分子生物学复习题(名解+知识点).docx

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1、分子生物学复习题11 整理版 一名解1. Supercoil(超螺旋):DNA 双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋。超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种,负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。2. positive supercoiling正超螺旋:按 DNA 双螺旋一样方向缠绕而成的超螺旋称为正超螺旋。3. negative supercoiling负超螺旋:按 DNA 双螺旋相反方向缠绕而成的超螺旋称为负超螺旋。由于生物界仅觉察负超螺旋的存在,推想负超螺旋有利于DNA 的表达。4. Palindrome回文序列:在同一条 DNA 单链上,存在两段实质上一样,但序列颠倒并且二者碱基能形成互补的序列,这

2、两段序列很简洁就会依据碱基互补原则,相互吸引、配对,从而使得这条单链回折形成互补的双链构造。5. domain构造域:分子量大的蛋白质三级构造常可划分为一个或数个球状或纤维状的区域,折叠较为严密,各行使其功能,称为构造域。6. Motif基序:一般指构成任何一种特征序列的根本构造。作为蛋白质构造域中的亚单元,其功能是表达构造域的多种生物学作用。7. protein family蛋白质家族:指构造相像,功能相关的一组蛋白质。通常一个蛋白质家族由同一个基因家族内的基因编码8. microRNA/miRNA微 RNA:内源性的非编码 RNA 分子。这些小的 miRNA 和蛋白质形成复合体时具有各种调

3、整功能,在动物中,miRNA 可以通过和 mRNA 不翻译区域互补结合不需要完全互补来抑制蛋白质翻译。9. the ubiquitin-mediated pathway 泛素化途径:泛素间隔或连续地附着到被降解的蛋白质赖氨酸残基上,这一过程称为蛋白质泛素化。泛素:一个由76 个氨基酸组成的高度保守的多肽链,因其广泛分布于各类细胞中而得名。泛素能共价地结合于底物蛋白质的赖氨酸残基,被泛素标记的蛋白质将被特异性地识别并快速降解,泛素的这种标记作用是非底物特异性的。泛素依靠的蛋白选择性降解过程: 泛素活化酶E1)与泛素结合,活化泛素。 E1-泛素随后与泛素携带蛋白E2)结合,成为 E2-泛素,E1

4、被置换。 E2-泛素在泛素蛋白连接酶E3作用下与目标蛋白连接。这样多个泛素结合上目标蛋白后,目标蛋白即被标记,随后被proteosome蛋白酶体降解。这个过程需要ATP 供给能量。10. open reading frame(ORF) ( 开放阅读框): 指一组连续的含有三联密码子的能被翻译成多肽链的 DNA 序列。它由起始密码子开头,到终止密码子完毕。11. satellite DNA 卫星 DNA:又称随体 DNA。真核基因中的高度重复序列,其碱基组成与主体 DNA 有较大的差异,因而可用密度梯度沉降技术,如氯化铯梯度离心,将它与主体 DNA 分别。由于不具有启动子,所以一般不转录。12.

5、 Human Genome Project(HGP) 人类基因组打算:这一打算旨在为 30 多亿个碱基对构成的人类基因组准确测序,觉察全部人类基因并搞清其在染色体上的位置,破译人类全部遗传信息。13. Promoter启动子:启动子是 RNA 聚合酶识别、结合和开头转录的一段DNA 序列,它含有 RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列位点。启动子的作用:在基因表达的调控中,转录的起始是关键,常常某个基因是否应当表达打算于在特定的启动子起始过程。启动子是确保转录准确而有效起始DNA 序列。14. Spliceosome剪接体:Spliceosome剪接体:在剪接过程中形成的剪接复合物称

6、为剪接体。剪接体的主要组成是蛋白质和小分子的核内小 RNA(snRNA),负责全部编码蛋白的 mRNA 的剪接。15. alternative splicin选g择性剪接:也叫可发变剪接或变位剪接,指一个基因的转录产物在不同的发育阶段、分化细胞和生理状态下,通过不同的拼接方式,可以得到不同的mRNA 和翻译产物,也即用不同的剪接方式选择不同的剪接位点从一个mRNA 前体产生不同的mRNA 剪接异构体的过程。16. RNA editing RNA 编辑:剪接后修饰是某些RNA,特别是mRNA 前体的一种加工方式,如插入、删除或取代一些核苷酸残基,导致 DNA 所编码的遗传信息发生转变, 由于经过

7、编辑的 mRNA 序列发生了不同于模板 RNA 的变化。17. ribozyme (核酶):指具有催化功能的 RNA 分子,通过催化靶位点 RNA 链中磷酸二酯键的断裂,特异性地剪切底物 RNA 分子,从而阻断基因的表达。18. Wobble hypothesis 变位假说: 一个 tRNA 上的反密码子第一位碱基与密码子的第三位碱基,由于非碱基互补配对而识别不止一个密码子的现象。19. SD sequence (SD 序列):存在于原核生物 mRNA 起始密码子上游 712 个核苷酸的富含嘌呤的保守片段,可将 mRNA 的 AUG 起始密码子置于核糖体的适当位置以便起始翻译作用。20. Op

8、eron操纵子:存在于原核生物当中,由启动基因、操纵基因和一系列的构造基因严密结合而成,是多数原核生物基因调控的实现方式。21. enhancer 增加子:能显著提高与其连锁的构造基因转录水平的一类顺式调控元件。增加子的作用与启动子的相对位置无关,无方向性,有组织特异性。22. Antisense RNA(反义 RNA):指与 mRNA 互补的 RNA 分子, 也包括与其它 RNA 互补的 RNA 分子。由于核糖体不能翻译双链的 RNA,所以反义 RNA 与 mRNA 特异性的互补结合, 即抑制了该 mRNA 的翻译。通过反义 RNA 把握 mRNA 的翻译是原核生物基因表达调控的一种方式。2

9、3. Silencers 沉默子: 基因的负调控元件。沉默子的 DNA 序列被调控蛋白结合后阻断了转录起始复合物的形成或活化,使基因表达活性关闭。24. genomic imprinting 基因组印记:把握某一表型的等位基因由于来源于不同的亲本而产生差异表达,即机体只表达亲本一方的基因,另一方的基因不表达。25. epigenetics 表观遗传:在基因组 DNA 序列不发生转变的状况下,由于甲基化、基因组印记、RNA 编辑等缘由,造成基因表达产物的转变从而转变表型的现象。在代与代之间是可遗传的。26. Insertion sequence,IS插入序列:原核生物中最简洁的一种转座元件,由一

10、个转座酶基因及两侧的反向重复序列组成,不含有任何宿主基因。他们是细菌染色体或质粒的正常组成成分。27. transposons转座子:能在同一细胞中同一 DNA 分子内或不同 DNA 分子间移动的一段 DNA 序列。有两种转座形式:复制型转座,非复制型转座 replicative transposition复制型转座:转座元件在转座时复制自身一份拷贝,而后该拷贝转座到的位点,转座的结果是原位点仍保存原来的转座元件,每转座一次会增加一个拷贝数。 non-rreplicative transposition非复制型转座:转座元件直接从原位点转座到位点,转座的结果是原位点丧失了转座元件,每转座一次并

11、不增加拷贝数。 hybridization杂交:两条互补的核苷酸单链在适当的条件下退火形成异质双链的过程称杂交。28. medium培育基:是一种人工配制的适合微生物生长生殖或产生代谢产物用的混合养料,它具备微生物所需的六大养分元素,且其间比例适宜。29. virus病毒:是超显微的,无细胞构造,专性活细胞内寄生,在活细胞外具一般化学大分子特征,一旦进入宿主细胞又具有生命特征。30. cruciform (cross-shaped)十字形构造:具有反向重复序列或回文序列的 DNA 由双链间互补转化为链内互补而形成的构造。31. Endonuclease内切酶:可以在 DNA 或 RNA 分子内

12、部切断磷酸二酯键的酶。32. Exonclease外切酶:仅能水解位于核酸分子链末端核苷酸的酶。依据其作用的方向性,分为 5-3或 3-5核酸外切酶活性。33. Restrictionendonuclease限制性内切酶:能够识别 DNA 分子的特定核苷酸序列,并在识别位点或其四周断开 DNA 双链的一类核酸酶。34. Bases accumulation force碱基积存力:即疏水相互作用,即双螺旋内两相邻碱基相互靠拢聚拢在一起形成的力。是一种协同作。产生的力,由氢键引起,使处于中间的碱基比两边的碱基稳定。35. interspersed repeat sequence,IRS 散在重复序

13、列:散在方式分布于基因组内的重复序列。这类 DNA 序列一般都是中度重复序列。依据重复序列的长度可以分为4 类:长散在重复序列(LINE)、短分散重复序列(SINE)、长末端重复序列、DNA 转座子。36. Template strand模板链:也称反义链或负链。双链 DNA 中,可作为模板转录为 RNA的 DNA 链,该链与转录的 RNA 碱基互补。37. Coding strand编码链:也称有义链或正链。DNA 双链中含编码蛋白质序列的那条链,与模板链互补。其序列与信使核糖核酸一样,只是信使核糖核酸中的U尿嘧啶 组成与编码链中的T胸腺嘧啶组成相区分。38. TATA BoxTATA 框:

14、真核生物启动子转录起始点上游约-25-30 范围的 7bp 左右的富含 AT 的保守序列,与基因转录起始位点的定位有关。是很多真核生物类型启动子39. Cistron顺反子:编码一个多肽的遗传单位。40. Polycistron多顺反子:原核细胞中数个构造基因常串联为一个转录单位,转录生成的 mRNA 可编码几种功能相关的蛋白质。41. Monocistron单顺反子:真核生物的一种 mRNA 只编码一种蛋白质。42. Upstream region上游区域:一个基因的开头一般被认为是模板链的 3端,第一个被转录核苷酸的前面3端那一侧,被成为上游区域。43. codon密码子:mRNA 链上

15、3 个连续的核苷酸,它们打算一个特定氨基酸,mRNA上特定的核苷酸序列对应蛋白质链上的氨基酸序列。44. anticodon反密码子:tRNA 分子的反密码子环上的三联体核苷酸残基序列。在翻译期间,反密码子与 mRNA 中的互补密码子结合。45. wobble摇摆配对:一个 tRNA 上的反密码子第一位碱基与密码子的第三位碱基,由于非碱基互补配对而识别不止一个密码子的现象。46. si RNA干扰小 RNA:siRNA 是具有 2125 个 bp 长度的短双链小分子 RNA,通常是外源性的非编码 RNA 分子。这些短 RNA 和蛋白质形成复合体时具有各种调整功能, 可以通过和目标 mRNA 的

16、完全互补结合诱发目标 RNA 解体,沉默目标基因的表达。47. PI等电点:蛋白质是两性电解质,它的解离与环境pH 有关。当其处于某一pH 值的环境中时,所带、负电荷相等,静电荷为零,呈兼性离子,此时溶液的pH 值为该蛋白质的等电点。48. Point mutation点突变:指碱基替代,包括转换和颠换,具有很高的回复突变率。49. Spontaneous mutation自发突变:自然发生的变异,有背景辐射或环境因素引起,如自然宇宙射线,细胞自身有害代谢产物及由DNA 复制过程中碱基配对错误引起的突变。50. Induced mutation诱发突变:指人工利用物理、化学因素诱导发生的突变,

17、也称为人工诱变。51. Nonsense mutation无义突变:在蛋白质的构造基因中,一个核苷酸的转变可能代表某个氨基酸的密码子变成终止密码子,使蛋白质合成提前终止,合成无功能的或无意义的多肽。52. Missense mutation错义突变:由于构造基因中某个核苷酸的变化使一种氨基酸的密码子变成另一种氨基酸的密码子。53. Frame shift mutation移码突变:由删去或插入不是 3 的倍数的核苷酸造成的,突变位点之前的密码子不发生转变,但突变位点后的全部密码子都发生变化,编码的氨基酸消灭错误,其结果可导致核苷酸序列与相对应蛋白质的氨基酸序列之间的正常关系发生变化。54. H

18、ot spot突变热点:DNA 分子上某些位点发生突变的频率远远高于其平均数。55. direct repair直接修复:将被损伤的碱基回复到原来状态的一种修复机制,不需要切除碱基或核苷酸。56. pseudo-reverse mutation假性修复:在其次个、另外的位点再发生一次突变来代偿前一次突变发生的错误发生在非起始突变位点上,但能够掩盖或抵消起始突变的第二次突变,它分为基因内校正和基因间校正。57. nucleosome核小体:真核生物染色体的根本构造单位,由DNA与组蛋白H1、H2A、 H2B、H3、H4组成,DNA以左手螺旋缠绕于组蛋白核心上。58. Fluorescence q

19、uantitative PCR ,Q-PCR荧光定量 PCR 根本原理:在待扩增区域结合上荧光标记的 DNA 探针,在扩增过程中,具有 5外切酶活性的 Taq 酶延长引物链到 DNA 探针时,将DNA 探针逐个降解,释放出荧光报告基因,这样PCR 体系中荧光强度与 PCR 产物量之间存在正比关系,可通过测定荧光强度而对 PCR 产物定量,在此根底之上对模板序列进展定量。59. Human Gene Program(人类基因组打算):HGP 人类基因组打算:是一项国际性的争论打算,其目标为确定人类基因组所携带的全部遗传信息,并确定,说明和记录组成人类基因组的全部DNA 序列。60. 编码序列co

20、ding sequence:编码蛋白质或 RNA 的 DNA 序列61. 非编码序列non-coding sequence:不具有编码功能的 DNA 序列,如真核生物基因的内含子。62. Repetitive sequence重复序列:真核生物染色体基因组中重复消灭的核苷酸序列。这些序列一般不编码多肽,在基因组内可成簇排布,也可散布于基因组。63. interspersed repeat sequence(散在重复序列):散在方式分布于基因组内的重复序列。这类 DNA 序列一般都是中度重复序列。依据重复序列的长度可以分为4 类:长散在重复序列(LINE)、短分散重复序列(SINE)、长末端重复

21、序列、DNA 转座子。64. tandem repeat串联重复序列:重复序列以各自的核心序列重复单元首尾相连屡次重复称为串联重复序列,散在地分布于染色体上以插入缺失方式形成多态性。65. Anabolism合成代谢:生物体内成分合成过程的统称。66. Metabolism分解代谢:生物体内简洁大分子降解成简洁分子的物质代谢过程。67. Operator操纵子:原核生物中由启动子、操纵基因和构造基因组成的一个转录功能单位。68. conditional mutation条件性突变:69. medium培育基:是供微生物、植物和动物组织生长和维持用的人工配制的养料,一般都含有碳水化合物、含氮物质

22、、无机盐包括微量元素以及维生素和水等。有的培育基还含有抗菌素和色素,用于单种微生物和鉴定。二补充1. 酵母培育基叫什么名字?YPD或 YEPD :Yeast Extract Peptone Dextrose Medium别名:酵母浸出粉胨葡萄糖培育基,参与琼脂的又叫酵母膏胨葡萄糖 YPD琼脂培育基2. 双链的构造(the structure of the DNA double-helix):具有 5 端到 3 端的方向性维持DNA 双链构造稳定的化学键:氢键(hydrogen bonding):对核酸与蛋白质本身的稳定性无奉献,对这些大分子的特别构造起作用:如 -螺旋, -片层范德华力离子键碱

23、基积存力/疏水相互作用(stacking interation/ hydrophobic interation):维持核酸构造稳定性,碱基疏水且相互积存,双链中这一积存作用扩大化。3. A 型、B 型、Z 型DNA 的特点:A 型A-form DNA:每旋转一圈包括 11 个碱基对,高 2.3nm脱水状态下形成A 型DNA,右手螺旋B 型B-form DNA:每旋转一圈包括 10 个碱基对,高 3.4nm,即碱基对之间相隔 0.34nm最常见的右手螺旋DNA,由两条反向平行、互补、相互缠绕的DNA 链组成,相邻碱基对之间相距 0.34nm,碱基平面根本与螺旋轴垂直Z 型Z-form DNA:每

24、旋转一圈包括 12 个碱基对,高 4.6nm左旋DNA 双螺旋,糖磷骨架呈“之”字形走向,往往消灭在多聚G-C 区。碱基平面不与螺旋轴垂直,螺旋轴不穿过碱基对,活性明显降低4. GC 含量与Tm 值的关系:Tm,melting temperatureDNA 解链温度:DNA 解链过程中单链到达一半时的温度或DNA变形过程中紫外吸取到达最大增值一半时的温度。GC%含量特点:在高等生物中GC 含量接近 50%,低等生物GC 含量可以有很大差异。GC%越大,Tm 越大Tm 受到DNA 一级序列简洁性影响。越简洁Tm 越大。5. DNA 的变性denaturation 和复性renaturation

25、与核酸杂交技术hybridization 的关系:Denaturation变性:由物理 pH,温度,离子强度的转变或化学因素导致 DNA 或RNA 氢键破坏,从双链构造变成单链构造的过程。Renaturation 复性:指 DNA 双螺旋变形后的两条互补单链重恢复成双螺旋构造的过程。DNA 变性和复性与Hybridization 核酸杂交技术的关系:DNA 的变性和复性是核酸杂交技术的根底。其根本原理就是应用核酸分子的变形和复性的性质。将来源不同的 DNA或 RNA 经热变形后渐渐冷却复性,假设这些异源DNA 之间在某些区域有一样的序列,则复性时会形成杂交DNA 分子,DNA 与互补的RNA

26、之间也可以发生杂交。6. 测序技术的根本原理:How DNA sequencing working? 习题p23-3Sanger 双脱氧链终止法根本原理:双脱氧核苷酸分子的脱氧核糖的 3” 位置的 -OH 缺失。当它与其他正常核苷酸混合在同一个扩增反响体系中时,在 DNA 多聚酶的作用下,虽然它也能够象正常核苷酸一样参与DNA 合成,以其 5” 位置的磷酸基,与上位脱氧核苷酸的 3” 位置的 -OH 结合,但是,由于它自身 3” 位置 -OH 的缺失,至使下位核苷酸的 5” 磷酸基无法与之结合。该方法以待测单链或双链 DNA 为模板,使用能与 DNA 模板结合的一段寡核苷酸为引物,在 DNA

27、多聚酶的催化作用下合成的 DNA 链互补链。假设是 dNTP 掺入其中, DNA 互补链则将连续延长下去;假设是 *ddNTP*-ddATP 或 *-ddCTP 或 *-ddGTP 或 *-ddTTP 即双脱氧核苷酸 掺入其中, DNA 互补链的合成则到此终止。而双脱氧核苷酸的掺入是随机的,故各个生 DNA 片段的长度互不一样。不同长度 DNA 片段在凝胶中的移动速率不同,而聚丙烯酰胺凝胶区分率极高,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳能区分出小至一个碱基长度差的DNA 片段,从而将混合产物中不同长度 DNA 片段分别开,再通过放射自显影曝光,依据片段尾部的双脱氧核苷酸读出该 DNA 的碱基排列挨次。以待测

28、链为模板,形成的互补链参与双脱氧核苷酸断裂为不同长度DNA 片段电泳分别7. replication origin复制原点复制起点的概念和构造:p3-1Replication origin, oriC复制起点:复制起始的地方,序列保守。关键序列在于两组短的重复:3 个 13bp 的保守序列和 4 个 9bp 的串联重复序列。大肠杆菌复制起点上 4 个 9bp 重复序列为DnaA 蛋白的结合位点。8. 复制的共价延长滚环复制:Covalent extension共价延长:先导链共价结合到一条亲本链上的复制方式,主要是滚环复制。Rolling circle replication滚环复制:滚环复制

29、是特定的环状 DNA 分子的复制方式,是某些噬菌体的养分复制过程和接合质粒的转移复制过程。先将环状双链中的一条链切断, 5 端与蛋白质结合,然后以 3-OH 作为引物区,在 DNA 聚合酶的作用下,以未断的链做模板, 合成的子链。通常滚环复制的产物是一个多聚体,之后再被切成单个拷贝。9. 复制的根本要素:具 5”到 3”方向性引物模板DNA 聚合酶性质3-5外切酶活性5-3外切酶活性聚合酶+聚合酶+-聚合酶+-10. 原核生物三种DNA 聚合酶的特性: 大肠杆菌DNA 聚合酶的比较:5-3聚合酶活性+生链合成-+主要功能主要参与复制过程校在无聚合酶、聚合复制过程延长核苷读、损伤修复;除去酶时起

30、聚合作用酸链的聚合作用主冈崎片段 5端 RNA引物,使冈崎片段间修复作用要的复制酶缺口消逝具外切酶活性11. 转录和复制的主要异同点:复制产物是DNA特点半保存复制模板双链均复制转录(产物是RNA) 不对称转录仅模板链复制并且只能是DNA 的一个区段原料dNTP脱氧N=A,T,C, NTPN=A,U,C,G G酶 产物碱基配对引物方向 补充:一样点:都以DNA 为模板进展的。依靠DNA 的DNA 聚合酶子代双链DNA A=T,CG需要5 ”端3”端依靠DNA 的RNA 聚合酶mRNA,tRNA,rRNA 等A=U,GC,T=A不需要由于 RNA 聚合酶可以重头合成出链都依靠DNA 的双链,合成

31、前都必需解旋为单链。聚合过程每次都只延长一个核甘酸核苷酸之间连接的都是磷酸二脂键不同点: 复制的产物与亲代具有高保真性,大多数状况下与母链是完全一样的。但转录的产物除UT 相互替换,成熟的RNA 与模板序列差异较大。 DNA 复制需要连接酶,转录不需要12. 转录时候位置是怎么标的哪一个碱基叫+1?第一个被转录的碱基标为+1,这一位置的上游依据它们离开第一个碱基的距离用符号标记。13. 原核生物和真核生物基因转录的差异 原核生物基因转录只有一种RNA 聚合酶参与;真核生物基因转录有三种以上RNA 聚合酶poll I ,负责不同类型的基因转录,合成不同类型的RNA,在细胞核内定位也不同。 转录产

32、物差异大。原核生物初始转录产物大多数都是编码序列;而真核生物的初始产物含有内含子序列,成熟的mRNA 只占初始转录产物的一小局部。 原核生物的初始转录产物几乎不需进一步加工,可直接行使翻译模板功能,转录和翻译是偶联的;真核生物转录产物历经剪接、修饰的转录后加工成熟过程。 原核生物的转录产物mRNA 为多顺反子,真核生物mRNA 是单顺反子。转录单位 原核生物的启动子通常位于基因的上游且保守性较强,真核生物poll I位于基因上游, 位于基因内部且不同基因间启动子差异较大。 原核生物无增加子,真核生物有。 原核生物的在细胞质中进展,真核生物在细胞核中进展14. 真核三种RNA 聚合酶特点:酶细胞

33、内定位 转录产物RNA Pol I RNANucleolirRNA聚合酶 I核仁RNA Pol RNANucleoplasm hnRNAmRNA 前体聚合酶核质RNA Pol RNANucleoplasm tRNAs, 5srRNA,聚合酶核质U6snRNA ,局部小 RNAs15. 原核生物RNA 聚合酶 (RNA Polymerase in prokaryote)原核生物RNA 聚合酶只有一个RNA polymerase holoenzymeRNA 聚合酶全酶:a,2b ,b, w,s,其中 a2bb w 局部称为核心酶s 因子的作用:负责模板链的选择和转录起始,它是酶的别构效应物,使酶专

34、一性识别模板上的启动子。是转录起始时所必需的因子。其不仅增加了聚合酶对启动子的亲和力,而且还 降低了它对非专一位点的亲和力。16. Capping5 ”端的帽子构造、作用5端的帽子是一个特别的构造,它由甲基化鸟甘酸经焦磷酸与mRNA 的 5端核苷酸相连, 形成 5,5-三磷酸连接。真核生物mRNA 有帽子构造,原核生物mRNA 没有。作用: 防止 mRNA 降解 提高翻译效率 作为进出细胞核的识别标志 提高 mRNA 的剪接效率17. 三个终止密码子:UAA, UGA, UAG终止密码子和密码子可以互变p9-1缘由:由于没有能够识别它们的tRNA。假设tRNA 能够人工突变从而识别终止密码子,

35、可以把终止密码子变为编码密码子;同样,编码某个氨基酸的密码子发生突变而无法被识别, 这个密码子就会成为终止密码子。18. Mechanism of Translation in Prokaryotes原核翻译的机理 三个阶段:起始,延长,终止(1) initiation起始:E.coli翻译过程的起始是翻译起始复合物的生成,其具体分五步: IF3 、IF1使核蛋白体大、小亚基分别并帮助小亚基与mRNA的SD序列结合,IF1占据A位; fMettRNAMetIF2GTP复合物识别并结合于mRNA起始密码子AUG上; fMetRNAMet定位于P位,A位空出; 大、小亚基结合; IF2结合的GTP

36、水解释能, IF1、IF2 、IF3脱落,形成70S翻译起始复合物。(2) elongation延长:翻译的肽链延长也称核蛋白体循环,是指在核蛋白体上,按 mRNA的密码挨次,经进位、成肽、转位三步循环过程,使氨基酸缩合成多肽链过程。 进位:EFTu、EFTs帮助特异氨基酰tRNA按A位对应的密码子进入,需GTP。 成肽转肽: 转肽酶催化P位fMet或肽酰与A位氨基酰以肽键相连,P位上空载的tRNA脱落,P位空出。需Mg2+、K+。 转位移位:由转位因子EFG催化,GTP供能,核蛋白体沿mRNA由53移动一个密码子的位置,使A位的肽酰tRNA移到P位,A位空出。需Mg2+。 如此进位、成肽、转

37、位反复循环进展,使肽链不断延长。(3) termination终止当核糖体到达一个终止密码子时转录就完毕了,没有 tRNA 能够与在 A 位上的终止密码子结合。原核真核的翻译机理不同19. 原核翻译中,核糖体的 30s 小亚基怎样和起始位点结合? 原核 mRNA 有两个起始识别位点:AGGAGGSD 序列 起始密码子AUG在一条 mRNA 上可能会有很多 AUG,能作为起始密码子的AUG 由 SD 序列来标明。核糖体 30S 亚基中的 16SrRNA 通过与SD 序列发生直接的碱基配对而识别这一序列。20. 真核识别起始AUG 依靠scanning扫描 40S小亚基识别mRNA5帽子并与它结合

38、 40S小亚基延mRNA5到3方向扫描 当40S小亚基移动到AUG起始密码子处,扫描停顿 60S大亚基在蛋白因子的作用下,与40S小亚基形成80S核糖体,开头翻译21. translation initiation complex翻译的起始混合物包括哪几局部?没有大亚基,由于是后装配上的由核糖体亚基、一个 mRNA 模板、一个起始的 tRNA 分子和起始因子组成并组装在蛋白质合成起始点的复合物。22. 原核生物mRNA 半衰期特点原核生物 mRNA 半衰期短。细菌基因的转录与翻译是严密相连的,基因转录一旦开头,核糖体就结合到生的mRNA 链的 5端,启动蛋白质合成,而此时该 mRNA 的 3端

39、还远远没有转录完全。23. pH 怎么影响蛋白质所带的静电荷蛋白质溶液的pH 大于等电点时,该蛋白质颗粒带负电荷,反之则带正电荷.24. 维持蛋白质一、二、三级构造的主要化学键重点一级构造:氨基酸的连接挨次和排列方式。肽键和二硫键二级构造:多肽链主链原子的局部空间构造。有 -螺旋, -折叠, -转角和无规卷曲。肽健间的氢键。三级构造:一条多肽链中全部原子的空间排布。如构造域。长距离的疏水键、二硫键、氢键非共价键:氢键、范德华力、盐键、疏水相互作用。25. 磷酸化发生的位点主要由多种蛋白激酶催化,发生在丝氨酸、苏氨酸和络氨酸等三种氨基酸的侧链上。26. 真核生物三种启动子的构造特点:真核生物三类

40、启动子分别由RNA 聚合酶、进展转录类别启动子包括核心启动子和上游把握元件两局部,需要UBF1 和 SL1 因子参与作用。类别启动子包括四类把握元件:根本启动子、起始子、上游元件和应答元件。识别这些元件的反式作用因子有通用转录因子、上游转录因子和可诱导因子。类别启动子有两类:上游启动子和基因内启动子,分别由装配因子和起始因子促进转录起始复合物的形成和转录。27. 乳糖操纵子乳糖操纵子的构造:构造基因:大肠杆菌乳糖操纵子含Z、Y、A三个构造基因 lacZ:编码 -半乳糖苷酶,可将乳糖水解为半乳糖和葡萄糖两个单糖。lacY:编码 -半乳糖苷透性酶,负责将乳糖由胞外运送到胞内。lacA:编码 -半乳

41、糖苷转乙酰酶,催化乙酰-CoA 的乙酰基转移到半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。调整基因:基因编码的阻遏蛋白可与操纵区O 结合。当阻遏蛋白与操纵区结合时,lac 基因的转录起始受到抑制。操纵区O:操纵区是DNA 上的一小段序列,是阻遏蛋白的结合位点。CAP 位点:可以与cAMP-CRP 复合物结合。CRP 为 cAMP 的受体蛋白,二者结合后形成复合物可以结合在启动子尚有的CAP 位点,促进构造基因的转录。lacP:启动子序列2调控机理negative control(负调控)positive control(正调控)负调控:是指调整基因产物repressor阻遏蛋白的调控,repressor有活性

42、时阻遏了lac Z Y A的表达。当环境中无乳糖时:I基因产生的蛋白质即阻遏物同操纵基因O结合,阻挡了RNA多聚酶的向前推动,不能合成mRNA,也就无后几个酶的合成;当环境中有乳糖时:乳糖作为诱导物,同阻遏物结合,使阻遏物失去同操纵基因结合的活性, 从O基因上脱离下来,RNA多聚酶的合成功能得以实现,产生出mRNA,并由此进展蛋白质 的合成,产生三个相应的酶。 正调控:是指CRP-cAMP复合物的调控,当环境中有乳糖时,cAMP ,cAMP激活CRP,CRP-cAMP复合物与CAP结合,促进转录。28. 色氨酸操纵子色氨酸生物合成中的两大调控过程 机理:色氨酸操纵子构造:(1) Negativ

43、e regulation负调控-trp 阻遏蛋白 当环境中色氨酸水平较高时,色氨酸与阻遏蛋白结合激活阻遏蛋白,使阻遏蛋白结合到操纵基因上从而阻挡RNA 聚合酶进展转录。 当环境中色氨酸水平较低时,没有色氨酸与阻遏蛋白结合,阻遏蛋白未活化无法结合到操纵基因上,RNA 聚合酶可进展转录。(2) Attenuation衰减作用2341色氨酸的操纵区和第一个构造基因E 之间存在一段前导肽序列(Theleader sequence ),其中包含一个弱化子位点(an attenuator site)。前导肽基因含有4个GC富含区域,其中1区含有两个相邻的色氨酸密码子。这4个区域可形成两种选择的发夹构造:

44、12;34 或 23 .当培育基中色氨酸的浓度很低时,负载有色氨酸的tRNATrp也就少,这样翻译通过两 个相邻色氨酸密码子的速度就会很慢,当4区被转录完成时,核糖体才进展到1区(或停 留在两个相邻的Trp密码子处)。核糖体在这一地方的停留促进了正在被转录出来的RNA 形成非终止型发夹构造,这时的前导区构造是23配对,不形成34配对的终止构造, 所以转录可连续进展。而当培育基中色氨酸浓度高时,核糖体可顺当通过两个相邻的色 氨酸密码子,在4区被转录之前,核糖体就到达2区,这样使2-3不能配对,34区可以 自由配对形成茎环状终止子构造,,Trp操纵子中的构造基因被关闭而不再合成色氨 酸。HIGH

45、trp:12;34(short mRNA) LOW trp:23(full long mRNA)1234UUUUUUUUUUUU29. 人类基因组的根本特点: 人类基因组Human genome是人类的基因组。共有 23 对染色体,分别是 22 对体染色体和性染色体X 染色体与Y 染色体。 含有约 31.6 亿个DNA 碱基对。 碱基对是以氢键相结合的两个含氮碱基,以A、T、C、G 四种碱基排列成碱基序列。其中一局部的碱基对组成了大约 20230 到 25000 个基因。 人类基因组的基因密集区主要由GC 组成,贫瘠区主要由 AT 组成。GC 屡次重复延长通常发生基因富集区四周,供给了基因之间的阻隔和垃圾基因。30. 真核基因、染色体的根本构造和特点: 真核基因的根本构造和特点:以单顺反子存在基因分编码区和非编码区。编码区可被翻译,包括起始密码子AUG和终止密码子UAA, UAG,UGA。真核生物基因的编码区被非编码区分割开来,非编码区不会被翻译成多肽序列,但对于基因遗

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