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1、外文摘要信息获取夏 旭南方医科大学医学情报学教研室电话：61648544Email：南方医科大学医学情报学教研室常用外文摘要数据库 PubMed（核心内容）EMBase Engineering Village 2 Web of Science Scopus BIOSIS Preview SciFinder Scholar南方医科大学医学情报学教研室一、PubMed简介（了解）二、认识PubMed文献（了解）三、PubMed检索特点（掌握）四、PubMed基本检索（重点）五、PubMed高级检索（重点）六、特征栏检索（重点）七、PubMed检索结果处理（重点）八、PubMed主题词检索（掌握）九
2、、MyNCBI个性化服务（了解）PubMed主要内容南方医科大学医学情报学教研室一、PubMed简介（了解）二、认识PubMed文献（了解）三、PubMed检索特点（重点）四、PubMed基本检索功能（重点）五、PubMed高级检索功能介绍（掌握）PubMed（1）南方医科大学医学情报学教研室一、PubMed简介南方医科大学医学情报学教研室PubMed概况(com;org;net)美国国立医学图书馆（National Library of Medicine-NLM）国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information-NCBI）向因特
3、网用户提供免费MEDLINE检索服务(自1997-6-26起)南方医科大学医学情报学教研室 收录80多个国家5400多种生物医学期刊的题录与文摘，是世界上最权威的生物医学数据库。现有1865年以来的2000万篇文献记录。每年增加60余万条文献记录。90%的文献为英文；70%以上的文献有摘要；截至2010年6月，收录中国期刊111种（我校学报被收录）。大陆93种、台13、港4、澳1。PubMed概况南方医科大学医学情报学教研室PubMed的外部链接功能 提供NCBI开发的分子生物学数据库的链接，如Nucleotide、Protein、Genome、OMIN、Structure、Taxonomy等
4、。提供美国国立医学图书馆多种资源的链接 提供相关文献（RELATED ARTICLES）的链接 提供其它外部资源的链接，如生物医学期刊网站全文链接、NCBI资源。南方医科大学医学情报学教研室外部链接南方医科大学医学情报学教研室外部链接南方医科大学医学情报学教研室二、认识PubMed文献南方医科大学医学情报学教研室作者AU题名TI来源SOPubMed记录类型（状态）PubMed题录南方医科大学医学情报学教研室 PubMed记录类型（状态）PubMed 除了1966 年以前的OldMedline，其余文献记录按处理过程分4 种类型（或状态）属于Medline 收录范围，建立ti、au、ab 等基本
5、书目信息。不属于Medline 收录范围，但也建立ti、au、ab 等基本书目信息。赋予MeSH、PT 等字段并被index。南方医科大学医学情报学教研室三、PubMed检索特点南方医科大学医学情报学教研室 PubMed检索特点 检索运算符AND、NOT、OR必须大写。(vitamin c OR zinc)AND common cold 支持截词检索（*），但对词组无效。如bacter*,可以检出以bacter为词干的单词bacteria、bacterium等最多600个单词。截词检索时，系统的自动词语匹配功能和MeSH自动扩展功能将不再被执行，如：heart attack*将不映射到 MeS
6、H 词 Myocardial Infarction。南方医科大学医学情报学教研室PubMed检索特点 强制检索：双引号 或限定字段 endocrine disruption endocrine disruption 注意：所有的、*、()、-都必须是英文状态下输入。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室四、PubMed基本检索功能南方医科大学医学情报学教研室1.关键词检索 在检索框中键入一个或多个单词，如键入：vitamin c AND common cold hepatitis b AND(diagnosis OR therapy)检索词可出现于PubMed记录的标题、摘要
7、等全部可检索字段。南方医科大学医学情报学教研室作者AU题名TI来源SOMEDLINE收录文献出版商提供电子文献南方医科大学医学情报学教研室正在处理的文献南方医科大学医学情报学教研室OLDMEDLINE南方医科大学医学情报学教研室举例 甲型病毒（H1N1）性流感（flu,influenza）/猪流感swine flu 检索词：H1N1;flu;influenza;swine flu 造血干细胞移植(hsct)治疗地中海贫血 检索词：hematopoietic stem cell transplantation；thalassemia南方医科大学医学情报学教研室2.字段限定检索 篇名字段检索 ti
8、 作者字段检索 au 机构字段检索 ad 刊名字段检索 ta南方医科大学医学情报学教研室缩写 全称 缩写 全称AB Abstract LA LanguageAD Affiliation（机构）MH MeSH TermsAU Author（作者）PT Publication TypeDP Publication Date SO SourceCPPublication CountryTA Journal Title（刊名）TIAB Title/abstract TI Title（篇名）IS ISSN TW Text Words常用字段（检索时大小写都可以）南方医科大学医学情报学教研室篇名检索 在文
9、章的标题中进行检索 字段标识TI 检索举例：篇名中检索亚健康的相关文献 检索词：subhealth，sub-health 构建检索表达式：Subhealthti OR sub-healthti南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室 查作者文章被收录。西方人姓名书写格式：first name、Middle Name、last name。美国肯尼迪总统：John Frank Kenedy，Kenedy為 last name（姓）Frank為 middle name，比较少见，多看到 John F.Kenedy，中间名用缩写。如果姓名中间有逗号，逗号前肯定是姓。Kenedy，Joh
10、n F.Kenedy jf作者检索南方医科大学医学情报学教研室 中国人姓名格式：first name、last name Shi-zhen Zhong（Shi zhen Zhong）zhong sz Shizhen Zhong zhong s 当作者三个字以上的中国人时，注意这两种格式都要检索。即：Zhong szau OR zhong sau南方医科大学医学情报学教研室“姓”+空格+“名首字母缩写”例如键入phillips c，系统会自动在作者字段内进行检索。如果想进行更精确的检索，可以用双引号将作者名引起来，再加au（作者字段标识符），如：phillips cau。南方医科大学医学情报学教
11、研室Phillips CBPhillips C南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室检索举例 查找钟世镇院士发表的显微外科学(microsurgery)论文 检索姚开泰院士发表的鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)论文南方医科大学医学情报学教研室机构检索 查某一机构发表论文被收录情况 机构字段 AD 检索南方医院发表的SARS论文 南方医院：nanfang hospital;south hosipital;southern hospital表达式：SARS AND nanfang hospitalad南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情
12、报学教研室 输入期刊全名，如：molecular biology of the cellmol biol cell”Journal Name），系统自动转换；键入期刊标准缩写形式如：mol biol cell，或期刊的ISSN（国际标准出版物代码）如：1059-1524进行检索；如果期刊名恰好是MeSH词表中的词或一个单词，如：Gene Therapy，Science，Cell等，加ta（杂志名称）。刊名检索南方医科大学医学情报学教研室 如果杂志全名中包括括弧或方括号，键入时应该予以取消，例如杂志名为：J Hand Surg Am，检索时应转成：J Hand Surg Am.语种为中文的期刊直
13、接用汉语拼音 南方医科大学学报：Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao（继承 Di 1 jun yi da xue xue bao）南方医科大学医学情报学教研室5/29/2023 38检索问题 检索南方医科大学学报（原第一军医大学学报有多少篇文献被收录，最早收录时间是哪一年？南方医科大学医学情报学教研室五、PubMed高级检索南方医科大学医学情报学教研室高级检索界面检索框搜索器检索历史预览索引检索策略细节南方医科大学医学情报学教研室高级检索 检索策略细节（Details特征栏）检索框(Search Box)预览(Preview 特征栏)索引(Index 特征栏)搜索器(Se
14、arch Builder)检索史(Search History 特征栏)南方医科大学医学情报学教研室搜索器（Search Builder）Choose a field to search：选定检索字段 Enter search term(s)：输入检索词 Click the Show Index link to display a list of terms,if desired：点击索引链接查看索引表 Change the default AND operator,if necessary.改变字段/算符 Click the Add to Search Box button.单击添加到检索框
15、按钮 Repeat steps as necessary 视情况重复上述步骤 Click Search to run your query,or click Preview to see the result count of your query in the Search History section.单击搜索运行查询；或点击预览在检索史区显示查询结果数量。南方医科大学医学情报学教研室举例 小剂量阿斯匹林治疗高血压 Small dose;aspirin;hypertension 方法：通过搜索器和索引表将检索词逐一导入 1、输入Small dose，点击SHOW INDEX 2、在新界面
16、选择索引表中的一个或多个索引词，加入到检索框。3、aspirin、hypertension同理。最后搜索。4、可以改变默认字段和逻辑算符。5、检索史直接显示于高级检索界面的检索史区南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室实习(1)1.篇名中包含SARS的论文（Servere acute respiratory syndrome，SARS）2.阿司匹林（aspirin）临床应用于高血压（hypertension）3.Piotr J Durka发表的英文综述，要求保存下来。4.番石榴叶治疗腹泻 diarrhea;psidium guajava leaf5.最早发表的循证医学论文（e
17、vidence based medicine）6.公共卫生与热带医学学院（School of Public Health and Tropical Medicine）发表的论文，其中陈晓光教授发表了几篇论文。7.自己的姓名在PubMed中可能的著录格式？南方医科大学医学情报学教研室 PubMed(2)六、特征栏检索(重点)七、PubMed检索结果的处理(掌握)八、PubMed主题词检索(掌握)九、MyNCBI个性化服务(了解)南方医科大学医学情报学教研室六、特征栏检索 1.Limits(限定检索)2.Preview/Index（预览/索引）3.History（检索史）4.Clipboard（剪
18、贴板）5.Details（检索策略细节）用于查看检索词自动转换南方医科大学医学情报学教研室1、限定检索(limits)设置与选择检索条件，包括日期、文献类型、语种、子集（subsets）、年龄段、性别、文本选择（有无摘要/全文）等。研究对象：人类或动物（Humans or Animals）出版物类型包括：临床试验、评论、信件、Meta分析、实践指南、随机对照实验、综述。全文链接（Full Text 或 Free Full Text）、有摘要（Abstracts）。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室检索举例 姚开泰院士1985年以来发表的有关鼻咽癌（nasopharynge
19、al cancer）方面的文献 分析 姚开泰；2001年以来；nasopharyngeal cancer南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室2、检索史（Search History）各检索式之间可以进行逻辑组配，可以#n代替检索式。南方医科大学医学情报学教研室3、预览/索引预览（Preview）索引（Index）南方医科大学医学情报学教研室点击剪贴板加入剪贴板4、剪贴板(clipboard)南方医科大学医学情报学教研室检索策略细节5、检索策略细节南方医科大学医学情报学教研室七、PubMed检索结果处理（一）显示格式设置(Display Settings)（二）文件保存（10
20、000篇）(Send to File)（三）放进剪贴板(Send to Clipboard)（四）发送电子邮件(Send to E-mail)（五）结果排序(Display Settings-Sort by)（六）存为馆藏(Send to Collections)南方医科大学医学情报学教研室（一）显示格式设置（Display Settings）南方医科大学医学情报学教研室题录格式：作者、题名、出处显示格式Summary格式（默认）南方医科大学医学情报学教研室显示格式Abstract格式南方医科大学医学情报学教研室显示格式MEDLINE格式导入NoteExpress的必选格式南方医科大学医学情报
21、学教研室（二）文件保存南方医科大学医学情报学教研室（三）放进剪贴板（Clipboard）将每次选中的检索结果暂时保存至此；最后集中处理（下载存盘或发E-mail）；最多500条记录；断开连接后仍可保存8小时。南方医科大学医学情报学教研室选取记录，将记录发送到Clipboard南方医科大学医学情报学教研室记录保存到Clipboard后有提示信息南方医科大学医学情报学教研室在Clipboard中查看保存的记录南方医科大学医学情报学教研室在检索历史中显示Clipboard操作历史南方医科大学医学情报学教研室（四）发送电子邮件南方医科大学医学情报学教研室（五）结果排序(Display Settings
22、-Sort by)排序字段：1、Recently Added（收录日期）2、Pub Date（出版时间）3、First Author（第一作者）4、Last Author（最后一名作者）5、Journal（刊名）6、Title（篇名）南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室（六）存为馆藏(Send to Collections)南方医科大学医学情报学教研室八、PubMed 主题词检索南方医科大学医学情报学教研室MeSH(Medical Subject Headings)PubMed 记录中的医学主题词(MeSH)是由标引员为PubMed 中的Medline 文献所人工指定的词。
23、例：ascorbic acid 是MeSH Terms，而vitamin c则不是。标引员使用能恰当描述文章内容的最相关MeSH 词。通常一篇文章可有多个MeSH 词。南方医科大学医学情报学教研室 PubMed 能自动地为输入的检索词寻找相应的MeSH 词 用户利用一个MeSH 词能找出所有有关该主题的文献 不同拼写：leukemia(s),leukaemia(s)leukemia 同义词：tumor(s),tumour(s),cancer(s),neoplasm(s)neoplasmsMeSH(Medical Subject Headings)南方医科大学医学情报学教研室MeSH词独有特征
24、主要MeSH 词(MAJOR TOPIC):MeSH term as main subject of the article(*)次要MeSH 词 扩展(EXPLODE)：chosen MeSH term and all more specific underlying MeSH terms 副主题词(SUBHEADINGS)南方医科大学医学情报学教研室SubHeadings 副主题词 对一个主题词的多个方面进行修饰限定的词，又称限定词。目前有83 个副主题词 并非每个主题词都能和83 个副主题词组配。与医学影像相关的副主题词主要包括：radiography(放射照相术)、radionucli
25、de imaging(放射性核素成像)、ultrasonography(超声检查)、radiotherapy(放射疗法)等。南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室主题词等级排列，检索时可以将包含其下位词的文献都检索出来。一个主题词可以同时处在不同类目下。南方医科大学医学情报学教研室可选用的副主题词南方医科大学医学情报学教研室第一步：输入检索词检索有关糖尿病（Diabetes）影像学诊断方面的文献。南方医科大学医学情报学教研室第二步：确定主题词南方医科大学医学情报学教研室第三步：确定副主题词南方医科大学医学情报学教研室第四步：add to search builder南方医科大
26、学医学情报学教研室第五步：检索南方医科大学医学情报学教研室检索结束南方医科大学医学情报学教研室 第六步：输入检索词：hypertension,重复以上一至五步。然后利用高级检索，将两个检索式进行检索。也可先不检索，在输入第2个主题词后先组配，再检索。南方医科大学医学情报学教研室九、MyNCBI个性化服务1.存储检索式，定期发送最新相关文献。2.设定检索过滤器，检索结果个性化。3.存储检索结果文献。南方医科大学医学情报学教研室注册My NCBI账号南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室注意大小写南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室1.存储检索式南方医科大学医
27、学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室2.设定检索过滤器南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室查找可设定的过滤器南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室可自行定制过滤器南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室查看设定的过滤器南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医
28、学情报学教研室3.存储检索结果文献南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室南方医科大学医学情报学教研室实习(2)1.肌肉疲劳（muscle fatigue）无创检测（noninvasive detection）综述2.1950年以来麻疹爆发的英文综述（Measles；outbreak）3.2000年以来讨论放射诊断(radiodiagnosis)技术副作用(side effects)的文献4.南方医院发表的SARS中文论文(Nanfang Hospital)5.抗甲型流感病毒的疫苗研究综述Influenza A Virus，vaccine 6.广州管圆线虫病(Guangzhou Angiostrongylus)的免疫诊断(Immunodiagnosis)7.申请My NCBI帐号，将上述所有检索式保存。