鳄蜥线粒体基因组全序列及其结构分析.docx

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1、鳄蜥线粒体基因组全序列及其结构分析摘要:采用PCR扩增方法测定了鳄蜥关键词:鳄蜥(ShiniaurucrocodiluruAhl。);线粒体基因组;控制区MitochondrialGenomeofShiniaurucrocodiluruandItStructureQINPing-heng,TAOChun-rong,SHEYing,HOULi-ia,YANGiao-wen,WUZheng-jun,QINin-min(CollegeofLifeScience,GuangiNormalUniverity、GuangiKeyLaboratoryofRareandEndangeredAnimalEcol

2、ogy,Guilin541004,Guangi,China)Keyword:ShiniaurucrocodiluruAhl。;mitochondrialgenome;controlregion鳄蜥(ShiniaurucrocodiluruAhl。)隶属有鳞目鳄蜥科(Shiniauridae)鳄蜥属(Shiniauru),为独科独属独种动物,分布于中国广东、广西以及越南北部1。鳄蜥为第四纪冰川末期残留下来的古老爬行类动物,有“活化石之称”,其分类地位非常特殊,因此其在爬行纲动物的起源、演化和分类等方面的研究上,有着重要的学术价值。近年来,由于人为捕捉,栖息环境被污染、破坏,鳄蜥种群数量急剧下降,

3、目前在我国已不足1000只,已处于极度濒危的状况,被国家列为级保护动物,并被列入濒危物种国际贸易公约(ConventiononInternationalTradeinEndangeredSpecie)附录。目前,关于鳄蜥的研究主要集中在物种资源调查、生态、行为、生理和繁殖等方面1-6。动物线粒体DNA是研究物种系统发育、种群遗传变异和分化、起源与进化的有效遗传标记。试验测定了鳄蜥的线粒体基因组全序列,以期为鳄蜥的遗传结构、起源进化以及种质资源保护等相关研究提供分子信息。1材料与方法1、1材料鳄蜥死亡个体尾部肌肉。1、2基因组DNA的提取基因组DNA的提取参照汪永庆等7的方法。1、3引物的设计参

4、考爬行动物通用引物扩增12SrRNA、16SrRNA、ND2、ND3、COI、COIII、ND5、ND6和Cytb基因的部分片段,根据上述片段的测序结果,利用Primer5、0软件设计引物,用以扩增短片段之间的长片段序列,所用引物见表1。1、4PCR扩增测序2、2蛋白质编码基因3小结目前,国内外有关鳄蜥的研究主要集中在生态、行为、生理、和人工饲养等方面。本研究分析了鳄蜥线粒体基因组全序列,包括了13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个控制区(D-loop)。结果表明,鳄蜥线粒体基因组中基因的组成、顺序、编码链的选择、tRNA的结构都与爬行动物相同或相近。结果可为鳄蜥的分类、进化和系统发育等方面提供分子依据。

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