细菌基因组DNA提取实验.pdf

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1、细菌基因组 DNA 提取实验标签:细菌 基因组 DNA 提取细菌基因组 DNA 提取可以:(1)获得细菌基因组 DNA;(2)作为 PCR 模板;(3)用于测序、遗传信息分析等。实验方法实验方法细菌基因组 DNA 试剂盒提取法实验方法原实验方法原理理实验材料实验材料试剂、试剂试剂、试剂盒盒仪器、耗材仪器、耗材实验步骤实验步骤本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合 DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0109细菌中获得多至20 g 的基因组 DNA。用于 PCR、Southern 印迹分析、RAPD、RFLD 等分子生物学实验。细菌培养物细菌基

2、因组 DNA 试剂盒DNA 制备管小量滤器离心管一、试剂盒组成、贮存、稳定性一、试剂盒组成、贮存、稳定性1.说明书,耗材:DNA 制备管,小量滤器,2 ml 离心管,1.5 ml 离心管。2.RNase A:50 mg/ml,室温保存。3.溶菌酶:50%甘油溶解溶菌酶,使溶菌酶浓度为50 mg/ml,-20密闭贮存。4.Buffer S:细菌原生质制备液,加入RNase A 后,4密闭贮存。5.0.25M EDTA:室温密闭贮存。6.Buffer G-A:裂解液,室温密闭贮存。7.Buffer G-B:蛋白去除液,室温密闭贮存。8.Buffer DV-A:Buffer DV 的制备液,请参照实

3、验准备Buffer DV 的配制方法配制,室温密闭贮存。9.Buffer DV:相分离液,室温密闭贮存。10.Buffer BV:DNA 结合液,室温密闭贮存。11.Buffer W1:洗涤液,室温密闭贮存。12.Buffer W2 concentrate:去盐液。使用前按试剂瓶上指定的体积加入无水乙醇并混合均匀,室温密闭贮存。可用100%乙醇或95%乙醇。13.Eluent:2.5 mM Tris-HCl,pH 8.5,室温密闭贮存。二、实验准备二、实验准备1.第一次使用时,在 Buffer W2 中按试剂瓶上指定的体积加入无水乙醇并混合均匀。2.准备 Buffer DV:取2 ml Buf

4、fer DV-A,125 ml 异丙醇,75 ml 异丁醇,加入提供的250 ml 试剂瓶中,混合均匀。3.4预冷 Buffer DV。4.第一次使用试剂盒时,用50%甘油溶解溶菌酶,使溶菌酶浓度为50 mg/ml。5.第一次使用试剂盒时将随试剂盒携带的RNase A 全部加入 Buffer S 中,混合均匀。6.准备65水浴。7.检查 Buffer G-A 和 Buffer G-B 是否出现沉淀,若出现沉淀,于 65水浴加热至沉淀完全溶解后再使用。8.将 Eluent 或去离子水加热至65有利于基因组 DNA 的充分洗脱。三、操作步骤三、操作步骤1.用2 ml 离心管收集1.0109(1 m

5、l 菌液 OD600 为1-1.5)的细菌培养物,12000g 离心30 s,弃尽上清。用150 l 已加入 RNase A 的 Buffer S 悬浮沉淀。*确认 RNase A 已加入 Buffer S 中。*悬浮需均匀,不应留有小的菌块,否则将影响溶菌效果。2.加入20 l 溶菌酶贮存液,混合均匀,室温静置5 min。3.加入30 l 0.25 M EDTA(pH 8.0),混合均匀,冰浴5 min。4.加入450 l Buffer G-A,旋涡振荡15 s,65水浴10 min。5.加入400 l Buffer G-B 和1 ml Buffer DV(4预冷),用力混合,12 000g

6、 离心2 min。*请在实验前按照实验准备步骤2 内容,准备 Buffer DV。6.尽可能丢弃上相,保留相间沉淀和下相。加入1 ml 4预冷 Buffer DV,用力混合,12 000g 离心2 min。7.丢弃上相,将下相转移至滤器(滤器置于 2 ml 离心管中)。12 000g 离心1min。*上相无需完全弃尽,在转移无色下相时偶有混入的上相,可在 Tip 头内迅速分相,便于丢弃。*如在转移过程中吸入少量界面沉淀,不必去除,可过滤除去。*有色上相务必除尽,否则将抑制DNA 结合到 silica 膜上。8.弃滤器,在滤液中加入400 l Buffer BV,混合均匀。步骤9-12 可选择离

7、心法或负压法A.负压法9A.将制备管插到负压装置的插口上,将步骤8 中的混合液移入制备管中,开启并调节负压至-20-30 英寸汞柱,吸尽管中溶液。10A.保持负压,加入500 l Buffer W1,吸尽管中溶液。11A.保持负压,沿管壁四周加入700 l Buffer W2,吸尽管中溶液;以同样的方法再用700 l BufferW2 洗涤一次。*确认在 Buffer W2 concentrate 中已按试剂瓶上指定的体积加入无水乙醇。*沿管壁四周加入 Buffer W2 有助于彻底冲洗沾附在管壁上的盐份。*两次用 Buffer W2 冲洗能确保盐份被完全清除,消除对酶切反应的影响。12A.将

8、制备管置于一个2 ml 离心管中,12 000g 离心1 min。B.离心法9B.将制备管置于 2 ml 离心管中,将步骤 8 中的混合液移入制备管中,12,000g 离心1 min。10B.弃滤液,将制备管置回到原2 ml 离心管中,加入500 l Buffer W1,12000g 离心1 min。11B.弃滤液,将制备管置回到原2 ml 离心管中,加入700 l Buffer W2,12000g 离心1 min。以同样的方法再用700 l Buffer W2 洗涤一次。注意事项注意事项*确认在 Buffer W2 concentrate 中已按试剂瓶上指定的体积加入无水乙醇。*两次用 Bu

9、ffer W2 冲洗能确保盐份被完全清除,消除对酶切反应的影响。12B弃滤液,将制备管置回到原2 ml 离心管中,12 000g 离心1 min。13.将制备管置于另一洁净的1.5 ml 离心管中,在 silica 膜中央加100-200 lEluent 或去离子水,室温静置1 min。12 000g 离心1 min 洗脱 DNA。*将去离子水或 Eluent 加热至65将提高洗脱效率。收起1.Buffer G-B、Buffer BV 和 Buffer W1 含刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套和眼镜,避免沾染皮肤、眼睛和衣服、谨防吸入口鼻。若沾染皮肤、眼睛时,要立即用大量水或生理盐水冲洗,必要时寻求医疗咨询。

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