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1、第三章 病毒的分类与命名病毒分类与命名的意义病毒分类与命名的意义病毒分类是将自然界中存在的病毒种群,按照它们的性质相似性和亲缘关系加以归纳编排,以了解病毒共性与个性的特点.专门研究病毒分类的学科称为病毒分类学.由于新病毒的不断发现,且对已知不断性质的了解还不够全面,所以目前病毒分类学尚处于不成熟阶段.1.进行未知病毒的分类和命名。可利用病毒分科、属、种的关系，对未知病毒与已经描述过的病毒比较研究和鉴定,若发现新病毒,可按国际病毒分类命名委员会(InternationalCommitteeonTaxonomyofViruses,ICTV)的规定,提出新描述的病毒,附有足够的资料,申述理由3.对寻
2、找新的病毒疫苗株很有意义。利用病毒分类和命名的知识，有可能寻找新疫苗株。如Jenner发现牛痘苗能预防人的天花病，4分析和监测病毒病疫情上具有重要意义。例如，流感病毒是一种极易变型的病毒，不掌握和了解它的流行亚型，预防起来就十分困难。5通过病毒的分类命名，对病毒本质的了解也有一定帮助。在病毒的分类研究中，对病毒基因组结构、感染特征、宿主范围及各种生物学特征都可能得到深入的了解。2.有利于病毒研究工作的交流.病毒分类使病毒研究工作的交流能够顺利进行。n n自从自从自从自从1898189818981898年贝杰林克（年贝杰林克（年贝杰林克（年贝杰林克（BeijerinckBeijerinckBei
3、jerinckBeijerinck）首次提出）首次提出）首次提出）首次提出“病病病病毒毒毒毒”的概念以来，已经过去的概念以来，已经过去的概念以来，已经过去的概念以来，已经过去100100100100多年时间。病毒的多年时间。病毒的多年时间。病毒的多年时间。病毒的种类已发展到种类已发展到种类已发展到种类已发展到5450545054505450多种；多种；多种；多种；n n为了使如此多的病毒种类能够得到科学的命名和为了使如此多的病毒种类能够得到科学的命名和为了使如此多的病毒种类能够得到科学的命名和为了使如此多的病毒种类能够得到科学的命名和分类，国际病毒分类委员会分类，国际病毒分类委员会分类，国际病
4、毒分类委员会分类，国际病毒分类委员会(International(International(International(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)已提出和已提出和已提出和已提出和多次修订了病毒的命名和分类原则，并且建立了多次修订了病毒的命名和分类原则，并且建立了多次修订了病毒的命名和分类原则
5、，并且建立了多次修订了病毒的命名和分类原则，并且建立了由由由由目、科（亚科）、属和种目、科（亚科）、属和种目、科（亚科）、属和种目、科（亚科）、属和种分类阶元构成的病毒分类阶元构成的病毒分类阶元构成的病毒分类阶元构成的病毒分类系统；分类系统；分类系统；分类系统；n n目前病毒分类学这一门重要的基础学科已开始走目前病毒分类学这一门重要的基础学科已开始走目前病毒分类学这一门重要的基础学科已开始走目前病毒分类学这一门重要的基础学科已开始走向完善和逐渐成熟起来。向完善和逐渐成熟起来。向完善和逐渐成熟起来。向完善和逐渐成熟起来。n n第一节第一节 病毒的分类与沿革病毒的分类与沿革n n第二节第二节 关于
6、病毒命名的问题关于病毒命名的问题n n第三节第三节 病毒分类的原则病毒分类的原则n n第四节第四节 病毒分类系统病毒分类系统1、病毒的主要类群n n传统上，以传统上，以“原始寄主原始寄主”来将病毒划分为若干来将病毒划分为若干类群。类群。n n“原始寄主原始寄主”指病毒的反应首先引起人类注意指病毒的反应首先引起人类注意的寄主。的寄主。n n目前，从原核生物的细菌、支原体、放线目前，从原核生物的细菌、支原体、放线菌、立克次氏体、蓝藻等；菌、立克次氏体、蓝藻等；n n真核生物的藻类、真菌。真核生物的藻类、真菌。n n脊椎动物乃至人类中都能分离到病毒。脊椎动物乃至人类中都能分离到病毒。n n其中，从细
7、菌、被子植物、节肢动物、脊椎动其中，从细菌、被子植物、节肢动物、脊椎动其中，从细菌、被子植物、节肢动物、脊椎动其中，从细菌、被子植物、节肢动物、脊椎动物和人类中找到的病毒最多；物和人类中找到的病毒最多；物和人类中找到的病毒最多；物和人类中找到的病毒最多；病毒（病毒（VirusVirus）噬菌体（噬菌体（PhagePhage）植物病毒（植物病毒（Plant VirusesPlant Viruses）动物病毒（动物病毒（Animal VirusesAnimal Viruses）噬菌体（噬菌体（bacteriophagebacteriophage）噬蓝绿藻体（噬蓝绿藻体（cyanophagecyan
8、ophage）支原体噬菌体（支原体噬菌体（mycohasmemaphagemycohasmemaphage）植物病毒（植物病毒（plant virusesplant viruses）噬藻体噬藻体(phycophage)(phycophage)真菌噬菌体或真菌病毒真菌噬菌体或真菌病毒(mycophage)(mycophage)原生动物病毒原生动物病毒(protozoal viruses)(protozoal viruses)无脊椎动物病毒无脊椎动物病毒(inverteble viruses)(inverteble viruses)脊椎动物病毒脊椎动物病毒(verteble viruses)(ve
9、rteble viruses)医学病毒医学病毒(medicine viruses)(medicine viruses)兽医病毒兽医病毒(eterinary viruses)(eterinary viruses)昆虫病毒（昆虫病毒（insect virusesinsect viruses）1、原核生物病毒n n几乎所有的细菌均找到与相应的噬菌体；几乎所有的细菌均找到与相应的噬菌体；n n噬菌体具有寄主专一性；噬菌体具有寄主专一性；n n科、属、种甚至不同菌株的噬菌体不能相科、属、种甚至不同菌株的噬菌体不能相互感染。互感染。2、真核生物病毒植物病毒植物病毒n n高等植物普通存在病毒，且绝大多数属于
10、高等植物普通存在病毒，且绝大多数属于RNARNA病毒，但花椰菜花叶病毒和双链病毒病毒，但花椰菜花叶病毒和双链病毒组则属于组则属于DNADNA病毒。病毒。n n珊瑚轮藻病毒是第一个发现的具有感染性珊瑚轮藻病毒是第一个发现的具有感染性的真核藻类病毒；的真核藻类病毒；动物病毒动物病毒n n无脊椎动物中，昆虫的病毒病最多。无脊椎动物中，昆虫的病毒病最多。n n脊椎动物中，鱼类病毒至少有脊椎动物中，鱼类病毒至少有3535种（如草鱼种（如草鱼出血病）。出血病）。n n鸟类、禽类、哺乳动物、人类等鸟类、禽类、哺乳动物、人类等2、病毒分类的沿革n n1961196119611961年以前：各自研究领域的科学家
11、提出或建立年以前：各自研究领域的科学家提出或建立年以前：各自研究领域的科学家提出或建立年以前：各自研究领域的科学家提出或建立一些分类系统，但进展缓慢，且缺乏国际间的协一些分类系统，但进展缓慢，且缺乏国际间的协一些分类系统，但进展缓慢，且缺乏国际间的协一些分类系统，但进展缓慢，且缺乏国际间的协作；作；作；作；n nHolmes(1944)Holmes(1944)Holmes(1944)Holmes(1944)的拉丁双名分类法的拉丁双名分类法的拉丁双名分类法的拉丁双名分类法n n病毒目（病毒目（病毒目（病毒目（ViraleViraleViraleVirale）：三个亚目：细菌病毒亚目）：三个亚目：
12、细菌病毒亚目）：三个亚目：细菌病毒亚目）：三个亚目：细菌病毒亚目（PhagineaePhagineaePhagineaePhagineae）、植物病毒亚目（）、植物病毒亚目（）、植物病毒亚目（）、植物病毒亚目（PhytophagineaePhytophagineaePhytophagineaePhytophagineae）及动）及动）及动）及动物病毒亚目（物病毒亚目（物病毒亚目（物病毒亚目（ZoophagineaeZoophagineaeZoophagineaeZoophagineae）n n1962196219621962年年年年-1966-1966-1966-1966年：建立起国际病毒命名
13、委员会年：建立起国际病毒命名委员会年：建立起国际病毒命名委员会年：建立起国际病毒命名委员会（International Committee on Nomenclature of International Committee on Nomenclature of International Committee on Nomenclature of International Committee on Nomenclature of Viruses,ICNVViruses,ICNVViruses,ICNVViruses,ICNV）n n1966-19701966-19701966-1970196
14、6-1970年：年：年：年：WildyWildyWildyWildy任国际病毒命名委员会主席期任国际病毒命名委员会主席期任国际病毒命名委员会主席期任国际病毒命名委员会主席期间，组织国际间的协作，发表了间，组织国际间的协作，发表了间，组织国际间的协作，发表了间，组织国际间的协作，发表了ICNVICNVICNVICNV的第一次报的第一次报的第一次报的第一次报告。告。告。告。n n病毒的分类与命名中，描述并划定了病毒的分类与命名中，描述并划定了病毒的分类与命名中，描述并划定了病毒的分类与命名中，描述并划定了43434343个属（群）个属（群）个属（群）个属（群）及其成员，其中动物病毒分成及其成员，其
15、中动物病毒分成及其成员，其中动物病毒分成及其成员，其中动物病毒分成22222222个属，植物病毒个属，植物病毒个属，植物病毒个属，植物病毒分为分为分为分为15151515个组（群），细菌病毒分成个组（群），细菌病毒分成个组（群），细菌病毒分成个组（群），细菌病毒分成6 6 6 6个群个群个群个群1971-1999年：n n19731973年年5 5月，改名为国际病毒分类委员会月，改名为国际病毒分类委员会（International Commuttee on Taxonomy of International Commuttee on Taxonomy of Viruses,ICTVViruse
16、s,ICTV）.n n此后，病毒分类以多次修改充实。此后，病毒分类以多次修改充实。19991999，由，由PringlePringle执笔公布国际病毒分类委员会执笔公布国际病毒分类委员会第七次报告的检索表，设立第七次报告的检索表，设立3 3个病毒目，个病毒目，6464病毒科，病毒科，9 9个病毒亚科，个病毒亚科，233233个病毒属。个病毒属。n n2000年，ICTV第七次国际病毒分类报告中植物病毒分类进展较大n n共列出15科，73属n n2005年，ICTV第八次国际病毒分类报告中新增了9个科、2个亚科、56个属，约400个病毒种第二节第二节 关于病毒命名的问题关于病毒命名的问题n n俗
17、名：以寄主俗名加上症状特点组合起来俗名：以寄主俗名加上症状特点组合起来的命名方式。的命名方式。n n烟草花叶病毒（首先在烟草上发现，引起烟草花叶病毒（首先在烟草上发现，引起烟草叶子出现深浅不一绿色花斑）烟草叶子出现深浅不一绿色花斑）n nTobaccomosaicvirus，TMV一、传统的病毒命名方法二、病毒命名的现状早期病毒命名方式，没有一个统一的系统 地名（新城）症状（脊髓灰质炎）形态（弹状、轮状）人命（Rous）字母及数字（T4，R17）n n病毒的宿主多样性，同一病毒可在不同的病毒的宿主多样性，同一病毒可在不同的宿主中寄生并致病。宿主中寄生并致病。二、病毒分类和命名的规则二、病毒分类
18、和命名的规则（一）一般规则（一）一般规则（一）一般规则（一）一般规则（1 1 1 1）病毒分类和命名应该是国际性的，并且普遍适）病毒分类和命名应该是国际性的，并且普遍适）病毒分类和命名应该是国际性的，并且普遍适）病毒分类和命名应该是国际性的，并且普遍适用于所有的病毒。用于所有的病毒。用于所有的病毒。用于所有的病毒。（2 2 2 2）国际病毒分类系统采用目（）国际病毒分类系统采用目（）国际病毒分类系统采用目（）国际病毒分类系统采用目（orderorderorderorder）、科）、科）、科）、科(family)(family)(family)(family)、亚科亚科亚科亚科(subfamil
19、y)(subfamily)(subfamily)(subfamily)、属、属、属、属(genus)(genus)(genus)(genus)、种、种、种、种(species)(species)(species)(species)、分类阶元。、分类阶元。、分类阶元。、分类阶元。（3 3 3 3）ICTVICTVICTVICTV不不不不负责病毒种以下的分类和命名，病毒种负责病毒种以下的分类和命名，病毒种负责病毒种以下的分类和命名，病毒种负责病毒种以下的分类和命名，病毒种以下的血清型、基因型、毒力株、变异株和分离株以下的血清型、基因型、毒力株、变异株和分离株以下的血清型、基因型、毒力株、变异株和分
20、离株以下的血清型、基因型、毒力株、变异株和分离株的名称由公认的的名称由公认的的名称由公认的的名称由公认的国际专家小组确定国际专家小组确定国际专家小组确定国际专家小组确定。（4 4 4 4）人工产生的病毒和实验室构建的杂种病毒在病）人工产生的病毒和实验室构建的杂种病毒在病）人工产生的病毒和实验室构建的杂种病毒在病）人工产生的病毒和实验室构建的杂种病毒在病毒分类上不予考虑，它们的分类由公认的毒分类上不予考虑，它们的分类由公认的毒分类上不予考虑，它们的分类由公认的毒分类上不予考虑，它们的分类由公认的国际专家国际专家国际专家国际专家小组负责小组负责小组负责小组负责。（5 5）分类阶元只有在病毒）分类阶
21、元只有在病毒代表种代表种的特性得到的特性得到了充分了解和在公开出版物上进行过描述，了充分了解和在公开出版物上进行过描述，以致于明确了它们的分类地位，并使其分以致于明确了它们的分类地位，并使其分类阶元与其他类似的分类阶元相区别时，类阶元与其他类似的分类阶元相区别时，才能确定下来。才能确定下来。（6 6）当病毒有明确的科、而分属未确定时，）当病毒有明确的科、而分属未确定时，这一病毒种在分类学上称为该科的未确定这一病毒种在分类学上称为该科的未确定种（种（unassigned speciesunassigned species）。）。（7 7）与规则）与规则2 2各分类阶元相关联，并得到各分类阶元相关
22、联，并得到ICTVICTV批准的名称是唯一可以接受的。批准的名称是唯一可以接受的。（二）目的规则（二）目的规则n n目是一群具有某些共同特征的科。目是一群具有某些共同特征的科。n n目名的词尾是目名的词尾是目名的词尾是目名的词尾是“virales”“virales”“virales”“virales”。（三）科的规则（三）科的规则 科是一群具有某些共同特征的属（无论这科是一群具有某些共同特征的属（无论这些属是否构成亚科）。些属是否构成亚科）。n n科名的词尾是科名的词尾是科名的词尾是科名的词尾是“viride”“viride”“viride”“viride”。（四）亚科的规则（四）亚科的规则n
23、 n亚科是一群具有某些共同特性的种。这一分类亚科是一群具有某些共同特性的种。这一分类亚科是一群具有某些共同特性的种。这一分类亚科是一群具有某些共同特性的种。这一分类阶元只在需要解决复杂分类阶元问题时使用。阶元只在需要解决复杂分类阶元问题时使用。阶元只在需要解决复杂分类阶元问题时使用。阶元只在需要解决复杂分类阶元问题时使用。n n亚科名的词尾是亚科名的词尾是亚科名的词尾是亚科名的词尾是“virinae”“virinae”“virinae”“virinae”。（五）属的规则（五）属的规则n n属是一群具有某些共同特性的种。属是一群具有某些共同特性的种。n n属名的词尾是属名的词尾是属名的词尾是属名
24、的词尾是“virus”“virus”“virus”“virus”。n n一个承认的新属必须有一个同时被承认代表种一个承认的新属必须有一个同时被承认代表种一个承认的新属必须有一个同时被承认代表种一个承认的新属必须有一个同时被承认代表种(type species)(type species)(type species)(type species)。（六）种的规则（六）种的规则n n病毒种是指构成一个复制谱系病毒种是指构成一个复制谱系(replicating(replicating lineage)lineage)，占据一个特定小生境（，占据一个特定小生境（ecological ecological
25、 nicheniche），具有多原则分类），具有多原则分类(polythetic class)(polythetic class)特特性的病毒。性的病毒。n n种名由少数几个有实际意义的词组成，但种名由少数几个有实际意义的词组成，但不应该只是由宿主名加不应该只是由宿主名加“virus”“virus”构成。构成。n n种名必须赋予种恰如其分的鉴别特征。种名必须赋予种恰如其分的鉴别特征。n n数字、字母或其组合已经广泛用作种的形容词，数字、字母或其组合已经广泛用作种的形容词，数字、字母或其组合已经广泛用作种的形容词，数字、字母或其组合已经广泛用作种的形容词，然而新指定的编号、字母或其组合不再单独作
26、为然而新指定的编号、字母或其组合不再单独作为然而新指定的编号、字母或其组合不再单独作为然而新指定的编号、字母或其组合不再单独作为种的形容词。现存的数字或字母名称仍可以继续种的形容词。现存的数字或字母名称仍可以继续种的形容词。现存的数字或字母名称仍可以继续种的形容词。现存的数字或字母名称仍可以继续保留。保留。保留。保留。n n当当当当ICTVICTVICTVICTV下属委员会不能肯定某一个新种的分类地下属委员会不能肯定某一个新种的分类地下属委员会不能肯定某一个新种的分类地下属委员会不能肯定某一个新种的分类地位，或不能将这一新种确定在已设定的属中时，位，或不能将这一新种确定在已设定的属中时，位，或
27、不能将这一新种确定在已设定的属中时，位，或不能将这一新种确定在已设定的属中时，新种会作为暂定种新种会作为暂定种新种会作为暂定种新种会作为暂定种(tentative species)(tentative species)(tentative species)(tentative species)n n列在适当的属或科中，按一般分类而言，暂定种的名列在适当的属或科中，按一般分类而言，暂定种的名列在适当的属或科中，按一般分类而言，暂定种的名列在适当的属或科中，按一般分类而言，暂定种的名称不应该与已批准的名称重复，选择不相似或不相近称不应该与已批准的名称重复，选择不相似或不相近称不应该与已批准的名称重
28、复，选择不相似或不相近称不应该与已批准的名称重复，选择不相似或不相近于现在和不久前一直使用的名称。于现在和不久前一直使用的名称。于现在和不久前一直使用的名称。于现在和不久前一直使用的名称。（七）亚病毒感染因子的规则（七）亚病毒感染因子的规则n n有关病毒分类的规则也适用于类病毒有关病毒分类的规则也适用于类病毒（viroidsviroids）分类。）分类。n n类病毒种的词尾是类病毒种的词尾是类病毒种的词尾是类病毒种的词尾是“viroid”“viroid”“viroid”“viroid”，属的词尾为，属的词尾为，属的词尾为，属的词尾为“-“-“-“-viroid”viroid”viroid”vi
29、roid”，亚科的词尾是，亚科的词尾是，亚科的词尾是，亚科的词尾是“-viroinae”“-viroinae”“-viroinae”“-viroinae”（只用于（只用于（只用于（只用于需要这一分类阶元时），科的词尾是需要这一分类阶元时），科的词尾是需要这一分类阶元时），科的词尾是需要这一分类阶元时），科的词尾是“-“-“-“-viroidae”viroidae”viroidae”viroidae”。n n逆转座子（逆转座子（逆转座子（逆转座子（retrotransposonsretrotransposonsretrotransposonsretrotransposons）在分类和命名中）在分
30、类和命名中）在分类和命名中）在分类和命名中被考虑作为病毒。被考虑作为病毒。被考虑作为病毒。被考虑作为病毒。n n卫星卫星卫星卫星RNARNARNARNA和朊病毒不是按病毒分类，而是采用和朊病毒不是按病毒分类，而是采用和朊病毒不是按病毒分类，而是采用和朊病毒不是按病毒分类，而是采用任意分类（任意分类（任意分类（任意分类（arbitrary classificationarbitrary classificationarbitrary classificationarbitrary classification）。）。）。）。（八）书写规则（八）书写规则n n在正式使用场合，病毒目、科、亚科、属的
31、接受在正式使用场合，病毒目、科、亚科、属的接受在正式使用场合，病毒目、科、亚科、属的接受在正式使用场合，病毒目、科、亚科、属的接受名（名（名（名（accepted nameaccepted nameaccepted nameaccepted name）一律用斜体打印，名称的第）一律用斜体打印，名称的第）一律用斜体打印，名称的第）一律用斜体打印，名称的第一个字母要大写。一个字母要大写。一个字母要大写。一个字母要大写。n n种名用斜体打印，第一个词的首字母要大写，除种名用斜体打印，第一个词的首字母要大写，除种名用斜体打印，第一个词的首字母要大写，除种名用斜体打印，第一个词的首字母要大写，除了是专有
32、名词（了是专有名词（了是专有名词（了是专有名词（proper nounproper nounproper nounproper noun）外，其他词首字母）外，其他词首字母）外，其他词首字母）外，其他词首字母一律大写。一律大写。一律大写。一律大写。n n在正式使用场合，分类阶元名称应放在分类阶元在正式使用场合，分类阶元名称应放在分类阶元在正式使用场合，分类阶元名称应放在分类阶元在正式使用场合，分类阶元名称应放在分类阶元术语前。术语前。术语前。术语前。n n如，各分类单元正式的描述是如，各分类单元正式的描述是如，各分类单元正式的描述是如，各分类单元正式的描述是 n nReovirideae(Re
33、ovirideae(Reovirideae(Reovirideae(科科科科)，Phytoreovirus(Phytoreovirus(Phytoreovirus(Phytoreovirus(属属属属),wound tumor),wound tumor),wound tumor),wound tumor virusvirusvirusvirus（种）等。（种）等。（种）等。（种）等。双链DNA病毒FamilyFamilySubfamilySubfamily 淋巴滤泡病毒属淋巴滤泡病毒属 LymphocryptovirusLymphocryptovirus人疱疹病毒人疱疹病毒4 4型型 Huma
34、n herpesvirus 4 Human herpesvirus 4疱疹病毒科疱疹病毒科 HerpesviridaeHerpesviridae丙型疱疹病毒亚科丙型疱疹病毒亚科 GammaberpesvirinaeGammaberpesvirinae第三节第三节 病毒分类的原则病毒分类的原则1、病毒分类原理及其依据原理：原理：强调其分类和命名的稳定性、实用性、强调其分类和命名的稳定性、实用性、认可性和灵活性。认可性和灵活性。n n稳定性稳定性稳定性稳定性是指病毒名称及其隶属关系一旦确定下是指病毒名称及其隶属关系一旦确定下是指病毒名称及其隶属关系一旦确定下是指病毒名称及其隶属关系一旦确定下来，就
35、应该尽可能的保留。来，就应该尽可能的保留。来，就应该尽可能的保留。来，就应该尽可能的保留。n n实用性实用性实用性实用性是指病毒分类体制应该对病毒学研究领是指病毒分类体制应该对病毒学研究领是指病毒分类体制应该对病毒学研究领是指病毒分类体制应该对病毒学研究领域是有用的。域是有用的。域是有用的。域是有用的。n n认可性认可性认可性认可性是指病毒分类阶元和名称应该为病毒学是指病毒分类阶元和名称应该为病毒学是指病毒分类阶元和名称应该为病毒学是指病毒分类阶元和名称应该为病毒学研究者乐意接受和使用。研究者乐意接受和使用。研究者乐意接受和使用。研究者乐意接受和使用。n n灵活性灵活性灵活性灵活性是指病毒分类
36、阶元可以依据某些新发现是指病毒分类阶元可以依据某些新发现是指病毒分类阶元可以依据某些新发现是指病毒分类阶元可以依据某些新发现而进行重新修订和再确定。而进行重新修订和再确定。而进行重新修订和再确定。而进行重新修订和再确定。二、分类的类型 系统分类 实用分类三、分类的目的 病毒的进化 病毒的亲缘关系 鉴定未知病毒 病毒性疾病的防治病毒分类的八条原则n n主要以病毒粒子特性、抗原性质和病毒生物学特主要以病毒粒子特性、抗原性质和病毒生物学特主要以病毒粒子特性、抗原性质和病毒生物学特主要以病毒粒子特性、抗原性质和病毒生物学特性等作为依据。性等作为依据。性等作为依据。性等作为依据。病毒核酸和基因组特性病毒
37、核酸和基因组特性n n病毒核酸类型：病毒核酸类型：病毒核酸类型：病毒核酸类型：DNADNADNADNA或或或或RNARNARNARNA，单链或双链，线，单链或双链，线，单链或双链，线，单链或双链，线性或环状，正负链；性或环状，正负链；性或环状，正负链；性或环状，正负链；n nG+CG+CG+CG+C所占的比例、核苷酸序列等；所占的比例、核苷酸序列等；所占的比例、核苷酸序列等；所占的比例、核苷酸序列等；n n基因组大小、相对分子量等。基因组大小、相对分子量等。基因组大小、相对分子量等。基因组大小、相对分子量等。病毒的形状和大小病毒的形状和大小n n病毒形态：如大小、形状、包膜和包膜病毒形态：如大
38、小、形状、包膜和包膜突起的有无，衣壳结构及其对称性；突起的有无，衣壳结构及其对称性；n n病毒体的形状是杆状、球状、二十面体、病毒体的形状是杆状、球状、二十面体、子弹状、砖形，还是蝌蚪状等到；病毒子弹状、砖形，还是蝌蚪状等到；病毒体的长度和宽度、病毒体的直径。病毒体的长度和宽度、病毒体的直径。病毒颗粒的形态结构特征颗粒的形态结构特征 壳体的对称形：壳体的对称形：立体对称、螺旋对称或复合对称；立体对称、螺旋对称或复合对称；有无囊膜；有无囊膜；二十面体壳体的壳粒数目和直径、螺旋壳二十面体壳体的壳粒数目和直径、螺旋壳体的直径。体的直径。n n 病毒脂类含量和特性（对乙醚、氯仿等病毒脂类含量和特性（对
39、乙醚、氯仿等脂溶剂的敏感性）脂溶剂的敏感性）n n病毒的细胞培养特性病毒的细胞培养特性包括：对细胞和宿主的特异性；包括：对细胞和宿主的特异性；包括：对细胞和宿主的特异性；包括：对细胞和宿主的特异性；n n病毒在感染细胞内的复制过程；病毒在感染细胞内的复制过程；病毒在感染细胞内的复制过程；病毒在感染细胞内的复制过程；n n合成和装配部位；合成和装配部位；合成和装配部位；合成和装配部位；n n在核内、细胞质内或细胞表面成熟的情况；在核内、细胞质内或细胞表面成熟的情况；在核内、细胞质内或细胞表面成熟的情况；在核内、细胞质内或细胞表面成熟的情况；n n细胞内包涵体的形成和细胞病理变化。细胞内包涵体的形
40、成和细胞病理变化。细胞内包涵体的形成和细胞病理变化。细胞内包涵体的形成和细胞病理变化。n n 对其它物理和化学因子的敏感性：对其它物理和化学因子的敏感性：n n包括对酸的稳定性、对热的稳定性和加入两包括对酸的稳定性、对热的稳定性和加入两价阳离子后的稳定性。价阳离子后的稳定性。n n 病毒抗原性质病毒抗原性质n n包括病毒血清学性质包括病毒血清学性质包括病毒血清学性质包括病毒血清学性质n n抗原的关系。抗原的关系。抗原的关系。抗原的关系。流行病学特点流行病学特点包括：包括：包括：包括：n n病毒天然的宿主范围病毒天然的宿主范围病毒天然的宿主范围病毒天然的宿主范围n n病毒在自然状态下的传播与媒介
41、体的关系；病毒在自然状态下的传播与媒介体的关系；病毒在自然状态下的传播与媒介体的关系；病毒在自然状态下的传播与媒介体的关系；n n病毒的地理分布，致病机理，组织嗜亲性；病毒的地理分布，致病机理，组织嗜亲性；病毒的地理分布，致病机理，组织嗜亲性；病毒的地理分布，致病机理，组织嗜亲性；n n病毒引起的病理和组织病理学特点。病毒引起的病理和组织病理学特点。病毒引起的病理和组织病理学特点。病毒引起的病理和组织病理学特点。第四节第四节 病毒分类系统病毒分类系统Pringle分类根据核酸类型分为八大类：根据核酸类型分为八大类：根据核酸类型分为八大类：根据核酸类型分为八大类：n nDNADNADNADNA病
42、毒病毒病毒病毒n n单股单股单股单股DNADNADNADNA病毒病毒病毒病毒n n双股双股双股双股DNADNADNADNA病毒病毒病毒病毒n nDNADNADNADNA和和和和RNARNARNARNA逆转录病毒逆转录病毒逆转录病毒逆转录病毒n nRNARNARNARNA病毒病毒病毒病毒n n双股双股双股双股RNARNARNARNA病毒病毒病毒病毒n n正链、单股正链、单股正链、单股正链、单股RNARNARNARNA病毒病毒病毒病毒n n负链、单股负链、单股负链、单股负链、单股RNARNARNARNA病毒病毒病毒病毒n n裸露裸露裸露裸露RNARNARNARNA病毒病毒病毒病毒n n亚病毒亚病毒
43、亚病毒亚病毒n n三个病毒目三个病毒目n n有尾噬菌体病毒目有尾噬菌体病毒目有尾噬菌体病毒目有尾噬菌体病毒目n n单分子负链单分子负链单分子负链单分子负链RNARNARNARNA病毒目病毒目病毒目病毒目n n成套病毒目成套病毒目成套病毒目成套病毒目n n共共6464个病毒科、个病毒科、9 9个病毒亚科、个病毒亚科、233233个病毒属，个病毒属，其中其中2929个病毒属为独立的病毒属。个病毒属为独立的病毒属。n n亚病毒因子类群不设科和属，包括亚病毒因子类群不设科和属，包括:n n类病毒类病毒类病毒类病毒n n卫星病毒卫星病毒卫星病毒卫星病毒n nPrionPrionPrionPrionn n
44、一些属性不很明确的属或暂定病毒属用引一些属性不很明确的属或暂定病毒属用引号和后缀号和后缀“-like viruses”“-like viruses”表示，如表示，如“Norwailk-like viruses”“Norwailk-like viruses”类病毒类病毒n无衣壳蛋白、分子质量较低、能在寄主植物中自我复制的无衣壳蛋白、分子质量较低、能在寄主植物中自我复制的环状单链环状单链RNA分子分子nRNA本身无本身无mRNA活性，活性，不编码蛋白质，无抗原性不编码蛋白质，无抗原性n其复制完全依赖于寄主的转录酶系统其复制完全依赖于寄主的转录酶系统RNARNA的直接转录，不涉及的直接转录，不涉及D
45、NA，最终产物为，最终产物为环状类病毒（环状类病毒（+）RNA分子。分子。TL和和TR代表左末端和右末端，代表左末端和右末端，P、C、V分别代表致病区、分别代表致病区、中央保守区和可变区。中央保守区和可变区。CCR是中央反向重复序列，是中央反向重复序列，TCR是末是末端反向重复序列。端反向重复序列。对称滚环模式对称滚环模式鳄梨日斑类病毒等鳄梨日斑类病毒等（+）链为模板）链为模板多个单位长度的（多个单位长度的（-）链复制中间体）链复制中间体转录转录切割切割单位长度的线状（单位长度的线状（-）链分子）链分子自环化自环化单位长度的环状（单位长度的环状（-）链分子）链分子转录转录多个单位长度的（多个单
46、位长度的（+）链复制中间体）链复制中间体切割、环化切割、环化成熟的类病毒分子成熟的类病毒分子不对称滚环模式不对称滚环模式马铃薯纺锤形块茎类病毒等马铃薯纺锤形块茎类病毒等（+）链为模板）链为模板转录转录多个单位长度的（多个单位长度的（-）链复制中间体）链复制中间体转录转录多个单位长度的（多个单位长度的（+）链复制中间体）链复制中间体切割、环化切割、环化成熟的类病毒分子成熟的类病毒分子n机械接种传播机械接种传播n种子或花粉传播种子或花粉传播n蚜虫传播：番茄雄性株类病毒蚜虫传播：番茄雄性株类病毒n类病毒分为类病毒分为2个科个科7个属，另有个属，另有6种未分类病毒种未分类病毒l马铃薯纺锤形块茎类病毒科
47、马铃薯纺锤形块茎类病毒科Pospiviroidae马铃薯纺锤形块茎类病毒属马铃薯纺锤形块茎类病毒属-Pospiviroid啤酒花矮化类病毒属啤酒花矮化类病毒属Hostuviroid椰子死亡类病毒属椰子死亡类病毒属Cocadviroid苹果锈果类病毒属苹果锈果类病毒属Apscaviroid锦紫苏类病毒属锦紫苏类病毒属Coleviroidl鳄梨日斑类病毒科鳄梨日斑类病毒科鳄梨日斑类病毒属鳄梨日斑类病毒属Avsunviroid桃潜隐花叶类病毒属桃潜隐花叶类病毒属Pelamoviroidl六种未分类病毒六种未分类病毒乌饭树花叶类病毒乌饭树花叶类病毒Blueberrymosaicviroid-likeR
48、NABluMVd-RNA牛旁矮化类病毒牛旁矮化类病毒BurdockstuntviroidBuSVd茄潜隐类病毒茄潜隐类病毒EggplantlatentviroidELVd心叶烟矮化类病毒心叶烟矮化类病毒NicotianaglutinosastuntviroidNGSVd木豆花叶斑驳类病毒木豆花叶斑驳类病毒PigeonpeamosaicmottleviroidPPMMoVd番茄束顶类病毒番茄束顶类病毒TomatobunchytopviroidToBTVd 卫星病毒卫星病毒卫星病毒卫星病毒卫卫星星病病毒毒是是依依赖赖于于与与其其共共同同侵侵染染寄寄主主细细胞胞的的辅辅助助病病毒毒进进行行繁繁殖殖的
49、的核核酸酸分子，其核酸序列与辅助病毒基因组没有明显的同源性。分子，其核酸序列与辅助病毒基因组没有明显的同源性。卫卫星星的的核核酸酸分分子子若若含含有有编编码码外外壳壳蛋蛋白白的的遗遗传传信信息息，并并能能包包裹裹成成形形态态学学和血清学与辅助病毒不同的颗粒，称为卫星病毒；和血清学与辅助病毒不同的颗粒，称为卫星病毒；若若本本身身没没有有编编码码外外壳壳蛋蛋白白的的遗遗传传信信息息而而是是被被包包裹裹于于辅辅助助病病毒毒编编码码的的外外壳蛋白中，称为卫星核酸。壳蛋白中，称为卫星核酸。另另一一种种说说法法是是：卫卫星星体体是是一一类类仅仅由由核核酸酸分分子子组组成成的的亚亚病病毒毒因因子子，在在辅辅
50、助助病病毒毒存存在在下下能能共共感感染染宿宿主主细细胞胞，并并进进行行混混合合复复制制，卫卫星星体体获获得得衣衣壳壳的的结构基因后称为卫星病毒。结构基因后称为卫星病毒。卫星与辅助病毒和寄主之间有着专化性关系，表现为对病毒病症状的高卫星与辅助病毒和寄主之间有着专化性关系，表现为对病毒病症状的高度特异性调节。度特异性调节。一些卫星如葡萄扇叶病毒卫星一些卫星如葡萄扇叶病毒卫星RNA、芜菁皱缩病毒卫星、芜菁皱缩病毒卫星RNA、花生丛、花生丛簇病毒卫星簇病毒卫星RNA等能加重其辅助病毒在寄主上引起的症状。等能加重其辅助病毒在寄主上引起的症状。另一些卫星则能减轻寄主的发病症状，如烟草环斑病毒卫星另一些卫星