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1、计算化学中计算化学中惯用软件简单介绍惯用软件简单介绍1第1页药品生化有机合成石油化工选矿 高温冶金材料科学 软件 硬件无机化学物理化学有机化学分析化学结构化学数值分析 拓扑学 运筹学 统计狭义：狭义：狭义：狭义：量子化学量子化学 广义：广义：广义：广义：计算化学是一门包括各种学科边缘学科计算化学是一门包括各种学科边缘学科 计算化学计算化学什么是计算化学？什么是计算化学？2第2页3第3页计算过程计算过程5计算结果分析和整理1文件调研2确定计算目3计算模型结构4计算方法选取4第4页计算化学所需条件5第5页GaussView 简单介绍简单介绍GaussView是一个专门设计与高斯配套使用软件。其主要
2、用途有两个:构建高斯输入文件和以图形式显示高斯计算结果。6第6页特点特点：经过计算机进行图形绘制和空间分子模拟，能给人增加真实感。7第7页8第8页GaussView基本功效演示9第9页怎样使用怎样使用UEUE编辑作业编辑作业：以丙氨酸为例以丙氨酸为例UltraEdit UltraEdit 是一套功效强大文本编辑器是一套功效强大文本编辑器10第10页Gaussian作业格式：以丙氨酸为例作业格式：以丙氨酸为例作业名称，运行内存，运行核数作业名称，运行内存，运行核数计算执行路径行，包含计算执行路径行，包含方法方法,基组基组,任务类型任务类型titletitle部分，部分，标识和说明作用标识和说明作
3、用分子说明部分分子说明部分电荷和自旋多重度电荷和自旋多重度11第11页Route Section（计算执行路径行）（计算执行路径行）Route Section主要由主要由方法方法，基组基组，任务类型任务类型三部分组成三部分组成1.方法选择12第12页2.基组基组选择选择13第13页Sp单点能量计算（默认任务类型）单点能量计算（默认任务类型）ADMP&BOMP动力学计算Opt分子几何结构优化分子几何结构优化Force计算核受力Freq振动分析振动分析Stable波函数稳定性测试Irc反应路径计算Volume计算分子体积IrcMax在指定反应路径上找能量最大值Density=CheckPoint仅
4、计算布居分析Scan势能面扫描Guess=Only仅作分子轨道初猜Polar极化率和超极化率计算ReArchive从.chk文件中提取存档intrinsic reaction coordinate内禀反应坐标 3.GaussianGaussian程序能完成程序能完成任务类型任务类型14第14页Gaussian 09 简单介绍简单介绍程程序序界界面面点击此处即可上传作业点击此处即可上传作业15第15页分子说明部分电荷与多重度标题行计算执行路径返回主单并运行返回主菜单保留放弃任务检验计算执行路径Gaussian09 上传作业界面上传作业界面16第16页举例1.分子轨道分子轨道2.原子电荷原子电荷1
5、7第17页1.怎样查看分子轨道？在UE中编辑输入文件时需要在计算执行路径行加 pop=full 关键词1，3 丁二烯注意：计算结束后，输入命令 formchk xxx.chk xxx.fchk，再用GaussieView打开fchk文件18第18页19第19页1，3 丁二烯HOMO轨道20第20页1，3 丁二烯LUMO轨道21第21页Isatins猜测：假如此物质要和金 属配位，应该首会和哪个位点配位呢？2.怎样查看原子电荷?在UE中编辑输入文件时需要在计算执行路径行加 pop=nbo 关键词（即NBO电荷分析）22第22页23第23页24第24页试验给现象，理论供解释！25第25页谢谢大家！26第26页