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1、什么是神经网络什么是神经网络神经网络方法神经网络方法在生物信息学中的应用在生物信息学中的应用神经网络在神经网络在matlab中的实现中的实现2023/1/81神神经经网网络络知知识识l人工神经网络人工神经网络对人脑或自然神经网络若干基本特性的抽对人脑或自然神经网络若干基本特性的抽象和模拟象和模拟 非局域性非局域性非线性性非线性性非定常性非定常性非凸性非凸性l神经网络的基本性质神经网络的基本性质2023/1/82l神经元神经元神神经经网网络络知知识识2023/1/83/35l传递（激活）函数类型传递（激活）函数类型阈值函数线性函数对数函数正切函数神神经经网网络络知知识识2023/1/84l神经网
2、络结构神经网络结构神神经经网网络络知知识识2023/1/85/35神经网络分类神经网络分类前向网络反馈网络互联网络层内互联前向网络神神经经网网络络知知识识2023/1/86神神经经网网络络知知识识l神经网络模型神经网络模型感知器网络感知器网络线性神经网络线性神经网络BP网络网络径向基函数网络径向基函数网络反馈网络反馈网络自组织网络自组织网络神经元传递函数、网络学习函数、激活函数 不同net=newp()net=newlind()net=newff()net=newrbe()2023/1/87l网络训练函数网络训练函数神神经经网网络络知知识识trainbfgBFGS拟牛顿法trainbr贝叶斯方
3、法traincgbPowell-Beale共轭梯度法traincgfFletcher-Powell 共轭梯度法traincgpPolak-Ribiere 共轭梯度法traingd梯度下降法traingda自适应速率梯度下降法traingdm动量梯度下降法trainlmLevenberg-Marquardt算法traingdx动量和自适应速率梯度下降法2023/1/88/35学学习习算法算法适用适用问题问题类类型型收收敛敛性能性能占用存占用存储储空空间间其他特点其他特点trainlm函数拟合收敛快误差小大性能随网络规模增大而变差trainrp模式分类 收敛最快较小性能随网络训练误差减小而变差tr
4、ainscg函数拟合模式分类收敛较快性能稳定中等尤其适用于网络规模较大的情况trainbfg 函数拟合 收敛较快较大计算量随网络规模增大呈几何增大traingdx 模式分类 收敛较慢较小适用于“提前停止”方法，可提高网络推广能力神神经经网网络络知知识识l网络训练函数网络训练函数2023/1/89/35l网络权值、误差学习函数网络权值、误差学习函数神神经经网网络络知知识识mae绝对平均误差mse均方误差msereg规则化均方误差sse平方误差和l网络性能函数网络性能函数learpn标准化感知器学习规则learnwhLMS算法（近似梯度下降法）learngd梯度下降法learngdm 动量梯度下降
5、法2023/1/810/35以任意精度逼近任何函数以任意精度逼近任何函数鲁棒性、容错性强鲁棒性、容错性强进行快速、大量运算进行快速、大量运算学习和自适应不确定的系统学习和自适应不确定的系统神神 经经 网网 络络 的的 优优 点点同时处理定性、定量知识同时处理定性、定量知识2023/1/811神神经经网网络络知知识识l神经网络主要应用领域神经网络主要应用领域模式识别模式识别信号处理信号处理知识工程知识工程专家系统专家系统优化组合优化组合机器人控制机器人控制2023/1/812奶奶 牛牛 产产 奶奶 量量 预预 测测l研究意义研究意义l研究进展研究进展l神经网络方法神经网络方法神神经经网网络络应应
6、用用实实例例农场主关心什么先辈（竞争对手）做了什么2023/1/813初初 产产 奶奶 牛牛 产产 奶奶 量量 预预 测测l研究问题研究问题l研究数据研究数据l神经网络方法神经网络方法神神经经网网络络应应用用实实例例初产奶牛产奶量 亲代奶牛产奶量亲代奶牛30d、60d、90d、305d产奶量初产奶牛305d产奶量初产奶牛产奶量 初产奶牛营养量初产奶牛30d、60d、90d、305d营养量2023/1/814神神经经网网络络预预测测l训练集、测试集训练集、测试集交互检验交互检验 JackknifeJackknife检验检验采用标准集采用标准集随机选取随机选取GB126，CB25876个训练，12
7、或1个预测方法检验方法检验2023/1/815l模型建立模型建立依据原则依据原则（1）网络规模持平于样本集大小（2）输入层、隐层的结点数比例为2:1（3）运算简单、易于理解神神经经网网络络方方法法2023/1/816神神经经网网络络模模型型结结构构l模型结构步骤模型结构步骤 一一三层BP网络结构输出节点数为1l模型结构步骤二模型结构步骤二训练样本数76输入节点数为7隐层采用S型传递函数采用标准训练、权值、性能函数2023/1/817/35网网络络模模型型结结构构l网络结构模型网络结构模型网络模型网络模型层数节点数传递函数输入层7正切函数线性函数隐含层10输出层1训练函数：traingdx 网络
8、权值、误差学习函数：learngdm网络性能函数：mse是否是最好的选择方式是否是最好的选择方式2023/1/818/35神神经经网网络络预预测测l工作步骤工作步骤初始化网络权值矩阵和神经元阈值矩阵提供学习样本计算网络实际输出和隐层神经元输出计算误差对各层的影响修正权值和阈值计算网络输出误差判断误差是否满足要求结束训练2023/1/819神神经经网网络络程程序序实实现现lMATLAB神经网络工具箱神经网络工具箱主主 要要 程程 序序 设设 计计Net=newff(PR,S1,S2,TF1,TF2,BTF,BLF,PF);PR=minmax(Original_data);%确定输入层输入数据的大
9、小范围S1、S2;%分别为网络隐层、输出层神经元个数TF1、TF2;%分别为隐层、输出层传递函数BTF、BLF、PF;%分别为网络训练函数、学习函数和性能函数2023/1/820lMATLAB神经网络工具箱神经网络工具箱net.performFcn=mse;%设置性能函数为均方误差net.trainParam.goal=0.01;%设置性能目标值net.trainParam.epochs=25000;%设置最大训练步数net.trainParam.lr=0.02;%设置学习率设设 置置 各各 性性 能能 目目 标标 值值 如如 下下神神经经网网络络程程序序实实现现2023/1/821神神经经网
10、网络络程程序序实实现现lMATLAB神经网络工具箱神经网络工具箱主主 要要 程程 序序 设设 计计Original_data=textread(original.txt);net=train(net,Train_data,Train_target_data)；%网络训练Out_data(i)=sim(net,Test_data)；%网络仿真Target_data=textread(target.txt);R,P=corrcoef(Target_data,Out_data)；%精度验证2023/1/8222023/1/8232023/1/8242023/1/8252023/1/8262023/1
11、/8272023/1/82812023/1/829710112023/1/8302023/1/8312023/1/832预预测测结结果果最后预测结果最后预测结果真实产奶量预测奶量2023/1/833对初始权重敏感，易收敛于局部极小对初始权重敏感，易收敛于局部极小收敛缓慢甚至不收敛收敛缓慢甚至不收敛隐层节点数不好确定隐层节点数不好确定过拟合过拟合/过训练问题过训练问题B P神神 经经 网网 络络 的的 缺缺 点点2023/1/834l动量法和自适应动量法和自适应学习率学习率调整调整共轭梯度法共轭梯度法l遗传算法优化遗传算法优化解解决决方方案案l其他网络：多层感知器网络、径向其他网络：多层感知器网络、径向 多层感知器网络、径向基函数网络多层感知器网络、径向基函数网络2023/1/835