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1、第三章第三章化学办公软件化学办公软件ChemOffice 3.3 ChemFinder 3.3.1 ChemFinder简介简介 ChemFinder是一个智能型的快速化学搜索引擎,是一个智能型的快速化学搜索引擎,所提供的所提供的ChemInfo是目前世界上最丰富的数据库之一,是目前世界上最丰富的数据库之一,包含包含ChemACX、ChemINDEX、ChemRXN、ChemMSDX等,并不断有新的数据库加入。等,并不断有新的数据库加入。Chem Finder可以从本机或网上搜寻可以从本机或网上搜寻Word、Excel、Power point、ChemDraw、ISIS格式的分子结构文件,还可
2、格式的分子结构文件,还可以与以与Excel结合。可连接的关系式数据库包括结合。可连接的关系式数据库包括Oracle及及Access,输入的格式包括,输入的格式包括ChemDraw、MDL ISIS SD及及RD文件等。文件等。ChemFinder自带多个数据库,其数据库文件扩展自带多个数据库,其数据库文件扩展名为名为“sfw”。这些数据库存文件默认存放在:。这些数据库存文件默认存放在:“C:Program FilesCambridgeSoftChemOffice 2008ChemFinderSamples”文件夹中。文件夹中。3.3.2 根据结构式检索根据结构式检索执行执行【开始开始】/【程序
3、程序】/【ChemOffice】/【Chem Finder Ultra 11.0】命令,启动命令,启动ChemFinder 首先打开的是首先打开的是【ChemFinder】对话框,包含三个选项对话框,包含三个选项卡,单击卡,单击【取消取消】在左侧在左侧Expelor窗口中最下端选择窗口中最下端选择【Favorites】,出,出现现“Favorites”文件夹,点击该文件夹文件夹,点击该文件夹双击选中双击选中“CS_DEMO.CFX”数据库,即打开该数据库数据库,即打开该数据库 在在【Structure】输入框中已经有了一个苯环结构,输入框中已经有了一个苯环结构,这是该数据库的一个结构,这是该数
4、据库的一个结构,【Formula】显示其分子式显示其分子式为为“C6H6”,【MolWeight】显示其分子量为显示其分子量为“78.1118”,【Molname】显示的是其英文文件名称显示的是其英文文件名称“Benzene”,【Synonyms】显示苯的所有别名。显示苯的所有别名。单击单击 【Enter Query】清空各窗口清空各窗口 双击双击【Structure】窗口,出现窗口,出现ChemDraw绘制分子式绘制分子式的工具栏的工具栏【Tools】。用用ChemDraw的的【Tools】工具绘制环丁烷,单击工具绘制环丁烷,单击 【Find】按钮查找。按钮查找。3.3.3 根据分子式检索根
5、据分子式检索 还可以直接输入分子式紧缩相关资料。还可以直接输入分子式紧缩相关资料。Chem Finder具有模糊检索功能,不必输入准确的分子式。具有模糊检索功能,不必输入准确的分子式。接前一步操作,单击接前一步操作,单击 【Enter Query】清空各窗口清空各窗口 单击单击【Formula】窗口,输入窗口,输入“C9H8O4”,按回车键,按回车键 单击单击 【Enter Query】清空各窗口清空各窗口单击单击【Formula】窗口,输入窗口,输入“C5-6 N2”,按回车键,按回车键 执行执行【View】/【Switch Views】命令,显示窗口变命令,显示窗口变成列表,每执行一次,显
6、示形式不同。成列表,每执行一次,显示形式不同。3.3.4 根据化学名称检索根据化学名称检索 可以直接输入化学名(英文名)检索相关资料。可以直接输入化学名(英文名)检索相关资料。Chem Finder具有模糊检索功能,检索化学名时可用通具有模糊检索功能,检索化学名时可用通配符表示不清楚的字符,我们也不必为分子的名称怎么配符表示不清楚的字符,我们也不必为分子的名称怎么拼写而发愁了。以查找尼古丁的分子式为例:拼写而发愁了。以查找尼古丁的分子式为例:接前一步操作,单击接前一步操作,单击 【Enter Query】清空各窗口清空各窗口 单击单击【Molname】窗口,输入窗口,输入“nico”,按回,按
7、回车键车键 单击工具栏上的单击工具栏上的 【Next Record】,可以显示出尼古,可以显示出尼古丁分子来丁分子来 3.3.5 根据相对分子质量检索根据相对分子质量检索 可以直接输入相对分子质量来检索相关分子。相对可以直接输入相对分子质量来检索相关分子。相对分子质量也可以模糊检索,只要大致确定一个范围就可分子质量也可以模糊检索,只要大致确定一个范围就可以了。以了。接前一步操作,单击接前一步操作,单击 【Enter Query】清空各窗口清空各窗口 单击单击【MolWeight】窗口,输入窗口,输入“160-170”,按回,按回车键车键 3.3.6 使用化学反应数据库使用化学反应数据库在左侧在
8、左侧Expelor窗口中最下端选择窗口中最下端选择【Favorites】,出现,出现“Favorites”文件夹,点击该文件夹文件夹,点击该文件夹双击选中双击选中“ISICCRsm.CFX”数据库,即打开该数据库,数据库,即打开该数据库,界面如下图界面如下图接前一步操作,单击接前一步操作,单击 【Enter Query】清空各窗口清空各窗口 双击化学反应窗口,双击化学反应窗口,ChemFinder自动启动自动启动Chem Draw并打开绘图工具栏并打开绘图工具栏用反应物检索相关化学反应式:用反应物检索相关化学反应式:绘制卤代苯分子和一个反应箭头,关闭窗口,卤代苯分绘制卤代苯分子和一个反应箭头,
9、关闭窗口,卤代苯分子自动进入化学反应窗口子自动进入化学反应窗口单击单击 【Find】按钮查找,若检索项较多,可单击按钮查找,若检索项较多,可单击 按钮逐个查看,或执行按钮逐个查看,或执行【View】/【Switch Views】命命令,显示窗口变成列表查看。令,显示窗口变成列表查看。用产物检索相关化学反应用产物检索相关化学反应单击单击 【Enter Query】清空各窗口清空各窗口 双击化学反应窗口,双击化学反应窗口,ChemFinder自动启动自动启动Chem Draw并打开绘图工具栏并打开绘图工具栏绘制一个反应箭头和卤代苯分子,关闭窗口,卤代苯分绘制一个反应箭头和卤代苯分子,关闭窗口,卤代
10、苯分子自动进入化学反应窗口子自动进入化学反应窗口单击单击 【Find】按钮查找,若检索项较多,可单击按钮查找,若检索项较多,可单击 按钮逐个查看,或执行按钮逐个查看,或执行【View】/【Switch Views】命命令,显示窗口变成列表查看令,显示窗口变成列表查看 3.3.7 查找免费网络资源查找免费网络资源 在在ChemFinder菜单栏上有一个菜单栏上有一个【Online】菜单,菜单,可以在线查找化学信息。如果计算机联网,可以根据相可以在线查找化学信息。如果计算机联网,可以根据相关菜单命令进行搜索。关菜单命令进行搜索。ChemFinder将化学信息网站整合在其中,使用起将化学信息网站整合在其中,使用起来比较方便。来比较方便。小结小结 本章对本章对ChemOffice的组成及基本用法做了介的组成及基本用法做了介绍。绍。重点掌握重点掌握ChemDraw的软件,的软件,ChemDraw式式ChemOffice中最为常用的部分。中最为常用的部分。Chem3D为为我们提供了一定量的量子化学计算能力,我们提供了一定量的量子化学计算能力,Chem Finder则提供了查询相关化学信息的功能,既可则提供了查询相关化学信息的功能,既可以在本地查找,也可以联网查找相关信息。以在本地查找,也可以联网查找相关信息。