凝固的别离胶上加入了浓缩胶,等老 师讲解完的时候我们的浓缩胶也凝固啦,正好赶上大家的进度OvO所以最后完成得很快, 蛋白质带也挺清晰的下一次实验也会加油的、(八3八)/