化学手册网络数据库Beil.ppt

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1、Crossfire Beilstein/Gmelin 化学手册网络数据库化学手册网络数据库 姚丹丹2005内容提要内容提要背景资料背景资料客户端软件安装客户端软件安装CrossFire Beilstein/Gmelin 基本检索基本检索背景资料背景资料Leopold Gmelin17881853Germanchemist1822discovererofpotassiumferricyanide18171819wrotetheHandbuchderChemiefirstedition,4thed.1843-1855)1848-1850translatedintoEnglishfortheCave

2、ndishSocietybyH.Watts.背景资料背景资料Friedrich Beilstein1838-1906Russianchemist1881FirstEditionofBeilsteinsHandbookofOrganicChemistry(1,500compounds,2,200pages)1988BeilsteindatabaseonlineatSTN1993FirstreleaseoftheCrossFiresoftwarefortheBeilsteindatabase1994TheBeilsteinDatabaseavailableunderCrossFireasin-ho

3、useversionwithca.6,000,000organiccompounds(ca.7,5min1999)背景背景 资料资料Crossfire Beilstein/Gmelin 由Beilstein和Gmelin两个数据库组成。分别由德国BeilsteinInstitute和GmelinInstitute进行。前者收集有机化合物的资料,后者收集有机金属与无机化合物的资料。是传统贝尔斯坦有机化学手册(BeilsteinHandbuchderOrganischeChemie)及盖墨林无机与有机金属化学手册(GmelinHandbookofInorganicandOrganometallic

4、Chemistry)的电子化。背景资料背景资料Crossfire Beilstein/Gmelin TheworldslargestelectronicscollectionoforganicreactionsandchemicalfactsTheonlycomprehensive,electronicallysearchablesourceofstructures,properties, Beilstein/Gmelin物质信息:物质信息:化合物化学性质化合物物理性质化合物化合物结构信息化合物生物活性信息化合物参考文献信息反应信息:反应信息:化学反应信息制备物质的详细资料反应途径引用文献信息

5、:引用文献信息:参考文献根据1980年-的重要有机化学文献索引整理的摘要900万种化合物万种化合物50万个万个/年增年增1000万个有机化学反应万个有机化学反应200万篇参考文献万篇参考文献80万篇摘要万篇摘要背景资料背景资料Crossfire Beilstein/Gmelin 175 Journals 1771 年年 背景资料背景资料Crossfire Beilstein/Gmelin化学结构数据化学结构数据化学反应(制备)化学反应(制备)物理性质物理性质化学性质化学性质参考文献参考文献200万种无机和有机万种无机和有机金属化合物金属化合物14000种玻璃和陶瓷种玻璃和陶瓷3200种矿物种矿

6、物55000种合金种合金110万篇文献万篇文献15万篇摘要万篇摘要160万个反应万个反应地质学地质学/矿物学矿物学/冶金学信息资源冶金学信息资源材料科学材料科学/电子学电子学/催化学信息资源催化学信息资源背景资料背景资料Crossfire Beilstein/Gmelin 62 Journals 1772 年年 背景资料背景资料Elsevier-MDL背景资料背景资料创腾科技有限公司创腾科技有限公司 MDL MDL CrossfireCrossfire中国地区总代理中国地区总代理面向国内材料面向国内材料/生生命科学领域用户提命科学领域用户提供分子模拟、化学供分子模拟、化学/生物生物/材料信息学

7、、材料信息学、高性能计算全面解高性能计算全面解决方案的专业计算决方案的专业计算机公司机公司提供提供CrossfireCrossfire的的技术咨询技术咨询内容提要内容提要背景资料背景资料客户端软件安装客户端软件安装CrossFire Beilstein/Gmelin 基本检索方法基本检索方法客户端程序安装客户端程序安装网络检索CrossFire Beilstein/Gmelin 需要安装客户端程序CrossFireCrossFire新版本客户端具有更清晰的使用界面和页面新版本客户端具有更清晰的使用界面和页面HELP提示提示客户端软件安装客户端软件安装步骤(适用中科院用户)步骤(适用中科院用户)

8、升级程序的下载地址为:进入地址后,将Crossfire.rar下载并解压缩后,双InstallShell.exe,按提示安装,建议使用默认配置。CrossFire需要卸载客户端软件安装客户端软件安装安装信息安装信息(适用中科院用户)(适用中科院用户)提示输入TCP/IP地址cfd-提示输入license group namelib-cas*提示输入Host Namedemo-提示输入Port80提示输入PathLitLink/servlet/LitLink提示输入登陆帐号lib-c000*提示输入登陆密码:umt78c*权限控制方式为外部权限控制方式为外部IP+内部私有内部私有IP+口令口令以

9、中科院文献情报中心为例:以中科院文献情报中心为例:客户端软件安装客户端软件安装安装信息安装信息MDL ISIS Draw是是Crossfire平台上的特定产品,在这个平台上使用起来平台上的特定产品,在这个平台上使用起来有时会比有时会比ISIS Draw方便,但不能脱离此平台使用。方便,但不能脱离此平台使用。安装中需要选择画图软件安装中需要选择画图软件是使用最广泛的一种,除了在是使用最广泛的一种,除了在Crossfire,还可,还可以在以在MDL公司的其他各种产品中使用。公司的其他各种产品中使用。MDL DrawISIS Draw的换代产品,操作起来更简单,相对于的换代产品,操作起来更简单,相对

10、于ISIS Draw有很多改进,会逐渐取代有很多改进,会逐渐取代ISIS Draw,目前对于非,目前对于非MDL用户不是免费的。用户不是免费的。MDL Crossfire Structure Editor内容提要内容提要背景资料背景资料客户端软件安装客户端软件安装CrossFire Beilstein/Gmelin 基本检索方法基本检索方法 CrossFire Beilstein检索检索 CrossFire界面结构界面结构数据表格检索结构检索关键词检索CrossFire Beilstein检索检索 CrossFire Commander 7.0 界面结构界面结构5个功能按钮Query递交检索提

11、问/条件Results显示检索结果Reports生成结果报告(word、Excel、html)Alerts跟踪服务/发送最新资料Autonom根据结构式对化合物进行标准命名CrossFire Beilstein检索检索 CrossFire的界面结构的界面结构QueryHistory提问记录SelectDatabase选择数据库OpenQuery打开保存的检索提问DrawStructure绘制化学结构SaveQuery保存检索提问ModifyAlert修改跟踪检索信息PrintQuery打印检索提问CreateAlert创建跟踪检索服务ClearQuery清除检索提问StartSearch提交检

12、索提问菜单与功能快捷键CrossFire Beilstein检索检索选择数据库选择数据库选择数据库CrossFire Beilstein检索检索选择化学结构画图工具选择化学结构画图工具确认选用的画图工具与安装的画图工具一致CrossFire Beilstein检索检索关键词检索关键词检索在“SearchAllText”中输入关键词Truncate:截词选择例:检索例:检索PVC的相关物质信息的相关物质信息CrossFire Beilstein检索检索关键词检索关键词检索兰色的“Bar”提示关键词出现的频次选择检索内容:SubstancesReactionsCitationsCrossFire

13、Beilstein检索检索关键词检索关键词检索View检索结果命中记录Hits的数量CrossFire Beilstein检索检索关键词检索关键词检索双击某个Hit,浏览详细内容红色标志显示有生物活性的化合物CrossFire Beilstein检索检索关键词检索关键词检索可访问的数据内容可访问的数据数量链接相关数据内容点击快捷键show显示化合物结构窗口CrossFire Beilstein检索检索数据和事实的超链接数据和事实的超链接链接Reaction详细数据CrossFire Beilstein检索检索访问参考文献访问参考文献超链接获取参考文献记录超链接获取MDL-LitLink文献提供

14、服务CrossFire Beilstein检索检索访问参考文献访问参考文献超链接参考文献详细内容部分参考文献提供经过整理的摘要CrossFire Beilstein检索检索访问参考文献访问参考文献超链接获取MDL-LitLink文献提供服务注册服务CrossFire Beilstein检索检索结果显示方式结果显示方式选取检索结果记录的显示方式CrossFire Beilstein检索检索结果显示方式结果显示方式利用快捷键选取显示的数据内容“HitOnly”只显示与检索条件匹配的数据直接查询相关记录,不用重新提问CrossFire Beilstein检索检索相关记录检索相关记录检索CrossFi

15、re Beilstein检索检索检索历史检索历史显示特定日期的检索内容选取并复制检索内容到“Query”CrossFire Beilstein检索检索保存保存/打开提问式打开提问式点击“SaveQuery”保存提问式点击“OpenQuey”单击文件名预览保存提问式点击“OpenQuey”双击文件名copy检索提问CrossFire Beilstein检索检索提问集提问集“Querties”显示“Today”“Yesterdays”,“Previous”的检索提问“Queries”直接“Copy”检索提问CrossFire Beilstein检索检索数据表格检索数据表格检索数据表格索引区包括6种

16、索引查询内容填充区CrossFire Beilstein数据结构数据结构http:/ Beilstein检索检索数据表格检索数据表格检索单击数据索引名称浏览索引详细内容选择数据域名称CrossFire Beilstein检索检索数据表格检索数据表格检索点击“Selectforsearch”,查询内容自动添入“SearchField”对索引内容的描述与检索样例可以locate索引内容在“tree”中的位置CrossFire Beilstein检索检索数据表格检索数据表格检索输入查询数据的名称点击“Find”双击显示的数据域名称,该名称自动填充到数据表格检索区CrossFire Beilstein

17、检索检索数据表格检索数据表格检索例:检索化合物的相关例:检索化合物的相关信息信息输入数据域,填充检索内容“List”提供相应内容的选择与自动填充,如果相应内容,则检索无结果CrossFire Beilstein检索检索数据表格检索数据表格检索“List”提供相应内容的选择、自动填充和预检。CrossFire Beilstein检索检索数据表格检索数据表格检索检索结果显示CrossFire Beilstein检索检索数据表格检索数据表格检索输入查询词点击“Find”,在“Tree”中以背景颜色显示结果双击查询结果,数据域名自动进入“FieldName”“Enlarge”可以独立显示数据检索表格例

18、:查询在例:查询在760毫米汞柱下沸点毫米汞柱下沸点80%CrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索 命中21ReactionsCrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索结构和数据的联合检索检索对氯苯甲酰氯检索对氯苯甲酰氯的合成方法及的合成方法及NMR数据数据CrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索结构和数据联合检索结果CrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索选择“substanceasProductonly”CrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索超链接化合物的合成反应反应数据Cross

19、Fire Beilstein检索检索联合检索联合检索超链接反应物的信息超链接反应物的合成反应CrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索CrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索超链接反应物的信息CrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索超链接至起始反应物CrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索选择“ShowHitsetHistory”查看历史记录CrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索历史记录了反应的反合成路线CrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索对氯苯甲酰氯的NMR

20、数据以高亮背景显示CrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索输入化合物关键词选择需要检索的内容可以限定选项的具体数值例例:查询:查询PE的的“MeltingPoint”,”Density”信息信息关键词和数据的联合检索CrossFire Beilstein检索检索联合检索联合检索选择“ViewHit”,检索结果只显示符合查询条件的数据内容符合查询条件的内容以背景颜色显示CrossFire Beilstein检索检索检索结果导出检索结果导出选择以不同的格式导出全部检索记录CrossFire Beilstein检索检索检索结果导出检索结果导出选择“CompoundIDtoExc

21、ellasTable”的导出格式CrossFire Beilstein检索检索检索结果导出检索结果导出在Report中打开导出的检索结果CrossFire Beilstein检索检索检索结果报告生成检索结果报告生成选中检索记录内容用“CopytoReport”,以不同格式导出CrossFire Beilstein检索检索检索结果报告生成检索结果报告生成在Report中打开部分导出的检索记录CrossFire Beilstein检索检索定制跟踪服务定制跟踪服务建立检索条件后点击“CrearAlert”CrossFire Beilstein检索检索定制跟踪服务定制跟踪服务填写电子邮件地址等信息Cr

22、ossFire Beilstein检索检索结构式的自动标准命名结构式的自动标准命名点击“AutoNom”给出化学结构在“Option”中选择命名时参考的环系点击“GenerateName”,产生自动结构命名CrossFire Gmelin 检索检索 选择数据库选择数据库选择数据库CrossFire Gmelin 检索检索 数据域数据域数据域SearchFieldCrossFire Gmelin 检索检索 数据域数据域 Gmelin 检索检索预定义表格预定义表格预定义的检索表格PredefinedSearchFormCrossFire Gmelin 检索检索在SearchFieldName中查询

23、合金的数据域名称例例1:查询:查询Cr的重量百分比在的重量百分比在15-31%的镍铬合金数据,检索结果含的镍铬合金数据,检索结果含有热膨胀的相关数据有热膨胀的相关数据CrossFire Gmelin 检索检索在SearchFieldName中查询热膨胀数据域名称CrossFire Gmelin 检索检索以“HitOnly”显示与检索条件匹配的数据CrossFire Gmelin 检索检索Drawstructure利用结构进行反应检索例例2:查询:查询Cp2ZrCl2(茂金属催化剂)茂金属催化剂)的合成信息及催化作用信息、相关文的合成信息及催化作用信息、相关文献献(结构已知)(结构已知)Cros

24、sFire Gmelin 检索检索检索结果CrossFire Gmelin 检索检索ReactionDetails化合物(Products)信息的超链接Ref提供数据依据与更详细的反应描述CrossFire Gmelin 检索检索催化信息的超链接CrossFire Gmelin 检索检索催化信息参考文献的超链接早期文献仅提供文献源的相关信息近期文献提供经过重新整理的摘要CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索联合检索同时选择Beilstein/Gmelin数据库CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索联合检索 选择数据库选择数据库仅提供共有数据域的检索同

25、时选择Beilstein/GmelinCrossFire Beilstein/Gmelin联合检索联合检索 选择数据库选择数据库共同的数据域CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索联合检索选择2个数据库同时进行“PVC”关键词关键词检索后显示该词在不同数据库出现的频次CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索联合检索在各数据库中“Substances”检索的命中数量CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索联合检索各数据库中命中结果的显示CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索联合检索Beilstein的数据内容CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索联合检索Gmelin的数据内容 BrochureCrossFire Beilstein/Gmelin检索检索使用帮助使用帮助CrossFire Beilstein/Gmelin检索检索使用帮助使用帮助 EductionalCrossFire Beilstein/Gmelin检索检索使用帮助使用帮助 HelpCrossFire Beilstein/Gmelin检索检索使用帮助使用帮助 F1-页面帮助页面帮助

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