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1、 大学生暑期夏令营学习心得体会(武汉大学) 大学生暑期夏令营学习心得体会(武汉大学) 2023年的暑假，很荣幸，被称呼为NIBS的“summer”。 2023年的暑假，很幸运遇到了这么一群真诚又得意的人。 2023年的暑假，NIBS在我的回忆中留下了浓墨重彩的一笔。 收到录用邮件的那种欣喜若狂我到现在还记忆犹新，但刺眼间在NIBS的五周已经接近尾声。假如要用一个词来概括我在NIBS的感受的话，那应当是“快乐”，这个词的意思直白的不能再直白但是却最能表达我的情感。 在来NIBS之前我总是觉得底气特殊缺乏，作为一名大二学生，之前在学校试验室做的大局部都是微生物方面的试验，因此对于生化细胞等试验操作
2、把握的并不是许多。但是进试验室的第一天，王所的一句话令我立刻不再纠结：“在NIBS最重要的不是你做了什么，而是你学了什么”。或许来NIBS最重要的不是我会什么，而是我的热忱和我的态度;或许最重要的不是我从哪里来，而是我能走多远;或许最重要的不是我来干嘛，而是我为什么来。NIBS夏令营，让我更深刻的体会到要有胆识去想，有士气去做，更要有力量去承受。 泡在试验室的时间总是过得飞速。不管是带我的师兄，还是其他师兄师姐们，总是特殊急躁的为我介绍他们所做的课题和详细试验，并给我上手的时机。不仅仅是把protocal告知我，更多的是告知我每一个step的原理以及如何分析得到的结果，还订正了我很多试验操作的
3、不标准之处。也感谢师姐教我看文献以及如何有规律的去讲文献。正由于试验室师兄师姐们的热忱，这五周中，我不仅体验了生化细胞方面的试验(Bac-to-Bac Baculovirus E*pression System)，还体验了一系列动物试验(取小鼠的坐骨神经、脊髓、脑等组织，灌流、腹腔注射、冷冻切片等)。感谢试验室全部的师兄师姐们，你们真的都是一群真诚又得意的人，正由于有了你们，这五周的生活才会如此的美妙。 正如我前面所说的，最重要的不是我做了什么，而是我学了什么。给我印象最深刻的一点也许是师兄师姐总能沉醉在自己的试验中。这个沉醉不是指做试验的时间长短，而是指思想上的沉醉，不断地思考试验过程中遇到
4、的问题，不管是negative还是positive的结果，对于他们而言都能从中找到启发，即使是重复性的试验对于他们而言也有着大不同。我认为这种对科研怀抱着激情与严谨的态度是我觉得我这五周中真正需要学习的。在与王所的交谈中，我更是感受到做科研，首先要有一个良好的心态，要有承受一切结果的心理素养，不管是好的结果还是坏的结果或是根本没有结果。只有拥有一个安康的心态，才能做到享受试验而不是被试验所支配。 年会是夏令营的一个高潮，有PI的work report，还有师兄师姐的poster，完善的呈现出了NIBS自由的学术气氛。感受最前沿的科学进展，享受思维的碰撞，查找自己感兴趣的方向。还有一群得意的su
5、mmer们，一起跳舞，一起唱歌，一起玩嬉戏。 五周的时间过的飞速，还没有来得及细细品尝就已接近尾声。这五周来我印象最深的或许不是最终结果出来的欣喜，而是试验过程中的一步一个脚印。 感谢NIBS给我这次夏令营的时机 感谢王所给我的启发与指引 感谢Wang *D. lab 全部的师兄师姐 感谢全部的summer 我们，珍重，再见。 篇2：暑期大学生夏令营训练心得体会(武汉大学) 暑期大学生夏令营训练心得体会(武汉大学) 快要离开NIBS了，心中的确不舍。这短短一个多月对我的影响很大，仿佛有种翻开了新世界大门的感觉，尽管新世界并不肯定与想象全都。所以，假如说我有什么感想的话，最多的应当是感恩吧。 我
6、最感谢的是试验室的教师与师兄师姐。来NIBS的第一天，黄牛教师不仅饶有兴致地听完了我对课题的设想，而且还特殊依据我想做的东西，安排了曾经做过类似课题的孙汉资师兄带我。接下来的日子里，我在师兄师姐的帮忙下学会了如何使用Gromacs、Amber两种分子动力学模拟软件，学会了进展MD、SMD、Umbrella Sampling以及MM-PBSA分析，并使用gnuplot、VMD、Chimera等工具来画图、分析结果数据等。最终也就我感兴趣的chaperone蛋白-核酸相互作用，特殊是其中的熵传递，做了些许工作。虽然这些工作并不能算得上严格的科学讨论，究竟一个月时间太短，而计算领域的结果需要在讨论者
7、完全熟识软件原理、参数等的状况下才具有可信度，但是这个过程中学到的、感悟到的东西才是真正重要的。 正如全部的科研工作都不是一蹴而就的，学习的过程也是。 一开头，汉资师兄准备让我先把握MD的根本流程，于是安排我就着Gromacs的tutorials来一步步把跑simulation的步骤给过一遍。紧接着，汉资师兄很nice地跟我争论了我想做的课题，提出Umbrella Sampling或许能够供应蛋白-核酸相互作用这个秒级过程的信息，于是我也开头就这局部进展学习。这整个过程并不简洁，由于，我在此前根本没有接触过Linu*系统，编程语言也只学习过最根底的C，R语言也仅仅是自学过一段时间。但是要运行G
8、romacs首先要学会根本的Linu*系统操作，而其中的几个关键步骤更是需要对Python、Perl等语言有根本的理解。因此一开头我就陷入了一个逆境，无论是对Linu*系统的完全把握还是对Python、Perl脚本编程的把握，任何一个都需要花费1个月以上的时间。此时，试验室的其他学长给了我个很好的建议：即学即用。先想好你要做的是什么，然后Google一下，马上依样画葫芦解决问题。可以说，没有这个思想的启发，我无法在这短短一个月时间内高效地学到这么多东西。然而，如同Perl跟Python语言编程这种难度的内容，的确没方法很快把握，我也在需要用到这些内容的地方stuck了2-3天。这时，汉资师兄给
9、了我个很好的建议，假如这些Perl、Python脚本解决的问题并不是那么简单，为什么不用相对简洁的Shell脚本替代它呢?于是，我花了2天左右讨论如何进展Shell脚本编程，后来也在不断使用中练习这种编程方式，最终不仅可以用Shell替代局部的原脚本，也使后来的各种工作的速度显著提升。 然而，当我把握了在Gromacs中跑MD与Umbrella Sampling后，我意识到，它们都只是拿到结果的方式，如何对结果进展分析才是我下一步要解决的问题。与汉资师兄争论后，他告知我，熵并不是计算中值得关注的值，由于它对体系、算法等太敏感，而且较难通过试验直接测得，所以难以印证。但是他仍旧给我指了一条路-A
10、mber的MM-PBSA分析，并鼓舞我不要放弃自己的想法，说不定PhD时还能再试(2333333)。后面我就在折腾Amber的MM-PBSA分析的同时讨论如何搭建自己的体系了。首先我选取的典型chaperone之一的NC具有两个锌指构造域，而力场设定的作用力并缺乏以模拟并稳定自然的锌指状态，因而必需对8个配位键施加restraint。加之restraint的施加在Gromacs与Amber中的方式是不同的，所以我花了几天时间在这上面。另外，由于NC是个小蛋白，PDB中NC-ssDNA复合物的构造是由NMR得到的，这种构造文件常具有多个Model，因此需要另外写脚本予以拆分。克制了这些困难之后，我一方面参考官方网站上的指导与说明以及其他