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1、第五章 细菌的分类与命名第一页，本课件共有24页一、基本概念一、基本概念1 1细菌分类细菌分类 根据细菌各自的根据细菌各自的 特征，并按照亲缘关系分类，特征，并按照亲缘关系分类，以不同等级编排系统。分类以不同等级编排系统。分类 有两种：有两种：第二页，本课件共有24页细菌的生理生化分类法，包括细菌的生理生化分类法，包括 有传统分类法和数值分类法；有传统分类法和数值分类法；细菌核酸、蛋白质结构的同源细菌核酸、蛋白质结构的同源 程度进行分类法，称种系分类程度进行分类法，称种系分类 或自然分类。或自然分类。第三页，本课件共有24页2 2细菌命名细菌命名 在分类基础上，给在分类基础上，给 每种细菌一个
2、科学名称，便于每种细菌一个科学名称，便于 交流并保证所有的科研工作者交流并保证所有的科研工作者 给予同样名称。给予同样名称。第四页，本课件共有24页3 3细菌鉴定细菌鉴定 将未知细菌按分将未知细菌按分 类原则类原则,确定细菌的分类地位。确定细菌的分类地位。第五页，本课件共有24页二、分类等级二、分类等级1.1.细菌的分类等级依次为界、门、纲、细菌的分类等级依次为界、门、纲、目、科、属、种。细菌属于原核生目、科、属、种。细菌属于原核生 物界，包括有细菌、放线菌、支原物界，包括有细菌、放线菌、支原 体、衣原体、立克次体和螺旋体。体、衣原体、立克次体和螺旋体。分类等级表示方法如下：目、亚目、分类等级
3、表示方法如下：目、亚目、科、亚科等。科、亚科等。第六页，本课件共有24页2.2.种是细菌分类的基本单位，将生物学性种是细菌分类的基本单位，将生物学性状基本相同的细菌群体归成一个菌种；状基本相同的细菌群体归成一个菌种；性状相近、关系密切的若干菌种组成一性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属；相近的属归为一科；依次类推。个菌属；相近的属归为一科；依次类推。在两个等级之间，可添加次要的分类单在两个等级之间，可添加次要的分类单位，如亚门、亚纲、亚属和亚种等。群位，如亚门、亚纲、亚属和亚种等。群和组不是正式分类等级，具有某种共同和组不是正式分类等级，具有某种共同特性的某个集体，任何等级都可借用。特性的
4、某个集体，任何等级都可借用。第七页，本课件共有24页 3.3.同一菌种在某些方面仍有差异，同一菌种在某些方面仍有差异，可再分成亚种，亚种以下的分类等级为可再分成亚种，亚种以下的分类等级为 型，以区别某些特殊的特征。例如抗原型，以区别某些特殊的特征。例如抗原 结构不同而分的血清型；对噬菌体敏感结构不同而分的血清型；对噬菌体敏感 性不同的噬菌体型；对细菌素敏感性不性不同的噬菌体型；对细菌素敏感性不 同的细菌素型，生化反应和某些生物学同的细菌素型，生化反应和某些生物学 性状不同的生物型。性状不同的生物型。第八页，本课件共有24页4.4.由不同来源分离的同一种、同一亚种或同一由不同来源分离的同一种、同
5、一亚种或同一 型的细菌，称为株。株是从一次单独分离物型的细菌，称为株。株是从一次单独分离物 的单个原始菌落传代的纯培养物，例如从的单个原始菌落传代的纯培养物，例如从1010 个肺结核患者的痰液中分离出的个肺结核患者的痰液中分离出的1010株结核分枝株结核分枝 杆菌。具有某种细菌典型特征的菌株称为模式杆菌。具有某种细菌典型特征的菌株称为模式 菌或标准菌株，它是该种菌株的参比菌株。在菌或标准菌株，它是该种菌株的参比菌株。在 细菌的分类、鉴定和命名时以模式菌为依据，细菌的分类、鉴定和命名时以模式菌为依据，也可作为质量控制的标准。也可作为质量控制的标准。第九页，本课件共有24页三、细菌命名法 细菌的学
6、名的生物双名式，具备拉丁细菌的学名的生物双名式，具备拉丁 化文字形式和明确分类等级的两个特点，化文字形式和明确分类等级的两个特点，即有一个属名和一个种名构成。属名在即有一个属名和一个种名构成。属名在 前，是名词，首字母大写；种名在后，前，是名词，首字母大写；种名在后，是形容词，均用小写；两者均用斜体表是形容词，均用小写；两者均用斜体表 示。细菌学名的中文译名则种名在前，示。细菌学名的中文译名则种名在前，属名在后。属名在后。第十页，本课件共有24页例如例如SalmonellatyphiSalmonellatyphi(沙寒沙门菌沙寒沙门菌)。属名也可用第一个字母代表，如属名也可用第一个字母代表，如
7、S typhiS typhi等。有时泛指某一属细菌而不特指其中等。有时泛指某一属细菌而不特指其中的某个细菌则可在属名之后加上的某个细菌则可在属名之后加上spsp，如如Salmonella spSalmonella sp，即表示沙门菌属细，即表示沙门菌属细菌菌(sp(sp代表菌种代表菌种speciesspecies，复数用，复数用spp)spp)；第十一页，本课件共有24页如果使用如果使用1 1个亚种的名称，则在种名个亚种的名称，则在种名后再加亚种名如后再加亚种名如Klesbsiella Klesbsiella penumomae subspecies pneumomaepenumomae su
8、bspecies pneumomae。第十二页，本课件共有24页第二节 细菌的分类方法 一、生理学与生化学分类法一、生理学与生化学分类法 细菌的形态、染色以及特殊结构是细菌的形态、染色以及特殊结构是 最早的分类依据，方法有传统分类最早的分类依据，方法有传统分类 和数值分类法两种。和数值分类法两种。第十三页，本课件共有24页1 1传统分类法传统分类法 1919世纪以来，以形态世纪以来，以形态 生理特征为依据选择稳定的生物学生理特征为依据选择稳定的生物学 性状，如形态结构、染色性、培养性状，如形态结构、染色性、培养 特性、生化反应、抗原性作为分类特性、生化反应、抗原性作为分类 依据，然后按主次顺序
9、逐级区分。依据，然后按主次顺序逐级区分。使用方便，分类亦明确，但有主观使用方便，分类亦明确，但有主观 性。性。第十四页，本课件共有24页2 2数值分类法数值分类法 2020世纪世纪6060年代，随计年代，随计 算机的应用而发展的分类方法。它算机的应用而发展的分类方法。它 对各种生物学性状按对各种生物学性状按“等重要原则等重要原则”进行分类，选用进行分类，选用5050项以上的生理生项以上的生理生 化指标进行比较，分析相似度，划化指标进行比较，分析相似度，划 分属和种，并确定亲缘关系。分属和种，并确定亲缘关系。第十五页，本课件共有24页二、遗传学分类法 遗传学分类是以细菌的核酸、遗传学分类是以细菌
10、的核酸、蛋白质等组成的同源程度分类。蛋白质等组成的同源程度分类。该分类法的优点是：该分类法的优点是：第十六页，本课件共有24页对细菌的对细菌的“种种”有较为一致的概念；有较为一致的概念；使分类不会出现根本性的变化；使分类不会出现根本性的变化；可制定可靠的细菌鉴定方案；可制定可靠的细菌鉴定方案；有利于了解进化和亲缘关系。有利于了解进化和亲缘关系。第十七页，本课件共有24页基因型分类法有如下几种基因型分类法有如下几种:1 1DNAG+C molDNAG+C mol测定测定 DNADNA分子两条链上分子两条链上4 4种碱基的总分子量为种碱基的总分子量为 100100，测定其中，测定其中G+CG+C或
11、或A AT T摩尔百分比，能反映摩尔百分比，能反映 出细菌间出细菌间DNADNA分子同源程度，习惯上以分子同源程度，习惯上以G+CG+C作为作为 细菌分类标记。不同菌属间的细菌分类标记。不同菌属间的G+C molG+C mol范围范围 很大，在很大，在25257575之间，但同一种细菌之间，但同一种细菌G+C G+C mol mol相当稳定，不受菌龄、培养条件和其他相当稳定，不受菌龄、培养条件和其他 外界因素影响，亲缘关系越近的细菌，它们外界因素影响，亲缘关系越近的细菌，它们 G+C molG+C mol越相近。越相近。第十八页，本课件共有24页2 2核酸同源值测定核酸同源值测定利用利用DNA
12、DNA分子杂交技术测定分子杂交技术测定DNADNA分子的相分子的相似度。其步骤是先提取似度。其步骤是先提取DNADNA，加热变性解，加热变性解链链,然后将两种变性的然后将两种变性的DNA(DNA(其中一种为标其中一种为标记记DNADNA或或rRNA)rRNA)混合液在一定的温度下保混合液在一定的温度下保温复性温复性,重新得到杂交的双螺旋重新得到杂交的双螺旋DNADNA分子，分子，鉴定其双螺旋结合率。鉴定其双螺旋结合率。第十九页，本课件共有24页结合率大小反映结合率大小反映DNADNA碱基序列相似程碱基序列相似程度和菌种间的亲缘关系。同一菌的结度和菌种间的亲缘关系。同一菌的结合率为合率为1001
13、00，80809090的同源为的同源为同种内、同亚种的细菌，同种内、同亚种的细菌，6060-70-70的同源性为同种内不同亚种的细菌，的同源性为同种内不同亚种的细菌，2020-60-60则认为是同属中的不同菌种。则认为是同属中的不同菌种。第二十页，本课件共有24页3 3核蛋白体核蛋白体RNARNA碱基序列测定碱基序列测定 细菌核蛋白体细菌核蛋白体RNARNA序列比较保守，序列比较保守，其变化十分缓慢。分离提取细菌其变化十分缓慢。分离提取细菌 16SrRNA16SrRNA，用，用T1T1核酸酶消化，分析核酸酶消化，分析 寡核苷酸的碱基序列可测出寡核苷酸的碱基序列可测出rRNArRNA的的 相关性
14、。绘制各类群关系和树状谱，相关性。绘制各类群关系和树状谱，从而确定种系的发生关系。从而确定种系的发生关系。第二十一页，本课件共有24页第三节 细菌的分类糸统n医学有关的细菌分类表第二十二页，本课件共有24页类类 ，G G有细胞壁的真细菌有细胞壁的真细菌 分分 类类 依依 据据 菌菌 属属需氧需氧/微需氧、有动力、螺形微需氧、有动力、螺形螺菌属、弯菌属螺菌属、弯菌属G G菌菌 螺杆菌属螺杆菌属需氧需氧/微需氧、微需氧、G G杆菌与球菌杆菌与球菌 假假单单胞胞菌菌属属、军军团团菌菌属属、奈奈瑟瑟菌菌属属、莫莫拉拉菌菌属属产产碱碱杆杆菌菌属属、布鲁斯菌属、罗卡利马体属、鲍特菌属、弗郎西斯菌属布鲁斯菌
15、属、罗卡利马体属、鲍特菌属、弗郎西斯菌属兼性厌氧兼性厌氧G G杆菌、弧菌杆菌、弧菌 埃埃希希菌菌属属、志志贺贺菌菌属属、沙沙门门菌菌属属、克克雷雷伯伯菌菌属属变变形形杆杆菌菌属属、普普罗罗威威登登斯斯菌菌属属、耶耶尔尔森森菌菌属属、弧弧菌菌属属、巴巴氏氏杆杆菌菌属属、嗜嗜血杆菌属血杆菌属厌氧厌氧G G直、弯或螺形杆菌直、弯或螺形杆菌 类杆菌属、梭杆菌属类杆菌属、梭杆菌属厌氧厌氧G G球菌球菌 韦荣球菌属韦荣球菌属立克次体与衣原体立克次体与衣原体 立克次体属、考克斯体属、衣原体属立克次体属、考克斯体属、衣原体属螺旋体螺旋体 密螺旋体属、疏螺旋体属、钩端螺旋体属密螺旋体属、疏螺旋体属、钩端螺旋体属
16、第二十三页，本课件共有24页类，G+有细胞壁的细菌 G+G+球菌球菌 肠球菌属、球菌属肠球菌属、球菌属链球菌属、消化链球菌属链球菌属、消化链球菌属形成芽胞的杆菌形成芽胞的杆菌 芽胞杆菌属、梭菌属芽胞杆菌属、梭菌属形态规则的无芽胞形态规则的无芽胞G+G+杆菌杆菌李斯特菌属、丹毒丝菌属李斯特菌属、丹毒丝菌属 形态不规则的无芽胞形态不规则的无芽胞G+G+杆菌杆菌 棒状杆菌属、放线菌属、动弯杆菌属棒状杆菌属、放线菌属、动弯杆菌属 分枝杆菌分枝杆菌分枝杆菌属分枝杆菌属放线菌放线菌诺卡菌属、链霉菌属、红球菌属诺卡菌属、链霉菌属、红球菌属 类，无细胞壁的真细菌类，无细胞壁的真细菌 支原体属、脲原体属支原体属、脲原体属 类，古细菌类，古细菌 未发现有致病菌未发现有致病菌 第二十四页，本课件共有24页