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1、原核表达步骤原核表达先要将基因克隆到原核表达载体上,然后通过转化到JM109 或BL21 等菌株中,诱导表达蛋白,然后进行蛋白纯化。本实验方案的前提是,目的基因已克隆到载体,并已转进入JM109 菌株中。一鉴定目的蛋白是否在大肠杆菌JM109 或 BL21 中大量表达(一) 制样1 . 挑取经过双酶切鉴定的单克隆菌落于700ul LB 培养基,加入0.7ul Amp(100mg/mL) ,37oC200r/min 摇床培养,过夜活化。2. 以 1:50比例(200ul) ,将活化的过夜培养物加入10mL LB 液体培养基中,加入 10uLAmp(100mg/ml) ,37oC200r/min
2、摇床扩大培养 2h-3h,期间取样监控菌液的 OD 值,控制菌液 OD600 在 0.6-1.0 之间,以使大肠杆菌处于最适合表达外源蛋白的生长状态。 (一般 3h时,菌液浓度及达到标准, 但是不同的基因对菌的影响不同,所以第一次实验时需要确定这个最佳时间) 3. 从 10ml 扩大培养物中取 3ml 菌液作为不加 IPTG 的空白对照( CK) ,其余7ml 菌液加入 7ul IPTG(储存浓度为 0.5mol/l) ,使 IPTG 终浓度达到 0.5mmol/l。以 200r/min 的转速, 37oC 摇床培养 3h。4. 以 5000r/min 离心 2min 收集菌体,倾倒上清,每个
3、离心管收集3ml 培养物。5. 加入 1ml dH2O, 将管底沉淀用振荡器打散以充分洗涤, 8000r/min离心 2min,倾倒上清。6. 重复步骤 5。将离心管中的水倒干净。(二)菌落 SDS-PAGE 1. 在收集的菌体中加入200ul 1SDS PAGE loading buffer(可根据沉淀的量增加或减少 loading buffer 的量,一般 200ul 比较合适 )。用漩涡器剧烈震荡,确保将管底沉淀震散。2. 将样品于 100恒温加热器上开盖加热10min (Marker 也要加热)。样品凉后,12000r/min离心 3min,取每管的上清点样。上样量一般30ul40ul
4、,marker 20ul。(三) SDS-PAGE分析1. 根据目的片段的大小,制作不同浓度的分离胶蛋白分子量(kDa) 凝胶浓度(%) 4-40 20 12-45 15 10-70 12 15-100 10 25-200 8 名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 1 页,共 6 页 - - - - - - - - - 分离胶(两块)配方15% 12% 8% ddH2O 3.4ml 4.9ml 6.9ml 30% Acr-Bis (29:1) 7.5ml 6.0ml 4.0
5、ml 1.5M Tris-HCl ( pH8.8)3.8ml 3.8ml 3.8ml 10%SDS 150ul 150ul 150ul 10%过硫酸铵150ul 150ul 150ul TEMED 20ul 20ul 20ul 总体积15ml 15ml 15ml 按表中所列顺序从上到下加试剂,加完TEMED后,轻轻摇匀液体, 一块胶加7ml溶液。加完后,用1mLddH2O 封住分离胶液面,在室温(37)凝结 30min,至分离胶与水之间出现一条清亮的分界线,倾倒水层,用滤纸条将残余的水吸干。2. 制作浓缩胶浓缩胶(两块)配方5% ddH2O 3.4 mL 30% Acr-Bis (29:1)
6、0.85 mL 1M Tris-HCl ( pH6.8)0.63 mL 10%SDS 50 uL 10%过硫酸铵50 uL TEMED 20 uL 总体积5ml 胶配好后混匀, 灌胶 2ml,插梳子时根据点样量和浓缩胶长短调整梳子插入的深度,于室温 (37 )凝胶 30min。3. 胶凝好后, 拔梳子,将胶放入电泳槽中, 加入 1 Tris-Gly 电泳缓冲液没过点样孔,胶外侧缓冲液界面应完全没过电极4. Marker 点 5uL,用 10uL 小枪点样,以防样品冲出点样孔与旁边样品混杂。电压打到 70V,保证电流在 20mA-30mA 之间,当样品跑入浓缩胶时可适当调高电压,但不宜多次调整电
7、压,否则条带会跑歪。5. 当溴酚蓝电泳至胶槽底部时, 一般需要 2.5h ,停止电泳,剥胶,将浓缩胶部分切除后,加入考马斯亮蓝染色液,40r/min 染色 3h,可以过夜染色。6. 用移液器回收考马斯亮蓝染色液,再用蒸馏水将浮色冲洗干净后,倒入考马斯亮蓝脱色液, 40r/min 脱色至胶背景透明,期间可每2h 更换一次脱色夜。根据菌落 SDS-PAGE的结果,可以看到目的蛋白是否大量表达。二鉴定目的蛋白形成的是包涵体还是可溶性蛋白1. 从冻存的菌液中取10ul,接种于 5ml 的 LB 培养基中, 加入 5ul Amp(100 mg/ml), 过夜活化菌株。2. 按照 1:50 的比例,从活化
8、的菌株中,取1ml 菌液接种于 50ml LB 培养名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 2 页,共 6 页 - - - - - - - - - 基中,加入 50ul Amp(100 mg/ml),扩大培养 3 h。3. 扩大培养后的菌液 , 取出 10ml,不加 IPTG ,作为空白对照。剩余的40ml菌液中加入 40ul IPTG(0.5mol/l), 诱导蛋白表达。 两者在 37 ,200rpm的条件下培养 3h。4. 用 50ml 离心管收集菌体, 8000rpm,
9、离心 3min。注意配平。5. 倒掉上清, 加入 40ml 左右的 dH2O 洗菌体一遍, 12000 rpm,离心 2min。注意要将菌体充分打散。6. 倒掉上清,用枪头将上清吸干净。根据菌体的浓度,加入适量的PBS buffer 悬浮菌体。7. 用大功率的超声波将菌体破碎,其间超声波每工作2min,停止 1min。菌体要始终保持在冰水混合物上,以保证低温,蛋白不易变性。如此反复 6-10 遍,直至菌液清澈。8. 12000rpm, 离心 3min,分离上清和沉淀。9. 在沉淀中加入 250ul 1 SDS Loading buffer , 取 200ul 上清,加入 50 ul 5 SDS
10、 Loading buffer,在恒温加热器上100 加热 10min。10. 加热后的样品冷却到室温后,12000rpm,离心 2min。11. 取上清 40ul 点样,按照一中的方法进行SDS-PAGE 检测。点样顺序是:对照的上清,沉淀,样品的上清,沉淀。12. 根据 SDS-PAGE结果,判断目的蛋白是以包涵体还是以可溶性蛋白的形式产生。如果蛋白在沉淀中大量表达,则形成包涵体,需要改变诱导表达条件,比如将扩大培养与诱导培养的温度改为25 ,并延长相应培养时间。如果蛋白在上清中表达,则形成可溶性蛋白,可继续进行下一步实验。三纯化目的蛋白(整个过程要尽量保持在4 进行)1. 大量诱导目的蛋
11、白(一般需要2-4 L 的菌量),用超声波破碎细胞,收集上清。2. GST纯化柱的柱床保存在20%的乙醇中,使用之前,先用吸管将柱床轻轻加入到柱子中,打开柱子,流出乙醇,使柱床沉积下来。3. 加入 10ml PBS buffer, 洗柱床 3 遍,使得柱床重新平衡。4. 将准备好的样品加入到柱子中,每次加入 5-10ml 样品,使样品结合在柱子上( 每次上样量不能太多,因为柱子的结合能力有限) 。5. 用 PBS buffer洗柱子 3 遍,每次用 10ml,去除柱子中非特异性结合的杂蛋白。6. 加入 5ml 洗脱液( 10m mol/l 的还原型谷胱甘肽,用50mmol/l tris-buf
12、ferr或者 PBS buffer 溶解)将目的蛋白洗脱出来。用 1.5ml 离心管收集流出来的样品,每管接0.5ml 样,一共收集6-8 管( 一般情况,第一管流出的是 PBS ,第二和第三管大部分是目的蛋白,所以OD值很大,第三至第六管的 OD值慢慢降低。不要偷懒一次接太多,不然会影响后续收集蛋白。还原型谷胱甘肽很容易被氧化,如果一次没有用完,请用保鲜膜封口置于 4 度冰箱保存,超过2 天的话请更换新的洗脱液。) 7. 用 PBS buffer洗柱子 1 遍。8. 用分光光度计测每一管的OD 值,记录下读数,将读数大于200 的样品留下(一般是第 2 至第 4 管) ,冻于 -20 冰箱中
13、。名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 3 页,共 6 页 - - - - - - - - - 9. 重复步骤 4-8,直至所有样品均纯化完毕。10. 可以用 SDS-PAGE检测纯化出来的样品浓度以及纯度。重生柱子的方法 : (柱子使用三四次之后,需要重生,即让柱子上的GST结合基团重新暴露出来)1用还原型谷胱甘肽洗脱液洗柱子3 遍,每次加入 10ml。2. 用 PBS缓冲液洗柱子 4 遍,每次加入 10ml。3. 用 50 mmol Tris HCl(pH 8.0)洗柱
14、子 3 遍,每次加入 10ml。4用 0.5M NaCl(pH 8.0)洗柱子 3 遍,每次加入 10ml。5. 用 100 mM 醋酸钠( pH 4.5)洗柱子 3 遍,每次加入 10ml。6. 用 0.5M NaCL 洗柱子 3 遍,每次加入 10ml。柱子长时间不用,需要按照以下方式清洗及保存:1. 按照重生的 1-6 步骤先将柱子重生一遍。2. PBS洗柱子 2 遍,每次加入 10ml。3. 将柱床用吸管吸出,分别用5%,10%,15%,20%的乙醇洗 2 遍。4. 用单蒸水轻轻冲洗柱子底部的膜,洗出杂蛋白。5. 柱床保存在含 20%乙醇的 PA 瓶中。柱子和柱床置于4 度冰箱保存。如
15、果柱子用于纯化不同的蛋白,只需要按照重生方法的1, 2 步骤操作即可,然后直接纯化另外一个蛋白。如果柱子流速很慢,可能是柱子底部的膜被杂蛋白堵住了。柱子重生之后,将柱床用吸管吸出,然后用单蒸水将柱子底部的膜轻轻冲洗,再将柱床加入到柱子中,重新上样。如果柱子需要重生,请用完柱子的同学自觉完成这份工作,以免影响下一位同学的使用。四根据不同的用途浓缩蛋白1. 若蛋白用于制作抗体如果洗脱液用的是tris-bufferr 配制的,需要用 1/4 的 PBS buffer 进行透析,然后在冷冻干燥机中冻干浓缩,因为公司最终需要将目的蛋白溶于 PBS buffer中。如果洗脱液是用PBS buffer 配制
16、的,则直接在冷冻干燥机中冻干浓缩。GST 纯化柱手册上建议的是用tris-bufferr 配制洗脱液,但用PBS buffer 配制的洗脱液可以将目的蛋白洗脱下来。可自己选用。2. 若蛋白用于活性检测由于蛋白在 tris-bufferr 和 PBS buffer 中,均能保持活性, 所以不论用哪种,都不需要透析,直接浓缩干燥即可。名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 4 页,共 6 页 - - - - - - - - - 大肠杆菌 IPTG 诱导原核表达(2011-04-1
17、2 20:16:14)转载标签:杂谈分类:生物医药行业小量表达1 取单克隆菌落小养过夜2 大养 50ml,至 OD600 达 0.4-0.63 取 1ml 培养液, 13000rpm,1min 离心收集, 30ul 水溶,加入30ul 2SDS loading buffer , 20 保存4 加入 IPTG 至 1mM ,每隔 2hr 重复步骤 35 配置相应的SDSPAGE 胶6 将样在沸水中煮5min,上样 10ul,60V 跑浓缩胶, 120V 跑分离胶。7 取胶,考马斯亮蓝染色30min,脱色液脱色过夜大量表达1 前三步相同2 加入 IPTG 至 1mM,培养 6hr3 4, 8000
18、rpm,离心 10min,去上清4 用 10ml 1PBS 重悬沉淀,加入溶菌酶10mg,25, 30min5 加入蛋白酶抑制剂PMSF 至终浓度为1mM6 冰上超生破碎,200W,30S 超声, 30S间隔, 30 个循环7 加入 TritonX 100,至终浓度为1,室温混合30min 以提高融合蛋白的可浓性8 4, 12000rpm,离心 10min,分别取上清,沉淀9 上清,沉淀同时跑电泳,观察蛋白是在上清还是沉淀中包涵体中蛋白的纯化1 将离心收集的菌体用包涵体蛋白纯化缓冲液洗涤一次2 用 1/50 菌液的上述缓冲液悬浮菌体,按每1ml 加入 1mg 溶菌酶,于25水浴 30min3
19、加入 PMSF 至 1mM ,800W 超生破碎菌10min4 剪切菌体 DNA5 5000rpm , 4, 10min 离心,去上清6 25ml 上述缓冲液洗涤沉淀3 次7 用上述缓冲液悬浮至终浓度为0.5mg/ml8 悬浮蛋白溶液装入透析袋,于50倍体积透析液I 中透析, 4, 10hr9 换 100 倍体积透析液II 进行透析, 4,10hr10换 100 倍体积透析液III 进行透析, 4, 10hr11换 100 倍体积透析液IV 进行透析, 4, 10hr12吸出透析后的蛋白,稍离心除去丝状不溶物,分光光度计测蛋白浓度名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - -
20、 - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 5 页,共 6 页 - - - - - - - - - His6 标记蛋白过NTA 柱纯化1 将 Ni NTA 填料从 4取出,与乙醇混匀,装上柱子2 以 10 倍柱体积的H2O 过柱,洗去乙醇3 以 50ml binging buffer过柱4 蛋白溶液于4, 12000rpm 离心 10min,取上清,用bingding buffer 稀释至 5 倍5 蛋白稀释液过柱,可适当降低过柱速率,使蛋白与柱充分结合6 以 50ml washing buffer 过柱7 以 20ml elution buffer 过柱,用 Eppendorf 管接过柱溶液,每管测A280 值,与未过柱前所测A280 值比较8 每管进行 SDS-PAGE 鉴定蛋白丰度名师资料总结 - - -精品资料欢迎下载 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 名师精心整理 - - - - - - - 第 6 页,共 6 页 - - - - - - - - -