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1、第七章细菌的分类命第七章细菌的分类命名名本讲稿第一页，共十七页微生物分类鉴定目的 分类是人类认识微生物，进而利用和分类是人类认识微生物，进而利用和改造微生物的一种手段，微生物工作者只改造微生物的一种手段，微生物工作者只有在掌握了分类学知识的基础上，才能对有在掌握了分类学知识的基础上，才能对纷繁的微生物类群有一清晰的轮廊，了解纷繁的微生物类群有一清晰的轮廊，了解其亲缘关系与演化关系，为人类开发利用其亲缘关系与演化关系，为人类开发利用微生物资源提供依据微生物资源提供依据本讲稿第二页，共十七页第一节 微 生 物 分 类 学微生物分类学微生物分类学(Taxonomy)(Taxonomy)是一门按微生物
2、类群的亲缘关是一门按微生物类群的亲缘关是一门按微生物类群的亲缘关是一门按微生物类群的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群（TaxonTaxonTaxonTaxon）的科学）的科学 分类学的任务分类学的任务分类学的任务分类学的任务 分类（分类（分类（分类（ClassificationClassification）：是指根据相似性或亲缘）：是指根据相似性或亲缘关系，将一个有机体放在一个单元中关系，将一个有机体放在一个单元中 命名（命名（命名（命名（Nom
3、enclatureNomenclature）：是按照国际命名法规给予有）：是按照国际命名法规给予有）：是按照国际命名法规给予有）：是按照国际命名法规给予有机体一个科学的名称机体一个科学的名称机体一个科学的名称机体一个科学的名称 鉴定（鉴定（鉴定（鉴定（IdentificationIdentificationIdentificationIdentification）：是指确定一个新分离物是）：是指确定一个新分离物是否归属于某个已命名的分类单元的过程。否归属于某个已命名的分类单元的过程。本讲稿第三页，共十七页一、微生物的分类单位n n界（界（界（界（Kingdom）门门（Phylum or Div
4、ision）纲（ClassClass）目（目（目（目（OrderOrder）科（科（FamilyFamily）属（属（属（属（GenusGenus）种（种（种（种（Species）n n 种是最基本的分类单位。种是最基本的分类单位。种是最基本的分类单位。种是最基本的分类单位。但分类单元之间科加入亚门、但分类单元之间科加入亚门、但分类单元之间科加入亚门、但分类单元之间科加入亚门、亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以下又可分为亚亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以下又可分为亚亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以下又可分为亚亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以下又可分为亚种、变种、型、菌株等种、变种
5、、型、菌株等种、变种、型、菌株等种、变种、型、菌株等 本讲稿第四页，共十七页微生物种与亚种的概念n n种种种种(Species)(Species)(Species)(Species)凡是于典型培养菌紧密相同的其他培养凡是于典型培养菌紧密相同的其他培养凡是于典型培养菌紧密相同的其他培养凡是于典型培养菌紧密相同的其他培养菌同统一起来，区分为细菌的一个种（菌同统一起来，区分为细菌的一个种（菌同统一起来，区分为细菌的一个种（菌同统一起来，区分为细菌的一个种（SpeciesSpecies），即），即是以某个是以某个“典型菌株典型菌株”为代表、十分类似的菌株的总为代表、十分类似的菌株的总称。称。19871
6、98719871987年，国际细菌分类委员会颁布，年，国际细菌分类委员会颁布，年，国际细菌分类委员会颁布，年，国际细菌分类委员会颁布，DNADNA同源同源 70%70%，而且其，而且其T T T Tm m55o oC C的菌群为一个种的菌群为一个种的菌群为一个种的菌群为一个种 n n亚种（亚种（亚种（亚种（Subspecies)Subspecies)在种内，有些菌株在遗传学上关在种内，有些菌株在遗传学上关系密切，而且在表型上仅存在较小的某些差异，在种系密切，而且在表型上仅存在较小的某些差异，在种内分成内分成2 2 2 2个或个或2 2 2 2个以上的分类单位，即为亚种个以上的分类单位，即为亚种
7、个以上的分类单位，即为亚种个以上的分类单位，即为亚种本讲稿第五页，共十七页微生物亚种以下的变型分类亚种以下亚种以下 生物变型生物变型生物变型生物变型表示特殊的生化或生理特征表示特殊的生化或生理特征 血清变型血清变型血清变型血清变型表示抗原结构不同表示抗原结构不同 致病变型致病变型表示某些寄主的专一致病性表示某些寄主的专一致病性 噬菌变型噬菌变型表示对噬菌体的特异性反应表示对噬菌体的特异性反应 形态变型形态变型形态变型形态变型表示特殊的形态特征表示特殊的形态特征 本讲稿第六页，共十七页微 生 物 的 菌 株n n菌株菌株(Strain)或称品系或称品系或称品系或称品系 是指同种微生物不同来源是指
8、同种微生物不同来源的的纯培养物即培养物即单个分离物的个分离物的纯培养后代，常以数字、培养后代，常以数字、字母、人命或地名等表示字母、人命或地名等表示 n n分离物是指已分离得到但分离物是指已分离得到但为经鉴定的定的纯培养物的后代培养物的后代即即为分离物分离物 n n群群(Group)为为工作方便而将近似的种或介于种工作方便而将近似的种或介于种工作方便而将近似的种或介于种工作方便而将近似的种或介于种间间的的的的菌株按其形菌株按其形菌株按其形菌株按其形态态或或或或结结合生理生化、生合生理生化、生合生理生化、生合生理生化、生态态特征特征特征特征归为归为若干若干若干若干类类群。群。群。群。如放如放如放
9、如放线线菌中的菌中的菌中的菌中的链链霉菌属内的种霉菌属内的种霉菌属内的种霉菌属内的种归为归为1 1本讲稿第七页，共十七页二、微 生 物 的 命 名n n微生物的命名按国微生物的命名按国际命名法命名，即命名法命名，即Linna所所创立的立的“双名法双名法”每一种微生物都用属与种命名，由每一种微生物都用属与种命名，由2 2个拉个拉丁丁词或希腊或希腊词或拉丁化了的其他文字或拉丁化了的其他文字组成。属名和种成。属名和种名用斜体表达名用斜体表达 属名在前，用拉丁名属名在前，用拉丁名词表示微生物的表示微生物的构造、形构造、形态、某科学家名字等，描述微生物的主要特、某科学家名字等，描述微生物的主要特征。第一
10、字母大写征。第一字母大写 种名在后，第一字母小写。用拉种名在后，第一字母小写。用拉丁形容丁形容词表示，描述微生物的色素、形状、来源、病表示，描述微生物的色素、形状、来源、病名、地名、某科学家的名字等等名、地名、某科学家的名字等等 在种名后，附上在种名后，附上命名者的姓和命名年份命名者的姓和命名年份本讲稿第八页，共十七页第二节 原核微生物分类系统n n一、原核微生物伯杰氏分一、原核微生物伯杰氏分类类系系统统 伯杰氏伯杰氏细菌菌鉴定手册定手册 伯杰氏系伯杰氏系统细菌学手册菌学手册本讲稿第九页，共十七页细 菌 分 类 系 统n n最有代表性和最有影响的最有代表性和最有影响的细菌分菌分类系系统 伯杰氏
11、伯杰氏细菌菌鉴定手册定手册（Bergeys Manual of DeterminativeBacteriology)1923年年,1925年年,1930年年,1934年年,1939年年,1948年年,1957年年,1974年分年分别出版了第一至出版了第一至第八版，第八版，1994年出了第九版年出了第九版 以形以形态、生理、生理生化、生化、G+C mol%、生、生态分布等特征分布等特征为主主本讲稿第十页，共十七页微生物的分类技术水平n n微生物分微生物分类中使用的技中使用的技术水平水平 n n 细胞形胞形态水平水平 n n 细胞胞组分水平分水平 n n 蛋白蛋白质水平水平 n n 基因基因组水平
12、水平 本讲稿第十一页，共十七页伯杰氏系统细菌学手册n nBergeys Manual of Systematic Bacteriology)second edition 2001 以以生理生化、生理生化、G+C mol%、系、系统发育地位等育地位等为主主体体现了了现代分子生物学的研究成代分子生物学的研究成果果 尚未出尚未出齐本讲稿第十二页，共十七页细菌的分类细菌的分类一、细菌在生物中分类地位一、细菌在生物中分类地位目前公认目前公认“四界分类系统四界分类系统”动物界动物界 植物界植物界 原核生物：细菌、放线菌、螺旋体、原核生物：细菌、放线菌、螺旋体、生物生物 原生生物界原生生物界 霉形体、立克次
13、氏体、衣原体霉形体、立克次氏体、衣原体 真核生物：真菌、藻类、原虫真核生物：真菌、藻类、原虫 病毒界：病毒病毒界：病毒本讲稿第十三页，共十七页二、细菌分类的特征二、细菌分类的特征1 1形形态态学学特特性性：形形状状、大大小小，排排列列、结结构构、染染色色特特性性，有有无细胞壁无细胞壁2 2培养特性：培养基上的表现，菌落特征培养特性：培养基上的表现，菌落特征3 3生活方式：自主生活，共生，寄生生活方式：自主生活，共生，寄生4 4生生理理生生化化特特征征：化化学学组组成成，营营养养类类型型，营营养养需需要要，繁繁殖殖方式，生长条件，代谢途径，代谢产物。方式，生长条件，代谢途径，代谢产物。5 5抗原
14、构造：抗原构造：O O、K K、H H6 6对噬菌体的敏感性对噬菌体的敏感性7 7对抗生素及其他化学物质的敏感性对抗生素及其他化学物质的敏感性8 8病原性病原性本讲稿第十四页，共十七页9 9遗传学特征遗传学特征转转化化和和转转导导试试验验。与与细细菌菌之之间间亲亲缘缘关关系系密密切切相相关关，发生在亲缘关系相近的细菌种类发生在亲缘关系相近的细菌种类G+C%G+C%。G+CG+C含含量量对对一一个个种种一一般般是是恒恒定定的的，但但G+CG+C相相同同并并不一定是同一种。不一定是同一种。DNA-DNADNA-DNA杂合试验。将待检菌的杂合试验。将待检菌的DNADNA变性，其双链解为单变性，其双链
15、解为单链，而后与标记的参考菌株单链链，而后与标记的参考菌株单链DNADNA或或rRNArRNA杂交，形成杂交杂交，形成杂交DNA-DNADNA-DNA或或DNA-rRNADNA-rRNA，两种细菌，两种细菌DNADNA中共同的核苷酸序列愈中共同的核苷酸序列愈多，杂交互补区间愈多，二者同源性愈高，亲缘关系就愈多，杂交互补区间愈多，二者同源性愈高，亲缘关系就愈近。近。本讲稿第十五页，共十七页第三节第三节 细菌的命名细菌的命名采用林奈氏双名法：采用林奈氏双名法：1 1将将一一个个细细菌菌定定一一个个学学名名，用用属属名名和和种种名名表表示示，属属名名在在前前，用用拉拉丁丁文文或或拉拉丁丁化化的的名名
16、词词表表示示，且且第第一一个个字字母母要要大大写写，种种名名在在后后，用用拉拉丁丁文文或或拉拉丁丁化化的的形形容容词词或或名名词词所所有有格格表表示示，第第一一个个字字母母小小写写。中文译名与此相反，种名在前，属名在后。中文译名与此相反，种名在前，属名在后。2 2在种名之后附以命名人的姓氏及命名年代。在种名之后附以命名人的姓氏及命名年代。本讲稿第十六页，共十七页3 3 3 3转属：一种生物原为某人定为某属，后来又被旁转属：一种生物原为某人定为某属，后来又被旁人改为别属，这时将原命名人的姓氏置于括弧之内人改为别属，这时将原命名人的姓氏置于括弧之内放在学名之后，再在括弧之后，附以改定人的姓氏放在学名之后，再在括弧之后，附以改定人的姓氏和年代。和年代。Salmonella choleraesuis (Smith)Weldin,1927 (Smith)Weldin,1927沙氏菌沙氏菌 猪霍乱猪霍乱 （猪）（猪）(原命名人原命名人原命名人原命名人)()(新命名人新命名人)年代年代（属名）（属名）（属名）（属名）（种名）（种名）（种名）（种名）翻译：猪霍乱沙门氏菌。翻译：猪霍乱沙门氏菌。本讲稿第十七页，共十七页