DNA提取各种缓冲液的配制.doc

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1、植物总DNA的提取一、所需仪器设备及消耗品剪刀、塑料袋(封口)、冰箱、棕色广口瓶(1000、500、200、100、50ml)、量筒(1000、500、100、10ml)、烧杯(1000、500、200、100ml)、pH试纸、电子天平、高压灭菌锅、研钵、液氮罐(液氮)、水浴锅、离心机、移液器(1套)、枪头(1ml、200ml、20l)、枪头盒、离心管(1.5ml)(包括盒和架)、一次性手套、电泳仪、电泳槽、塑料胶带(宽)、微波炉、凝胶成像系统、垃圾桶、冰盒(自制)、记号笔、单面刀片二、所需化学药品及试剂CTAB、NaCl、EDTA-Na22H2O、Tris、冰乙酸、硼酸、-巯基乙醇、NaAc

2、、氯仿(三氯甲烷)、异戊醇、无水乙醇、溴酚蓝、琼脂糖、蔗糖、溴化乙锭(EB)、RNase、NaOH、HCl(浓)、ddH2O三、各种缓冲液的配制(一)2%CTAB提取缓冲液(300ml)(高压灭菌)4mol/L的NaCl 35ml3=105ml1mol/L的Tris-HCl 10ml3=30ml0.5mol/L的EDTA 4ml3=12mlCTAB 2g3=6g(二)1TE(母液pH8.0)(50ml)(高压灭菌)1mol/L的Tris-HCl(pH8.0) 500l0.5mol/L的EDTA(pH8.0) 100l最后加ddH2O定容到 50ml工作液为0.1TE(45ml灭菌的ddH2O中

3、,加入5ml已灭菌的1TE)(三)4mol/L的NaCl(150ml)(高压灭菌) 35.055g的NaCl,加ddH2O120ml溶解,再加水定容到150ml(四)1mol/L的NaCl(400l)(用于配制RNase储存液) 取4mol/L的NaCl(已灭菌)100l,加300l灭菌的ddH2O。(五)3mol/L的NaAc溶液(pH5.2)(50ml)(高压灭菌)NaAc3H2O 20.405g加ddH2O 30ml用冰乙酸调节pH至 5.2加ddH2O定容到 50ml(六)RNase储存液(10mg/ml)(1ml)1mol/L的Tris-HCl(pH7.5) 10l1mol/L的Na

4、Cl 15lRNase 10mg沸水浴1520min(七)EB储存液(1mg/ml)EB 30mgddH2O 30ml磁力搅拌至完全溶解,装入棕色瓶,铝箔包裹,保存于室温。制胶时EB终浓度为0.5g/ml(30ml加15l、40ml加20l)(八)10TBE缓冲液(电泳缓冲液)(高压灭菌)Tris碱 54g硼酸 27.5g0.5mol/L的EDTA(pH8.0) 20ml以上溶于400ml的ddH2O中,在定容到500ml工作液为1TBE或0.5TBE(九)6上样缓冲液(4保存)0.25%的溴酚蓝(2.5mg/1ml 40%(w/v)的蔗糖水溶液)40%(w/v)蔗糖水溶液(2g/5ml的dd

5、H2O,加热溶解,注:温度不能太高)(十)1mol/L的HCl溶液(不用灭菌) 8.62 ml的浓盐酸,加灭菌ddH2O 91.38ml,混匀,室温保存(100ml)。(十一)5mol/L的NaOH溶液(50ml,10g的NaOH溶于50ml灭菌的ddH2O中)(不用灭菌)200g的NaOH,溶于灭菌的ddH2O中,定容至1000ml(十二)1mol/L的Tris-HCl(pH8.0)(100ml)(高压灭菌) 12.11g的Tris碱 80ml的ddH2O加浓盐酸调节pH值至8.0(大约加4.2ml)(十三)0.5mol/L的EDTA(pH8.0)(50ml)(高压灭菌) 9.305g的ED

6、TA-Na22H2O1g的NaOH 磁力搅拌器剧烈搅拌40ml的ddH2O最后加水定容到50ml,用NaOH调节pH值至8.0DNA定量用紫外分光光度计法,1 OD26050g/ml双链DNA。PCR(聚合酶链反应)一、所需仪器设备及消耗品冰箱(4、20)、高压灭菌锅、离心机、移液器(1套)、枪头、枪头盒、PCR管(包括盒和架)、PCR仪、离心管(包括盒和架)、一次性手套、电泳仪、电泳槽、塑料胶带(宽)、微波炉、凝胶成像系统、垃圾桶、冰盒(自制)、记号笔、单面刀片二、所需化学药品及试剂质粒(阳性对照)、引物(1、2)、4dNTP、DNA模板、buffer(MgCl2)、TaqDNA聚合酶、dd

7、H2O、琼脂糖、DNA标准样品(DNA ladder)、溴化乙锭(EB)、5TBE电泳缓冲液(Tris、硼酸、EDTA)三、PCR反应体系与反应程序仅供参考成分母液浓度各成分加入量(l/20l)各成分终浓度或含量无离子水9.7缓冲液(buffer)1021MgCl225mmol/L1.21.5 mmol/L4dNTP2mmol/L20.2 mmol/L引物5pmol/L20.5pmol/LTaqDNA聚合酶5U/l0.63U模板DNA20ng/l2.550ng操作顺序: 水、4dNTP混合 buffer、taqDNA聚合酶混合,、混合 加入引物 混匀、分装PCR管 向每个PCR管加入模板DNA

8、PCR扩增反应程序:94预变性35min。进入循环:94变性30s56退火3045s72延伸12min,3036个循环。循环结束后再72延伸7min。外源脱水应答转录因子DREB基因在转基因小麦中的诱导型表达与抗旱生理效果Induced Expression of DREB Transcriptional Factor and Study on Its Physiological Effects of Drought Tolerance in Transgenic Wheat成分母液浓度各成分加入量(l/25l)各成分终浓度或含量无离子水13?缓冲液(buffer)102.514dNTP2mm

9、ol/L20.2 mmol/L引物15?1mol/L?引物25?1mol/L?TaqDNA聚合酶5U/l0.2?1U模板DNA20ng/l1?50ngPCR扩增反应程序:94预变性5min。进入循环:94变性45s45退火45s72延伸1min,35个循环。循环结束后再72延伸10min。一般PCR反应中引物的终浓度为0.21.0mol/L,1.0mol/L时,特异性降低或形成引物二聚体,0.2mol/L时,降低产量。PCR反应中每种dNTP的终浓度为20200mol/L。所用引物浓度是5mol/L吗?PCR反应时,每个引物的终浓度是多少?4dNTP的终浓度是多少?TaqDNA聚合酶的终浓度是

10、多少?模板DNA的终浓度是多少?4 少少终 模少是的聚 ?是浓 度的引时吗 是物 浓 每反量产时 0体二形降性时 0./ . .浓物反 0后环环 延 火 性 环 变序应增 / 合 物 / 物/ / .0 子含浓终 量加浓成 效理抗达的中转基 因答 束环环0 0 性序序增 入 个 装引引混、合合聚 混混、序 . .合 / /引/ / / ./ 0 .子含浓浓 /量加浓成参程反系反 、 液电 、 (、 (准 、 、聚 ( 、(、照试及学刀单笔、制盒垃统成炉微宽料槽、电手次架括(离 )架( 、枪套器移、菌、0耗及设应链聚 /0 法光用.至值 0容 搅搅搅力 的 菌压) ( /. 加(.值节 0 .

11、菌压(0() / 0 容 的, 的菌菌) 菌0于 的00( / ) 保温混 酸的 菌灭(溶 高太度,溶加 /(溶蔗 液水蔗 0 (的存保液缓 . 0容在 ). 菌压)液电冲 0 ( .为终温于,包,入装全 / 存 0 0 0存 0 定 . 酸 0 菌灭( ( (液 / 灭 )已 的 液储 于(0( / 到水解溶 加 菌压(0 的灭入, .为 0 定 0 . 0 0 的菌压) ( 0 的 菌灭)0(缓取 配的种 )( (化糖、琼溴醇无戊烷甲氯 基硼乙 、试品化刀单号记自盒垃系成、微)胶、电套一架盒( (心头枪、0、 、套器机、水氮罐氮钵灭高子纸 、0、 00、 、0、0() 、 0(口、冰)(塑耗及器需提 需及)、0、(、 0、子氮水机 0头 架电胶微系自刀试 乙 烷戊溴( ()种取() (压的00 . 为 ,的 ( 解 /( 储 液 灭 0 酸 0 0 0 装包终 电菌 .) 0 缓存 蔗液溶 加高溶灭 混) 0菌)菌 容 / (压 . / (菌的 力 容 .用 聚应及、器、 (手、微成制单刀、( ( 聚、准 、 系成量/浓子0 / 引 . 聚、引 入增性 0 答基的理 量 浓 0 / /增变 延环 / 性二 量反 吗的 是聚是 4

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