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1、第一章绪论1 .文献检索(information retrieval)是指收集整理文献并按一定方式组织和存储，同时根 据用户的信息需求查找出相关信息的过程，又称为“文献存储与检索”。狭义的文献检索是 指根据用户信息需求，利用检索工具或检索系统从文献信息集合里找出用户所需文献的过 程。2 .文献检索语言是根据文献检索需要而人工规范的语言系统，用来描述文献特征和表达 信息检索提问的一种专用语言，供信息标引以及文献检索时使用。3 .文献指以文字、图像、公式、声频、视频、代码等手段将信息、知识记录或描述在一 定的物质载体上，并能起到存贮和传播信息情报和知识作用的一切载体。三个基本要素：内容上的知识或信
2、息；揭示和表达知识信息的标识符号；记录信息符号的 物质载体。4 .信息素养又称为信息素质,是伴随着社会信息化的形成和发展而出现的一个名词术语，指具有检 索、分析、评价和利用各种信息源以解决信息需求及制定明智决策的能力,是对个人信息 行为能力、独立学习能力以及批判性思维能力等概括性描述。第二章医学文献信息资源1.按文献内容的加工深度和内容性质划分一次文献、二次文献、三次文献、零次文献(1)零次文献零次文献指未经正式发表或未进入正式交流的最原始的文献。(2)一次文献是指作者以其本人的研究成果(如实验、观察、调查研究等的结果)为基本 素材写成的原始创作，如专著、期刊论文、科技报告、学位论文等。(3)
3、二次文献是将大量无序分散的一次文献收集、整理、加工、著录其特征(如著者、篇 名、分类、主题、出处等)，并按一定的顺序加以编排，形成供读者检索所需一次文献线索的部分出版商提供的免费文献二.PubMed的主要来源(1) Medline ： PubMed 的主体，这些记录标注为PubMed-indcxcd for MEDLINE o(2) In-process citations：为加快报道速度，PubMed将尚未标引MeSH主题词、文献 类型的最新文献记录先存入临时库，完成加工处理后再转入MEDLINE。这些记录标注 为PubMed-in Process。(3) Publisher supplie
4、d citation： PubMed接受出版商提供的电子期刊文献数据，但一 些综合性期刊中的非生物医学文献，MEDLINE并不收录，这些记录标注为PubMed. as supplied by publisher。(4) OLDMEDLINE：收录1966年以前出版且未被MEDLINE收录的文献记录，并 标注为PubMed - OLDMEDLINE。三.PubMed记录的主要字段字段标识：字段名称ALL： All FieldAB： AbstractAD： AffiliationAU ： Authors1 AU ： First AuthorCY ： CounttyDP： Publication D
5、ateEDAT： Entrez DateFAU ： Full Author NameGN ： Grant NumberGS： Gene SymbolLASTAU ： Last AuthorPMID： PubMed Unique Identifier字段标识：字段名称IS： ISSNLA： LanguageMH： MeSH TermsMAJR： MeSH Major TopicPT ： Publication TypeSH： MeSH SubheadingsSO： SourceTA： Journal TitleTI： TitleTIAB： Title/AbstractTW： Text Words
6、UID： Unique IdentifiersNM： Substance Number四.自动词语匹配检索(Automatic Terms Mapping)1 .输入有实际意义的检索词，点击“5&小”，系统按照自动词语匹配的原理进行检索2 .PubMed最具特色的检索功能之一3 .基本原理：对输入的检索词，首先在多个索引词表进行搜索、比对，并自动转换为相应的 MeSH主题词、著者或刊名，再将检索词在all fields （所有字段）中检索，并 执行“OR”逻 辑运算。如有多个检索词或短语词组，则继续将其拆分为单词后分别在an fields （所有字段） 中检索，单词之间的逻辑关系为“AND”4
7、.Search Details框详细显示自动词语匹配的实际检索式5.有较好的查全率，同时保证一定的查准率五.著者检索1.在检索框中输入著者姓名，PubMed自动执行著者检索。一般姓在前名在后，姓用 全称，名 用首字母例如，输入Smith SR2.2002年以后的文献，PubMed可实现姓名全称检索，而且姓名排列顺序不限例如，输入全名Steven R Smith,可检索出2002年以来该著者被PubMed收录的 文献。3.通过字段限定检索及组合检索可实现更精确的著者检索例如，输入Smith SR 1AU可检索出第一著者为Smith SR的所有文献。4.当刊名与MeSH词相同时 PubMed默认将
8、其作为MeSH词检索。采用刊名字段限定避 免误检。六.短语精确检索将检索词加上双引号进行强制检索- 短语精确检索时，PubMed关闭自动词语匹配功能，避免了自动词语匹配时将短 语拆分可 能造成的误检，可提高查准率。 例如，输入“metabolic syndrome” , PubMcd在所有可检索字段中查找含有短语词 组 metabolic syndrome 的文献女七.截词检索 在检索词后加“*”可实现截词检索，以提高查全率 载词检索时，PubMcd关闭自动词语匹配功能 例如，输入immun*可检索 出immun开头的所有词语，如immunity, immunology, immune, im
9、munological 等A.字段限定检索 字段限定检索的形式：检索词字段标识 例如，leukemia Tl可检索出篇名中含有leukemia的文献 myocarditis MAJR可检索出 MeSH Major Topic 为 myocarditis 的文献 字段限定检索可提高查准率九.布尔逻辑检索 支持AND, OR, NOT布尔逻辑运算 逻辑运算符要大写 直接输入几个检索词，系统默认词之间是AND的逻辑组配关系 可以输入检索式的序号进行布尔逻辑运算，如#1 AND #3Ps： 1.检索过滤条件一经选定，会保持激活状态而在此后的检索中持续起作用。2.用MeSH词检索时，只检索来源于MEDL
10、ILNE的文献，不检索PubMed其他来源 的文献。临床试验数据库(CHncal Trials)1.点击PubMed主页More Resources栏目下的Clinical Trials,进入NLM研制开发的临床试 验数据库2.Clinicai Trials是十分重要的循证医学信息资源，收录了美国及全世界多国经注册登 记的众多临床试验的详细信息。小结：1.主题词检索是PubMed最具特色的功能之一，能保证较好的查准率及查准率。2,主题词组配副主题词使检索结果更为专指，限定在主要主题词检索能使结果更 准确。3.主题词检索也有一些固有的缺陷，比如很多专指的概念没有相应的主题词，一些新出现 的概念要
11、几年后才收录为主题词。这种情况下，采用字段限定检索等方 法也能得到较好的 查准率。止匕外，主题词检索还可能会漏掉一些最新的文献Gnprocess citations)BIOSIS Previewsl.BIOSIS Previews (BP)是世界著名的有关生命科学研究的文摘数据库，由美国 生物科学 信息服务社(BIOSIS)编辑出版,来源于BA (生物学文摘)、BA/RRMa物学文摘/技术报告、 综述和会议文献)。2.1. CI为全球生命科学领域中最权威、功能最强大的引文数据库，为BP的记录 增加高附 加值的引文索引。一 .SciFinder Web数据库概述：美国化学文摘(Chemical
12、Abstracts, CA) 1907年创刊，由美国化学文 摘社 (Chemical Abstracts Service, CAS)编辑出版。SciFinder是CA的网络版，是 目前世界上 检索化学化工及其相关信息的最权威的文摘型数据库，也是生命科学 尤其是药学领域重要的检索工具之一。二 .Embase数据库类型：世界上重要的医药学文摘索引数据库；H.Scopus数据库是由Elsevier公司研发的大型文摘索引数据库。第五章全文型数据库检索第一节中国知网1 .中国学术文献网络出版总库是其核心资源，其学科领域分自然科学与工程技术及人文与 社会科学两部分，数据为每日更新。2 .网址：3 .系统提
13、供基本检索、高级检索、专业检索、作者发文检索、科研基金检索、句子检索及 来源期刊检索等功能。4 .可以对所选择的文献进行分析第二节维普资讯网1.中文科技期刊数据库收录了国内出版的中文期刊12000余种，分为全文版、文摘 版、引文版三个版本，有8个专辑28个专题。维普资讯网通过维普期刊资源整合服务平 台为用户提供服务，支持手机阅读。该平台包含五大功能模块，分别是期刊文献检索、文 献引证追踪、科学指标分析、高被引析出文献及搜索引擎 服务。5 .维普资讯网主页()6 .高级检索之向导式检索扩展功能：查看同义词：可以全选，以扩大搜索范围。 查看同名作者：可以列表形式显示不同单位同名作者，用户可以选择作
14、者单位来限制同名 作者范围。为了保证检索操作的正常进行，系统对该项进行了一定的限制：最多勾选数据不超过5个。 查看分类表：直接点击按钮，弹出分类表页，操作方法同分类检索。 查看相关机构：最多勾选数据不超过5个。 期刊导航：注意：需要输入准确的刊名。第三节万方数据知识服务平台1,拥有中华医学会的系列期刊的独家版权。2 .中文:英文：第六章引文检索系统1 .引文不乜0 口)是指一篇学术论文中所引用的参考文献，通常是以脚注或尾注的形式出 现。它是一篇文章的重要组成部分。2 .引文索引(Citation Index)是一种以科技期刊、专利、专题丛书、技术报告等文献资料所 发表的论文后所附的参考文献(即
15、引文)的作者、题目、出处等项目，按照引证与被引证的关 系进行排列而编制的索引。3 .引文索引的作用：1 .检索同一主题相关的新文献；2 .评价作用：1) 学术论文的影响力；2) 研究人员的学术水平；3) 机构或国家的科研实力；4) 学术期刊的质量；3.为学科发展研究提供计量数据。4. Web of Science检索数据库1. Science Citation Index-Expanded (SCIE)2. Social Sciences Citation Index (SSCI)3. Arts & Humanities Citation Index(A&HCI)5Journal Citati
16、on Reports(期刊引用报告)简称JCR,由ISI编辑出版，是国内外学 术界 共认的多学科期刊评价工具被引次数：JCR统计年文献的被引总次数。影响因子(Impact Factor, IF):某刊前两年发表的文献在当年被引用的次数该刊前两年发表的文献数6 . Essential Science Indicators,简称ESI,由ISI (美国科技信息所)于2001年推出的衡量科学研究绩效、跟踪科学发展趋势的基本分析评价工具。ESI是基于SCIE和SSCI所收录的文献记录而建立的引文分析数据库7 .中国科学引文数据库(Chinese Science Citation Database,简称
17、 CSCD)第七章网络信息资源一 .搜索引擎分类(按工作方式)全文搜索引擎(Full Text Search Engine)目录索引类搜索引擎(5&-仆Index/Directory)元搜索引擎(乂& Search Engine)二 .医学搜索引擎1. Medical Matrix2. Medscape3. SCIRUS三 .网上免费信息资源High Wire PressFree Medical JournalsPubMed CentralBiomedCLentralDOAJPloSMedlinePlus四 .国内开放存取和免费网络资源1 .中国预印本服务系统2 .奇迹电子文库、3 ,中国医学
18、生物信息网4 .中国科技论文在线5 .中国学术会议在线6 .大学公开课7 .中国科学院科技期刊开放获取平台五.循证医学（Evidence Based Medicine,简称日8 乂）即遵循证据的医学，是遵循 最佳科学依据的医学实践过程第八章摘要是论文主要内容不加注释和评论的简短扼要而又连贯的陈述。它起检索和报道文献的作 用。1 .摘要写法：采用结构式摘要：目的(0切。戊20)方法(Methods结果(Results)结论(Conclusion)新的文献形式，如索引、文摘、目录以及其相应的数据库 等。因其具有检索功能而称为检索工 具或检索系统。（4）三次文献是科技人员围绕某一专题，借助二次文献，
19、在充分研究与利用大量一次文献的基础上，经过阅读、分析、归纳、概括，撰写而成的新的文献。表现形式主要有：综述（Review） 述评（Comment）、进展（Progress、Advance） 现状（Update）、发展趋势（Trend）等期刊文献、百科全书、年鉴、手册等参考工具书。2 .其中中图法具有比较突出的优点，已为大多数图书馆所取用。3 .图书馆目录目录是著录一批相关文献，并按照一定次序排列而成的一种揭 示与报道文 献的工具。4 .查找馆藏图书的方法一般有两种，一种是直接进开架书库或阅览室到书架上查找，另一种方法是先利用馆藏目录查到要找图书的索书号，再根据索书号到书库中索取。5 .参考工具
20、书类型参考工具书：是根据一定需要以特定的编排形式和检索方法，为人们迅速提供某方面的基本知识或资料线索，专供查阅的特定类型的图书。 特点具有知识性、资料性、检索性。 按编辑体例与功用分：字典、词典、年鉴、手册、类书、政书、百科全书、表谱、图录、名录等。 按内容分有综合性的、专科性的；6 .馆际互借馆际互借（interlibratyloan,简称ILL）是图书馆之间相互利用对方馆藏来满足本馆读者需求的一种资源共享服务。馆际互借一般针对图书，是一种返还式文献资源共享方式，是图书馆根据读者需求，将本馆没有收藏的图书，从其他收藏馆借阅过来提供读者使用的一种服务。文献传递是在馆际互借基础上发展起来的，是馆
21、际互借的一种，是非返还式的文 献资源共 享方式。7 .科技查新概念新颖性8 .查新在科研项目创新性鉴证方面的作用有两方面：在立项阶段、在成果申报和鉴定阶段9 ,学科服务由图书馆学科馆员来推动，通过电话、邮件、研究室、课题组等方式，将图书馆 信息服务延伸到用户之中。10 .数字图书馆是以现代信息技术为依托，以分布式海量数字化信息资源库为基础，不受地理 位置和时空限制，以求最大限度地满足用户个性化需求的虚拟图书馆。第三章医学文献信息检索基础1 .数据库的类型按收录信息内容的类型不同划分2 .文献型数据库（书目型和全文型）3 .数值型数据库4 .事实型数据库5 .图像数据库6 .多媒体数据库7 .数
22、据库的结构从用户的角度看，数据库主要由文档、记录和字段三个层次构成。数据库通常由若干个文档(file)组成，每个文档又由若干条记录(record)组成，每条记录则包含若干字段(field) o从数据库组成的方式来划分:顺排文档和倒排文档8 .文献数据库的检索途径检索系统主要依信息的各项特征来编排，形成不同的检索途径。检索途径是检索系统提供的检索入口。常用的检索途径：主题词途径、关键词途径、分类途径、题名途径、著者途 径，等。9 .检索语言(retrieval language)又称文献存储与检索语言、标引语言等，是信息 检索系 统存储与检索过程中共同使用的一种专用语言，是在文献检索领域中用来描
23、述文献特征和 表达信息检索提问的一种专用语言。10 检索语言的类型11 .医学主题词(Medical Subject Headings,简称MeSH)是NLM编制的世界 医学领域 最权威、最常用的一部规范化的、可扩充的动态叙词表。12 医学主题词MeSH词的种类叙词(descriptor)：又称主题词(subject heading)(2)款目词(加中term):又称入口词(3)限定词(qualifier)：又称副主题词(subheading)(4)特征词(check tag)：在主题词字段检索主题词(main headings)又称叙词(Descriptors),是用于描述主题事物或内容的规
24、 范化词 汇。 主题词的形式 主题词的树状结构号 主题词的单一性 主题词的动态性限定词又称副主题词，是限定主题概念的一类规范化词汇，对主题词起细分作用 以及揭示 多个主题词之间的关系。限定词的数量及其可组配的主题词的范围均有 严格规定。目前， MeSH表规定使用的限定词有83个款目词又称入口词，是主题词的同义词或近义词，作用是将自由词引见到主题词。8.文献检索方法1 .检索工具法(常用法)利用检索工具查找所需信息2 .浏览法定期或不定期浏览最近出版的期刊、专著等了解最新信息3 .引文追踪法从现有文献出发，以其参考文献为线索查找相关文献4 .综合法/循环法联合运用上述方法获取文献9 .布尔运算符
25、AND、OR、NOT,分别表示逻辑与、逻辑或、逻辑非三种逻辑运算关系.10 .布尔逻辑运算的优先顺序当一个检索表达式含有多个布尔算符时，执行的顺序为not优先运算，and其次，or最后。可用圆括号改变运算顺序，将需要优先运算者置于圆括号中。例如，查找“维生素C或维生素E对糖尿病患者肾脏的保护作用”，检索式为：（维生素Cor维生素E） and糖尿病and肾。11 .截词检索截词检索，利用截断的词的一个局部即截词，进行检索的技术自动地对同一概念检索词的不同词尾变化、词根相同等一类提问词进行检索，并自动用OR 连接各词的检出结果，避免文献的漏检和逐词键入的麻烦，提高查全率；常用的截词符号有“ * ”
26、、“ ？ ”。12 .限定检索又称限定字段检索，是利用检索词出现的字段进行的检索；用户可以指定检索某一字段或某几个字段以使检索结果更为准确，减少误检；检索系统的限定 检索会采用缩写形式的字段标识符；如TI表示Title, AD表示Address AU=鲁迅；cytokine in TI13 .扩展检索是同时对多个相关检索词执行逻辑“或”检索的技术；即当用户输 入一个检 索词后，系统不仅能检出该检索词的文献，还能检出与该检索词同属于一个概念的同义词 或下位词的文献，如PubMed中主题词的扩展检索。13.文献检索步骤1 .分析检索课题，明确检索要求2 .选择检索工具，确定检索方法3 .选定检索途
27、径、检索词，制订检索策略式4 .评价检索结果，优化检索策略5 .文献筛选，获取原始文献14 .文献信息检索的步骤15 .获取全文的方法1 .本馆馆藏2 .馆际互借3 .网上搜索引擎、期刊主页、OA期刊网站等4 .直接向著者索取16 .检索效果的评价查全率与查准率查全率=检出相关信息量/信息库内相关信息总量XI00%查准率=检出相关信息量/检出信息总量乂 100%是评价检索效果的两个重要指标。两者之间存在着相反的相互依赖关系。应依具体课题需求，合理调节查全率和查准率。17 .检索策略的调整缩小检索范围，提高查准率可以采用的方法增加主题概念面，并用AND算符检索;(2)使用位置算符或者用NOT排除
28、无关概念；(3)精确为词组检索；(4)选用更确切的下位概念；(5)增加限定条件;(6)限定字段检索；(7)限定检索范围为某一子集或子库；(8)如有主题词检索途径的检索系统，采用主题词检索途径中可以提高查准率的方法，以及主题词途径与其他途径联合检索等。第四章文摘型数据库检索一.数据库简介1 .中国生物医学文献服务系统noMed)由中国医学科学院医学信息研究所研 发，是检 索国内生物医学文献的重要文摘型数据库。2 .SinoMed由8个子库构成，分别是中国生物医学文献数据库(CBM)、中国医学科普 文献数据库、北京协和医学院博硕学位论文库、西文生物医学文献数据库3 讨8 乂)、日文生物医学文献数据
29、库、俄文生物医学文献数据库、英文会议文摘数据库、英文文集汇编文摘数据库。第一节中国生物医学文献服务系统一.以下CBM为例介绍单库检索方法及结果处理：1 .收录1978以来1600余种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录700余万篇。2 .全部题录均进行主题标引和分类标引等规范化加工处理。二.主题检索1 .主题检索指基于主题概念采用规范化的主题词进行检索，是CBM的特色检索功能。CBM 采用美国国立图书馆的医学主题词表(McSH)中译本和中国中医科学院中医药信息研究所 的中国中医学主题词表进行主题标引。2 .检索步骤 输入单个检索词，确定主题词。 选择副主题词、是否加权及是否扩展。 若
30、有多个主题词需要检索，则每次检索一个主题词并重复以上步骤对多个主题词进行逻辑组配，直到全部主题词发送到检索框完毕，点击“主题检索”即可。三.分类检索中国图书馆分类法医学专业分类表是CBM分类标引和检索的依据。第二节 PubMed一、数据库概述1 .PubMed是国际上最重要、最权威的生物医学文献数据库之一，由美国国家医学图书馆 (National Library of Medicine, NLM)下属的国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)研制开发。2 .其网址是.nih.gov/pubmcd/ 或3 .部分文献可直接获取全文，包括： PubMed Central (PMC,收录期刊约800种)：NLM开发的免费生物医学数字化期 刊全文 数据库开放获取(Open Access,OA)期刊J