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1、关于核酸的生物合成第1页,讲稿共76张,创作于星期二遗传信息传递的中心法则遗传信息传递的中心法则(重点)(重点)复制复制RNADNA蛋白质蛋白质转录转录翻译翻译揭开了遗传信息传递的奥秘揭开了遗传信息传递的奥秘第2页,讲稿共76张,创作于星期二复制复制:遗传信息从亲代传递到子代:遗传信息从亲代传递到子代DNA分子的过程分子的过程转录转录:以:以DNA分子为模板,在细胞核内合成与其结构相应的分子为模板,在细胞核内合成与其结构相应的RNA分子,分子,将将DNA的遗传信息抄录到的遗传信息抄录到mRNA分子中。(碱基互补配对原则)分子中。(碱基互补配对原则)翻译翻译:以:以mRNA为模板,以三个邻近碱基
2、序列决定一种氨基酸的遗传密码子形为模板,以三个邻近碱基序列决定一种氨基酸的遗传密码子形式,决定蛋白质合成时氨基酸的序列。式,决定蛋白质合成时氨基酸的序列。遗传信息通过复制、转录和翻译,最终传递给蛋白质的规律,即被遗传信息通过复制、转录和翻译,最终传递给蛋白质的规律,即被称作称作中心法则中心法则。第3页,讲稿共76张,创作于星期二逆(反向)转录逆(反向)转录转录转录复制复制RNADNA蛋白质蛋白质翻译翻译反转录反转录对中心法则的补充对中心法则的补充第4页,讲稿共76张,创作于星期二所谓逆转录:是指在所谓逆转录:是指在逆转录酶逆转录酶的作用下以的作用下以RNA为模板为模板合成合成DNA的过程。的过
3、程。病毒病毒RNA逆转录酶逆转录酶RNA(被水解)(被水解)单链单链DNA(模板)模板)RNA-DNA杂交体杂交体复制复制双链双链DNA整合入整合入宿主细宿主细胞基因胞基因如人免疫缺损病毒(如人免疫缺损病毒(HIVHIV)就是一种)就是一种逆转录病毒逆转录病毒,它感染人的,它感染人的T T淋巴细胞,淋巴细胞,导致人体免疫缺陷,引起艾滋病(导致人体免疫缺陷,引起艾滋病(AIDSAIDS)。)。第5页,讲稿共76张,创作于星期二第二节第二节 DNA的生物合成的生物合成第6页,讲稿共76张,创作于星期二 DNA究竟是究竟是如何复制如何复制的?的?换言之,遗传信息从上一代传递到下一代是如何开始的?换言
4、之,遗传信息从上一代传递到下一代是如何开始的?J.Watson J.Watson 和和 F.Crick在在提出提出DNA分子双螺旋结构学说时推测分子双螺旋结构学说时推测过过DNA的的复制(即复制(即DNA复制假说)复制假说)。第7页,讲稿共76张,创作于星期二DNA复制假说复制假说:在:在DNA复制过程中,双螺旋复制过程中,双螺旋DNA的的两条链两条链相分离相分离,并以每条,并以每条DNA链为链为模板模板,利用细胞中的脱氧核糖核,利用细胞中的脱氧核糖核苷酸苷酸(dNTP)作为作为底物底物,按照,按照碱基互补的原则碱基互补的原则,分别,分别合成另合成另一条一条DNA,从而形成结构相同的两个子代从
5、而形成结构相同的两个子代DNA双螺旋分子。双螺旋分子。思考思考,我们已经知道的我们已经知道的DNA复制现象复制现象第8页,讲稿共76张,创作于星期二一、一、DNA的复制的复制1.1.DNA复制是半保留复制复制是半保留复制含义:新合成的含义:新合成的DNA分子链中,一条链来自亲分子链中,一条链来自亲代代DNADNA,而另一条链则是新合成的。,而另一条链则是新合成的。(一)(一)DNA复制的特征复制的特征第9页,讲稿共76张,创作于星期二为什么是半保留复制?为什么是半保留复制?其它其它可能可能的复制方式:的复制方式:全保留式或散布式全保留式或散布式。全保留式:全保留式:即恢复原来的即恢复原来的DN
6、A双螺旋,并产生一个新的子代双螺旋,并产生一个新的子代DNA双螺旋。双螺旋。散布式:散布式:即复制模板链被分成许多小片段,散布于子代即复制模板链被分成许多小片段,散布于子代DNA中。中。第10页,讲稿共76张,创作于星期二1958 Meselson and Stahl密度梯度实验密度梯度实验 实验结果支持实验结果支持半保留复制半保留复制方式方式培养于普培养于普通培养液通培养液含含15N-DNA的细菌的细菌 第一代第一代继续培养于继续培养于普通培养液普通培养液 第二代第二代细菌的细菌的DNA双链双链(粗线代表含(粗线代表含15N)(细线代表含细线代表含14N)梯度离心结果梯度离心结果普通普通DN
7、A沉降位置沉降位置重重DNA沉降位置沉降位置第11页,讲稿共76张,创作于星期二DNA半保留复制的意义半保留复制的意义 能充分保证能充分保证DNA代谢代谢稳定性稳定性与复制与复制忠实性忠实性;经过经过许多代的复制,许多代的复制,DNA分子上的遗传信息仍可分子上的遗传信息仍可准确准确地传递给后代地传递给后代。第12页,讲稿共76张,创作于星期二2.DNA复制具有特定的起始点复制具有特定的起始点 DNA复制是从复制起始位点开始向两个方向进行复制是从复制起始位点开始向两个方向进行的的双向复制双向复制。复制叉复制叉复制泡复制泡第13页,讲稿共76张,创作于星期二3.3.DNA的半不连续复制的半不连续复
8、制DNA分子的两条链反向平行;分子的两条链反向平行;即一条链是即一条链是35,另一条链是,另一条链是5 3;而所有已知而所有已知DNA聚合酶的聚合酶的合成方向都是合成方向都是5 3。实际实际DNA复制中,如何实现齐头并进的合成?复制中,如何实现齐头并进的合成?第14页,讲稿共76张,创作于星期二3 5 3 5 3 5 前导链前导链(leading strand)后随链后随链(lagging strand)解链方向解链方向冈崎片段冈崎片段5 3 3 5 DNA复制叉复制叉第15页,讲稿共76张,创作于星期二前导链前导链:一条链(一条链(35)的合成方向和复制叉前进方向相同,可)的合成方向和复制叉
9、前进方向相同,可以以连续复制连续复制合成的新链。合成的新链。后随链后随链:另一条链的合成方向与复制叉前进方向相反,另一条链的合成方向与复制叉前进方向相反,不能连续复不能连续复制制,只能分成若干小片段分别合成,然后连接起来形成新链。,只能分成若干小片段分别合成,然后连接起来形成新链。后随链中的小片段称为后随链中的小片段称为冈崎片段冈崎片段。第16页,讲稿共76张,创作于星期二3.3.DNA的半不连续复制的半不连续复制DNA分子的两条链反向平行;分子的两条链反向平行;即一条链是即一条链是35,另一条链是,另一条链是5 3;而所有已知而所有已知DNA聚合酶的聚合酶的合成方向都是合成方向都是5 3。实
10、际实际DNA复制中,如何实现齐头并进的合成?复制中,如何实现齐头并进的合成?前导链连续复制而后随链不连续复制,即前导链连续复制而后随链不连续复制,即DNA半不半不连续连续复制。复制。第17页,讲稿共76张,创作于星期二(二)参与(二)参与DNA复制的酶类和复制的条件复制的酶类和复制的条件1.DNA复制的条件(或复制体系)复制的条件(或复制体系)n底物底物 dNTP(dATP,dGTP,dCTP,dTTP)n模板单链的模板单链的DNA母链母链n引物寡核苷酸引物(引物寡核苷酸引物(RNA)n其他酶和蛋白质因子其他酶和蛋白质因子 DNA聚合酶(聚合酶(DNA指导的指导的DNADNA的聚合酶的聚合酶)
11、引物酶或引物酶或RNA聚合酶(引发酶)聚合酶(引发酶)解螺旋酶解螺旋酶 DNA旋转酶(拓扑异构酶)旋转酶(拓扑异构酶)单链单链DNA结合蛋白结合蛋白 DNA连接酶连接酶第18页,讲稿共76张,创作于星期二2.参与参与DNA复制的酶类复制的酶类DNA复制速度甚快,复制高效率和高度忠实性,都是由于复制速度甚快,复制高效率和高度忠实性,都是由于许多许多酶参与了复制过程酶参与了复制过程。主要有:主要有:DNA聚合酶、聚合酶、引物酶、参与引物酶、参与DNA解旋、解旋、解链的酶、解链的酶、单链结合酶、单链结合酶、DNA连接酶连接酶第19页,讲稿共76张,创作于星期二1)DNA聚合反应与聚合反应与DNA聚合
12、酶聚合酶(DNA polymerase)定义:在聚合过程中,能够催化四种定义:在聚合过程中,能够催化四种dNTP通过与模板链的通过与模板链的碱基互补配对,合成新的对应碱基互补配对,合成新的对应DNA链。链。n n1 1dATPdATPn n2 2dGTPdGTPn n1 1dTTPdTTPn n2 2dCTPdCTP+DNADNA聚合酶聚合酶DNADNAMg2Mg2+,引物引物dAMPdAMPdGMPdGMPdTMPdTMPdCMPdCMPDNADNA+2(n2(n1 1+n+n2 2)PPi)PPi2n2n1 1+2n+2n2 2第20页,讲稿共76张,创作于星期二以四种脱氧核糖核苷酸为以四
13、种脱氧核糖核苷酸为底物底物DNA聚合酶的特点聚合酶的特点分别是:分别是:d dATP,dGTP,dCTP,dTTP DNA聚合酶能够区分聚合酶能够区分rNTP(核糖核苷酸)和核糖核苷酸)和dNTP,DNA聚合酶的活性中心对聚合酶的活性中心对rNTP有空间排斥作用。有空间排斥作用。rNTP的分子中又的分子中又2 -OH存在,产生空间位阻,影响催化存在,产生空间位阻,影响催化第21页,讲稿共76张,创作于星期二反应需要接受反应需要接受模板链模板链的指导的指导即母链,单链即母链,单链DNA反应反应不能自行从头合成不能自行从头合成DNA链链()必须有一条必须有一条RNA链作为引物链作为引物,催化此引物
14、催化此引物3 -OH端与端与dNTP 5 -PPi作用,作用,形成形成3,5-磷酸二酯键,从而逐步延长磷酸二酯键,从而逐步延长DNA链。链。第22页,讲稿共76张,创作于星期二即从即从5 端开始向端开始向3 端的方向进行端的方向进行DNA链的合成具有方向性链的合成具有方向性()第23页,讲稿共76张,创作于星期二原核、真核细胞原核、真核细胞DNA聚合酶的类型和功能聚合酶的类型和功能TLS1 Rev 1TLS,体,体细细胞高胞高变变1Pol 相相对对准确的准确的TLS(穿越(穿越环环丁丁烷烷二聚体)二聚体)1Pol TLS1Pol 体体细细胞高胞高变变(somatic hypermutation
15、)1Pol 减数分裂相关的减数分裂相关的DNA损伤损伤修复修复1Pol TLS1Pol DNA交交联损伤联损伤修复修复1Pol DNA复制,核苷酸切除修复,碱基切除修复复制,核苷酸切除修复,碱基切除修复4Pol DNA复制,核苷酸切除修复,碱基切除修复复制,核苷酸切除修复,碱基切除修复23Pol 线线粒体粒体DNA复制和复制和损伤损伤修复修复3Pol 碱基切除修复碱基切除修复1Pol 合成引物合成引物4Pol 功能功能亚亚基数目基数目真核生物真核生物TLS(translesion synthesis)3Pol (UmuC,UmuD)DNA损伤损伤修复,穿越修复,穿越损伤损伤合成(合成(TLS)
16、1Pol (Din B)染色体染色体DNA复制复制9Pol 全全酶酶染色体染色体DNA复制复制3Pol 核心核心酶酶DNA损伤损伤修复修复1Pol 去除去除RNA引物,引物,DNA损伤损伤修复修复1Pol 功能功能亚亚基数目基数目原核生物(原核生物(E.coli)第24页,讲稿共76张,创作于星期二2 2)引物酶)引物酶定义:催化定义:催化RNA引物合成的酶称为引物酶引物合成的酶称为引物酶意义:意义:DNA聚合酶聚合酶不能自行从头不能自行从头以以2 2个游离的单脱氧核苷酸为个游离的单脱氧核苷酸为起点合成起点合成DNA链;链;因此,首先需要合成一小段多核苷酸作为因此,首先需要合成一小段多核苷酸作
17、为引物引物(primer)这段是这段是RNA链片断链片断,主要为,主要为DNA链合成提供链合成提供自由自由3-OH末端末端。第25页,讲稿共76张,创作于星期二3 3)参与)参与DNA解旋、解链的酶及蛋白质因子解旋、解链的酶及蛋白质因子解螺旋酶解螺旋酶定义:定义:解开解开DNA双链间的氢键双链间的氢键,使其称为单链的酶,使其称为单链的酶,或称解链酶。或称解链酶。特点:需要水解特点:需要水解ATP提供能量提供能量第26页,讲稿共76张,创作于星期二拓扑异构酶拓扑异构酶由于由于DNA复制前方形成超螺旋结构,阻碍了复制前方形成超螺旋结构,阻碍了DNA的解旋、解链;的解旋、解链;因此,需要不断松弛因此
18、,需要不断松弛DNA模板的超螺旋结构。模板的超螺旋结构。定义:定义:松弛松弛DNA超螺旋结构的酶超螺旋结构的酶,称为拓扑异构酶。,称为拓扑异构酶。分为分为型和型和型。型。第27页,讲稿共76张,创作于星期二DNA拓扑异构酶拓扑异构酶型型通过形成短暂的通过形成短暂的单链裂解单链裂解-结合循环结合循环,催化催化DNA复制的拓扑异构状态的变化;复制的拓扑异构状态的变化;特点:剪切一条链,不需要特点:剪切一条链,不需要ATP第28页,讲稿共76张,创作于星期二拓扑异构酶拓扑异构酶型型通过引起瞬间通过引起瞬间双链酶桥的双链酶桥的断裂断裂,然后打通和再封闭,然后打通和再封闭,以改变以改变DNADNA的拓扑
19、状态。的拓扑状态。特点:剪切两条链,需要特点:剪切两条链,需要ATP第29页,讲稿共76张,创作于星期二4 4)单链结合酶)单链结合酶定义定义:结合于因:结合于因DNA双链打开而形成的单股双链打开而形成的单股DNA链上的链上的酶,称为单链机结合酶(酶,称为单链机结合酶(DNA结合蛋白)。结合蛋白)。意义意义:维持模板链处于单链状态;:维持模板链处于单链状态;保护单股保护单股DNA链不被核酸酶水解。链不被核酸酶水解。第30页,讲稿共76张,创作于星期二5 5)DNA连接酶连接酶DNA连接酶,连接酶,即连接两个冈崎片段即连接两个冈崎片段;一片段一片段DNA链上脱氧核苷酸的链上脱氧核苷酸的3 3 羟
20、基和相邻另一片段羟基和相邻另一片段DNA链链上脱氧核苷酸的上脱氧核苷酸的5 5 磷酸基团,形成磷酸基团,形成磷酸二酯键磷酸二酯键,从而把两个片,从而把两个片段的段的DNA链连接起来。链连接起来。5 3 5 3 5 3 5 3 P HODNA连接酶连接酶ATPADP形成形成磷酸二酯键磷酸二酯键第31页,讲稿共76张,创作于星期二第32页,讲稿共76张,创作于星期二根据目前的知识,可将根据目前的知识,可将DNA复制的过程大体分为三复制的过程大体分为三个阶段:个阶段:起始、延伸和终止起始、延伸和终止。1.1.复制的起始复制的起始DNA合成的起始包括:合成的起始包括:起点的识别、模板起点的识别、模板D
21、NA超螺旋及双螺旋超螺旋及双螺旋的解除、引物的合成的解除、引物的合成复制的起始复制的起始(三)(三)DNA的复制过程的复制过程第33页,讲稿共76张,创作于星期二辨认起点辨认起点DNA复制有复制有固定的起点固定的起点(origin,ori),即复制,即复制起点的一段特殊起点的一段特殊DNA序列。序列。区别区别:原核细胞中只有一个复制起点,:原核细胞中只有一个复制起点,而真核细胞而真核细胞DNA双链有多个复制起点。双链有多个复制起点。E.coli 复制起始点复制起始点 oriC复制的起始复制的起始辨认起点辨认起点 (举例)举例)第34页,讲稿共76张,创作于星期二E.coli 复制起始点复制起始
22、点 oriC GATTNTTTATTT GATCTNTTNTATT GATCTCTTATTAG 1 13 17 29 32 44 1 13 17 29 32 44 TGTGGATTA-TTATACACA-TTTGGATAA-TTATCCACA58 66 166 174 201 209 237 24558 66 166 174 201 209 237 245 同向重复序列同向重复序列 反向重复序列反向重复序列5 3 5 3 富含富含A、T第35页,讲稿共76张,创作于星期二辨认起点辨认起点复制的起始复制的起始 辨认起点辨认起点(举例,特点)(举例,特点)复制起点的一般特征复制起点的一般特征:由由
23、多个独特的短重复序列多个独特的短重复序列组成。组成。短重复序列能够被酶识别并结合。短重复序列能够被酶识别并结合。一般一般富含富含A、T,利于双螺旋,利于双螺旋DNA解旋,以产解旋,以产生单链生单链DNA复制模板。复制模板。第36页,讲稿共76张,创作于星期二模板模板DNA解除高级结构解除高级结构需要的酶:需要的酶:解螺旋酶、拓扑异构酶和解螺旋酶、拓扑异构酶和DNA结合蛋白结合蛋白复制的起始复制的起始 辨认起点辨认起点(举例,特点)(举例,特点)解除高级结构解除高级结构 (复制叉)(复制叉)详细作用过程详细作用过程第37页,讲稿共76张,创作于星期二经松弛经松弛DNA超螺旋结构后,解开一段双链,
24、并由超螺旋结构后,解开一段双链,并由DNA结合蛋白保护和稳定结合蛋白保护和稳定DNA单链,形成复制点,又称为单链,形成复制点,又称为复复制叉。制叉。复制的起始复制的起始 辨认起点辨认起点(举例,特点)(举例,特点)解除高级结构解除高级结构 (复制叉)(复制叉)第38页,讲稿共76张,创作于星期二引物引物RNA的合成的合成需要的酶:需要的酶:引物酶引物酶合成过程:合成过程:当两股单链暴露出足够数量碱基对时,引当两股单链暴露出足够数量碱基对时,引物酶发挥作用。物酶发挥作用。引物酶能识别复制起点引物酶能识别复制起点,并以四种核,并以四种核糖核苷酸为原料,以解开的一段糖核苷酸为原料,以解开的一段DNA
25、链为模板,按碱链为模板,按碱基配对规律,基配对规律,从从5 3 方向合成引物方向合成引物RNA片段片段。主要作用:提供了引物主要作用:提供了引物3-OH末端末端复制的起始复制的起始 引物合成引物合成 辨认起点辨认起点(举例,特点)(举例,特点)解除高级结构解除高级结构 (复制叉)(复制叉)第39页,讲稿共76张,创作于星期二为什么需要有为什么需要有RNA引物来引发引物来引发DNA复制呢复制呢?复制的起始复制的起始这可能为尽量这可能为尽量减少减少DNA复制起始处的突变复制起始处的突变有关。有关。DNA复制复制开始处的几个核苷酸最容易出现差错开始处的几个核苷酸最容易出现差错,因此,用,因此,用RN
26、A引物即使出现差错最后也要被引物即使出现差错最后也要被DNADNA聚合酶聚合酶切除,切除,提高了提高了DNA复制的准确性。复制的准确性。引物合成引物合成 辨认起点辨认起点(举例,特点)(举例,特点)解除高级结构解除高级结构 (复制叉)(复制叉)第40页,讲稿共76张,创作于星期二2.2.复制的延伸复制的延伸需要的酶:需要的酶:DNA聚合酶聚合酶(真核细胞为(真核细胞为DNA Pol )半不连续复制半不连续复制前导链前导链随从链随从链如何保持前导链与随后链合成的协调一致如何保持前导链与随后链合成的协调一致?突环突环复制的起始复制的起始复制的延伸复制的延伸 引物合成引物合成 辨认起点辨认起点(举例
27、,特点)(举例,特点)解除高级结构解除高级结构 (复制叉)(复制叉)第41页,讲稿共76张,创作于星期二3.3.复制的终止(完整复制的终止(完整DNA链链的形成)的形成)复制的起始复制的起始复制的延伸复制的延伸复制的终止复制的终止辨认起点辨认起点(举例,特点)(举例,特点)解除高级结构解除高级结构(复制叉)(复制叉)引物合成引物合成1 1)水解引物及填补空隙)水解引物及填补空隙 冈崎片段合成后,由冈崎片段合成后,由DNA pol(真核细胞可能是真核细胞可能是DNA聚合酶聚合酶)水解去除水解去除RNA引物引物,并,并填补填补留下的留下的空隙空隙(5 3)聚合。聚合。第42页,讲稿共76张,创作于
28、星期二3.3.复制的终止(完整复制的终止(完整DNA链链的形成)的形成)复制的起始复制的起始复制的延伸复制的延伸复制的终止复制的终止辨认起点辨认起点(举例,特点)(举例,特点)解除高级结构解除高级结构(复制叉)(复制叉)引物合成引物合成2 2)完整双链)完整双链DNA分子的形成分子的形成 填补空隙后,填补空隙后,DNA片段与片段之间还有一个缺口片段与片段之间还有一个缺口(一个一个3,5-磷酸二酯键的长度磷酸二酯键的长度),),由由DNA连接酶连接酶催化连接催化连接成完整的链,从而产生成完整的链,从而产生完整的双链完整的双链DNA分子分子。第43页,讲稿共76张,创作于星期二前导链前导链产生完整
29、的产生完整的子染色单体。子染色单体。后随链后随链3 3 端留下缩端留下缩短的未复制的短的未复制的ssDNA区区。破坏了遗传信破坏了遗传信息的完整息的完整如何保证染色体的稳定性?如何保证染色体的稳定性?端粒酶端粒酶第44页,讲稿共76张,创作于星期二DNA复制的全过程复制的全过程小结小结包括三个阶段包括三个阶段起始、延伸、终止起始、延伸、终止起始起始复制起点;复制起点;解除模板解除模板DNA超螺旋及双螺旋;超螺旋及双螺旋;引物合成;引物合成;延伸延伸冈崎片断、冈崎片断、半不连续复制半不连续复制终止终止引物水解,连接引物水解,连接DNA片段片段观看观看DNA复制动画复制动画第45页,讲稿共76张,
30、创作于星期二DNA复制的精确性(高保真复制)复制的精确性(高保真复制)DNA复制必须具有复制必须具有高度精确性高度精确性,在大肠杆菌的细胞,在大肠杆菌的细胞DNA复制中其复制中其错误率约为错误率约为1/101/109 91/101/101010,即每即每10109 910101010个个核苷酸才出现一个错误,也就是大肠杆菌染色体核苷酸才出现一个错误,也就是大肠杆菌染色体DNA复制复制100010001000010000次才出现一个核苷酸的错误。次才出现一个核苷酸的错误。这么高的精确性的保证主要与下列因素有关:这么高的精确性的保证主要与下列因素有关:第46页,讲稿共76张,创作于星期二1 1、碱
31、基的配对规律:、碱基的配对规律:摸板链与新生链之间的碱基配对保摸板链与新生链之间的碱基配对保证碱基配错几率约为证碱基配错几率约为1/101/104 41/101/105 5。2 2、DNA聚合酶的校对功能,聚合酶的校对功能,使碱基的错配几率又降低使碱基的错配几率又降低10010010001000倍。倍。3 3、DNA的损伤修复系统。的损伤修复系统。主要因素:主要因素:第47页,讲稿共76张,创作于星期二(四)(四)DNA的突变的突变它是指在各种因素作用下,它是指在各种因素作用下,DNA分子中的碱基或片断发分子中的碱基或片断发生改变生改变,通过,通过DNA的复制遗传给后代,表现出异常的遗传特的复
32、制遗传给后代,表现出异常的遗传特征。征。DNA的突变形式主要有:的突变形式主要有:一个或几个碱基对被置换;一个或几个碱基对被置换;插入一个或几个碱基对;插入一个或几个碱基对;一个或多个碱基对缺失。一个或多个碱基对缺失。第48页,讲稿共76张,创作于星期二影响因素:影响因素:自发突变、化学因素、物理因素或病毒自发突变、化学因素、物理因素或病毒例如:电离辐射、紫外线、化学诱变剂例如:电离辐射、紫外线、化学诱变剂常见常见DNA损伤损伤:碱基丢失、碱基变化、错误的碱基、缺:碱基丢失、碱基变化、错误的碱基、缺失或插入、嘧啶二聚体、链断裂、链交联失或插入、嘧啶二聚体、链断裂、链交联第50页,讲稿共76张,
33、创作于星期二第三节第三节 RNA的生物合成的生物合成第53页,讲稿共76张,创作于星期二RNA的生物合成主要分为的生物合成主要分为转录转录和和自我复制自我复制两种形式两种形式 体内体内RNA合成的主要方式合成的主要方式 以以DNA分子为模板合成出分子为模板合成出RNA分子的过程称为转录。分子的过程称为转录。自我复制:一些自我复制:一些RNA病毒以病毒以RNA模板合成模板合成RNA。第54页,讲稿共76张,创作于星期二一、一、RNA的转录的转录首先,认识首先,认识RNA转录体系转录体系包括:包括:DNA模板模板四种核糖核苷酸(四种核糖核苷酸(NTP)RNA聚合酶聚合酶某些蛋白质因子及必要的无机离
34、子某些蛋白质因子及必要的无机离子第55页,讲稿共76张,创作于星期二(一)(一)RNA转录的特征转录的特征以以DNA一条链的片断为模板一条链的片断为模板 称为称为模板链模板链 1.模板模板另一条链称为编码链另一条链称为编码链转录的不对称性转录的不对称性 5 CGCTATAGCGTTT 3 DNA编码链编码链3 GCGATATCGCAAA 5 DNA模板链模板链5 CGCUAUAGCGUUU 3 RNA转录物转录物模板链并非永远在同一条单链上模板链并非永远在同一条单链上第56页,讲稿共76张,创作于星期二2.参与转录的酶参与转录的酶原核生物只有原核生物只有1种种RNA聚合酶聚合酶真核生物具有真核
35、生物具有3种不同的种不同的RNA聚合酶,聚合酶,RNA聚合酶聚合酶、RNA聚合酶聚合酶 和和RNA聚合酶聚合酶以大肠杆菌以大肠杆菌RNA聚合酶为例聚合酶为例第57页,讲稿共76张,创作于星期二核心酶核心酶(core enzyme)全酶全酶(holoenzyme)RNA聚合酶是多亚基酶聚合酶是多亚基酶大肠杆菌大肠杆菌RNA聚合酶聚合酶 亚基能特异性地识别亚基能特异性地识别DNA模板链上的起始部位。模板链上的起始部位。第58页,讲稿共76张,创作于星期二3.RNA转录的方向转录的方向 RNA聚合酶通过在聚合酶通过在RNA的的3-羟基端加入核苷酸延长羟基端加入核苷酸延长RNA链,链,以以5 到到3
36、方向方向合成合成RNA。4.其它特征其它特征RNA聚合酶聚合酶不需要引物不需要引物就能直接启动就能直接启动RNA链的延长。链的延长。在在RNA合合成成中中会会形形成成RNA-DNA杂杂合合双双螺螺旋旋和和转转录录泡泡的的特特殊殊结构。结构。RNA聚合酶向前移动时,聚合酶向前移动时,DNA双螺旋伴有拓扑学的结构变化。双螺旋伴有拓扑学的结构变化。RNA聚合酶和聚合酶和DNA的特殊序列的特殊序列启动子结合后,就能启动启动子结合后,就能启动RNA合成。合成。第59页,讲稿共76张,创作于星期二E.coli的的RNA聚合酶催化的转录过程聚合酶催化的转录过程第60页,讲稿共76张,创作于星期二DNA复制特
37、征和复制特征和RNA转录特征的比较转录特征的比较DNA复制复制RNA转录转录模板模板两条单链均复制两条单链均复制模板链转录(不对称转录)模板链转录(不对称转录)原料原料4种脱氧核糖核苷酸种脱氧核糖核苷酸4种核糖核苷酸种核糖核苷酸酶酶DNA聚合酶聚合酶RNA聚合酶聚合酶产物产物子代双链子代双链DNA(半保留复制(半保留复制)mRNA,tRNA,rRNA配对配对A-T,G-CA-U,T-A,G-C第61页,讲稿共76张,创作于星期二(二)转录的过程(二)转录的过程RNA转录过程可分为转录过程可分为起始、延伸、终止起始、延伸、终止三个阶段三个阶段 1.起始起始包括四个方面包括四个方面第62页,讲稿共
38、76张,创作于星期二亚基亚基起着识别起着识别DNA分子上起始信号的作用分子上起始信号的作用 识别启动子识别启动子RNA聚合酶结合模板聚合酶结合模板DNA的部位,称为的部位,称为启动子启动子(promoter)。第63页,讲稿共76张,创作于星期二生成封闭型启动子复合物生成封闭型启动子复合物 得到开放型的启动子复合物得到开放型的启动子复合物 亚基被释放脱离核心酶亚基被释放脱离核心酶 DNA构象活化构象活化 解开解开DNA双链,识别其中的模板链双链,识别其中的模板链 该部位应该富含该部位应该富含A-T碱基对,有利于碱基对,有利于DNA解链解链 动画演示转录启动过程.第64页,讲稿共76张,创作于星
39、期二 形成闭合启动子复合体形成闭合启动子复合体形成开放启动子复合体形成开放启动子复合体RNA聚合酶识别结合启动子聚合酶识别结合启动子转录开始转录开始启动子清除启动子清除 转转 录录 延延 伸伸5335-35 -10 +1第65页,讲稿共76张,创作于星期二 另外:另外:在起始位点的全酶结合第一个三磷酸核苷常是在起始位点的全酶结合第一个三磷酸核苷常是GTP或或ATP。形成的启动子、全酶和三磷酸核苷复合物称为形成的启动子、全酶和三磷酸核苷复合物称为三元起始复合物三元起始复合物。第一个核苷酸掺入的位置称。第一个核苷酸掺入的位置称为为转录起始点转录起始点。第66页,讲稿共76张,创作于星期二53 2.
40、延伸延伸 核心酶沿模板移动,并按模板序列选择下一个核苷酸,将核苷酸核心酶沿模板移动,并按模板序列选择下一个核苷酸,将核苷酸加到生长加到生长的的RNA链链3-OH端,催化形成磷酸二酯键。端,催化形成磷酸二酯键。RNA-DNA的杂交区的杂交区 53 杂交区结合不太牢固,解链后,杂交区结合不太牢固,解链后,DNA又恢复双螺旋结构又恢复双螺旋结构 第67页,讲稿共76张,创作于星期二3.终止终止 在在DNA分子上有引起终止转录的特殊碱基序列称为分子上有引起终止转录的特殊碱基序列称为终止子终止子。分为依赖分为依赖因子型和非依赖因子型和非依赖因子型因子型以非依赖以非依赖因子型为例说明因子型为例说明第68页
41、,讲稿共76张,创作于星期二5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU.3 5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU.3 RNA 5 TTGCAGCCTGACAAATCAGGCTGATGGCTGGTGACTTTTTAGTCACCAGCCTTTTT.3 DNA UUUU.UUUU.5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU.3茎环茎环/发夹结构发夹结构第69页,讲稿共76张,创作于
42、星期二(三)转录后的修饰、加工(三)转录后的修饰、加工 转录中新合成的转录中新合成的RNA往往是往往是前体分子,前体分子,需要经过进一步的加工修需要经过进一步的加工修饰,才转变为饰,才转变为具有生物学活性的、成熟的具有生物学活性的、成熟的RNA分子分子,这一过程称为转录后,这一过程称为转录后修饰、加工。修饰、加工。主要包括剪接、剪切和化学修饰三种加工方式。主要包括剪接、剪切和化学修饰三种加工方式。结合上方式,以加工结合上方式,以加工mRNA为例进行说明为例进行说明第70页,讲稿共76张,创作于星期二1mRNA的转录后加工的转录后加工 以真核细胞以真核细胞mRNA的加工为例,进行说明的加工为例,
43、进行说明 真核细胞的真核细胞的mRNA由由RNA前体前体核内分子量较大而不均一核内分子量较大而不均一的的RNA(称为称为核内不均一核内不均一RNA,hnRNA)加工而成加工而成。分为剪接、加分为剪接、加“帽帽”、加多聚腺苷酸的、加多聚腺苷酸的“尾尾”、修饰、修饰 第71页,讲稿共76张,创作于星期二剪接剪接 转录转录 外显子外显子1 1 内含子内含子外显子外显子2 2 55 33 55 33 33 55 外显子外显子1 1 外显子外显子2 2 核酸内切酶核酸内切酶RNARNA拼接酶拼接酶 内含子内含子DNADNA 第72页,讲稿共76张,创作于星期二5加加“帽帽”5末端连接上一个末端连接上一个“帽子帽子”结构的结构的m7GpppmNP第73页,讲稿共76张,创作于星期二加多聚腺苷酸的加多聚腺苷酸的“尾尾”3末端连接上一段约有末端连接上一段约有20200个腺苷酸的多聚腺苷酸个腺苷酸的多聚腺苷酸(poly A)的)的“尾巴尾巴”结构结构 第74页,讲稿共76张,创作于星期二修饰修饰核糖的核糖的2-羟基被甲基化羟基被甲基化第75页,讲稿共76张,创作于星期二感感谢谢大大家家观观看看第76页,讲稿共76张,创作于星期二