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1、细胞生物学研究方法1 Still waters run deep.流静水深流静水深,人静心深人静心深 Where there is life,there is hope。有生命必有希望。有生命必有希望第一章第一章 绪论绪论第二章第二章 细胞基本知识概要细胞基本知识概要 第三章第三章 细胞生物学研究方法细胞生物学研究方法第四章第四章 细胞质膜与细胞表面细胞质膜与细胞表面第五章第五章 物质跨膜运输与信号传递物质跨膜运输与信号传递第六章第六章 细胞质基质与内膜系统细胞质基质与内膜系统第七章第七章 细胞的能量转换细胞的能量转换第八章第八章 细胞核与染色体细胞核与染色体第九章第九章 核糖体核糖体第第 十
2、十 章章 细胞骨架细胞骨架第十一章第十一章 细胞增殖及其调控细胞增殖及其调控第十二章第十二章 细胞分化与基因表达调控细胞分化与基因表达调控第十三章第十三章细胞衰老与凋亡细胞衰老与凋亡第三章第三章细胞生物学研究方法细胞生物学研究方法METHODS AND TECHNIQUES第三章第三章 细胞生物学研究方法细胞生物学研究方法进行初步观察形成可验证的假说设计对照试验收集资料解释结果作出合理结论查阅已有知识Caenorhabditis elegansDrosophila melanogasterArabidopsis thaliana生物学研究模式生物不同物种享有共同分子机制本章内容提要本章内容提要
3、l第一节第一节 细胞形态的观察方法细胞形态的观察方法显微技术显微技术 一、光学显微镜一、光学显微镜 二、电子显微镜二、电子显微镜 三、显微操作技术三、显微操作技术l第二节第二节 生物化学与分子生物学技术生物化学与分子生物学技术l第三节第三节 细胞分离技术细胞分离技术l第四节第四节 细胞培养与细胞杂交细胞培养与细胞杂交第一节第一节 细胞形态的观察方法细胞形态的观察方法 显微技术显微技术l光学显微镜:以可见光(或紫外线)为光源。l电子显微镜:以电子束为光源。、光学显微镜、光学显微镜l1.构成:照明系统:光源、折光镜和聚光镜,有时附加滤光片控制光的波长。光学放大系统:目镜和物镜组成。机械装置l2.原
4、理:经物镜形成倒立实像,经目镜放大成虚像。(一)普通(一)普通复式复式光学显微镜光学显微镜Light Pathway of Microscope3.分辨力:指分辨物体最小间隔的能力。l光学显微镜的分辨力光学显微镜的分辨力 R=0.61/NA其中其中为入射光线波长;为入射光线波长;NA为镜口率为镜口率 sin/2,n=介质折射率;=镜口角(样品对物镜镜口的张角)。l显微镜的几个光学特点:显微镜的几个光学特点:介质折射率越接近镜头玻璃的(1.7)越好。sin /2的最大值小于1;油镜介质为香柏油,镜口率可接近1.5。普通光线的波长为400700nm,光镜分辨力约为0.2m,人眼的分辨力为0.2mm
5、,因此显微镜的最大有效倍数为1000X。光镜样本制作样品 固定 包埋 切片 染色(如伊红和美蓝能与蛋白质结合;品红能与DNA结合)(二)荧光显微镜(二)荧光显微镜 Fluorescence microscopel特点:光源为短波光;特点:光源为短波光;l有两个特殊的滤光片;有两个特殊的滤光片;l照明方式通常为落射式。照明方式通常为落射式。原理原理Fluorescence image,DNA in blue and Microtubules in greenl用于观察能激发出荧光的结构。用途:免疫荧光用于观察能激发出荧光的结构。用途:免疫荧光观察、基因定位、疾病诊断。观察、基因定位、疾病诊断。直
6、接荧光标记技术直接荧光标记技术直接荧光标记技术直接荧光标记技术(三)激光共聚焦扫描显微境(三)激光共聚焦扫描显微境 Laser confocal scanning microscope,LCSMl用激光作光源,逐点、逐行、逐面快速扫描,形成立体图像,可重构样品的三维结构。l能显示细胞样品的立体结构。l分辨力是普通光学显微镜的3倍。l用途类似荧光显微镜,但可以排除焦平面以外光的干扰,增强图像反差和提高分辨率。laser confocal scanning microscope,LCSM激光共聚焦扫描显微镜光路图(原理)LCSM Image of a Xenopus Melanophore(爪蟾黑
7、色素细胞)microtubule cytoskeleton(green)and the nucleus(blue)http:/www.itg.uiuc.edu/l把透过标本的可见光的光光程程差差或或相相位位差差转换成振振幅幅差差,从而提高了各种结构间的对比度,使各种结构变得清晰可见。可可用用于于观观察察活活细细胞胞。在构造上,相差显微镜有不同于普通光学显微镜两个特殊之处。1.环形光阑(annular diaphragm):位于光源与聚光器之间。2.相位板(annular phaseplate):物镜中加了涂有氟化镁的相位板,可将直射光或衍射光的相位推迟1/4。(四)相差显微镜(四)相差显微镜相
8、差显微镜相差显微镜相差显微镜相差显微镜原理原理原理原理可用于可用于观察活细胞观察活细胞用途:观察未经染色的玻片标本用途:观察未经染色的玻片标本(五)微分干涉相差显微镜(五)微分干涉相差显微镜 Differential interference contrast microscope(DIC)l1952年Nomarski发明,利用两组平面偏振光的干涉,加强影像的明暗效果,能显示结构的三维立体投影。标本可略厚一点,折射率差别更大,故影像的立体感更强。l偏振光经合成后,使样品中厚度上的微小区别转化成明暗区别,增加了样品反差且具有立体感。适于研究活细胞中较大的细胞器。微分干涉显微镜微分干涉显微镜原理原
9、理(六)(六)录像增差显微镜技术录像增差显微镜技术(video-enhance microscopy)计算机辅助的微分干涉显微镜可在高分辨率下研究活细胞中的颗粒及细胞器的运动(七)暗视野显微镜(七)暗视野显微镜 dark field microscopel聚光镜中央有挡光片,照明光线不直接进入物镜,只允许被标本反射和衍射的光线进入物镜,因而视野背景是黑的,物体边缘是亮的。l可观察 4200nm的微粒子,分辨率比普通显微镜高50倍。(八)偏光显微镜(八)偏光显微镜polarizing microscopel用于检测具有双折射性的物质,如纤维丝、纺锤体、胶原、染色体等。l光源前有偏振片(起偏器),
10、使进入显微镜的光线为偏振光,镜筒中有检偏器(与起偏器方向垂直的偏振片)。l载物台是可以旋转。淀粉(九)当代显微镜的发展趋势(九)当代显微镜的发展趋势l采用组合方式,集普通光镜、相差、荧光、暗视野、DIC、摄影装置于一体。l自动化与电子化。二、电子显微镜二、电子显微镜(一)透射电子显微镜一)透射电子显微镜transmission electron microscope,TEMl以电子束作光源,电磁场作透镜。电子束波长与加速电压(通常50120KV)的平方根成反比。l由电子照明系统、电磁透镜成像系统、真空系统、记录系统、电源系统等5部分构成。l分辨力0.2nm,放大倍数可达百万倍。l用于观察超微结
11、构(小于0.2m)。1.原理原理透射电子显微镜透射电子显微镜TRANSMISSION ELECTRON MICROSCOPE,TEM电子显微镜的基本构造电子显微镜的基本构造TEM LIGHT PATHWAY电镜与光镜的比较电镜与光镜的比较 电子显微镜与光学显微镜的基本区别电镜与光镜光路图比较电镜与光镜光路图比较2、制样技术l(1)超薄切片超薄切片l用于电镜观察的标本须制成厚度仅50nm的超薄切片,用超薄切片机(ultramicrotome)制作。l通常以锇酸和戊二醛固定样品,丙酮逐级脱水,环氧树脂包埋,以热膨胀或螺旋推进的方式切片,重金属(铀、铅)盐染色。超薄切片机超薄切片机超薄切片机超薄切片
12、机样本制备样本制备样本制备样本制备示意图示意图示意图示意图(2)负染技术负染技术(Negative staining)l用重金属盐(如磷钨酸或醋酸双氧铀)染色;吸去染料干燥后,样品凹陷处铺了一层重金属盐,而凸出的地方没有染料沉积,从而出现负染效果,分辨力可达1.5nm左右。Negative Stained Archaebacteria 金属投影金属投影(3)冰冻蚀刻冰冻蚀刻 freeze-etchingl亦亦称称冰冰冻冻断断裂裂。标标本本置置于于干干冰冰或或液液氮氮中中冰冰冻冻。然然后后断断开开,升升温温后后,冰冰升升华华,暴暴露露断断面面结结构构。向向断断面面喷喷涂涂一一层层蒸蒸汽汽碳碳和和
13、铂铂。然然后后将将组组织织溶溶掉掉,把把碳碳和和铂铂的的膜膜剥剥下下来来,此此膜膜即即为为复复膜膜(replica)。冰冻断裂与蚀刻复型:主要用来观察膜断裂面的蛋白质颗粒和膜表面结构。技术示意图技术示意图an onion root tip cell with no etching.l断面的三种处理方法:l蚀刻(etching)、不蚀刻(no etching)、深度蚀刻(deep etching,主要用于观察细胞质中的细胞骨架纤维及其结合蛋白)培养细胞内面的深度蚀刻电镜照片,示 Clathrin衣被快速冷冻快速冷冻深深度蚀刻技术度蚀刻技术(4)电镜三维重构技术电镜三维重构技术 电子显微术、电子衍
14、射与计算机图象处理相结合而形成的具有重要应用前景的一门新技术。电镜三维重构技术与X-射线晶体衍射技术及核磁共振分析技术相结合,是当前结构生物学(Structural Biology,主要研究生物大分子空间结构及其相互关系)的主要实验手段。l20世纪60年代问世,用来观察标本表面结构。l分辨力为610nm,由于人眼的分辨力(区别荧光屏上距离最近两个光点的能力)为0.2mm,扫描电镜的有效放大倍率为0.2mm/10nm=20000X。l电子“探针”扫描,激发样品表面放出二次电子,探测器收集二次电子成象。CO 2临界点干燥法防止引起样品变形的表面张力问题。(二)扫描电子显微镜(二)扫描电子显微镜Sc
15、anning electron microscope(SEM)l工作原理:是用一束极细的电子束扫描样品,在样品表面激发出次级电子,次级电子的多少与样品表面结构有关,次级电子由探测器收集,并经闪烁器转变成光信号,再经光电倍增管和放大器转变成电压信号来调制荧光屏上电子束的强度,显示出与电子束同步的扫描图像。l为了使标本表面发射出次级电子,标本在固定、脱水后,要喷涂上一层重金属膜,重金属在电子束的轰击下发出次级电子信号。SEM LIGHT PATHWAY人类红细胞人类红细胞酵母酵母人类精子人类精子三、扫描隧道显微镜三、扫描隧道显微镜三、扫描隧道显微镜三、扫描隧道显微镜scanning tunneli
16、ng microscopescanning tunneling microscope,STMSTMl原理:根据量子力学中的隧道效应设计,当原子尺度的针尖在不到一个纳米的高度上扫描样品时,此处电子云重叠,外加一电压(2mV2V),针尖与样品之间形成隧道电流。电流强度与针尖和样品间的距离有函数关系,将扫描过程中电流的变化转换为图像,即可显示出原子水平的凹凸形态。l装置:扫描的压电陶瓷,逼近装置,电子学反馈控制系统和数据采集、处理、显示系统。l分辨率:分辨本领高,横向为0.10.2nm,纵向可达0.001nm。l用途:三态(固态、液态和气态)物质均可进行观察。属非破坏性测量。是纳米生物学研究领域中的重要工具 扫描隧道显微镜原理引自引自http:/www.iap.tuwien.ac.at STM image of a DNA molecule