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1、精心整理 生物化学名词解释及基本概念整理 第一章 蛋白质化学 基本概念 1、等电点（pI）：使氨基酸离解成阳性离子和阴性离子的趋势和程度相等，总带电荷为零（呈电中性）时的溶液 pH 值.A 溶液 pHpI,氨基酸带负电荷，在电泳时向正极运动。2、修饰氨基酸（稀有氨基酸）：蛋白质合成后，氨基酸残基的某些基团被修饰后形成的氨基酸。没有相应的密码子,如甲基化、乙酰化、羟基化、羧基化、磷酸化等。3、肽键（peptidebond）：合成肽链时，前一个氨基酸的羧基与下一个氨基酸的氨基通过脱水作用形成的酰胺键，具有部分双键性质。4、肽键平面（酰胺平面）：参与肽键的六个原子位于同一平面，该平面称为肽键平面。肽
2、键平面不能自由转动。5、蛋白质结构：A 一级结构：是指多肽链从 N 端到 C 端的氨基残基种类、数量和顺序。主要的化学键：肽键,二硫键。B 二级结构：是指蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构，即蛋白质主链原子的局部空间排布（不涉及侧链原子的位置）。分 -螺旋(-helix)：较重要，为右手螺旋，每圈螺旋含 3.6 个 氨基酸残基（13 个原子），螺距为 0.54nm、-片层（-折叠，-pleatedsheet）、-转角(-turn)、无规则卷曲（random coil）、-螺旋(-helix)。维持二级结构的化学键：氢键。模体：蛋白质分子中，二级结构单元有规则地聚集在一起形成 混合或均有的空间
3、构象，又称超二级结构。C 结构域：蛋白质三级结构中，折叠紧凑、可被分割成独立的球状或纤维状，具有特定功能的区域，称为结构域。为构成三级结构的基本单元。D 三级结构：是指整条多肽链中所有氨基酸残基的相对空间位置(肽链上所有原子的相对空间位置).化学健：疏水键和氢键、离子键、范德华力等来维持其空间结构的相对稳定。E 四级结构：蛋白质分子中几条各具独立三级结构的多肽链间相互结集和相互作用，排列形成的更高层次的空间构象。作用力：亚基间以离子键、氢键、疏水力连接。此外，范德华力、二硫键(如抗体）。6、分子伴侣：一类在序列上没有相关性但有共同功能，在细胞中能够帮助其他多肽链（或核酸）折叠或解折叠、组装或分
4、解的蛋白称为分子伴侣。如热休克蛋白。7、一级结构是形成高级结构的分子基础，蛋白质一级结构的改变，可能引起其功能的异常或丧失（“分子病”）；同功能蛋白质序列具有种属差异与保守性。蛋白质分子的空间结构是其发挥生物学活性的基础，蛋白质分子构象的改变影响生物学功能或导致疾病的发生，蛋白质一级结构不变，但由于折叠错误，导致蛋白质构象改变而引起的疾病，称为蛋白质构象病（折叠病）。8、蛋白质变性：在某些理化因素的作用下，特定的空间结构被破坏而导致其理化性质改变及生物活性丧失的过程。为非共价键和二硫键断裂，物理（高温、高压、紫外线），化学（强酸碱、有机溶剂、重金属盐）等因素导致。9、20种 AA 名称及缩写：
5、A 非极性疏水性 AA：甘氨酸（Gly）、丙氨酸（Ala）、缬氨酸（Val）、亮氨酸（Leu）、异亮氨酸（Ile）、苯丙氨酸（Phe）、脯氨酸（Pro）、蛋氨酸（Met）B 极性中性 AA:色氨酸（Trp）、丝氨酸（Ser）、酪氨酸（Tyr）、半胱氨酸（Cys）天冬酰胺（Asn）、谷氨酰胺（Gln）、苏氨酸（Thr）C 酸性 AA:天冬氨酸（Asp）、谷氨酸（Glu）D 碱性 AA:赖氨酸（Lys）、精氨酸（Arg）、组氨酸（His）E 芳香族 AA:苯丙氨酸（Phe）、色氨酸（Trp）、丝氨酸（Ser）精心整理 10、蛋白质理化性质：两性电离及等电点（多接近 5.0，少数为碱性）、亲水胶体性
6、质（具有水化层、双电层，保持其胶体稳定）、紫外吸收峰在 280nm 波长、显色反应（茚三酮反应、双缩脲反应）。11、蛋白质的分离纯化：利用不同蛋白质分子的溶解性（solubility）、分子大小（size）、带电情况（charge）、亲和能力等的不同将其提纯。粗提：透析、盐析、沉淀法等；精提：层析法（凝胶过虑层析、离子交换层析、亲和层析）、电泳法（蛋白质分子在高于或低于其 pI 的溶液中为带电的颗粒，在电场中能向正极或负极移动，如薄膜电泳、SDS-PAGE 电泳、凝胶电泳）、离心法（不同颗粒之间存在沉降系数差时，在一定离心力作用下，颗粒各自以一定速度沉降，在密度梯度不同区域上形成区带的方法）。
7、第二章酶 1、酶：一类由活细胞合成的、对其特异底物具有高效催化能力的蛋白质或核酸。2、酶活性中心：酶分子中与底物结合并与催化活性直接有关的化学基团所构成的特殊空间区域，具底物结合位点和催化位点。3、诱导契合学说：当底物与酶接近时，能诱导酶的构象发生有利于底物与之结合的变化，使酶与底物特异结合，催化反应的进行。4、酶分类：氧化还原酶类、转移酶类、水解酶类、裂解酶类、异构酶类、合成酶类。5、辅助因子：分辅酶和辅基、辅酶与酶蛋白结合不紧密，辅基与酶蛋白结合牢固。6、酶促反应动力学：研究底物浓度、酶 E 浓度、pH 值、温度、激活剂和抑制剂等因素对酶促反应速度影响。7、米-曼式方程：。Km（米氏常数）
8、等于酶促反应速度为最大速度一半时的底物浓度,单位为 mol/L.Vmax是酶完全被底物饱和时的反应速度，与酶浓度成正比。8、酶的转换数：当酶被底物充分饱和时，单位时间内每个酶分子催化底物转变为产物的分子数。用于比较每单位酶的催化能力。9、酶的抑制剂：能使酶活性下降而不引起酶蛋白变性的物质。分可逆性抑制和不可逆性抑制，可逆性抑制：抑制剂与酶通过不太稳定的非共价键结合，分竞争性抑制（均能与酶的底物中心结合，抑制作用的强弱取决于I 与 S的浓度比,增大底物浓度可解除抑制作用，如丙二酸抑制琥珀酸脱氢酶）、非竞争性抑制（抑制剂与底物结合中心以外的位点结合，不可转化为产物，增加底物浓度不能解除非竞争性抑制
9、剂的抑制作用，磺胺类药物抑菌作用）、反竞争性抑制（I 只能与 ES 复合物结合生成 ESI 后酶失去催化活性）。不可逆性抑制：抑制剂与酶的必需基团以共价键(或非常稳定的非共价键）结合，如有机磷中毒及重金属盐中毒。Km Vmax 竞争性抑制 增大 不变 非竞争性抑制 不变 减小 反竞争性抑制 减小 减小 Vmax是酶完全被底物饱和时的反应速度，与酶浓度成正比。Km等于酶促反应速度为最大速度一半时的底物浓度,单位为 mol/L.12、酶结构调节：通过对现有酶分子结构的影响来改变酶催化活性的调节方式，为快速调节。形式：酶原激活、变构、共价修饰调控。酶原激活:无活性的酶原去掉一个或几个特定肽键后转变为
10、有活性酶的过程。构象发生改变，活性中心暴露或形成。酶的变构调节：调节物通过非共价键与酶分子上的调节位点结合，使酶的构象发生改变而调节酶的活性。关键酶（限速酶）：可以通过改变其催化活性而使整个代谢途径的速度或方向发生改变的酶。共价修饰调控：酶分子上的某些基团在另一种酶的催化下发生可逆的共价修饰，从而引起酶活性的改变。有(去)磷酸化，(去)尿苷酸化等形式。13、同功酶：分子结构、底物亲和力、抑制剂等不相同但催化相同化学反应的一组酶。14、酶活力:酶催化一定化学反应的能力。15、LDH:乳酸脱氢酶，体内具五种形式，同功酶类。第三章维生素 1、TPP(硫胺素焦磷酸)、FMN(黄素单核苷酸)、FAD(黄
11、素腺嘌呤二核苷酸)、NAD+（尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸）、尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸（NADP+）、辅酶 A（CoASH)、四氢叶酸(FH4）、磷酸吡哆醛（PLP）2、各种维生素简介：化学名称 活性形式 生理功能 典型缺乏症 来源 维生素 A A1、A2、视黄醛、视觉细胞中的感光成分、保护上皮夜盲症、干眼症、皮肝脏、胡萝卜、玉米 子的趋势和程度相等总带电荷为零呈电中性时的溶液值溶液氨基酸带正电荷在电泳时向负极运动氨基酸所带总电荷为零在电泳时不移动氨基酸带负电荷在电泳时向正极运动修饰氨基酸稀有氨基酸蛋白质合成后氨基酸残基的某些基团过脱水作用形成的酰胺键具乙酰化羟基化羧基化磷酸化等肽键平面酰胺平面参
12、与肽键的六个原子位于同一平面该平面称为肽键平面肽键平面不能自由转动有部分双键性质蛋白质结构一级结构是指多肽链从端到端的氨基残基种类数量间排布不涉及侧链原子的位置分螺旋较重为右手螺旋每圈螺旋含个氨基酸残基个原子螺距为片层折叠转角无规则卷曲螺旋维持二级结构的化学键氢键模体蛋白质分子中二级结构单元有规则地聚集在一起形成混合或均有的空间构象又精心整理 视黄酸 细胞结构和功能的完整性、抗氧化 肤干燥角质化 维生素 D 1，25-（OH）2-D3(D2)促进肠道对钙的吸收、促进骨对钙的吸收和沉积 佝偻病、软骨病 肝、奶、蛋黄 维生素 E（生育酚）原型 重要的抗氧化剂、与动物生育有关、促进血红素的合成 小脑
13、萎缩、贫血、不育 小麦胚芽、葵花籽油、各种油料种子 维生素 K K1，K2（天然）K3和 K4（合成）-羧化酶（催化凝血因子 Glu 残基羧化）的辅酶 凝血障碍（双香豆素为 Vk拮抗剂）K1-绿叶菜 K2-肠菌合成 维生素 B1 TPP-酮酸氧化脱羧酶和转酮醇酶等的辅酶 脚气病 肝脏、瘦肉、种子的外皮、酵母 维生素 B2 FMN、FAD 黄素脱氢酶的辅酶，充当氢和电子的传递体。口角炎、舌炎、口腔（喉）溃疡、眼睛充血等。肝、肾、蛋、奶、酵母、蔬菜、青草 维生素 B3（pp）NAD+、NADP+大多数脱氢酶的辅酶，参与氢的传递 糙皮病(癞皮病,皮炎）、痴呆、腹泻、色素沉积等 肝脏、心脏、肾脏、肉类
14、、花生、谷物的种皮、苜蓿草、色氨酸转化 维生素 B5 CoASH 辅酶 A是酰化酶的辅酶，是酰基的载体 生长受阻，繁殖障碍 肉类、谷类、蔬菜、酵母 维生素 B6 PLP、磷酸吡哆胺 转氨酶等氨基酸代谢酶类的辅酶，传递氨基、参与血红素的合成、参与血红蛋白的功能 脂溢性皮炎、口角炎、神经系统机能障碍 肉类、全谷食品、蔬菜、肠菌合成 维生素 B7（生物素）生物素原型 脂肪酸合成、糖异生等代谢过程中的羧化酶的辅基 脱屑性皮炎、秃头症、结膜炎、嗜睡及厌食等神经症状 肝脏、蛋黄、叶菜、花菜、酵母 维生素 B9（叶酸）FH4 一碳单位的载体，是一碳基团转移酶的辅酶 巨幼红细胞性贫血 内脏、蔬菜、酵母 维生素
15、 B12 甲基钴胺素、5-脱氧腺苷钴胺素 转甲基酶的辅酶、参与分子内的重排 巨幼红细胞性贫血 动物内脏、牛奶、蛋黄、微生物制品（微生物能合成，动植物不能）维生素 C 强还原剂，参与氧化还原反应、羟化酶的辅酶、有利于肠道中铁的吸收 坏血病、贫血 第四章生物氧化 1、氧化磷酸化：呼吸链中电子的传递过程偶联 ADP 磷酸 化，生成 ATP 的过程。底物磷酸化（次要方式）：高能键断裂偶联 ADP 磷酸化为 ATP（或 GDP/GTP)的过程。偶联部位：NADH 与 CoQ 之间（复合体）、CoQ 与 Cytc 之间（复合体）、Cytc 与 O2之间（复合体）。化学渗透学说：电子沿呼吸链传递时，泵出 H
16、+形成跨膜电化学梯度，H+顺电化学梯度回流，释放能量会偶联 ATP 的生成。H+由 ATP 合成酶的 F0亚单位回流时才会偶联 ATP 的生成。影响磷酸化的因素：抑制剂：a、呼吸链抑制剂：鱼藤酮、粉蝶霉素 A、异戊巴比妥（复合体）；抗霉素 A（）；CO、CN、H2S（）。b、解偶联剂：使 H+不经 ATP 合酶的 F0回流，2,4-二硝基苯酚。c、氧化磷酸化抑制剂：寡霉素。AD的调节作用；甲状腺激素：诱导细胞膜上 Na+，K+ATP酶的生成，解偶联蛋白基因表达增加。2、呼吸链：代谢物脱下的氢原子通过多种酶所催化的连锁反应逐步 传递，最终与氧结合生成水的传递链,也叫电子传递链。A、递氢体：传递氢
17、的酶或辅酶，亦可以作为电子传递体。B、电子传递体：传递电子的酶或辅基/辅酶。子的趋势和程度相等总带电荷为零呈电中性时的溶液值溶液氨基酸带正电荷在电泳时向负极运动氨基酸所带总电荷为零在电泳时不移动氨基酸带负电荷在电泳时向正极运动修饰氨基酸稀有氨基酸蛋白质合成后氨基酸残基的某些基团过脱水作用形成的酰胺键具乙酰化羟基化羧基化磷酸化等肽键平面酰胺平面参与肽键的六个原子位于同一平面该平面称为肽键平面肽键平面不能自由转动有部分双键性质蛋白质结构一级结构是指多肽链从端到端的氨基残基种类数量间排布不涉及侧链原子的位置分螺旋较重为右手螺旋每圈螺旋含个氨基酸残基个原子螺距为片层折叠转角无规则卷曲螺旋维持二级结构的
18、化学键氢键模体蛋白质分子中二级结构单元有规则地聚集在一起形成混合或均有的空间构象又精心整理 C、呼吸链组成：4 种复合体、CoQ、Cytc 组成两条主要的呼吸链（NADH 氧化呼吸链、琥珀酸氧化呼吸链（FADH2氧化呼吸链）D、复合体组成：复合体（NADH-CoQ 还原酶）：是 NADH+H的电子进入呼吸链的入口，FMN 为其辅基,传递途径为NADHFMN，Fe-S CoQH2；复合体（琥珀酸-辅酶Q还原酶），FAD 为其辅基，传递途径为琥珀酸-FAD，Fe-S 簇CoQH2；复合体（CoQ-CytC 还原酶）接受CoQ 传递来的电子，并泵出4个H+/2e,传递途径为CoQH2-Cytb，Fe
19、-S，Cytc1Cytc，血红素为其辅基；复合体（Cytc 氧化酶）将电子从 Cytc 传递给分子氧，催化分子氧还原为 H2O,泵出 2 个 H/2e，FeCu 中心等为其辅基，传递途径为Cytc-CuA-Cytaa3-CuB-O2。每传递一对电子，复合体 I、分别泵出 4、4、2 个 H+E、呼吸链组份排序确定：根据标准氧化还原电位的高低；检 测电子传递体氧化的顺序；体外将呼吸链的各复合体进行拆分和重组；利用阻断剂研究分析。3、P/O比值：物质氧化时，每消耗 1mol 氧原子所消耗无机磷酸的 mol 数。4、胞液中 NADHH+穿梭形式：磷酸甘油穿梭（NADHH+-FADH2 生成 1.5m
20、olATP）、苹果酸-天冬氨酸穿梭(NADH H+-NADH H+生成 2.5molATP)。第五章糖代谢 1、糖酵解：通过一系列酶促反应将葡萄糖降解为丙酮酸的过程。（各组织器官的细胞液中均进行）能量：第一阶段为 15 步，共消耗 2molATP（1 和 3 步）形成两分子磷酸丙糖；第二阶段为 610 步，共生成 4molATP，均为底物水平磷酸化，由磷酸丙糖氧化为丙酮酸，6 步发生一次氧化还原反应生成 2 分子 NADH+H+。酶调节：a、第一步：己糖激酶（HK)肝脏中为葡萄糖激酶（GK）：变构抑制剂为 G-6-P，GK则为 F-6-P；b、第三步：磷酸果糖激酶-I(PFK-I)：变构抑制剂
21、为 ATP、柠檬酸、H+，变构激活剂为 F-2,6-BP、AMP、ADP；c、第十步：丙酮酸激酶：变构调节：抑制剂为 ATP、乙酰辅酶 A、长 FFA、Ala(肝脏），激活剂为 F-1，6-BP；共价修饰：磷酸化修饰活性降低。反应式：葡萄糖2ADP 2NAD2Pi2 丙酮酸2ATP 2NADH 2H2H2O 生理意义：糖有氧氧化的第一阶段；缺氧时迅速提供能量；红细胞仅以此途径获能；一些中间产物是氨基酸（如丙酮酸）、脂类（如磷酸二羟丙酮）等合成的前体 2、丙酮酸还原为乳酸的意义：使 NADH+H+重新氧化为 NAD+，保证无氧条件下，糖酵解可以继续进行。3、糖的有氧氧化：G丙酮酸（胞浆）、丙酮酸
22、乙酰辅酶 A（线粒体）、TCA循环（线粒体）、氧化磷酸化（线粒体）。丙酮酸乙酰辅酶 A：线粒体基质中进行，丙酮酸脱氢酶系催化（辅基及辅酶有TPP、硫辛酸、FAD、NAD+、CoA、Mg2），总反应为：三羧酸循环（TCA）:生物体内糖类、脂肪和氨基酸等的氧化产物乙酰辅酶 A与草酰乙酸缩合生成柠檬酸，柠檬酸再通过一系列氧化步骤产生 CO2、NADH+H+及 FADH2，并重新生成草酰乙酸，从而降解乙酰基并产生能量的代谢过程，在线粒体基质里完成。能量：乙酰 CoA+3NAD+FAD+GDP+Pi+2H2OCoA-SH+3(NADH+H+)+FADH2+2CO2+GTP 一分子乙酰 CoA彻底氧化所生
23、成的能量为 10ATP,一分子 G彻底氧化产生的总 ATP为 3032，酶调节：a、丙酮酸脱氢酶系：变构调节抑制剂为 ATP、乙酰辅酶 A、NADH，激活剂为 AMP；共价修饰磷酸化失活。b、柠檬酸合成酶：变构抑制剂为柠檬酸、NADH、琥珀酰 CoA，抑制剂为 ADP。c、异柠檬酸脱氢酶：变构抑制剂为 ATP、NADH、琥珀酰 CoA，激活剂为 ADP、NAD+、Ca2。d、-酮戊二酸脱氢酶系：变构抑制剂为 ATP、NADH、琥珀酰 CoA，激活剂为 ADP、NAD+、Ca2。生理意义：氧化供能；糖、脂、蛋白质等彻底氧化分解的共有途径；中间代谢物是许多生物合成的前体物。4、巴斯德（Pasteu
24、r）效应：在有氧的条件下，糖的有氧氧化抑制无氧酵解的现象。反 Pasteur 效应：在某些代谢旺盛的正常组织或肿瘤细胞中，即使在有氧的条件下，仍然以糖的无氧酵解为产生 ATP的主要方式的现象。5、磷酸戊糖途径：G-6-P经一系列反应生成 NADPH+H+和 5-磷酸核糖，并完成三碳、四碳、五碳、六碳、七碳糖转换的代谢途径，在胞浆进行。分氧化阶段（G-6-P氧化为 5-磷酸核酮糖，生成 2NADPH H）和非氧化阶段（生成 5-磷酸核糖，完成 5C/3C/7C/4C/6C 糖的相互转换，利用转醛醇酶和转酮醇酶）。子的趋势和程度相等总带电荷为零呈电中性时的溶液值溶液氨基酸带正电荷在电泳时向负极运动
25、氨基酸所带总电荷为零在电泳时不移动氨基酸带负电荷在电泳时向正极运动修饰氨基酸稀有氨基酸蛋白质合成后氨基酸残基的某些基团过脱水作用形成的酰胺键具乙酰化羟基化羧基化磷酸化等肽键平面酰胺平面参与肽键的六个原子位于同一平面该平面称为肽键平面肽键平面不能自由转动有部分双键性质蛋白质结构一级结构是指多肽链从端到端的氨基残基种类数量间排布不涉及侧链原子的位置分螺旋较重为右手螺旋每圈螺旋含个氨基酸残基个原子螺距为片层折叠转角无规则卷曲螺旋维持二级结构的化学键氢键模体蛋白质分子中二级结构单元有规则地聚集在一起形成混合或均有的空间构象又精心整理 生理意义：提供生物合成的原料（戊糖和 NADPH）；为细胞提供还原态
26、的环境：NADPH 是谷胱甘肽还原酶的辅酶；为戊糖的利用及3C（甘油醛-3-磷酸）、4C、5C、6C（F-6-P）、7C糖互相转换提供通路。6、糖异生作用：由非糖物质（生糖氨基酸、甘油、乳酸、丙酮酸、丙酸等）合成G或糖原的过程称为糖异生，反应器官主要在肝脏、肾脏，反应场所为线粒体及胞浆（动物不能将乙酰辅酶A转化为丙酮酸）。反应途径：糖异生并不是糖酵解的逆转，但多数反应相同，丙酮酸草酰乙酸PEP：第一步以丙酮酸羧化酶（生物素）催化，消耗 1ATP，在线粒体进行；第二步以 PEP羧激酶催化，消耗 1GTP，在线粒体及胞浆进行。F-1，6-BP F-6-P：果糖-1，6-二磷酸酶，消耗 1ATP。G
27、-6-P G:葡萄糖-6-磷酸酶,消耗 1ATP。反应式：2 丙酮酸4ATP 2GTP 2NADH 2H+4H2O 葡萄糖4ADP 2GDP 6Pi2NAD+，共消耗 6ATP和 2NADH+H+生理意义：饥饿时维持血糖浓度的相对恒定（主要）；乳酸再利用；降低原尿的 H+，缓解酸中毒（肾脏）；反刍动物血糖的主要来源：丙酸异生为葡萄糖。7、糖原合成与分解：糖原合成：由 G合成糖原的过程，糖原为带有分枝的高分子葡萄糖聚合物，化学键形式有1，4糖苷键、1，6糖苷键。主要在肝脏和肌肉的胞浆中合成。反应途径：GG-6-P G-1-P+UTP UDP-G（尿苷二磷酸葡萄糖）+糖原（n）糖原（n1）UDP,
28、最后一步以糖原合酶催化，UDP-G 为 G残基供体，每加一个 G残基，消耗 2ATP.糖原合酶：仅催化链的延伸，形成 1，4糖苷键，不催化其从头合成。糖原的分支以糖原分支酶催化，分支处为 1，6糖苷键。糖原降解：糖原(n)+Pi 糖原(n-1)+G-1-P，由糖原磷酸化酶催化，仅作用于 1，4糖苷键，还有糖原脱支酶。G-1-P G-6-P G（葡萄糖-6-磷酸酶催化，肌肉中无此酶，G-6-P直接进入糖酵解，肝肾中可形成 G）酶的调节：糖原磷酸化酶：原理：磷酸化活性高，去磷酸化活性降低；共价修饰：肾上腺激素和胰高血糖素升高，活性增强；变构调节：肌肉中激活剂为 AMP,抑制剂为 ATP、G-6-P
29、；肝脏中抑制剂为 G.糖原合成酶：原理：磷酸化活性低，去磷酸化活性增高；共价修饰：肾上腺激素降低其活性；变构调节：激活剂为G-6-P。8、共有的代谢产物:主要的为乙酰辅酶 A,G-6-P,在糖的循环中较为重要，乙酰辅酶 A在脂肪代谢中也有利用，将脂肪代谢和糖代谢相互联系，另外 a-酮戊二酸在核苷酸代谢中有重要作用，与糖代谢相互联系。第六章脂肪代谢 1、氧化：脂肪酸氧化时，每次脂酰基羧基端 C被氧化为酮基，然后裂解一分子的乙酰辅酶 A,因此脂肪酸的氧化称为 氧化。2、脂类：脂肪及类脂、衍生脂类的总称，其主要功能有：细胞的结构成分；能量的贮存形式；生理调节作用，如激素（性激素）、第二信使（甘油二酯
30、）；共价修饰蛋白质；保温作用；物质运输和消化相关；调节机体密度。3、脂肪酸的合成与氧化分解：合成：在肝、脂肪、乳腺、脑等的胞液中，原料为乙酰CoA、NADPH+H+，产物主要以 C16饱和脂肪酸为主 a、乙酰 CoA由线粒体转运进胞液中，利用柠檬酸丙酮酸转运系统共消耗 2ATP和 2NADPH+H+b、合成过程及能量消耗：乙酰 CoA丙二酸单酰 CoA，乙酰 CoA羧化酶进行催化，消耗 1ATP，生成一分子 16c 的棕榈酸需要 8 分子乙酰 CoA（7 分子转化为丙二酸单酰 CoA），（8-16+7）ATP,14NADPH+H+。合成过程中利用脂肪酸合酶进行催化，哺乳类中共有 7 种酶活性，
31、酰基载体蛋白（ACP）为其中一种，较为重要。合成过程中重复缩合、加氢、脱水、加氢的合成过程，每重复一次，增加一个二碳单位。c、合成调节：乙酰 CoA羧化酶：变构调节：激活剂为柠檬酸、异柠檬酸，抑制剂为脂酰 CoA、棕榈酰 CoA；共价调节：其磷酸化时活性降低，如胰岛素可以使其去磷酸化活性增高，胰高血糖素、肾上腺素和生长激素使其磷酸化，活性降低，与糖原合酶的共价调节类似；诱导调节：调节乙酰 CoA羧化酶合成。氧化分解：活化：脂肪酸脂酰 CoA，在胞浆中进行，共消耗 2ATP，由脂酰 CoA合成酶催化。脂酰 CoA的转运：进入线粒体，由肉碱进行携带，肉碱脂酰转移酶（、）及肉碱-脂酰肉碱转位酶催化。
32、脂肪酸的 氧化：线粒体中进行，产物为乙酰辅酶 A，FADH2,NADH+H+，重复脱氢水化再脱氢硫解过程，逐步生成乙酰辅酶 A，如 16C则 氧化 7 次，生成 7FADH2，7NADH H+，子的趋势和程度相等总带电荷为零呈电中性时的溶液值溶液氨基酸带正电荷在电泳时向负极运动氨基酸所带总电荷为零在电泳时不移动氨基酸带负电荷在电泳时向正极运动修饰氨基酸稀有氨基酸蛋白质合成后氨基酸残基的某些基团过脱水作用形成的酰胺键具乙酰化羟基化羧基化磷酸化等肽键平面酰胺平面参与肽键的六个原子位于同一平面该平面称为肽键平面肽键平面不能自由转动有部分双键性质蛋白质结构一级结构是指多肽链从端到端的氨基残基种类数量间
33、排布不涉及侧链原子的位置分螺旋较重为右手螺旋每圈螺旋含个氨基酸残基个原子螺距为片层折叠转角无规则卷曲螺旋维持二级结构的化学键氢键模体蛋白质分子中二级结构单元有规则地聚集在一起形成混合或均有的空间构象又精心整理 酮体：脂酸在肝分解氧化时特有的中间代谢物（乙酰乙酸、-羟丁酸和丙酮），生成部位主要在肝的线粒体基质中，原料为来自脂肪酸氧化的乙酰辅酶 A。酮体在肝内生成，在肝外组织（线粒体中）利用，均为糖异生或 TCA循环的原料如乙酰乙酸乙酰辅酶 A、丙酮丙酮酸或乳酸、-羟丁酸乙酰乙酸。生理意义：酮体是肝输出能源的一种形式；是肌肉、脑组织在饥饿等状态下的重要能源。4、甘油三酯的合成与分解：以甘油和乙酰辅
34、酶 A为材料，在肝脏及脂肪组织（甘油二脂途径）中或小肠黏膜细胞（甘油一酯途径）合成。甘油三酯的水解发生在脂肪细胞的胞浆中，分解成为甘油和脂肪酸（FFA），FFA由载脂蛋白经过血浆进行运输，激素敏感酯酶（HSL）为其限速酶。调节：经共价修饰调节，磷酸化活性升高，胰高血糖素、肾上腺素、去甲肾上腺素、肾上腺皮质激素和甲状腺素等可通过第二信使使其活性升高，胰岛素和前列腺素使其活性降低。甘油去向：直接运至肝、肾、肠等组织。主要在肝、肾进行糖异生，脂肪细胞及骨骼肌等组织因甘油激酶活性很低，故不能很好利用甘油。5、甘油磷脂：由甘油、脂酸、磷酸及含氮化合物等（如丝氨酸）组成。主要作用有构成生物膜脂质双分子层；
35、乳化剂，促进脂类的消化吸收与转运。其合成主要在肝肾肠的滑面内质网上，途径有CDP-甘油二酯途径和甘油二酯途径，可在多种磷脂酶（PL）作用下水解。6、胆固醇：主要肝脏（占 80%），其次是小肠粘膜上皮、皮肤的胞浆和内质网上以乙酰 CoA、NADPH+H+、ATP为原料合成。HMGCoA 还原酶（羟甲基戊二酸单酰 CoA）是限速酶，胆固醇在体内可以转化为类固醇激素、7-脱氢胆固醇或胆汁酸，亦可组成膜结构。7、脂蛋白：载脂蛋白与脂类以非共价键形成的球状复合物。分四种乳糜微粒 CM（运输外源性甘油三酯及胆固醇）、极低密度脂蛋白 VLDL（运输内源性甘油三酯及胆固醇）、低密度脂蛋白 LDL（运输内源性胆
36、固醇回肝脏或至肝外组织）、高密度脂蛋白 HDL（肝外组织的胆固醇运回肝脏）。第七章氨基酸代谢 1、来源与去路：EAA指必需氨基酸，体内不能合成，Lys、Met、Trp、Val、Leu、Ile、Thr、Phe、His、Arg，Tyr 和 Cys 为条件必需 AA。2、AA的脱氨基作用：有转氨基、氧化脱氨基、联合脱氨基、非氧化脱氨基等方式。转氨基作用：在转氨酶催化下，-氨基酸的氨基转移到-酮酸的酮基上，生成另一种氨基酸和另一种-酮酸的过程。体内最为重要的两种转氨酶为谷丙转氨酶（GPT：肝中活性最强）和谷草转氨酶（GOT：心脏中活性最强）。意义：动物体合成非必氨基、联系糖代谢与氨基酸代谢的桥梁。氧化
37、脱氨基作用：关键酶有 L-氨基酸氧化酶（辅基FMN）、D-氨基酸氧化酶（辅基FAD+）。主要为 L-谷氨酸的氧化脱氨，反应场所主要为肝脏的线粒体基质中，L-谷氨酸+H2O-酮戊二酸+NH4+NADH（NADPH）+H+。关键酶为L-谷氨酸脱氢酶，变构抑制剂为 GTP、ATP，激活剂为 ADP、GDP。联合脱氨基作用：氨基酸的氨基经转氨基作用转移给-酮戊二酸生成 L-谷氨酸，L-谷氨酸再经氧化脱氨基作用生成-酮戊二酸和游离氨的过程。反应主要在肝脏的线粒体基质中进行。在骨骼肌中进行嘌呤核苷酸循环，快速利用 AA，其中有次黄嘌呤核苷酸（IMP）的参与。3、AA脱羧：氨基酸脱羧酶的辅酶为 PLP，脱羧
38、形成相应的胺，体内的胺有-氨基丁酸（GABA）、牛磺酸、组胺、5-羟色胺（5-HT）等，为体内生理活性物质。4、氨的代谢：体内氨的来源主要为 AA脱氨作用，去路：在肝脏内可进行生物合成或合成尿素；肝外组织中可进行生物合成或者转运入肝形成尿素或进入肾脏形成铵盐。肝外组织产生的 NH3主要是以无毒的谷氨酰胺（Gln：脑和肌肉中，Glu 结合氨形成 Gln，在转运到肝及肾中）及丙氨酸（Ala：骨骼肌中进行）两种形式运输到肝脏或肾脏。5、尿素形成（鸟氨酸循环）：主要发生在肝脏的线粒体及胞液中，过程：NH3氨甲酰磷酸+鸟 AA 瓜 AA+Asp 精氨酸代琥珀酸Arg（+延胡索酸）尿素+鸟 AA，继续循环
39、。总反应：CO2+NH3+3ATP+Asp 2H2O尿素2ADP 2PiAMP+PPi 延胡索酸。共消耗 4 个高能磷酸键，Asp 是氨的中间传递体，延胡索酸和 Asp 将尿素循环和 TCA联系起来。尿素分子中一个 N来自于 NH3，另一个来自于 Asp。调节：第一步反应的酶为氨甲酰磷酸合成酶-（CPS-）。第三步酶为精氨酸代琥珀酸合成酶。（高血氨症）子的趋势和程度相等总带电荷为零呈电中性时的溶液值溶液氨基酸带正电荷在电泳时向负极运动氨基酸所带总电荷为零在电泳时不移动氨基酸带负电荷在电泳时向正极运动修饰氨基酸稀有氨基酸蛋白质合成后氨基酸残基的某些基团过脱水作用形成的酰胺键具乙酰化羟基化羧基化磷
40、酸化等肽键平面酰胺平面参与肽键的六个原子位于同一平面该平面称为肽键平面肽键平面不能自由转动有部分双键性质蛋白质结构一级结构是指多肽链从端到端的氨基残基种类数量间排布不涉及侧链原子的位置分螺旋较重为右手螺旋每圈螺旋含个氨基酸残基个原子螺距为片层折叠转角无规则卷曲螺旋维持二级结构的化学键氢键模体蛋白质分子中二级结构单元有规则地聚集在一起形成混合或均有的空间构象又精心整理 6、动物体氨基酸的合成：酮酸氨基化：Ala：丙酮酸；Asp（Asn）：草酰乙酸；Glu（Gln）：酮戊二酸；其他 AA转化：Gly：Ser；Cys:Ser 与 Met；Pro:Glu；Tyr:Phe；尿素循环：Arg。7 一碳单位
41、：某些氨基酸（Ser、Gly、His 和 Trp、Met）在分解代谢过程中产生的含有一个碳原子的基团，如-CH3、-CH2-、-CHO，四氢叶酸（FH4）一碳基团转移酶的辅酶，是一碳单位的载体；功能部位是N5和 N10。生理功能：合成嘌呤和嘧啶等的原料、为体内的甲基化反应间接提供甲基。8、芳香族 AA代谢：包括 Phe、Tyr、Trp（色 AA），主要在肝脏中代谢。Tyr 代谢可产生儿茶酚胺类物质，酪氨酸羟化酶为其合成的限速酶（缺乏得白化病），Phe 代谢产生苯丙酮酸（苯丙酮酸尿症 PUK），Trp 代谢合成褪黑素及 5羟色胺。第八章核苷酸代谢 1、核苷酸：是核酸的构件分子，有核糖、碱基及磷酸
42、三个组成成分，紫外吸收（260nm）。生物学功能：核酸的基本组成单位；参与能量的转移：ATP/GTP/UTP；第二信使:cAMP和 cGMP；是重要物质（如辅酶、SAM等）的构成成分；某些核苷酸的衍生物是多种生物合成过程的活性中间物质:UDP葡萄糖和 CDP 甘油二酯。2、嘌呤核苷酸的从头合成途径：利用简单的前体分子合成核苷酸的途径，在肝、小肠、胸腺等的胞液中合成。先合成 IMP,再以 IMP合成 AMP 和 GMP，IMP的合成是在磷酸核糖的基础上合成嘌呤环。合成原料：R-5-P、Gln、Gly、N10-甲酰四氢叶酸、CO2、Asp，消耗 ATP.简单过程：R-5-P转化为 PRPP(活化)
43、，磷酸核糖焦磷酸合成酶 催化该反应，再以 PRPP为基础进行合成 IMP。共消耗 1 分子 PRPP、2 分子谷氨酰胺、1 分子甘氨酸、1 分子天冬氨酸和 1 分子 CO2和 2 个甲酰基（N10甲酰四氢叶酸)，消耗了 7 分子 ATP。关键酶为 PRPP酰胺转移酶（变构酶）。AMP 和 GMP 的生成：IMP+Asp 腺苷酸代琥珀酸(AMPS)延胡索酸+AMP，第一步由 AMPS 合成酶催化，第二步由 AMPS 裂解酶催化，消耗 1GTP。IMP黄嘌呤核苷酸（XMP）GMP，第一步由 IMP脱氢酶催化，生成 1NADH+H+，第二步由 GMP 合成酶催化，消耗 2ATP.合成特点：PRPP是
44、 5-磷酸核糖的活性供体；嘌呤核苷酸是在磷酸核糖分子上逐步合成嘌呤环的；先合成 IMP，再转变成 AMP 或GMP。调节：主要受反馈抑制调节。PRPP合成酶：受变构调节（嘌呤核苷酸和嘧啶核苷酸为其抑制剂）；PRPP酰胺转移酶：受变构调节（抑制剂：IMP/AMP/GMP，激活剂：PRPP）3、嘌呤核苷酸的补救合成：碱基与 PRPP直接合成。腺嘌呤+PRPP AMP+PPi；次黄嘌呤(或鸟嘌呤）PRPP IMP（GMP)，次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶（HGPRT）进行催化。HGPRT 不足时为高尿酸尿症和高尿酸血症，完全缺乏时为自毁容貌症。4、嘧啶核苷酸的从头合成：特点：先合成嘧啶环，再与磷酸核
45、糖连接。原料：Gln、HCO3-、Asp、PRPP。过程：先合成 UMP（氨甲酰磷酸合成酶为该反应的限速酶，UMP 为其抑制剂），再以 UTP合成 CTP（是以 UMP 在三磷酸水平上转化而来的 UMP UTP，消耗 2ATP,UTP+Gln CTP+Glu，消耗 1ATP），以 dUMP 合成 dTMP。5、嘧啶核苷酸的补救合成：尿嘧啶+PRPP UMP PPi 6、补救合成的意义：简单，消耗 ATP少，节省 AA；脑主要以补救合成途径合成核苷酸。7、脱氧核糖核苷酸的合成：由相应的 NDP（二磷酸水平）还原生成（除 dTMP），NDP dNDP，消耗 1NADPH+H+，核糖核苷酸还原酶（R
46、R)催化该反应进行，受变构调节：激活剂为 ATP，抑制剂为 dATP、dTTP、dCTP。dTMP的生成是在脱氧一磷酸水平上进行的，以 dUMP 直接合成或补救合成。8、核苷酸合成的抗代谢物：碱基类似物：6-巯基嘌呤（IMP的类似物）竞争抑制 HGPRT，抑制嘌呤核苷酸的补救合成途径，可用作抗癌药物；5-氟尿嘧啶抑制 dTMP的合成；氨基酸类似物：氮杂丝氨酸（Gln 类似物）抑制嘌呤核苷酸的从头合成途径；抑制 UMP 及 CTP的合成；子的趋势和程度相等总带电荷为零呈电中性时的溶液值溶液氨基酸带正电荷在电泳时向负极运动氨基酸所带总电荷为零在电泳时不移动氨基酸带负电荷在电泳时向正极运动修饰氨基酸
47、稀有氨基酸蛋白质合成后氨基酸残基的某些基团过脱水作用形成的酰胺键具乙酰化羟基化羧基化磷酸化等肽键平面酰胺平面参与肽键的六个原子位于同一平面该平面称为肽键平面肽键平面不能自由转动有部分双键性质蛋白质结构一级结构是指多肽链从端到端的氨基残基种类数量间排布不涉及侧链原子的位置分螺旋较重为右手螺旋每圈螺旋含个氨基酸残基个原子螺距为片层折叠转角无规则卷曲螺旋维持二级结构的化学键氢键模体蛋白质分子中二级结构单元有规则地聚集在一起形成混合或均有的空间构象又精心整理 叶酸类似物：叶酸还原酶和二氢叶酸还原酶的抑制剂，可做抗肿瘤药物；核苷酸类似物：如阿糖胞苷（胞苷类似物），抑制 CDP还原为 dCDP。9、嘌呤核
48、苷酸的分解代谢：终产物为尿酸，疾病有腺苷脱氨酶（ADA）基因缺陷，导致重症联合免疫缺陷病；痛风症。10、嘧啶核苷酸的分解代谢：终产物为嘧啶碱。第十章核酸的化学 1、核酸：核酸是由核苷酸通过 3,5-磷酸二酯键聚合而成的生物大分子，包括 DNA 和 RNA。2、DNA 与 RNA 的区别：组成 结构 生物学功能 DNA 脱氧核糖核苷酸 1)一级结构：DNA 分子的核苷酸组成和连 2)接顺序，以 3,5-磷酸二酯键连接，5-P，3-OH，通常由 53方向写；3)DNA 的二级结构:两条脱氧多核苷酸链 反向平行盘绕所形成的双螺旋结构；4)DNA 的三级结构：DNA 螺旋双链进一步 扭曲盘旋形成的超螺
49、旋结构,双链环状 DNA 分子和线性DNA 大分子易形成超螺旋结构；5)染色质：真核细胞核内，DNA 分子被蛋 白质包装形成的高度压缩结构，是真核生物DNA 的高级结构，在细胞周期不同时期压缩程度及形态不同。1)多数生物的遗传物质 2)是遗传信息的载体,通过基因表达决定蛋白质的结构和功能 RNA 核糖核苷酸 1)一级结构：单链分子 2)二级结构：多单链，局部形成双螺旋结构（发卡或茎环,如 tRNA）3)三级结构：二级结构进一步折叠形成 4)四级结构：RNA 与蛋白质相结合（如 rRNA）1)是一些病毒的遗传物质;2)mRNA：遗传信息的中间载体;tRNA：转运氨基酸，识别密码子;rRNA：蛋白
50、质合成的场所 3)某些 RNA 具有催化作用：核酶 4)一些小分子 RNA 参与基因表达的调控（如microRNA）3、B型 DNA 双螺旋结构模型要点：1)两条链反向平行，围绕同一中心轴构成右手双螺旋。2)螺旋表面有大沟和一个小沟；3)每圈螺旋含 10 个碱基对(bp)，螺旋直径 2nm，螺距为 3.4nm；4)磷酸-脱氧核糖骨架位于螺旋外侧；碱基平面伸入内侧，与纵轴垂直；糖环平面与纵轴平行；5)两条单链通过碱基间的氢键相连，A与 T 配对，形成两个氢键，C对 G配对，形成三个氢键；6)影响双螺旋稳定的作用力：碱基堆积力、氢键、疏水相互作用和静电排斥力。4、DNA 碱基组成的 Chargaf