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2、仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。质谱数据鉴定蛋白质基本流程质谱数据鉴定蛋白质基本流程鸟枪法文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。MS/MS质谱图实例质谱图实例文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。肽段碰撞碎裂段碰撞碎裂选定的肽段离子在碰撞室与惰性气体作用而发生碰撞诱导解离(collision-induced dissociation,CID)文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。碰撞诱导解离(CID)产生的碎片离子类型肽链断裂点与离子
3、类型示意图N端C端在CID碎裂模式中，主要有三种不同的肽键断裂方式，产生6中不同的碎裂离子：即N端的a,b,c型离子与C端的x,y,z型离子.每种断裂类型分别生成互补的两种离子,如a-x,b-y,c-z。最常见的是a 型离子、b 型离子和y型离子，其他类型离子较少出现离子类型符号右下标的数字表示该离子所含有的氨基酸残基数目.断裂后的离子还可能丢失一个中性的水分子或氨分子文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。MS/MS质谱的解析质谱的解析文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。串联质谱图（串联质谱图（MS/MS）的大规
4、模）的大规模解析解析分为三类：数据库搜索方法目前最被广泛使用的方法。其基本思路是“模板匹配”，将实验得到的图谱与从数据库理论酶切产生的肽段的理论预测图谱进行比对，按照一定的打分规则鉴定出匹配最好的肽段从头测序方法基于肽段序列标签的方法文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。串串联质谱图（MS/MS）的大）的大规模解析流程模解析流程原始原始质谱数据数据（.raw、.wiff文文件）件）数据格式转换蛋白蛋白质序序列数据列数据库转换为打分软件(如Mascot)可识别的数据格式（如：mgf）Uniprot DBensemblDBNCBI DB自构蛋白质序列肽段段图
5、谱打分打分比比对软件（如件（如Mascot）得到得到肽段段图谱比比对结果果控制假阳性率控制假阳性率（FDR）1%或或5%得到得到结果果文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。原始质谱数据原始质谱数据不同质谱仪产出的质谱数据格式是不同的，如.raw、.wiff文件。查看这些文件需要专门的软件，如：Thermo Xcalibur Browserraw文件文件三三维数据数据MS/MS图谱文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。原始质谱数据格式转换原始质谱数据格式转换由于原始数据一般不能被肽段图谱比对打分软件所识别，所以需要经过格式转为打分软件可识别的格式数据，如：.mgf格式文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。图谱肽段打分比对图谱肽段打分比对常用软件如：Mascot文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。肽段与图谱匹配情况l 图谱与最终鉴定得到的肽段间的匹配情况可以用plabel软件查看(plabel生成质谱图时所需信息的是从.mgf格式文件中提取的)文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。谢谢！