医学数据统计处理及SAS软件的应用.pptx

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1、SAS软件简介软件简介SAS是美国与西欧使用最为广泛的三大著名统计分析软件(SAS,SPSS和SYSTAT)之一,是目前国际上最为流行的一种大型统计分析系统,被誉为统计分析的标准软件。是国际上公认的最权威的统计软件。以苛刻严格著称于世的美国FDA新药审批程序中,新药试验结果的统计分析规定只能用SAS进行,其他软件的计算结果一律无效!哪怕只是简单的均数和标准差也不行!由此可见SAS的权威地位。2004年开始中国新药临床试验结果规定应用SAS软件分析。第1页/共86页SAS与SPSS比较作为统计软件大家族里的“傻瓜相机”,SPSS的功能是最弱的,但易用性排在所有统计软件之首。不过SPSS的易用性也

2、极大的限制了它的功能和可扩展性。除了SPSS本身的菜单提供的功能,用户无法通过编程或者插件来扩展它的功能,而且SPSS提供的都只是最基本的常用的方法。第2页/共86页SAS全球专业认证全球专业认证SAS专业认证是一项拥有极高国际声誉的专业认证,在欧美等国的职场上流行的一句话“IfyouhaveaSAScertification,Youwillneverloseyourjob”。销售模式:只租不售(每5年一个周期)财富500强中97%的企业都在使用SAS商业智能解决方案 第3页/共86页第4页/共86页20032003年年(301(301医院与军事医科院博医院与军事医科院博士生)各统计软件使用情

3、况士生)各统计软件使用情况第5页/共86页Pubmed检索检索SCI英文文献各统计软件使用英文文献各统计软件使用情况情况第6页/共86页SAS软件功能软件功能进行数据管理进行数据管理l数据输入、建库、保存数据输入、建库、保存 进行统计分析进行统计分析lt t检验检验l方差分析方差分析l卡方检验卡方检验l相关、回归相关、回归l秩和检验秩和检验l第7页/共86页SAS的安装的安装 SAS8.12版本是windows操作系统下的32位软件,和其他windows系统下的软件安装方法类似。用鼠标左键双击光盘根目录下的setup图标,然后按照提示安装。第8页/共86页SAS的启动的启动 单击开始菜单“程序

4、”项。桌面上双击此快捷方式也可启动SAS。第9页/共86页执行开始菜单中程序单项【程序】【TheSASSystem】【TheSASSystemforWindows】第10页/共86页SAS退出退出方式方式1 1:选择关闭按钮:选择关闭按钮方式方式2 2:执行菜单命令:执行菜单命令【FileFile】【ExitExit】方式方式3 3:在命令框执行:在命令框执行BYEBYE或或ENDSASENDSAS命令命令第11页/共86页SASSAS窗口窗口PGM窗口(ProgramEditor):提供编写SAS程序的文本编辑器LOG窗口:显示执行程序过程中的相关信息OUTPUT窗口:显示程序运行的结果命令

5、窗口与探索者窗口第12页/共86页程序编辑窗口日志窗口结果输出窗口探索者窗口命令窗口第13页/共86页第14页/共86页第15页/共86页第16页/共86页SAS程序的编写程序的编写 一个完整的SAS程序一般由数据步(DATA步)和过程步(PROC步)两部分组成。DATA步以DATA语句开始,通过指定数据集名称、定义变量名及类型和读入数据等建立SAS数据集。过程步以PROC语句开始,通过调用不同的分析模块来分析SAS数据集。第17页/共86页u其它格式的数据库直接导入转换:excel(.xls);dbase(.dbf);lotus(.wk)等u将数据读入系统,建立数据集(直接输入Editor窗

6、口)。SAS数据集建立数据集建立第18页/共86页外部数据导入外部数据导入例:有一批体检数据,包括受检者的姓名、性别、年龄、身高、体重信息。例:有一批体检数据,包括受检者的姓名、性别、年龄、身高、体重信息。要求按性别分别计算身高、体重的描述性统计量:均值、标准差、最大值、要求按性别分别计算身高、体重的描述性统计量:均值、标准差、最大值、最小值。最小值。该数据以该数据以Excel.xls文件形式储存。文件形式储存。文件名称:文件名称:tijiandata.xls第19页/共86页第20页/共86页ImportData第21页/共86页第22页/共86页第23页/共86页第24页/共86页库标记导

7、入的SAS数据库文件名第25页/共86页第26页/共86页探索者窗口第27页/共86页第28页/共86页第29页/共86页在在Editor 程序编辑窗口输入源程程序编辑窗口输入源程序序数据步:将数据读入系统,建立数据集:DATA语句开始,后面加上数据库的名字。INPUT语句描述数据变量,用$表示变量是字符型CARDS语句指示后面是数据,每行为一个观测数据,数据间无分号。数据最后以“;”开头的空行结束。每个语句都以“;”结束。第30页/共86页SAS程序数据步格式程序数据步格式Data;Input$.;Cards;.;第31页/共86页数据步 过程步第32页/共86页SAS过程步过程步对数据集中

8、数据进行分析、处理。以PROC语句开始,调用SAS过程。每个语句都以“;”结束。整个程序最后要有RUN语句。第33页/共86页过程步第34页/共86页SAS程序的书写格式程序的书写格式不分大小写单个名称中不能空格,不同名称间必须空格一行可写多条语句,用分号分割一条语句可写多行数据行后不加分号,数据最后单独加分号行程序用“RUN;”语句结束第35页/共86页运行运行SAS程序程序方式一:鼠标点击执行按钮方式一:鼠标点击执行按钮 方式二:按功能键方式二:按功能键“F8”方式三:执行菜单命令方式三:执行菜单命令 RunSubmit方式四:在命令框输入方式四:在命令框输入SUBMIT 命令命令并执行并

9、执行第36页/共86页第37页/共86页SAS程序实例程序实例 例子某学生上学期8门课程的分数分别为88,90,87,76,92,78,80,86。试用SAS编程求其平均分数。(1)在PGM窗口键入下列程序datafenshu;inputchengji;cards;8890877692788086;procmeans;varchengji;run;过程步 数据步第38页/共86页查看结果查看结果(output 窗口)窗口)AnalysisVariable:chengjiNMeanStdDevMinimumMaximum-884.62500005.878228676.000000092.0000

10、000-从结果看出,该学生上学期8门课程的平均成绩为84.625。第39页/共86页查看运行过程及出错信息查看运行过程及出错信息l激活激活LOG窗口窗口(F6)l黑色文字黑色文字:源程序及运行情况:源程序及运行情况l蓝色文字蓝色文字:程序运行情况的说明信:程序运行情况的说明信息息l红色文字红色文字:出错信息:出错信息l绿色文字绿色文字:警告信息:警告信息第40页/共86页第41页/共86页保存保存SAS程序程序及其他窗口内容及其他窗口内容l激活相应窗口,然后选择:方式一:鼠标点击“存盘”工具按钮方式二:执行菜单命令【File】【Save】/【Saveas】l可保存程序、数据文件、运行结果、日志

11、等。lSAS保存成纯文本格式文件(.txt)。第42页/共86页保存的文件的名第43页/共86页在在SAS系统内打开已保存的文件系统内打开已保存的文件只能在ProgramEdit窗口打开文件,选择:方式一:鼠标点击“打开”工具按钮方式二:执行菜单命令【File】【Open】可打开以前保存的程序、数据文件、运行结果、日志等文件及其他文本格式的文件。第44页/共86页SAS程序主要关键词程序主要关键词means;(n,mean,std,Q1,Q3,CV,median,clm)univariatenormal;(正态性检验,均数是否为0的假设检验:参数与非参数检验)ttest;(两个样本均数比较的t

12、检验)anova;(各样本含量相等的方差分析)glm;(各样本含量不等的方差分析)npar1way;(非参数检验)reg;(线性回归方程:单元或多元)corr;(线性相关:线性相关或秩相关)freq;(卡方、Fisher检验)logistic;(非线性回归)lifetest;(生存分析)proc第45页/共86页定量资料的描述性分析第46页/共86页分析结果第47页/共86页定量资料的正态性检验第48页/共86页正态性检验结果第49页/共86页配对设计的配对设计的t-test 为了比较两种方法对乳酸饮料中脂肪的含量测定结果是否不同,随机抽取了10份乳酸饮料制品,分别采用哥特里-罗紫法和脂肪酸水

13、解法测定其结果,问两种方法检测结果是否不同?编号编号哥特里哥特里-罗罗紫法紫法脂肪酸水解脂肪酸水解法法1 10.840 0.840 0.580 0.580 2 20.591 0.591 0.509 0.509 3 30.674 0.674 0.500 0.500 4 40.632 0.632 0.316 0.316 5 50.687 0.687 0.337 0.337 6 60.978 0.978 0.517 0.517 7 70.750 0.750 0.454 0.454 8 80.730 0.730 0.512 0.512 9 91.200 1.200 0.997 0.997 10100.

14、870 0.870 0.506 0.506 第50页/共86页第51页/共86页第52页/共86页成组设计资料的成组设计资料的t-test国产药国产药进口药进口药-5-5-17-1764644848636347477777606074745858-2-2-14-14898972727777484863636161707054543636222282826666-14-14采用国产药物和进口药物治疗绝经后妇女骨质疏松症,试比较两种药物的疗效是否有差别第53页/共86页第54页/共86页第55页/共86页完全随机设计资料的方差分析(完全随机设计资料的方差分析(教科书教科书73页)页)安慰剂组安慰剂

15、组2.4g2.4g组组4.8g4.8g组组7.2g7.2g组组3.53 3.53 2.42 2.42 2.86 2.86 0.89 0.89 4.59 4.59 3.36 3.36 2.28 2.28 1.06 1.06 4.34 4.34 4.32 4.32 2.39 2.39 1.08 1.08 2.66 2.66 2.34 2.34 2.28 2.28 1.27 1.27 3.59 3.59 2.68 2.68 2.48 2.48 1.63 1.63 3.13 3.13 2.95 2.95 2.28 2.28 1.89 1.89 4.04 4.04 2.63 2.63 2.32 2.32

16、 1.74 1.74 3.53 3.53 2.86 2.86 2.61 2.61 2.16 2.16 3.65 3.65 2.93 2.93 3.64 3.64 3.37 3.37 3.85 3.85 2.17 2.17 2.58 2.58 2.97 2.97 4.07 4.07 2.72 2.72 3.65 3.65 1.69 1.69 3.93 3.93 2.22 2.22 3.68 3.68 2.11 2.11 4.19 4.19 2.90 2.90 2.65 2.65 2.81 2.81 2.96 2.96 2.97 2.97 3.02 3.02 2.52 2.52 第56页/共86页

17、第57页/共86页方差齐性检验方差齐性检验第58页/共86页第59页/共86页第60页/共86页第61页/共86页第62页/共86页第63页/共86页第64页/共86页四格表资料的四格表资料的2-test组别有效无效合计有效率胞磷胆碱4665288.5%神经节苷脂1882669.2%合计64147882.1%某医师欲比较胞磷胆碱与神经节苷脂治疗脑血管疾病的疗效,将78例脑血管疾病患者随机分为两组,试比较两种药物的疗效第65页/共86页第66页/共86页第67页/共86页第68页/共86页配对四格表资料的配对四格表资料的2 2-test-test配对设计的卡方检验第69页/共86页第70页/共8

18、6页第71页/共86页第72页/共86页非参数检验(配对)第73页/共86页第74页/共86页第75页/共86页非参数检验非参数检验9D9D11C11CDSCDSC2 25 53 32 25 55 52 26 66 63 36 66 64 46 66 64 47 77 74 48 87 75 510109 97 7121210107 711111111比较小白鼠接种三种不同菌型伤寒杆菌9D、11C、DSC1后存活的日数。第76页/共86页第77页/共86页第78页/共86页第79页/共86页第80页/共86页第81页/共86页直线相关与回归直线相关与回归年龄年龄尿肌酐含量尿肌酐含量13133.543.5411113.013.019 93.093.096 62.482.488 82.562.5610103.363.3612123.183.187 72.652.65某地方病研究所调查了8名正常儿童的尿肌酐含量,试估计尿肌酐含量对其年龄的回归方程。第82页/共86页回归相关第83页/共86页第84页/共86页第85页/共86页感谢您的观看!第86页/共86页

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