临床样本的采集运输和保存及核酸提取.ppt

上传人:石*** 文档编号:35646582 上传时间:2022-08-22 格式:PPT 页数:63 大小:2.88MB
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1、现在学习的是第1页,共63页研究背景研究背景一、样本的采集、处一、样本的采集、处 理、保存及运输理、保存及运输现在学习的是第2页,共63页现在学习的是第3页,共63页(一)、样本的采集(一)、样本的采集地贫检测样品采集:地贫检测样品采集:l 外周血外周血: 5mLl 脐带血脐带血: 0.51mLl 羊羊 水:水:2030mLl 绒绒 毛:毛:15mgl 唾唾 液液l 组组 织织现在学习的是第4页,共63页现在学习的是第5页,共63页现在学习的是第6页,共63页现在学习的是第7页,共63页现在学习的是第8页,共63页现在学习的是第9页,共63页现在学习的是第10页,共63页研究背景研究背景 二、

2、核酸的提取二、核酸的提取现在学习的是第11页,共63页现在学习的是第12页,共63页现在学习的是第13页,共63页现在学习的是第14页,共63页细胞破碎方法细胞破碎方法 应用应用 机械法机械法1.1.匀浆法匀浆法机体软组织机体软组织2.2.捣碎法捣碎法动物韧性组织动物韧性组织3.3.研磨法研磨法细菌、酵母细菌、酵母 物理法物理法1.1.超声法超声法细胞混悬液细胞混悬液2.2.反复冻融法反复冻融法培养细胞培养细胞3.3.冷热交替法冷热交替法细菌、病毒细菌、病毒4.4.低渗裂解低渗裂解红细胞红细胞 化学法化学法1.1.有机溶剂有机溶剂细菌、酵母、血液细菌、酵母、血液2.2.去垢剂去垢剂组织、培养细

3、胞、组织、培养细胞、血液血液3.3.酶解法酶解法细菌、酵母、血液细菌、酵母、血液现在学习的是第15页,共63页现在学习的是第16页,共63页现在学习的是第17页,共63页现在学习的是第18页,共63页(A值等于1时,相当于50g/ml双链DNA, 40g/ml单链DNA或RNA,20g/ml单链寡核苷酸)现在学习的是第19页,共63页现在学习的是第20页,共63页现在学习的是第21页,共63页EB与DNA的结合现在学习的是第22页,共63页A260/A280比值是纯度检测的重要指标!比值是纯度检测的重要指标!现在学习的是第23页,共63页现在学习的是第24页,共63页DNA完整性鉴定:完整性鉴

4、定:现在学习的是第25页,共63页 正常时,正常时,28S RNA的荧光强度约的荧光强度约为为18S RNA的的2倍倍,否则提示,否则提示RNA的的降解降解RNA完整性鉴定:完整性鉴定:现在学习的是第26页,共63页现在学习的是第27页,共63页现在学习的是第28页,共63页现在学习的是第29页,共63页现在学习的是第30页,共63页抗凝剂处理血肝素柠檬酸*EDTA*-80保存2个月,第10天收率90%4 第四天收率90%第10天提取效果差第十天收率85%室温提取效果差第四天收率90%第十天提取效果差现在学习的是第31页,共63页现在学习的是第32页,共63页酚酚抽抽提提法法提提取取步步骤:骤

5、:现在学习的是第33页,共63页DNA酚抽提法示意图现在学习的是第34页,共63页现在学习的是第35页,共63页现在学习的是第36页,共63页现在学习的是第37页,共63页现在学习的是第38页,共63页现在学习的是第39页,共63页现在学习的是第40页,共63页现在学习的是第41页,共63页现在学习的是第42页,共63页现在学习的是第43页,共63页现在学习的是第44页,共63页影响影响DNA质量的因素质量的因素现在学习的是第45页,共63页现在学习的是第46页,共63页现在学习的是第47页,共63页现在学习的是第48页,共63页组织材料组织材料起始样品量起始样品量Total RNA提取量提取

6、量blood1ml1520gleukocytes110107 7个个约约100 gLiver tissue1g约约5000 gCulture cells110107 7个个约约100gRenal tissue1g约约3000gSkeleton tissue1g约约1500gCerebral tissue1g约约1500g现在学习的是第49页,共63页现在学习的是第50页,共63页现在学习的是第51页,共63页1. 内源性内源性RNA酶(酶(intrinsic RNase)现在学习的是第52页,共63页现在学习的是第53页,共63页现在学习的是第54页,共63页OC-CH2-CH3OC-CH2-

7、CH3O=DEPC水制备:0.1%DEPC在37C处理1h,并高压灭菌15min。玻璃制品和塑料制品应浸泡在0.1%的DEPC水溶液中, 37C处理1h或室温下过夜。DEPC非选择性的修饰蛋白质和非选择性的修饰蛋白质和RNA,且与一些缓冲液不相容,且与一些缓冲液不相容,故在分离和纯化,故在分离和纯化RNA的过程中不使用的过程中不使用DEPC现在学习的是第55页,共63页现在学习的是第56页,共63页现在学习的是第57页,共63页现在学习的是第58页,共63页现在学习的是第59页,共63页现在学习的是第60页,共63页现在学习的是第61页,共63页现在学习的是第62页,共63页现在学习的是第63页,共63页

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