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1、第1页分子生物学技术分子生物学技术(二二)临床博士临床博士上海医学院分子生物学试验室上海医学院分子生物学试验室第2页讲义讲义:医学分子生物学技术和医学分子生物学技术和分子生分子生物学试验主编:潘銮凤,物学试验主编:潘銮凤,13号楼号楼9楼楼913室室吴老师,吴老师,25元元参考书:参考书:1.冯作化主编:医学分子生物学冯作化主编:医学分子生物学2.谷志远主编:当代医学分子生物学谷志远主编:当代医学分子生物学3.曼尼阿帝斯主编:分子克隆试验指南曼尼阿帝斯主编:分子克隆试验指南4.高天祥主编:医学分子生物学高天祥主编:医学分子生物学5.陈丙莺主编:基础与临床分子生物学陈丙莺主编:基础与临床分子生物
2、学第3页上课时间上课时间:周二早晨周二早晨8:00-9:40和周四和周四9:55-11:35地点地点:周二新周二新201,周四新周四新301,9月月2日日-10月月16日日试验试验:周二早晨周二早晨9:00-17:00和周四早晨和周四早晨9:50-17:00地点地点13-9楼楼,10月月21日日-11月月13日日答疑答疑:11月月18日日,周二早晨周二早晨9:30-17:00,地点地点:13-920考试考试:11.25周二周二,时间和地点待定时间和地点待定第4页考试:闭卷考,理论和试验相结合考试:闭卷考,理论和试验相结合综合性考试综合性考试50%试验汇报试验汇报35%试验过程、结果和学习态度试
3、验过程、结果和学习态度15%培养目标培养目标:科研能力为主科研能力为主,了解能力、分析问了解能力、分析问题、处理问题能力。技术关键理论题、处理问题能力。技术关键理论,试验设试验设计计,技术应用。技术应用。基础理论自学为主基础理论自学为主,欢迎试验课内提问和讨欢迎试验课内提问和讨论论第5页分子生物学基本原理概述分子生物学基本原理概述1第6页生物大分子生物大分子核酸核酸蛋白质蛋白质糖类糖类脂类脂类小分子小分子第7页核糖核糖碱基碱基核酸核酸核苷酸核苷酸磷酸磷酸核苷核苷嘌呤嘌呤嘧啶嘧啶AGT(U)C第8页核苷酸链核苷酸链第9页核苷酸核苷酸磷酸磷酸2-脱氧核糖脱氧核糖碱基碱基第10页第11页H脱氧脱氧第
4、12页第13页(C)(U)(G)(A)(T)碱碱基(基(base)Purine第14页DNA一级结构一级结构:核苷酸排列次序核苷酸排列次序C:线条式:线条式B:简化结构式:简化结构式A:化学结构式:化学结构式pApCpTpG.ACTG.P5.3OH长度:核苷酸长度:核苷酸nucleotide,nt第15页DNA二级结构模式图二级结构模式图(双螺旋结构双螺旋结构)A-DNAB-DNAZ-DNA第16页B-DNA第17页长度:碱基对长度:碱基对(basepair,bp)第18页DNA三级结构三级结构(超螺旋结构)超螺旋结构)第19页RNA第20页RNA:由四种核苷酸由四种核苷酸(G、A、C、U)组
5、成)组成戊糖为核糖戊糖为核糖第21页RNA类型类型:信使信使RNA(messengerRNA,mRNA)转运转运RNA(transferRNA,tRNA)核糖体核糖体RNA(ribosomalRNA,rRNA)核酶核酶(ribozyme)核内不均一核内不均一RNA(hnRNA)小分子核内小分子核内RNA(snRNA)反义反义RNA(antisenseRNA)小干扰小干扰RNA(smallinterferenceRNA,siRNA小小/微微RNA(microRNA,miRNA)第22页AUGAUGAUG蛋白蛋白1蛋白蛋白2蛋白蛋白3非翻译区非翻译区翻译区翻译区mRNA结构结构原核(多原核(多顺反
6、子)顺反子)真核(单顺反子)真核(单顺反子)第23页RNA结构结构第24页第25页第26页蛋白质蛋白质(protein)第27页蛋白质一级结构:蛋白质多蛋白质一级结构:蛋白质多肽链中氨基酸排列次序肽链中氨基酸排列次序20种氨基酸种氨基酸肽键肽键第28页丙氨酸丙氨酸精氨酸精氨酸天冬酰胺天冬酰胺天冬氨酸天冬氨酸半胱氨酸半胱氨酸谷氨酰胺谷氨酰胺谷氨酸谷氨酸甘氨酸甘氨酸组氨酸组氨酸异亮氨酸异亮氨酸亮氨酸亮氨酸赖氨酸赖氨酸甲硫氨酸甲硫氨酸苯丙氨酸苯丙氨酸辅氨酸辅氨酸丝氨酸丝氨酸苏氨酸苏氨酸色氨酸色氨酸酪氨酸酪氨酸缬氨酸缬氨酸第29页蛋白质二级结构蛋白质二级结构a a-螺旋螺旋b b-片层片层第30页超二
7、级结构、三级结构、四级结构超二级结构、三级结构、四级结构第31页蛋白质组学蛋白质组学(proteomicsproteomics)生命现象发生往往是多原因相互作用,生命现象发生往往是多原因相互作用,包括多个蛋白质包括多个蛋白质,同时蛋白质在执行生,同时蛋白质在执行生理功效时表现是多样、动态理功效时表现是多样、动态细胞内全部蛋白质存在及其活动方式细胞内全部蛋白质存在及其活动方式 已知基因蛋白质表示谱已知基因蛋白质表示谱比较蛋白质组学研究比较蛋白质组学研究蛋白质组学支撑技术平台和生物信息学研究蛋白质组学支撑技术平台和生物信息学研究第32页基因基因(gene):是核酸分子中贮存遗传是核酸分子中贮存遗传
8、信息遗传单位,是指贮存有功效蛋白信息遗传单位,是指贮存有功效蛋白质多肽链或质多肽链或RNA序列信息及表示这些序列信息及表示这些信息所必需全部核苷酸序列信息所必需全部核苷酸序列基因组基因组(genome):细胞或生物体中,细胞或生物体中,一套完整单倍体遗传物质总和。人体一套完整单倍体遗传物质总和。人体23条染色体(核基因组)和线粒体上条染色体(核基因组)和线粒体上遗传物质(线粒体基因组)遗传物质(线粒体基因组)第33页顺式调控元件顺式调控元件(顺式作用元件顺式作用元件)真核基因结构真核基因结构第34页顺式调控元件(顺式调控元件(cis-actingelements):指那些与指那些与结构基因表示
9、调控相关、能够被基因调控蛋结构基因表示调控相关、能够被基因调控蛋白特异性识别和结合白特异性识别和结合DNA序列序列反式作用因子(反式作用因子(trans-actingelements):可经过可经过结合顺式作用元件而调整基因转录活性蛋白质结合顺式作用元件而调整基因转录活性蛋白质因子因子第35页v开启子开启子(promotor):RNA聚合酶聚合酶特异性识别和结合特异性识别和结合DNA序列序列v增强子增强子(enhancer):为一段为一段DNA序序列,其中含有多个能被反式作用因子列,其中含有多个能被反式作用因子识别与结合顺式作用元件识别与结合顺式作用元件顺式调控元件:顺式调控元件:负增强子负增
10、强子:缄默子缄默子(silencer)增强子增强子调变子调变子(modulator)第36页v反应元件反应元件(responseelement):与信息分子结合特异与信息分子结合特异DNA序列,序列,介导基因对细胞外某种信号产生介导基因对细胞外某种信号产生反应。反应。v终止子终止子(terminator):基因编基因编码区下游码区下游一段一段DNA序列,提供序列,提供RNA聚合酶停顿工作信号。聚合酶停顿工作信号。第37页1990年正式开启由6个国家20个机构完成年2月15日发表草图204月14日宣告完成人类基因组:31.6亿个核苷酸3万-3.5万个基因,占2%人类基因组计划人类基因组计划hum
11、angenomeproject(HGP)第38页第39页第40页第41页基因和基因相关次序基因和基因相关次序(2030)非编码(非编码(90)内含子,开启子内含子,开启子5前次序,前次序,3后次序后次序假基因假基因基因片断基因片断编码次序(编码次序(10)基因以外非编码次序基因以外非编码次序(7080)中度中度/高度重复次序高度重复次序(2030)分散重复次序(分散重复次序(40)成簇重复次序(成簇重复次序(60)单一单一/低度重复次序低度重复次序(7080)人人类类基基因因组组人类基因组序列组成人类基因组序列组成第42页部分生物基因组中正常染色体数及基因数部分生物基因组中正常染色体数及基因数生物生物碱基数目(碱基数目(bp)染色染色体数体数基因数基因数人人3.2109233万万4万万小鼠小鼠3.2109203万万4万万果蝇果蝇810746000线虫线虫810760酵母酵母1.4107176300大肠杆菌大肠杆菌 4.610613500l l噬菌体噬菌体5104150乙肝病毒乙肝病毒 3.210314两栖类、鱼类、被子植物两栖类、鱼类、被子植物11011bp第43页第44页