生物信息的传递上转录精选PPT.ppt

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1、关于生物信息的传递上转录第1页,讲稿共92张,创作于星期二 基本概念 转录起始:RNA聚合酶、启动子 转录的基本过程 转录后加工 原核生物与真核生物mRNA的特征比较 RNA合成与DNA合成异同点Contents第2页,讲稿共92张,创作于星期二一、基本概念生物体以DNA为模板合成RNA的过程。转录(transcription):第3页,讲稿共92张,创作于星期二参与转录的物质参与转录的物质原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板:DNA酶:RNA聚合酶其他蛋白质因子RNA合成方向合成方向:5 3第4页,讲稿共92张,创作于星期二第5页,讲稿共92张,创作于星期二转录的不对称性:在R

2、NA的合成中,DNA的二条链中仅有一条链可作为转录的模板,称为转录的不对称性。编码链与模板链与mRNA序列相同的那条DNA链称为编码链;将另一条根据碱基互补原则指导mRNA合成的DNA链称为模板链。第6页,讲稿共92张,创作于星期二第7页,讲稿共92张,创作于星期二模板链并非永远在同一条单链上转录方向转录方向5 5 3 3 3 3 5 5 模板链模板链编码链编码链编码链编码链模板链模板链转录方向转录方向DNA分子上转录出分子上转录出RNA的区段,称为结构基因。的区段,称为结构基因。结构基因:第8页,讲稿共92张,创作于星期二几个概念几个概念第9页,讲稿共92张,创作于星期二转录单位RNA链的转

3、录,起始于链的转录,起始于DNA模板的一个特定位点,并在另一位点模板的一个特定位点,并在另一位点终止,此转录区域称为一个转录单位。一个转录单位可以是一个终止,此转录区域称为一个转录单位。一个转录单位可以是一个基因(真核),也可以是多个基因(原核)。基因(真核),也可以是多个基因(原核)。基因的转录是有选择性的,细胞不同生长发育阶段和细胞环境条件的改变,基因的转录是有选择性的,细胞不同生长发育阶段和细胞环境条件的改变,将转录不同的基因。将转录不同的基因。转录的起始由转录的起始由DNA上的启动子区控制,转录的终止由上的启动子区控制,转录的终止由DNA上的终上的终止子控制,转录是通过止子控制,转录是

4、通过DNA指导的指导的RNA聚合酶来实现的聚合酶来实现的 第10页,讲稿共92张,创作于星期二 基本概念 转录起始:RNA聚合酶、启动子 转录的基本过程 转录后加工 原核生物与真核生物mRNA的特征比较 RNA合成与DNA合成异同点Contents第11页,讲稿共92张,创作于星期二二、参与转录起始的关键酶与元件(一)RNA聚合酶原核生物RNA聚合酶(大肠杆菌为例)全酶=核心酶+因子第12页,讲稿共92张,创作于星期二第13页,讲稿共92张,创作于星期二第14页,讲稿共92张,创作于星期二第15页,讲稿共92张,创作于星期二大肠杆菌RNA聚合酶的组成分析亚基基因相对分子量亚基数组分功能rpoA

5、365002核心酶核心酶组装,启动子识别rpoB1510001核心酶和共同形成RNA合成的活性中心rpoC1550001核心酶?110001核心酶?rpoD700001因子存在多种因子,用于识别不同的启动子第16页,讲稿共92张,创作于星期二 真核生物RNA聚合酶酶位置转录产物相对活性对-鹅膏蕈碱的敏感性RNA聚合酶核仁rRNA50-70%不敏感RNA聚合酶核质hnRNA20-40%敏感RNA聚合酶核质tRNA约10%存在物种特异性真核细胞的三种RNA聚合酶特征比较第17页,讲稿共92张,创作于星期二RNA聚合酶与DNA聚合酶的区别RNA聚合酶DNA聚合酶大小(M)大,4.8105dol小,1

6、.09105dol引物无有产物较短,游离较长,与模板以氢键相连作用方式一条链的某一段两条链同时进行外切酶活性无5 3,3 5校对合成能力 无有修复能力无有第18页,讲稿共92张,创作于星期二(二)启动子(promoter)启动子定义:指能被RNA聚合酶识别、结合并启动基因转录的一段DNA序列。第19页,讲稿共92张,创作于星期二 原核生物启动子结构Pribnow41-44bp第20页,讲稿共92张,创作于星期二开始转录开始转录T T G A C AA A C T G T-35 区区(Pribnow box)T A T A A T Pu A T A T T A Py-10 区区1-30-5010

7、-10-40-205 3 3 5 原核生物启动子保守序列原核生物启动子保守序列RNA-pol辨认位点辨认位点5 5 RNA聚合酶保护区聚合酶保护区结构基因结构基因3 3 第21页,讲稿共92张,创作于星期二 TTGACA区:提供了RNA聚合酶全酶识别的信号 TATA区:酶的紧密结合位点(富含AT碱基,利于双链打开)第22页,讲稿共92张,创作于星期二编码链AACTGTATATTA模板链TTGACATATAAT35DNA转录起始点Probnow盒子启动子35 10 +1转录区53RNA转录起点与新生RNA链第一个核甘酸相对应DNA链上的碱基。第23页,讲稿共92张,创作于星期二大肠杆菌RNA聚合

8、酶全酶所识别的启动子区T85T83G81A61C69A52T89A89T50A65A100第24页,讲稿共92张,创作于星期二典型启动子的结构 -35 -10 转录起点TTGACA 16-19bp TATAAT 5-9bp第25页,讲稿共92张,创作于星期二Initiation第26页,讲稿共92张,创作于星期二 真核生物启动子真核生物启动子真核有真核有三种三种不同的启动子和有关的元件启动子最为复杂,它和原核的启动子有很多不同最为复杂,它和原核的启动子有很多不同真核生物启动子的结构核心启动子(核心启动子(core promoter)上游启动子元件(上游启动子元件(upstream promot

9、er element,UPE)第27页,讲稿共92张,创作于星期二1、核心启动子、核心启动子 定义:指保证指保证RNA聚合酶聚合酶转录正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括转录起始位点及转录起始位点上游TATA区区 作用:作用:选择正确的转录起始位点,保证精确起始TATA TATA 常在常在-25bp左右,相当于原核的-10序列序列T T T T85858585A A9797T T T T93939393A A85858585A A A A63636363A A A A83838383A A A A5050第28页,讲稿共92张,创作于星期二第29页,讲稿共92张,创作于星期二2、上游启动子

10、元件包括CAAT盒(CCAAT)和GC盒(GGGCGG)等作用:控制转录起始频率。CAAT:-70-80bpGGGCGG:-80-110bp第30页,讲稿共92张,创作于星期二SV40 早期启动子组蛋白H2B TATACAATGC第31页,讲稿共92张,创作于星期二(三)转录起始复合物 原核生物转录起始复合物第32页,讲稿共92张,创作于星期二 转录因子 转录复合体TBPTAFsTFIIATFIIB TFIIF Pol IITFIIE RNA pol 的转录起始 真核生物转录起始复合物第33页,讲稿共92张,创作于星期二 基本概念 转录起始:RNA聚合酶、启动子 转录的基本过程 转录后加工 原

11、核生物与真核生物mRNA的特征比较 RNA合成与DNA合成异同点Contents第34页,讲稿共92张,创作于星期二三、转录的基本过程1 1、起始位点的识别、起始位点的识别:RNARNA聚合酶与启动子DNADNA双链相互作用并与之相结合的过程。2、转录起始转录起始RNARNA链上第一个核甘酸键的产生第35页,讲稿共92张,创作于星期二第36页,讲稿共92张,创作于星期二3、RNA链的延伸链的延伸 亚基脱落,RNApol聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着DNA模板前移;在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链不断延长。核心酶核心酶 DNA RNA第37页,讲稿共92张,创作于星期二4、转录终

12、止 终止子(terminator,t)强终止子内部终止子 弱终止子 需要因子(rho factor)又称为依赖性终止子 (Rho-dependent terminator)不依赖Rho()因子的转录终止依赖Rho()因子的转录终止第38页,讲稿共92张,创作于星期二不依赖不依赖不依赖不依赖 因子的终止因子的终止 终止位点上游一般存在一个富含GC碱基的二重对称区,RNA形成发夹结构;在终止位点前面有一段由4-8个A组成的序列,RNA的3端为寡聚U第39页,讲稿共92张,创作于星期二发夹式结构和寡聚发夹式结构和寡聚U的共同作用使的共同作用使RNA从三元复合物中解离出来。第40页,讲稿共92张,创作

13、于星期二 终止效率与二重对称序列和寡聚U的长短有关,长度 效率第41页,讲稿共92张,创作于星期二依赖因子的终止因子:六聚体蛋白、水解各种核甘三磷酸促使新生RNA链从三元转录复合物中解离出来,从而终止转录。第42页,讲稿共92张,创作于星期二第43页,讲稿共92张,创作于星期二第44页,讲稿共92张,创作于星期二第45页,讲稿共92张,创作于星期二 基本概念 转录起始:RNA聚合酶、启动子 转录的基本过程 转录后加工 原核生物与真核生物mRNA的特征比较 RNA合成与DNA合成异同点Contents第46页,讲稿共92张,创作于星期二四、转录后加工第47页,讲稿共92张,创作于星期二5端加帽3

14、端加尾RNA的剪接RNA的编辑第48页,讲稿共92张,创作于星期二 5端的一个核苷酸总是7-甲基鸟核苷三磷酸(m7Gppp)。mRNA5端的这种结构称为帽子(cap)。1、在5端加帽第49页,讲稿共92张,创作于星期二m7Gppp鸟苷酸转移酶第50页,讲稿共92张,创作于星期二 帽子结构功能:能被核糖体小亚基识别,促使mRNA和核糖体的结合;m7Gppp结构能有效地封闭mRNA 5末端,以保护mRNA免受5核酸外切酶的降解,增强mRNA的稳定。第51页,讲稿共92张,创作于星期二2、3端加尾多聚腺苷酸尾巴AAUAAA:准确切割加poly(A)第52页,讲稿共92张,创作于星期二第53页,讲稿共

15、92张,创作于星期二多聚腺苷酸尾巴功能:提高了mRNA在细胞质中的稳定性。第54页,讲稿共92张,创作于星期二3、RNA的剪接地中海贫血病人的珠蛋白基因,1/4第55页,讲稿共92张,创作于星期二真核真核mRNAmRNA的剪辑的剪辑第56页,讲稿共92张,创作于星期二第57页,讲稿共92张,创作于星期二第58页,讲稿共92张,创作于星期二生物体内内含子的主要类型:GU-AG、AU-ACAU-AC、类内含子、类内含子5.AAGUAAGU.CURAY.(10-40)(U/C)11NCAG G.3 IntronexonexonPolyprimidine第59页,讲稿共92张,创作于星期二 5.AAG

16、UAAGU.CURAY.(10-40)(U/C)11NCAG G.3 IntronexonexonPolyprimidineCAG=UAG AAG GAG第60页,讲稿共92张,创作于星期二参与RNA剪接的物质:snRNA(核内小分子RNA)snRNP(与snRNA结合的核蛋白)第61页,讲稿共92张,创作于星期二第62页,讲稿共92张,创作于星期二UACUACA-AGUGU4U5U6E1E2U1U2UACUACA-AGUGU6E1E2U1、U4、U5第63页,讲稿共92张,创作于星期二第64页,讲稿共92张,创作于星期二类内含子的自我剪接第65页,讲稿共92张,创作于星期二类内含子的自我剪接

17、第66页,讲稿共92张,创作于星期二4、RNA的编辑编编辑辑(editing)是指转录后的RNA在编码区发生碱基的突变、加入或丢失等现象。第67页,讲稿共92张,创作于星期二C变为U碱基的突变碱基的突变碱基的突变碱基的突变第68页,讲稿共92张,创作于星期二尿苷酸的缺失和添加1986.R.Benne在研究锥虫线粒体mRNA转录加工时发现mRNA的多个编码位置上加入或丢失尿苷酸,1990年在高等动物和病毒中也发现了编辑现象。第69页,讲稿共92张,创作于星期二 锥虫coxII 基因的编辑第70页,讲稿共92张,创作于星期二第71页,讲稿共92张,创作于星期二 基本概念 转录起始:RNA聚合酶、启

18、动子 转录的基本过程 转录后加工 原核生物与真核生物mRNA的特征比较 RNA合成与DNA合成异同点Contents第72页,讲稿共92张,创作于星期二五、原核生物与真核生物mRNA的特征比较1、原核生物mRNA的特征 半衰期短 多以多顺反子的形式存在 多顺反子mRNA:编码多个蛋白质的mRNA。单顺反子mRNA:只编码一个蛋白质的mRNA。第73页,讲稿共92张,创作于星期二 结构基因结构基因Z:-半乳糖苷酶半乳糖苷酶Y:透过酶透过酶A:乙酰基转移酶:乙酰基转移酶ZYAOPDNA第74页,讲稿共92张,创作于星期二 5 端无“帽子”结构,3 端没有或只有较短的poly(A)结构。SD序列:m

19、RNA中用于结合原核生物核糖体的序列。第75页,讲稿共92张,创作于星期二2、真核生物mRNA的特征 5 端存在“帽子”结构多数mRNA 3 端具有poly(A)尾巴(组蛋白除外)以单顺反子的形式存在“基因”的分子生物学定义:产生一条多肽链或功能RNA所必需的全部核甘酸序列。第76页,讲稿共92张,创作于星期二原核生物和真核生物mRNA结构的比较第77页,讲稿共92张,创作于星期二 基本概念 转录起始:RNA聚合酶、启动子 转录的基本过程 转录后加工 原核生物与真核生物mRNA的特征比较 RNA合成与DNA合成异同点Contents第78页,讲稿共92张,创作于星期二六、RNA合成与DNA合成

20、异同点相同点:1、都以DNA链作为模板2、合成的方向均为53 3、聚合反应均是通过核苷酸之间形成的3,5-磷酸 二酯键,使核苷酸链延长。第79页,讲稿共92张,创作于星期二不同点:复制转录模板两条链均复制模板链转录(不对称转录)原料dNTPNTP酶DNA聚合酶RNA聚合酶产物子代双链DNA(半保留复制)mRNA,tRNA,rRNA配对A-T;G-CA-U;T-A;G-C引物RNA引物无第80页,讲稿共92张,创作于星期二中国科学院2001年硕士研究生入学考试:名词解释:Transcription;Reverse transcription 第81页,讲稿共92张,创作于星期二1、下列有关TAT

21、A盒(Hognessbox)的叙述,哪个是正确的:A.它位于第一个结构基因处B.它和RNA聚合酶结合C.它编码阻遏蛋白D.它和反密码子结合 B 第82页,讲稿共92张,创作于星期二 2.转录需要的原料是:A.dNTPB.dNDP C.dNMP D.NTP E.NMPD第83页,讲稿共92张,创作于星期二3、DNA模板链为 5-ATTCAG-3 ,其转录产物是:A.5 -GACTTA-3 B.5 -CTGAAT-3 C.5 -UAAGUC-3 D.5 -CUGAAU-3 D第84页,讲稿共92张,创作于星期二4、DNA复制和转录过程有许多相同点,下列描述哪项是错误的?A.转录以DNA一条链为模板

22、,而以DNA两条链为模板进行复制 B.在这两个过程中合成均为5-3方向 C.复制的产物通常情况下大于转录的产物 D.两过程均需RNA引物 D第85页,讲稿共92张,创作于星期二 5、真核生物的mRNA加工过程中,5端加上(),在3端加上(),后者由()催化。如果被转录基因是不连续的,那么,()一定要被切除,并通过()过程将()连接在一起。帽子结构、多聚腺苷酸尾巴、poly(A)聚合酶、内含子、剪接、外显子第86页,讲稿共92张,创作于星期二6、10位的()区和35位的()区是RNA聚合酶与启动子的结合位点,能与因子相互识别而具有很高的亲和力。TATA、TTGACA第87页,讲稿共92张,创作于

23、星期二7、决定基因转录基础频率的 DNA 元件是(),它是()的结合位点 启动子、RNA聚合酶 8、原核生物 RNA 聚合酶核心酶由()组成,全酶由()组成。22、22第88页,讲稿共92张,创作于星期二9、下面那一项不属于原核生物mRNA的特征()A:半衰期短 B:存在多顺反子的形式 C:5端有帽子结构 D:3端没有或只有较短的多聚(A)结构 第89页,讲稿共92张,创作于星期二10、比较RNA转录与DNA复制,下列哪些是正确的?A.都在细胞核内进行 B.转录是连续的 C.链的延长均为53 D.与模板链的碱基配对均为GC 第90页,讲稿共92张,创作于星期二11、真核细胞中的mRNA帽子结构是()A.7-甲基鸟嘌呤核苷三磷酸 B.7-甲基尿嘧啶核苷三磷酸 C.7-甲基腺嘌呤核苷三磷酸 D.7-甲基胞嘧啶核苷三磷酸 第91页,讲稿共92张,创作于星期二感感谢谢大大家家观观看看第92页,讲稿共92张,创作于星期二

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