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1、第二章 核酸的结构与功能 1.DNA变性(Denaturation of DNA):双链 DNA(dsDNA)在变性因素(如过酸、过碱、加热、尿素等)影响下,解链成单链 DNA(ssDNA)的过程称之为 DNA变性。DNA变性后,生物活性丧失,但一级结构没有改变,所以在一定条件下仍可恢复双螺旋结构。2 核酸分子杂交(hybridization of nucleic acids):在复性过程中,将不同来源的DNA单链分子或 RNA分子放在同一溶液中,只要在 DNA或 RNA的单链分子之间存在着一定程度的碱基配对关系,就可以在不同的分子间形成杂化双链,这种现象称为核酸分子杂交。3 增色效应(hyp
2、erchromic effect):DNA变性时,双螺旋松解,碱基暴露,OD260值增高称之为增色效应。4 探针:探针是经过特殊标记的核酸片段,具有特定的序列,能够与待测的核酸片段互补结合,因此可用于检测核酸样品中的基因。第十章 DNA的生物合成 1.中心法则:遗传信息从 DNA通过转录流向 RNA,RNA通过翻译指导合成蛋白质,这种遗传信息的传递规律称之。少数 RNA也是遗传信息的贮存者,RNA能逆转录为 DNA,是对中心法则的补充。2.半保留复制(semiconservative replication):DNA生物合成时,母链 DNA解开为两股单链,每股单链分别作为模板,以 dNTP(d
3、ATP、dGTP、dCTP、dTTP)为原料,按照碱基配对(AT、G C)规律与模板上的碱基配对,经依赖 DNA的 DNA聚合酶(DNA-pol)催化,合成一条与模板互补的新链,新形成的两个子代 DNA 与亲代 DNA碱基序列一致,子代 DNA分子中一股单链是从亲代完整地接受过来,另一股单链是新合成的,故称为半保留复制。3.逆转录和逆转录酶(reverse transcription and reverse transcriptase):指遗传信息从 RNA流向 DNA。即以 RNA为模板,dNTP为原料,在逆转录酶催化下,合成与 RNA互补的双链 DNA的过程。逆转录酶(依赖 RNA的 DN
4、A聚合酶)为多功能酶,具有三种酶活性:1)RNA指导的 DNA聚合酶:利用病毒 RNA作模板合成一条互补 DNA链;2)RNase H:水解 RNA-DNA杂化双链中的 RNA链;3)DNA指导的 DNA聚合酶:以新合成的 DNA链为模板合成另一条互补 DNA链。第十一章 RNA的生物合成 1.不对称转录(asymmetric transcription):有两重含义,一是指双链 DNA分子中只有一股单链作为转录模板(模板链),另一股链不转录;二是模板链并非永远在同一单链上。2.断裂基因(split gene):真核生物的结构基因是由若干个编码区和非编码区互相间隔但又连续镶嵌而成,这些基因称为
5、断裂基因。3.外显子和内含子(exon and intron):在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表达为RNA的核酸序列称为外显子。内含子是隔断基因线性表达而在剪接过程中被除去的核苷酸序列。第十二章 蛋白质的生物合成 1.多聚核蛋白体(polyribosome):由一个 mRNA分子与一定数目的单个核蛋白体结合而成,呈串珠状排列。每个核蛋白体可以独立完成一条肽链的合成,所以多核蛋白体上可以同时进行多条肽链的合成,可以加速蛋白质合成速度,提高 mRNA的利用率。2.信号肽(signal peptide):各种新生分泌蛋白的 N 端存在保守的氨基酸序列称信号肽,约 13-36个氨基酸残基,可分为
6、 N 端碱性区、疏水区和 C 端加工区三个区段。可将合成的蛋白质引导至细胞的适当靶部位,是决定蛋白质靶向输送特性的重要元件。3 开放阅读框架(open reading frame,ORF):从 mRNA 5端起始密码子 AUG到 3 端终止密码子之间的核苷酸序列,各个三联体密码连续排列编码一条蛋白质多肽链,称为开放阅读框架。第十三章 基因表达调控 1 顺式作用元件(cis-acting element):指可影响自身基因表达活性的真核 DNA序列。它们通过 DNA-蛋白质和蛋白质-蛋白质间的相互作用最终影响 RNA聚合酶的活性而调节转录。根据它们在基因中的位置,作用性质及发挥作用的方式,分为启
7、动子,增强子及沉默子等。2 反式作用因子(trans-acting factor):是一类可以调节真核基因转录的蛋白因子,大多数真核转录调节因子由某一基因表达后,通过与特异的顺式作用元件相互作用(DNA-蛋白质相互作用)反式作用于另一基因的转录,故称反式作用蛋白或反式作用因子。3 操纵子(operon):原核生物的几个功能相关的结构基因往往排列在一起,转录生成一段 mRNA,然后分别翻译成几种不同的蛋白质。这些蛋白可能是催化某一代谢过程的酶,或共同完成某种功能。这些结构基因及其上游的启动序列,操纵序列及其它调控序列共同构成一个转录单位,称为操纵子 4 增强子(enhancer):真核生物基因上
8、远离转录起始点(1 30kb)、决定基因的时间、空间特异性表达、增强启动子转录活性的 DNA序列,其发挥作用的方式通常与方向、距离无关。5 管家基因:某些基因产物对生命全过程都是必需的或必不可少的。这类基因在一个生物体的各个生长阶段和几乎所有组织细胞中持续表达,且其表达较少受环境因素的影响,这类基因被称为管家基因。第十四章 基因重组与基因工程 1 DNA克隆(DNA clone):又称基因克隆或重组 DNA,就是应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质(同源的或异源的、原核的或真核的、天然的或人工的DNA)与载体 DNA结合成一具有自我复制能力的DNA分子复制子,继而通过转化或转染宿主细胞,
9、筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增、提取获得大量同一 DNA分子,这个过程称作 DNA克隆。2.基因组 DNA文库(gene library):是指包含某一生物细胞全部基因组 DNA序列的克隆群体,它以 DNA片段的形式贮存着该生物的全部基因组 DNA的信息。其构建过程是分离生物体的全部染色体 DNA,用限制性核酸内切酶随机切割成长短大致相同的数以万计的片段,将所有片段重组于同一类载体上,便得到许多重组体,将重组体全部转化入宿主菌中保存起来,就形成基因文库。3.cDNA文库(cDNA library):包含某一组织细胞在一定条件下所表达的全部 mRNA经反转录而合成的 cDNA序列的克
10、隆群体,它以 cDNA片段的形式贮存着该组织细胞的基因表达信息。其构建过程是将细胞表达的所有 mRNA经反转录合成 cDNA,与适当的载体连接后,转入宿主细胞而获得的克隆群体,包含了细胞表达的各种 mRNA信息。第十五章 细胞信息转导 2 第二信使(secondary messenger):通常将 Ca2+、DAG、IP3、Cer、cAMP、cGMP等在细胞内传递信息的小分子化合物称为第二信使,其作用是对胞外信号起转换和放大的作用。细胞表面受体接受胞外信号后,经过信号转换激活质膜上的效应器,产生细胞内的信息物质第二信使,进一步将信息传递到细胞内,产生相应的生物学效应。第二十章 癌基因、抑癌基因
11、与生长因子 1 癌基因(oncogene):癌基因是指能在体外引起细胞转化、在体内诱导肿瘤的基因,分为病毒癌基因和细胞癌基因。2 抑癌基因(anti-oncogene):是一类抑制细胞过度生长、繁殖从而遏制肿瘤形成的负调节基因。它与调控生长的原癌基因协调表达以维持细胞正常生长、增殖和分化。抑癌基因的丢失或失活不仅丧失抑癌作用,也可能变成具有促癌作用的癌基因而导致肿瘤的发生。第二十二章 常用分子生物学技术的原理及其应用 1 Southern blotting:又称为 DNA印迹技术。是将基因组 DNA经限制性内切酶消化后进行琼脂糖凝胶电泳,变性处理后再利用毛细作用将胶中的 DNA分子转移并固定到
12、膜性支持物上(NC 膜)进行杂交反应的技术。主要用于基因组 DNA的定性和定量分析,亦可分析重组质粒和噬菌体。2 Northern blotting:又称为 RNA印迹技术。指 RNA经琼脂糖凝胶电泳分离后转移至膜性支持物上(NC膜)用于杂交反应的技术。主要用于检测某一组织或细胞中已知的特异 mRNA的表达水平以及比较不同组织和细胞中的同一基因的表达情况 3 Western blotting:又称蛋白质印迹术或免疫印迹技术。指蛋白质经聚丙烯酰胺凝胶电泳分离之后转移(电转)到膜性支持物上(NC膜),再与溶液中的抗体探针相互结合的技术。主要用于检测样品中特异性蛋白质的存在、细胞中特异蛋白质的半定量分析以及蛋白质分子间的相互作用研究等。核酶(ribozyme):具有催化作用的核糖核酸。管家基因(housekeeping gene)和基本(组成性)表达(constitutive gene expression):有些基因产物对生命全过程都是必需的或必不可少的。这类基因在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达,通常被称为管家基因。管家基因的表达水平受环境因素影响较小,在生物体的各个生长阶段的几乎所有组织中持续表达,或变化很小,称为基本表达。基本表达只受启动序列或启动子与 RNA 聚合酶相互作用的影响,不受其他机制调节。