生物化学课件本四4资料讲解.ppt

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1、生物化学课件本四4 两条链的碱基均在主链内侧,一条链上的A一定与另一条链上的T配对,G一定与C配对。根据分子模型计算,一条链上的嘌呤碱必须与另一条链上的嘧啶碱相匹配,其距离才正好与双螺旋的直径相吻合。A=T,GC。由于碱基对的大小基本相同,所有无论碱基序列如何,双螺旋DNA分子整个长度的直径相同,螺旋直径为2nm。碱基组成的规律 A T C G A=T,G=C,A+G=C+T。具有种的特异性。没有组织、器官特异性。成对碱基大致处于同一平面,该平面与螺旋轴基本垂直。糖环平面与螺旋轴基本平行,磷酸基连在糖环的外侧。相邻碱基对平面间的距离为0.34nm,该距离使碱基平面间的电子云可在一定程度上交盖,

2、形成碱基堆积力。双螺旋每转一周有10个碱基对,每转的高度为3.4nm。螺旋桨式扭曲 DNA双螺旋的表面有一条大沟和一条小沟。大多数天然DNA属于双链DNA(dsDNA),某些病毒如174 和M13的DNA为单链DNA(ssDNA)。双链DNA分子主链上的化学键受碱基配对等因素影响旋转受到限制,使DNA分子比较刚硬,呈比较伸展的结构。但一些化学键亦可在一定范围内旋转,是DNA分子有一定的柔韧性。3 DNA二级结构的其他类型二级结构的其他类型n nB-DNA Watson和Crick提出的模型n nA-DNAn nZ-DNAn n二重对称结构 反向重复顺序、回文结构n n镜像重复 三螺旋DNA 4

3、 DNA的高级结构的高级结构(1)环状DNA的超螺旋结构真核生物染色体DNA 双链线状分子 细菌染色体DNA、某些病毒DNA、细菌质粒DNA、真核细胞的线粒体和叶绿体DNA,均为双链环形DNA。生物体内绝大多数双链环形DNA,可进一步扭曲成超螺旋DNA。(正、负)超螺旋超螺旋DNA(共价闭环共价闭环DNA)n n超螺旋DNA具有更为致密的结构,可以将很长的DNA分子压缩在一个较小的体积内。如果一条双链DNA有100000bp,长度?细胞直径?n n同时,增加了DNA的稳定性。(2)真核生物染色体的结构 真核细胞的染色质和一些病毒的DNA是双螺旋线形分子,由于与组蛋白结合,其两端不能自由转动。D

4、NA与蛋白质形成染色体。n nDNA分子n n核小体n n螺线管结构n n突环结构n n微带n n染色体5 DNA和基因组和基因组(1)基因和基因组基因(gene):DNA分子中最小的功能单位。结构基因调节基因间隔序列基因组(genome)某物种所含的全套遗传物质。细胞、细胞器、质粒中所有的基因,即一定生物体内所有基因的总称。(2)病毒和细菌基因组的特点共同点:较小大部分序列用于编码蛋白质,间隔序列少具有操纵子(operon)结构机构小,精简、高效机构小,精简、高效n n操纵子 功能相关的基因串联在一起,由共同的调控元件调控,并转录成同一mRNA分子,可指导多种蛋白质的合成。n n病毒基因组的

5、特点每种病毒只有一种核酸每种病毒只有一种核酸 单链单链/双链,环形双链,环形/线形线形;不少病毒以不少病毒以RNARNA为遗传物质为遗传物质 RNA RNA病毒病毒有重叠基因有重叠基因n n细菌基因组的特点“染色体染色体”通常由一个环形或线形的通常由一个环形或线形的DNADNA分子组成;分子组成;单复制起点;单复制起点;质粒;质粒;编码蛋白的基因为单拷贝,但编码蛋白的基因为单拷贝,但rRNArRNA基因一般为多拷基因一般为多拷贝;贝;多种调控区,少量重复序列;多种调控区,少量重复序列;可移动可移动DNADNA序列(转座子)。序列(转座子)。(3)真核生物基因组的特点较大;多复制起点;较大;多复

6、制起点;无操纵子结构;无操纵子结构;大量的重复序列:高度重复序列、中度重复序列、大量的重复序列:高度重复序列、中度重复序列、低度重复序列、单一序列;(假基因)低度重复序列、单一序列;(假基因)断裂基因。断裂基因。重复序列重复序列断裂基因断裂基因(split gene)n n外显子(exon)内含子(intron)6 RNA的结构和功能的结构和功能n n大多数天然RNA是一条单链。n n局部双链。臂/茎n n类型:mRNArRNAtRNAhnRNA snRNA asRNA(1)tRNA 主要功能:在蛋白质合成过程中具有转运氨基酸的作用。约占细胞RNA总量的15%。种类多。结构:三叶草形二级结构三

7、叶草形二级结构,具有四臂四环。tRNA的三级结构的三级结构n n倒写的字母L(2)rRNA 主要功能:构成核糖体的骨架,参与蛋白质合成。原核细胞:5s,16s,23s真核细胞:5s,5.8s,18s,28s(3)mRNA和和hnRNAn nmRNA 主要功能:蛋白质合成的模板。约占细胞总RNA的3%-5%,代谢活跃,寿命较短。原核生物mRNA一般不需要转录后加工。真核生物mRNA的前体在细胞核中合成,包括内含子和外显子的整个基因均被转录,形成分子大小极不均一的核内不均一RNA(hnRNA)。n nsnRNAn nasRNA RNA干扰(RNA interference)n nncRNA(非编码

8、RNA)n nRNA可能是DNA和蛋白质的共同祖先。7 核酸的性质核酸的性质(1)一般性质两性电解质 酸性水解核酸的酶类:内切酶、外切酶;核糖核酸酶、非特异性核酸酶(2)紫外吸收260nm(250-290)n n增色效应(3)核酸结构的稳定性 稳定因素碱基对间的氢键碱基堆积力环境中的正离子(4)核酸的变性 双链核酸的变性:双螺旋区氢键断裂,空间结构破坏,形成单链无规则线团状态的过程。n n核酸变性后n n增色效应n n黏度下降,浮力密度升高n n生物学功能部分或全部丧失n n熔解温度 Tm DNADNA的热变性中,将紫外吸收的增加量达最大增的热变性中,将紫外吸收的增加量达最大增量一半时的温度称为熔解温度。量一半时的温度称为熔解温度。影响影响TmTm的因素的因素(5)核酸的复性 变性核酸的互补链在适当条件下重新缔合成双螺旋的过程。退火n n减色效应n n影响因素(6)核酸的分子杂交 在退火条件下,不同来源的DNA互补区形成双链,或DNA单链和RNA单链的互补区形成DNA-RNA杂合双链的过程。n nSouthern杂交n nNorthen杂交n nDNA芯片n n核酸的测序n nSanger 链终止法n nGilbert 化学法此课件下载可自行编辑修改,仅供参考!此课件下载可自行编辑修改,仅供参考!感谢您的支持,我们努力做得更好!谢谢感谢您的支持,我们努力做得更好!谢谢

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