生物学文献检索绪论.ppt

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1、生物学文献检索生物学文献检索 绪论绪论常民常民什么是文献？什么是文献？CNS期刊杂志期刊杂志书籍书籍一些基础定义一些基础定义l信息信息 Information Information 是是对对客客观观世世界界中中各各种种事事物物的的变变化化和和特特征征的的反反应应；是是客客观观事事物物之之间间相相互互作作用用和和联联系系的的表表征征；是是客客观事物经过感知或认识后的再现。观事物经过感知或认识后的再现。在在人人类类社社会会中中，信信息息是是以以语语言言、文文字字、符符号号、图图形形、声声波波、光光波波、电电磁磁波波等等形形式式传传递递，以以纸纸张张、胶胶片片、磁磁带带、光光盘盘等等作作为为纪纪录

2、录知知识识的的载载体体来来表表示示。信信息息是是不不同同于于物物质质和和能能量量的的一一种种特特殊殊资源。资源。一些基础定义一些基础定义l知识知识 Knowledge Knowledge 知知识识是是人人类类对对客客观观事事物物的的认认识识、实实践践经经验验的的总总结。结。知知识识是是一一种种特特定定的的人人类类信信息息，它它是是对对信信息息进进行行提提炼炼和和深深化化的的结结果果。知知识识经经过过不不断断提提高高和和深深化化，形成较为完整的科学知识体系。形成较为完整的科学知识体系。一些基础定义一些基础定义l情报情报 Information Information 情报是用来及时传递的有用的知

3、识。情报是用来及时传递的有用的知识。情情报报来来源源于于知知识识，必必须须在在特特定定的的时时间间内内经经过过及及时时传传递递，并并能能为为用用户户所所接接受受和和利利用用。三三要要素素：知识性、传递性、效用性。知识性、传递性、效用性。一些基础定义一些基础定义l文献文献 Document Document，Literature Literature 文献是记录有知识的一切载体。文献是记录有知识的一切载体。文文献献具具有有知知识识、载载体体、信信息息符符号号和和记记录录方方式式 四个要素。四个要素。文文献献是是信信息息、知知识识、情情报报的的主主要要载载体体形形式式。人人类类社社会会利利用用文文

4、献献或或文文献献进进行行交交流流，其其实实质质是是利利用和交流文献中的信息、知识和情报。用和交流文献中的信息、知识和情报。信息、知识、情报的联系与区别信息、知识、情报的联系与区别信息 知识 情报文献的形式文献的形式l雕刻l印刷型：最悠久的形式l缩微型：胶片l声像型：l电子型：光盘型 网络型 目前而言，生物学文献检索主要对象为网络型文献，而电子文献的标准格式为PDF电子文档。文献的级别文献的级别l一次文献：即原始文献，是作者以生产和科研成果为依据而创作的原始文献。专著、期刊论文、研究报告、专利文献、学位论文、会议文献等都属于一次文献。文献的级别文献的级别l二次文献：对一次文献加工整序后的文献 包

5、括目录、文摘、索引、全文等。文献的级别文献的级别l三次文献：为了一定目的，对一二次文献进行综合分析、加工整理后编辑而成的文献。如科技动态、专题综述、情报调研报告、决策参考、进展、指南等l荟萃分析（荟萃分析（Meta-Analyses）：一种新形）：一种新形式的三次文献，运用定量方法汇总多个研式的三次文献，运用定量方法汇总多个研究结果的系统评价分析，例如：精神疾病究结果的系统评价分析，例如：精神疾病相关联的基因研究的荟萃分析。相关联的基因研究的荟萃分析。科技文献的出版类型科技文献的出版类型l科技图书科技图书 book book 阅读图书：科学专著、普及读物、教科书、科技图书阅读图书：科学专著、普

6、及读物、教科书、科技图书 参考工具书：百科全书、手册、辞典等参考工具书：百科全书、手册、辞典等大家要图书馆馆藏与网络虚拟图书馆并重。大家要图书馆馆藏与网络虚拟图书馆并重。l科技期刊科技期刊 journal journal科技期刊是科技文献的一种主要类型，常见的名称有：科技期刊是科技文献的一种主要类型，常见的名称有：专有名称，专有名称，CELLCELL、SCIENCESCIENCE、NATURENATUREJournalJournal，NEW ENGL J MEDNEW ENGL J MEDProceedingsProceedings，PROC NATL ACAD SCI U S A PROC

7、NATL ACAD SCI U S A ReviewReview，Annual ReviewAnnual Review，ANNU REV BIOCHEM ANNU REV BIOCHEMTrends,TRENDS ECOL EVOLTrends,TRENDS ECOL EVOLProgressProgress，PROG POLYM SCI PROG POLYM SCI BulletinBulletin，Letters Letters，PSYCHOL BULLPSYCHOL BULL，NANO LETTNANO LETTActaActa，BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA

8、 BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA 注意的一点是当前科技期刊向各大数据库集中的趋势注意的一点是当前科技期刊向各大数据库集中的趋势科技文献的出版类型科技文献的出版类型l会议文献，会议文献，Conference PaperConference Paper 论题先进，反映了某一专业的最新成就和发展趋论题先进，反映了某一专业的最新成就和发展趋势及学术动态。势及学术动态。l专利文献，专利文献，Patent DocumentPatent Document 特殊批准的，具有一定时期法律保护的创造发明。特殊批准的，具有一定时期法律保护的创造发明。专利的检索。专利的检索。l科技报告，科

9、技报告，Technical ReportTechnical Report 是关于某项研究项目或调查工作的成果的总结报是关于某项研究项目或调查工作的成果的总结报告，或者是对其中的某个阶段进展情况的实际记告，或者是对其中的某个阶段进展情况的实际记录。例如十一五科技规划等。录。例如十一五科技规划等。科技文献的出版类型科技文献的出版类型l政府出版物，政府出版物，Government DocumentGovernment Document 各国政府部门及其专设机构所发表的文件各国政府部门及其专设机构所发表的文件l标准文献，标准文献，Standard DocumentStandard Document 是

10、指对工农业产品和工程建设的质量、规格及是指对工农业产品和工程建设的质量、规格及其检验方法等方面所作的技术规定。其检验方法等方面所作的技术规定。l学位论文，学位论文，Thesis Dissertation Thesis Dissertation 学问论文是高等学校学生为了获得某种学位而学问论文是高等学校学生为了获得某种学位而撰写的科学论文。撰写的科学论文。ProQuest Digital Dissertations ProQuest Digital Dissertations，PQDDPQDD 万方硕博论文万方硕博论文科技文献的出版类型科技文献的出版类型l产品样本，产品样本，Product Li

11、teratureProduct Literaturel技术档案，技术档案，Technical RecordsTechnical Records科技文献的出版类型科技文献的出版类型科技文献的现状与特点科技文献的现状与特点l数量激增数量激增l类型复杂类型复杂l发表分散发表分散l文种多样文种多样l代谢频繁代谢频繁l运行环境发生变化运行环境发生变化l交流传播速度加快交流传播速度加快l某一方面的研究以前都有什么人用什么方法做过？某一方面的研究以前都有什么人用什么方法做过？l现在人们对这方面的研究有什么最新进展和认识？现在人们对这方面的研究有什么最新进展和认识？通常只有回答了这两个问题，才能说对课题有了一

12、定的了解。通常只有回答了这两个问题，才能说对课题有了一定的了解。当我们对学术领域中的某个课题产生兴趣的时候当我们对学术领域中的某个课题产生兴趣的时候有这样两个问题有这样两个问题有这样两个问题有这样两个问题知识是积累性的，人类历史上每一次知识是积累性的，人类历史上每一次突破性的重大发现在很大程度上都是突破性的重大发现在很大程度上都是前人研究成果的继续延伸。前人研究成果的继续延伸。引自引自Yale Bulletin and Calendar 2000年年29(34)卷卷 为什么找文献？为什么找文献？我们为什么要进行文献检索？我们为什么要进行文献检索？全世界的文献全世界的文献每年出版每年出版图书图书

13、8080万种万种期刊期刊4040万种万种其他文献信息资料其他文献信息资料400400万种万种发表科学论文大约发表科学论文大约500500万篇万篇每天出版每天出版1400014000篇左右论文，每篇左右论文，每3535秒就有秒就有1 1篇论文发表篇论文发表不到不到1 1分钟就有分钟就有1 1本新书问世本新书问世每小时出现近每小时出现近2020项技术发明项技术发明每天约有每天约有4040亿个信息单位的信息量向全世界发送。亿个信息单位的信息量向全世界发送。lSCISCI共收录共收录 73877387种期刊，其中生物种期刊，其中生物+医学（生命科学）医学（生命科学）杂志共杂志共35313531种，影响

14、因子前种，影响因子前2020名中生物医学占了名中生物医学占了1414种，种，而而PubMedPubMed收录收录3568035680种。种。l一名化学家每周阅读一名化学家每周阅读4040小时小时,浏览世界上一年内发表的浏览世界上一年内发表的有关化学方面的论文和著作就要有关化学方面的论文和著作就要4848年。根据生物医学年。根据生物医学的杂志数目比较，阅读生物医学的时间需要的杂志数目比较，阅读生物医学的时间需要500500年以上。年以上。l“一个科学家即使目前夜以继日地工作，也只能阅读有一个科学家即使目前夜以继日地工作，也只能阅读有关他自己专业世界上全部出版物的关他自己专业世界上全部出版物的5%

15、5%。”-德国学者德国学者哈根哈根分类名称分类名称1 1区最低影响因子区最低影响因子2 2区最低影响因子区最低影响因子3 3区最低影响因子区最低影响因子杂志数杂志数地学3.495 2.057 1.198 337地学天文8.452 4.197 2.539 52工程技术3.117 1.755 1.040 1585管理科学2.045 1.338 0.803 76化学5.953 3.447 1.921 331环境科学4.702 2.756 1.619 266农林科学2.142 1.454 0.851 393社会科学3.612 1.894 0.779 30生物9.026 3.830 2.201 950数

16、学1.797 1.034 0.623 413物理5.086 2.396 1.383 318医学6.102 3.369 2.081 2581综合性期刊9.470 2.032 0.790 587390SCI杂志分区表-2009影响因子影响因子-JrId:1JournalTitle:AADE editors journalMedAbbr:AADE Ed JISSN:0160-6999ESSN:IsoAbbr:NlmId:7708172-JrId:2JournalTitle:AANA journalMedAbbr:AANA JISSN:0094-6354ESSN:IsoAbbr:NlmId:04314

17、20-.-JrId:35680JournalTitle:Clinical and translational scienceMedAbbr:Clin Transl SciISSN:1752-8054ESSN:1752-8062IsoAbbr:NlmId:101474067知识分为两类，一类就是学科知识，而知识分为两类，一类就是学科知识，而另一类就是怎样找到这些知识的知识。另一类就是怎样找到这些知识的知识。塞缪尔塞缪尔约翰逊约翰逊文献检索的定义文献检索的定义l文献检索文献检索 Literature RetrieveLiterature Retrieve：就是查找就是查找文献，即以科学的方法利用专

18、门的工具，文献，即以科学的方法利用专门的工具，从大量的文献资料中迅速、准确、完整从大量的文献资料中迅速、准确、完整地查找到文献资料的过程。地查找到文献资料的过程。文献检索的基本原理文献检索的基本原理 原原 始始 文文 献献主主 题题 概概 念念文文献献特特征征标标识识检检 索索 课课 题题主主 题题 概概 念念检检索索提提问问标标识识检检 索索 结结 果果检索工具检索工具文文献献标标识识提提问问标标识识标识比较标识比较存贮过程存贮过程检索过程检索过程分分析析标标引引存存贮贮分分析析转转换换检检索索文献管理文献管理l常规管理l文献管理软件 EndNote EndNote；ReferenceManager ReferenceManager；Biblioscape Biblioscape；NoteExpress NoteExpress；医学文献王主要功能主要功能l在线搜索文献：直接从网络搜索相关文献并导入到Endnote的文献库内 l建立文献库和图片库：收藏，管理和搜索个人文献和图片、表格 l定制文稿：直接在Word中格式化引文和图形，利用文稿模板直接书写合乎杂志社要求的文章。