《第十三章真菌的分类学地位(普通真菌学)ppt课件.ppt》由会员分享，可在线阅读，更多相关《第十三章真菌的分类学地位(普通真菌学)ppt课件.ppt（38页珍藏版）》请在taowenge.com淘文阁网|工程机械CAD图纸|机械工程制图|CAD装配图下载|SolidWorks_CaTia_CAD_UG_PROE_设计图分享下载上搜索。
1、从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。第十三章第十三章 真菌在生物界的地位及其真菌在生物界的地位及其分类分类第一节第一节 真菌在自然界的地位真菌在自然界的地位第二节第二节 真菌的分子生物学鉴定方法真菌的分子生物学鉴定方法1 1 真菌真菌DNADNA碱基组成的分类鉴定方法碱基组成的分类鉴定方法 2 2 核酸分析技术核酸分析技术 3 3 真菌核型的脉冲电泳分析真菌核型的脉冲电泳分析第三节第三节 真菌的起源和演化真菌的起源和演化第四节第四节 真菌的命名和分类真菌的命名和分类从使用情况来看，闭胸式的使用
2、比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。第一节 真菌在自然界的地位从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。两界系统（两界系统（17531753）：）：植物界和动物界三界系统三界系统(1860)(1860)：原生生物界（藻类、原生动物、细菌和真菌）植物界和动物界四界系统四界系统(1938(1938、19561956、1959)1959)：原生生物界（蓝藻、原生动物和细菌）、真菌界、植物界和动物界五界系统（五界系统（19691969
3、）：）：原核生物界（蓝藻和细菌）、原生生物界（单细胞真核生物）、真菌界、植物界（高等藻类绿藻和红藻）和动物界一、真菌在生物中的分类地位一、真菌在生物中的分类地位从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。八界系统（八界系统（19811981，19881988）19951995年真菌字典（第八版）接受了8个界的系统：原核生物界、原生动物界、胆藻界、真菌界、眼虫动物界、藻物界、动物界、绿色植物界。两总界（两总界（1965）：）：始生总界（无细胞形态的病毒）和胞生总界（细菌、黏菌、真菌、植物、动物）三域（三
4、域（1971）：）：病毒域、原核域和真核域从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。五界系统从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。3 3域域7 7界系统界系统A Phylogenetic tree based on a distance analysis of 16
5、S-like rRNA molecular sequences from 75 taxa.Patterson&Sogin,1992)从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。Selected characters distinguishing the main kingdoms of eukaryota(Dictionary,2001)CharacterNutritionCell wallsMitochondrialCristae线粒体Flagellar鞭毛mastigonemesAnimalia
6、Heterotrophic(phagotrophic吞噬/osmotrophic渗透Absent,cellulosicmaterial notproducedFlattened扁平(rarely tubular)AbsentChromistaAutotrophic(photosynthetic or absorptive吸收Often cellulose;Tubular管状TubularFungiHeterotrophic(absorptive/osmotrophic)Chitin and glucansFlattenedAbsentPlantaeAutotrophic(photosynthe
7、tic)Cellulose andotherspolysaccharidesFlattenedAbsentProtpzoaHeterotrophic(phagotrophic吞噬)or autotrophic(photosynthetic)Absent whentrophic;variouswhen presentTubularNot tubular从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。二、真菌界的分类二、真菌界的分类三纲一类三纲一类（1969年以前）年以前）藻状菌纲（Phycomycetes)
8、低等真菌（lower fungi)子囊菌纲（Ascomycetes)子囊菌担子菌纲（Basidiomycetes）担子菌半知菌类（Deuteromycetes）半知菌（imperfect fungi从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。真菌界真菌界(五界系统五界系统)The Dictionary of Fungi,1983粘菌门（粘菌门（粘菌门（粘菌门（Myxomycota)-7Myxomycota)-7个纲个纲个纲个纲真菌门（真菌门（真菌门（真菌门（Eumycota)-5Eumycota)-5
9、个亚门个亚门个亚门个亚门鞭毛菌亚门（Mastigomycotina）-3个纲接合菌亚门（Zygomycotina）-2个纲子囊菌亚门（Ascomycotina）-5个纲担子菌亚门（Basidiomycotina）-3个纲半知菌亚门（Deuteromycotina）-3个纲从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。Introduction to Mycology,1979真菌界真菌界裸菌门裸菌门(Gymnomycota)集胞黏菌亚门 (Acrasiogymnomycotina)集胞黏菌纲(Acrasi
10、omycetes)原质体裸菌亚门 (Plasmodiogymnomycotina)原柄黏菌纲(Protostellomycetes)黏菌纲(Myxomycetes)鞭毛菌门鞭毛菌门(Mastigomycota)单倍体鞭毛菌亚门 (Haplomastigomycotina)壶菌纲(Chytridiomycetes)丝壶菌纲(Hyphochytridiomycetes)根肿菌纲(Plasmodiophoromycetes)双倍体鞭毛菌亚门(Diplomastigomycotina)卵菌纲(Oomycetes)真菌学概论，1983，裘维蕃从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾
11、构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。接合菌亚门接合菌亚门(Zygomycotina)接合菌纲(Zygomycetes)毛菌纲(Trichomycetes)子囊菌亚门子囊菌亚门(Ascomycotina)半子囊菌纲;不整囊菌纲 层囊菌纲;虫囊菌纲 腔囊菌纲 担子菌亚门担子菌亚门(Basidiomycotina)冬孢菌纲;无隔担子菌纲 隔担子菌纲 半知菌亚门半知菌亚门(Deuteromycotina)芽孢纲;腔孢纲;丝孢纲无鞭毛菌门无鞭毛菌门从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少
12、使用，在此不再说明。分子系统学和超微结构的深入研究，发分子系统学和超微结构的深入研究，发现卵菌、丝壶菌、粘菌、根肿菌等在亲现卵菌、丝壶菌、粘菌、根肿菌等在亲缘关系上与真菌较远，而地衣与真菌亲缘关系上与真菌较远，而地衣与真菌亲缘关系较近。缘关系较近。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。本书采用的分类系统 Smith（1981，1988）提出的生物8界系统，即原核生物界、原生动物界、原生动物界、胆藻界、真菌界真菌界、眼虫动物界、藻物界藻物界、动物界、绿色植物界。真菌界：真菌界：壶菌门、接合菌门、子
13、囊菌门、担子菌门、半知菌类壶菌门壶菌纲接合菌门接合菌纲、毛菌纲子囊菌门半子囊菌纲、不整囊菌纲、核菌纲、腔菌纲、盘菌纲、虫囊菌纲担子菌门冬孢纲、层菌纲、腹菌纲半知菌门芽孢纲、丝孢纲、腔孢纲从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。三、真菌分类系统的演变和比较三、真菌分类系统的演变和比较 （1 1）三纲一类的系统）三纲一类的系统 藻状菌纲藻状菌纲 担子菌纲担子菌纲 子囊菌纲子囊菌纲 半知菌类半知菌类 （2 2）Ainsworth （19731973）的系统）的系统 真菌（菌物）界包括粘菌门和真菌门，而真
14、菌门包括真菌（菌物）界包括粘菌门和真菌门，而真菌门包括5 5个亚门：个亚门：鞭毛菌亚门（鞭毛菌亚门（Mastigomycotina）接合菌亚门（接合菌亚门（Zygomycotina）子囊菌亚门（子囊菌亚门（Ascomycotina）担子菌亚门（担子菌亚门（Basidiomycotina）半知菌亚门（半知菌亚门（Deuteromycotina）（3 3）Alexopoulus（1979）的系统的系统 裸菌门裸菌门 鞭毛菌门鞭毛菌门 无鞭毛菌门无鞭毛菌门（4 4）Smith（1995）的系统的系统壶菌门、壶菌门、接合菌门、接合菌门、子囊菌门、子囊菌门、担子菌门、担子菌门、半知菌类半知菌类从使用情况
15、来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。真菌界真菌界5 5个门的主要特征个门的主要特征门门营营 养养 体体无性繁殖无性繁殖有性生殖有性生殖壶 菌原质团或没有隔膜的菌丝体 游动孢子休眠孢子囊或卵孢子接合菌菌丝体，典型的没有隔膜 孢囊孢子接合孢子子囊菌有隔膜的菌丝体，少数是单细胞分生孢子等子囊孢子担子菌有隔膜的菌丝体不发达担孢子半知菌有隔膜的菌丝体或单细胞 分生孢子等没有有性生殖，但可能进行准性生殖真菌界的真菌界的5 5个门个门从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但
16、在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。l界（Kingdom）l门（Phylum）-mycotal亚门(Subdivision)-mycotinal纲(Class)-mycetesl目(Order)-alesl科(Family)-aceael属(Genus)l种(Species)四、真菌的分类单元四、真菌的分
17、类单元从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。第二节第二节 真菌的分子生物学鉴定方法真菌的分子生物学鉴定方法一、真菌DNA碱基的分类鉴定 通过测定不同真菌DNA的四个碱基中A、G、C、T的组成来鉴定真菌，在真菌分类中有两个作用 1、可以鉴定真菌的种、属 2、可以作为判定真菌科属间的亲缘关系的参考标准从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构
18、、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。1 1、基于、基于SouthernSouthern杂交技术的分子标记杂交技术的分子标记 利用限制性内切酶酶解及凝胶电泳分离不同的生物DNA分子,然后用经标记的特异DNA探针与之进行杂交,通过放射自显影或非同位素显色技术来揭示DNA的多态性,主要有RFLP和VNTR。二、核酸分析技术二、核酸分析技术从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些
19、年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。1 1）RFLP(Restriction Fragment Length RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)Polymorphism)限制性片段长度多态性限制性片段长度多态性检测DNA在限制性内切酶酶切后形成的特定大小的DNA片段。由于不同来源DNA的特定的限制性内切酶酶切位点分布不同,每一种DNA与限制性内切酶酶切所产生的片段大小都是特异的,从而产生多态性。研究表明RFLP可有效地检测植物病原真菌的种内遗传分化,可用于区分病原真菌的近缘种、小种、专化型,也可用于比较不同地理区域病原的群体
20、遗传结构及病害的流行趋势。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。2）VNTR(Variable Number of Tandem Repeats)串联重复变异值真核生物DNA存在大量的串联重复序列的高变异区,可采用VNTR标记技术区分小卫星或微卫星序列的差异。VNTR基本原理与RFLP大致相同,但要求限制性内切酶的酶切位点必须不在重复序列中,以保证小卫星或微卫星的序列的完整性,通过电泳可充分显示不同长度重复序列片段的多态性。分子杂交所用DNA探针核苷酸序列也必须是小卫星或微卫星序列。从使用情况来
21、看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。1)RAPD(Randomly Amplified Polymorphic DNA)随随机扩增多态性机扩增多态性DNA分析分析RAPD基本原理是利用随机引物(一般为8-10bp)通过PCR反应非定点扩增DNA片段,然后用凝胶电泳分析扩增产物DNA片段的多态性。RAPD适合于种内菌株遗传多样性、亲缘关系的研究,是真菌种鉴定有效可靠的工具,近几年得到了大量的应用,但对于种间及近缘属之间的亲缘关系的研究有一定的局限性。2基于基于PCR技术的分子标记技术的分子标记从使用情况来看
22、，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。2)SSR标记标记(Simple Sequence Repeats,又微卫星又微卫星micro satellite又又RAMS)SSR标记是利用真核生物基因组中存在的大量重复序列(微卫星序列)设计引物,通过PCR扩增串联的重复序列，依据微卫星寡核苷酸的重复次数在同一物种不同基因型间的差异，揭示长度多态性，是目前研究遗传变异的较好方法。朱振东等从大豆疫霉菌大豆疫霉菌ESTs中发掘并建立了大豆疫霉菌的SSR标记,为大豆疫霉菌及相关属种的鉴定、遗传变异、分子作图等研究提供了一种
23、更加有效的分子标记系统。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。ISSR标记技术利用真核生物基因组中广泛存在的SSR序列设计与其结合的引物,对两个相距较近、方向相反的SSR序列间的DNA区段进行扩增。ISSR指纹分析可以作为区分具有相似形态或ITS序列的丝状真菌以及分析检测种的复杂度和验证新种的有效工具。3)ISSR(inter-simple sequence repeats 3)ISSR(inter-simple sequence repeats polymorphism)polymorphis
24、m)简单重复序列间多态性简单重复序列间多态性从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。SRAP标记是一种基于PCR技术的新型分子标记技术。SRAP标记利用上游引物对外显子进行特异性扩增,下游引物对内含子区域、启动子区域进行特异性扩增，因不同物种的内含子、启动子与间隔长度不等而产生多态性。4)SRAP(Sequence-Related Amplified 4)SRAP(Sequence-Related Amplified Polymorphism)Polymorphism)相关序列扩增多态性相关序列扩
25、增多态性从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。SRAP技术具有简便、稳定、中等产率和容易得到选择条带序列的特点,在基因组中分布均匀,适合于不同作物的基因定位、基因克隆和遗传图谱构建.目前已经在马铃薯、水稻、苹果、柑橘类果树、樱桃、梅子、油菜、大蒜、棉花、小麦和水稻稻瘟病中研究应用。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。AFLP基本原理:基因组酶切-限制性片段-特定的接头-接头序列-PCR引物-通过
26、聚丙烯酰胺电泳运用AFLP,1998年Patchara等分析了黑胫茎点霉(Leptophaeria maculans),获得了基因对基因假说的进一步证据。近年来,AFLP在瓜类枯萎病菌、双孢蘑菇、稻曲病菌等许多真菌的鉴定和分类中得到应用。5)AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism)扩增片段长度多态性扩增片段长度多态性从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。SNP(Single Nucleotide Polymorphisms)SNP标记可以检测出基因
27、组中因一个碱基的不同而产生的DNA多态性。原理：利用不同碱基在测序过程中峰值不同来检出DNA中因一个碱基的替换引起的DNA多态性。利用SNP标记已发现与人类一些重要疾病(哮喘病、糖尿病、癌症、血友病等)相连锁的标记座位.在植物遗传育种、进化、种质资源遗传多样性研究和保存等方面也发挥出越来越大的作用。6)基于单个核苷酸多态性的基于单个核苷酸多态性的DNA标记标记(SNP)从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。三、真菌核型的脉冲电泳三、真菌核型的脉冲电泳1984年美国哥伦比亚大学Schwartz和C
28、antor首创脉冲电泳,并成功地应用于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)染色体DNA的分离。核型分析就是应用脉冲电泳方法发展起来的一种新的实验技术,把整个染色体包埋在琼脂糖凝胶中,依赖染色体的大小和立体结构及在凝胶中的不同迁移速度把基因组分离成染色体带可以分辨10Mb的片段，易于分析大分子DNA。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。第三节第三节 真菌的起源真菌的起源多元论：认为真菌是由藻类演化而来。这些多元论：认为真菌是由藻类演化而来。这些藻类因丧失色素而从自养变成异
29、养，生理的藻类因丧失色素而从自养变成异养，生理的变化引起了形态的改变。他们根据性器官的变化引起了形态的改变。他们根据性器官的形态和交配方式进行推测，认为卵菌来自绿形态和交配方式进行推测，认为卵菌来自绿藻，接合菌来自接合藻，子囊菌来自红藻，藻，接合菌来自接合藻，子囊菌来自红藻，担子菌来自子囊菌。担子菌来自子囊菌。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。另一个学派认为除卵菌来自藻类外，其另一个学派认为除卵菌来自藻类外，其余的真菌来自原始鞭毛生物。鞭毛生物余的真菌来自原始鞭毛生物。鞭毛生物水生，具有一至
30、数根鞭毛，有的含叶绿水生，具有一至数根鞭毛，有的含叶绿素或红色素，有的含其他色素或无色素。素或红色素，有的含其他色素或无色素。含叶绿素的演化为藻含叶绿素的演化为藻,无色素的演化为真无色素的演化为真菌。菌。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。真菌界从接合菌再演化为子囊菌和担子菌。所真菌界从接合菌再演化为子囊菌和担子菌。所以，以，真菌的演化途径可能是：与眼虫藻有关的真菌的演化途径可能是：与眼虫藻有关的鞭毛生物鞭毛生物壶菌壶菌接合菌接合菌子囊菌子囊菌担子菌。担子菌。这是真菌演化的主轴，相当于绿色植物
31、中的：这是真菌演化的主轴，相当于绿色植物中的：绿藻绿藻轮藻轮藻苔藓苔藓维管束植物维维管束植物维管束植物维维管束植物管束植物。管束植物。过去认为卵菌是在产生高等真菌的演化线上的过去认为卵菌是在产生高等真菌的演化线上的一个早期分支，现在却认为它属于另一个演化一个早期分支，现在却认为它属于另一个演化线，大概起源于与金藻有关的无色素类型，因线，大概起源于与金藻有关的无色素类型，因而被排除在真菌以外。而被排除在真菌以外。进进 化化 过过 程程从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。从使用情况来看，闭胸式的使用比较广泛。敞开式盾构之中有挤压式盾构、全部敞开式盾构，但在近些年的城市地下工程施工中已很少使用，在此不再说明。谢谢大家！