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1、生化期末复习第22章 糖酵解作用1、糖酵解途径由葡萄糖分别分解到乙醇或乳酸两条途径的异同点 简答不同点:葡萄糖分解最终产生乙醇是在以酵母菌为例的生物中;而葡萄糖分解最终产生乳酸是在以人为例的生物中。相同点:(1)两条途径的葡萄糖分解过程都是在细胞质中进行的。 (2)两条途径所产生的能量一样,获能效率相同. (3)两条途径均不需氧2、由葡萄糖经糖酵解途径分解到乙醇或乳酸的产能计算。葡萄糖经糖酵解途径分解到乙醇或乳酸,两者产能一样。糖酵解的(1)、(3)两步为耗能反应。 (1)耗能:1 mol ATP (3)耗能:1 mol ATP糖酵解的(7)、(10)两步为放能反应。由于糖酵解的第(5)步之后
2、,所有反应的底物、产物及能量的变化均加倍。故 (7)产能:12 mol ATP (10)产能:12 mol ATP所以,总产能:2+2-1-1=2 mol ATP计算获能效率1摩尔G 2摩尔乳酸,已知:反应共放热196KJ(47千卡),而1摩尔ATP水解放能30.514KJ(7.3千卡),求获能效率? 解:=(230.514)100%/196=31%1摩尔G2摩尔乙醇,已知:反应共放热56千卡,求获能效率? 解:=(27.3)100%/56=26%第23章 柠檬酸循环1、糖有氧氧化的反应场所 填空糖有氧氧化分三个阶段:糖酵解、丙酮酸氧化脱羧和柠檬酸循环。 糖酵解的反应场所是细胞质中。丙酮酸氧化
3、脱羧和柠檬酸循环的反应场所:在原核细胞中,是在细胞膜上进行;在真核细胞中,是在线粒体内膜上进行。2、柠檬酸循环中第1次和第2次氧化脱羧基反应是哪两步?第1次:第(4)、(5)步 草酰琥珀酸氧化脱羧生成-酮戊二酸第2次:第(6)布 -酮戊二酸氧化脱羧生成琥珀酰-CoA3、丙二酸抑制细胞呼吸的机理丙二酸抑制细胞呼吸主要表现在柠檬酸循环中琥珀酸在琥珀酸脱氢酶的作用下生成延胡索酸的反应中。因为丙二酸与琥珀酸结构类似,可以作为琥珀酸脱氢酶的强抑制剂。当它与该酶结合时,使琥珀酸无法与该酶结合反应脱羧,使柠檬酸循环无法正常进行,抑制细胞呼吸。4、柠檬酸循环回补反应的主要途径 简答(1)、丙酮酸的羧化:丙酮酸
4、在丙酮酸羧化酶的催化下,羧化生成草酰乙酸。此反应需生物素作为辅酶。动物、植物和微生物中,还存在由苹果酸酶和苹果酸脱氢酶联合催化,以NAD+为辅酶,由丙酮酸生成草酰乙酸的反应。(2)、磷酸烯醇式丙酮酸的羧化:磷酸烯醇式丙酮酸在磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶作用下,羧化生成草酰乙酸,同时脱去一分子磷酸。草酰乙酸经加氢转变成苹果酸,穿梭进入线粒体内脱氢,还原成草酰乙酸。(3)、天冬氨酸和谷氨酸等的转氨基作用:天冬氨酸和谷氨酸等经脱氨基作用形成草酰乙酸和-酮戊二酸。异亮氨酸、缬氨酸、苏氨酸和甲硫氨酸等可转变成琥珀酰辅酶A。第24章 生物氧化1、生物氧化的特点 简答(1)生物氧化在细胞内进行。(2)生物氧化在体
5、温、近中性pH(7.0)及有水环境中进行,即反应条件温和。(3)生物氧化需酶、辅酶、中间传递体等的催化。(4)生物氧化逐步进行,能量逐步释放。(5)生物氧化中释放的能量常先贮存在高能化合物,主要是ATP中,再经转化,供给机体的需能反应。2、两条典型呼吸链递体的排列顺序 填空 必考NADH呼吸链: NADFMNCoQCytbCytc1CytcCytaa3OFADH2呼吸链: FADCoQCytbCytc1CytcCytaa3O3、化学渗透假说的主要内容 名词解释电子传递链是个H+泵,可将H+从线粒体基质中泵出内膜外,在内膜内、外形成H+梯度,积累起电化学势能。被泵出的H+ 被H+浓度梯度趋使,通
6、过ATP合酶的H+离子通道又流回线粒体基质,此释放自由能的反应与ATP合成反应相偶联。4、1mol葡萄糖有氧氧化的产能计算 耗能底物水平磷酸化 产能电子水平磷酸 化 产能净得 糖酵解1-1 -1 3-1 -1 61.5*2/2.5*2 3/571*2 2101*2 2丙酮酸氧化脱羧 2.5*2 5柠檬酸循环 42.5*2562.5*2571*2 281.5*2 3102.5*25总计 30/32 1.5*2/2.5*2:1.5*2:3-磷酸-甘油穿越途径 2.5*2:苹果酸-天冬氨酸穿越途径第25章 磷酸戊糖途径和糖的其他代谢途径1、磷酸戊糖途径的特点(1)葡萄糖直接脱氢和脱羧,不需经糖酵解途
7、径和三羧酸循环。(2)脱氢酶的辅酶为NADP+而不是NAD+。2、什么是糖异生?糖异生的生理意义糖异生:许多非糖物质,如:甘油、丙酮酸、乳酸及某些氨基酸等,能在动物肝脏等处转变为葡萄糖。这种由非糖物质转变成糖的酶促过程称糖异生作用生理意义:(1)在饥饿状态下,维持血糖浓度的相对恒定。(2)回收乳酸能量,更新肌糖原,防止乳酸中毒。(3)协助氨基酸代谢。第28章 脂肪酸的分解代谢1、 以软脂酸为例计算-氧化的产能第1次循环: 一分子乙酰辅酶A经TCA循环=20/2=10摩尔 一分子FADH2经呼吸链产ATP = 1.5摩尔 一分子NADH+H+经呼吸链产ATP = 2.5摩尔 反应(1)消耗 1摩
8、尔ATP中2个高能键 净得 =14 2 =12摩尔在第26次循环中:无需再次活化,所以无需再次耗能 净得 145=70第7次循环中:可得2分子乙酰CoA、1分子FADH2和1分子NADH+H+。 净得 20+1.5+2.5=24所以,软脂酸-氧化产ATP总数为:12+70+24=106 mol ATP2、含奇数个C和偶数个C的脂肪酸如何经-氧化彻底分解奇数个C:奇数个碳原子的脂肪酸,经-氧化会产生若干分子乙酰-CoA及1分子丙酰-CoA。丙酰辅酶A在动物体内代谢如下:丙酰-CoA先经羧化生成D-型甲基丙二酰-CoA,再经2次异构化而生成琥珀酰-CoA。此物为柠檬酸循环反应(6)的产物,最终进入
9、TCA循环被分解。而乙酰-CoA则直接进入柠檬酸循环分解产能。偶数个C:偶数个碳原子的脂肪酸,经-氧化会产生大量乙酰-CoA,而乙酰-CoA则直接进入柠檬酸循环分解产能。3、什么是酮体?其生成的生理意义?酮体:在肝、肾细胞中则有几种活性很强的酶,能将乙酰-CoA缩合为乙酰乙酸、-羟丁酸和丙酮,临床上把这三者合称为酮体。其中,乙酰乙酸占30%,-羟丁酸占70%,丙酮的量极少。生理意义:(1)、肝外组织对酮体的利用:酮体为肝外组织提供了可利用的能源。(2)、酮体是脂肪酸加工的“半成品”:酮体分子量小、水溶性较强、便于运输,有利于肝外组织对酮体的利用。 第29章 脂类的生物合成1、脂肪酸合成中,乙酰
10、-CoA为何需要被转运?是如何转运?为何需要被转运:乙酰-CoA是在线粒体内生成的,而脂肪酸是在线粒体外合成的,生成的乙酰-CoA又不能直接透过线粒体膜到细胞质中去,故乙酰-CoA需要被转运出线粒体才能供给合成脂肪酸。如何转运:动物机体中,可在ATP供能的情况下,以柠檬酸穿梭方式将乙酰-CoA转运到线粒体内。动物体内的乙酰-CoA,也可借酰基载体:肉碱的作用,将其上的乙酰基转运出线粒体外。植物体内,线粒体内产生的乙酰-CoA先脱去辅酶A基团,以乙酸的形式被运出线粒体;在线粒体外,再由脂酰-CoA合成酶催化,乙酸重新生成乙酰-CoA。2、脂肪酸的从头合成与-氧化的不同点脂肪酸合成脂肪酸-氧化反应
11、场所大多细胞质中,少数线粒体和微粒体内只能在线粒体中反应单位对CO2的需要 丙二酰-CoA需CO乙酰-CoA不需CO 催化酶 复合酶体系单体酶酰基载体 ACPHSCoA氢受(供)体 NADPH+H+FAD和NAD+3、线粒体与内质网中脂肪酸碳链延长系统作用的异同点不同点:(1)、线粒体中的碳链延长系统是以乙酰-CoA作为原料;而内质网中的碳链延长系统是以丙二酰-CoA作为原料。(2)、线粒体中的碳链延长系统与脂肪酸-氧化的逆过程类似;内质网中的碳链延长系统与脂肪酸从头合成相同。(3)、线粒体中的碳链延长系统不能用于合成新链;而内质网中的碳链延长系统可用于合成新链。(4)、线粒体中的碳链延长系统
12、最多延长至18个碳;而内质网中的碳链延长系统最多延长至2224个碳。相同点:(1)、两者都以NADPH+H+供氢。(2)、两者都可用于延长饱和及不饱和脂肪酸的碳链。(3)、两者的酰基载体都是HSCoA。(4)、两者均以2碳为单位延长。第30章 蛋白质降解和氨基酸分解代谢1、脱氨基作用的主要分类联合脱氨基作用:一般认为,氨基酸在体内不是直接氧化脱氨基,而是先与-酮戊二酸经转氨基作用转变为相应的-酮酸和谷氨酸,谷氨酸再通过2种方式氧化脱氨基。(1)、转氨酶-谷氨酸脱氢酶的联合脱氨基作用:-氨基酸先与-酮戊二酸在转氨酶的催化下,经转氨基作用,生成相应的-酮酸和谷氨酸;谷氨酸再经谷氨酸脱氢酶的作用,进
13、行氧化脱氨基,重新生成-酮戊二酸,并释放出氨。(2)、转氨酶-嘌呤核苷酸循环联合脱氨基作用:-酮戊二酸先接受来自其他氨基酸的氨基,生成谷氨酸;谷氨酸再与草酰乙酸经转氨基生成天冬氨酸。之后便与嘌呤核苷酸联合作用:次黄嘌呤核苷酸与天冬氨酸作用,生成中间产物:腺苷酸代琥珀酸。此物在裂合酶催化下,分裂成腺苷酸和延胡索酸。腺苷酸水解后产生游离氨和次黄嘌呤核苷酸。转氨基:转氨基作用是-氨基酸和-酮酸间的氨基转移反应。除赖氨酸、苏氨酸和甘氨酸外,其余-氨基酸均可参加转氨基作用,且各有其特异的转氨酶。转氨酶中,以谷丙转氨酶GPT和谷草转氨酶GOT最为重要。2、氨基酸如何经脱羧基作用分解代谢氨基酸在脱羧酶作用下
14、,脱羧生成CO氨基酸在脱羧酶作用下,脱羧生成CO及胺。氨基酸脱羧后生成的CO2,大部分直接排出细胞外,小部分被固定成为细胞内的组成成分。氨基酸脱羧的另一产物:胺,一部分具有药物作用,但绝大多数胺类对动物有毒。动物体内具有胺氧化酶,可继续氧化胺为醛及氨;醛被进一步氧化为脂肪酸,再沿脂类代谢途径分解。3、为何缺乏尿素循环酶类的病人无法食用蛋白质?该如何治疗?为何其中枢神经系统和肝脏易受毒害?为何缺乏尿素循环酶类的病人无法食用蛋白质:蛋白质分解成氨基酸,而氨基酸的脱氨基产物为氨,若缺乏尿素循环酶类,氨无法经过尿素循环生成尿素排出体外,故无法食用蛋白质。如何治疗:将病人膳食中的蛋白质换成必需氨基酸相应
15、的-酮酸,便可得到治疗。为何其中枢神经系统和肝脏易受毒害:中枢神经系统:氨浓度较高时,线粒体中发生: NH3+-酮戊二酸+NADH+H+ 谷氨酸+NAD+H2O-酮戊二酸同时又是柠檬酸循环中反应(6)的底物。所以游离氨与柠檬酸循环争夺-酮戊二酸并占优势,使柠檬酸循环因缺乏中间产物:-酮戊二酸而被迫减慢速度甚至停顿下来,使与柠檬酸循环紧密联系的呼吸链也受影响,从而使对O2浓度最敏感的中枢神经系统表现出缺氧。肝脏:在病人肝脏中,因柠檬酸循环的停顿而使脂类代谢中产生的乙酰-CoA无法彻底氧化分解,只能转变为酮体。酮体中多为酸性物质,若在血液中过量积累,会使血液pH值下降,出现酸中毒现象。4、生糖氨基
16、酸、生酮氨基酸、生糖兼生酮氨基酸的定义生糖氨基酸:能通过代谢转变成葡萄糖的氨基酸。生酮氨基酸:经过代谢能产生酮体的氨基酸。生糖兼生酮氨基酸:在体内既能转变成糖又能转变酮体的一类氨基酸。 第 31 章 氨基酸及其重要衍生物的生物合成1、必需氨基酸和非必需氨基酸的定义必需氨基酸:人体自身不能合成或合成速度不能满足人体需要,必须从食物中摄取的氨基酸。非必需氨基酸:人或动物机体能自身合成,不需通过食物补充的氨基酸。2、按合成起始物,氨基酸如何分类?分为6类:谷氨酸族氨基酸:由柠檬酸循环中间产物-酮戊二酸衍生而来的氨基酸。天冬氨酸族氨基酸:由草酰乙酸衍生而来的氨基酸。丙酮酸族氨基酸:由糖酵解产物:丙酮酸
17、衍生而来的氨基酸。属于这族的氨基酸有丙氨酸、缬氨酸。丝氨酸族氨基酸:由糖酵解中间产物:3-磷酸-甘油酸衍生而来的氨基酸。芳香族氨基酸:由磷酸戊糖途径中间产物:4-磷酸-赤藓糖和糖酵解中间产物:磷酸烯醇式丙酮酸衍生而来的氨基酸。组氨酸:合成起始物是5-磷酸-核糖。3、 生成谷氨酸的主要途径有两种成途径:1由-酮戊二酸形成谷氨酸:-酮戊二酸与游离氨在L-谷氨酸脱氢酶催化下发生氨基化作用。动物体内,L-谷氨酸脱氢酶可利用NAD+/NADH和NADP+/NADPH两类辅酶。2由-酮戊二酸形成谷氨酰胺:先由-酮戊二酸氨基化生成L-谷氨酸,再由L-谷氨酸生成谷氨酰胺。4、芳香族氨基酸合成的共同途径共同途径
18、:合成的起始物是磷酸戊糖途经的中间产物:4-磷酸-赤藓糖和糖酵解过程的一个中间产物磷酸烯醇式丙酮酸。两者缩合形成一个七碳酮糖开链磷酸化合物,称为3-脱氧-7-磷酸-阿拉伯庚酮糖酸,再经脱鳞酸环化,形成苯环后有脱水、加氢形成莽草酸。5、酰胺类氨基酸如何合成谷氨酰胺:先由-酮戊二酸氨基化生成L-谷氨酸,再由L-谷氨酸生成谷氨酰胺。天冬酰胺:天冬氨酸-羧基上转移上一个来自谷氨酰胺的酰胺基,生成天冬酰胺。两者谁更能合成:在谷氨酰胺合成反应中,ATP 只被打断1个高能磷酸键而生成ADP;而天冬酰胺合成反应中,ATP则被打断2个高能键生成AMP和PPi。因此从能量角度看,天冬酰胺的合成反应比谷氨酰胺合成更
19、易进行。6、氨基酸互相转化的例子脯氨酸的合成:先由-酮戊二酸氨基化形成谷氨酸。再由ATP供磷酸,谷氨酸生成-谷氨酰磷酸中间体。此中间产物在还原酶催化下,由NAD(P)H+H+ 供氢,-位上羧基被还原成醛基,生成谷氨酸半醛。然后自发脱水环化,生成二氢吡咯-5-羧酸。最后在二氢吡咯-5-羧酸还原酶作用下,由NAD(P)H+H+供氢,将不饱和C=N双键还原成饱和键,生成脯氨酸。酪氨酸的合成:合成的起始物是磷酸戊糖途经的中间产物:4-磷酸-赤藓糖和糖酵解过程的一个中间产物磷酸烯醇式丙酮酸。两者缩合形成一个七碳酮糖开链磷酸化合物,称为3-脱氧-7-磷酸-阿拉伯庚酮糖酸,再经脱鳞酸环化,形成苯环后有脱水、
20、加氢形成莽草酸。莽草酸经一系列反应生成分支酸,分支酸在分支酸变位酶作用下,转变为预苯酸。预苯酸经氧化脱羧作用形成对羟苯丙酮酸,再由谷氨酸进行转氨基即形成酪氨酸。 第33章 核酸的降解和核苷酸代谢1、核酸降解的过程核酸分解过 核酸酶 核苷酸酶 核苷酶核酸核苷酸 磷酸+核苷碱基+戊糖2、核酸内切酶和核酸外切酶的比较以及限制性核算内切酶的定义比较:核酸外切酶:作用于核酸链的一端,逐个水解下核苷酸的核酸酶为核酸外切酶。为非特异性核酸酶,对于RNA、DNA及低分子量寡核苷酸等底物都能分解。核酸内切酶:能水解核酸分子内部磷酸二酯键的磷酸二酯酶称核酸内切酶。特异性强。限制性核算内切酶的定义:细菌体内存在着一
21、类能识别并水解外源双链DNA的核酸内切酶3、核苷酸的合成主要途径(1)从氨基酸、Pi、核糖、CO和NH等简单化合物合成核苷酸,此途径经过从碱基到核苷的中间阶段,称“从头合成或从无到有途径”;(2)由核酸分解的中间产物:碱基和核苷再转变为核苷酸,称“补救途径”。4、嘌呤核苷酸和嘧啶核苷酸从头合成原子来源及其它核苷酸如何经IMP、UMP转化而来嘌呤核苷酸: 必考N1来自天冬氨酸的氨基氮,甲酸盐是C2和C8的来源,N3和N9来自于谷氨酰胺的酰胺氮,甘氨酸是C4、C5和N7的来源, CO2或碳酸氢盐是C6的来源。嘧啶核苷酸: 必考嘧啶核苷酸从头合成途径中,嘧啶环上原子来源于:C2、N3来自于CO2、N
22、H3(或氨甲酰磷酸);N1、C4、C5、C6来自于天冬氨酸。其它核苷酸如何经IMP、UMP转化而来腺嘌呤核苷酸的合成:(1) SAMP合成酶 IMP + 天冬氨酸 + GTPSAMP + GDP + Pi Mg2+ (2) SAMP裂解酶 SAMP AMP + 延胡索酸反应本质:在C6上加上一个氨基。所以,腺苷酸是由次黄苷酸IMP氨基化而来。鸟嘌呤核苷酸的合成:1) IMP脱氢酶、 K+ IMP + NAD+ + H2OXMP+ NADH + H+ (2) GMP合成酶 XMP + NH3 + ATP GMP+ AMP + ppi 所以,鸟苷酸由IMP氧化、氨基化而来。胞嘧啶核苷酸的合成:(1
23、) UMP磷酸激酶、 Mg2+ UMP + ATP UDP + ADP(2) UDP激酶 、 Mg2+ UDP + ATP UTP + ADP(3) CTP合成酶 、 Mg2+ UTP+NH3+ATP+H2O CTP+ADP+Pi胸腺嘧啶核苷酸的合成:合成过程:先由UMP还原,生成dUMP;再在嘧啶环C5上甲基化而成。5、为什么氨基蝶呤、氨甲基喋呤能抑制核苷酸的合成?氨基蝶呤、氨甲基喋呤等,是叶酸的结构类似物,可对二氢叶酸还原酶起到竞争性抑制剂作用,N10-甲酰-四氢叶酸无法供氨基给dUMP生成dTMP,从而减慢甚至终止核苷酸的合成。6、两条核苷酸合成补救途径嘌呤核苷酸合成的补救途径有2条:(
24、1)、第一条补救途径此途径在生物体内不重要。(2)、第二条补救途径:游离嘌呤碱基可在磷酸核糖转移酶催化下,直接和PRPP反应,生成5-核苷酸。该途径重要。嘧啶核苷酸合成的补救途径,也有2条:(1)、第一条补救途径:这条补救途径在嘧啶核苷酸合成补救途径中起重要作用。(2)、第二条补救途径:该途径不重要7、核糖核苷酸还原酶系的组成和还原过程催化还原酶系包括:由R1(调节亚基)、R2二亚基组成的核糖核苷酸还原酶、硫氧还蛋白还原酶和硫氧还蛋白。还原过程:核苷二磷酸再在核糖核苷酸还原酶作用下,被还原型硫氧还蛋白所还原,脱下核糖C2-OH上的氧,生成脱氧核苷二磷酸。还原型硫氧还蛋白转变为氧化型,并可在硫氧
25、还蛋白还原酶催化下,由NADPH + H+ 供氢,再被还原为还原型,循环参加反应。 第34章 DNA的复制和修复1、复制、转录、翻译的定义复制:指以亲代DNA分子双链为模板,按照碱基配对原则,合成与亲代DNA分子相同的两个双链DNA分子的过程。转录:是以DNA分子中一条链为模板,按照碱基配对原则,合成一条与模板DNA互补的RNA分子的过程。翻译:又称“转译”,是指在mRNA指令下,按照三联体密码原则,把mRNA上遗传信息转换成蛋白质中特定氨基酸顺序的过程。2、什么是Klenow片段?有何功能?Klenow片段:用枯草杆菌蛋白酶处理DNA聚合酶,可得到相对分子量分别为68000和35000的两个
26、片段。较大的片段称Klenow片段功能:53聚合酶的功能和35外切酶的功能3、什么是DNA的半不连续复制?发生的原因DNA的半不连续复制:前导链连续复制、滞后链不连续复制的现象,称“DNA的半不连续复制”。原因:DNA聚合酶催化合成的方向为53,而DNA分子的两条链是反向平行的,一条链的走向是35,另一条的走向是53;所以它们复制的互补链的走向为53和35。 35复制的互补链53合成能正常合成,而53复制的互补链35的合成则是有许多53方向合成的DNA片段连接起来的。4、大肠杆菌DNA聚合酶、的异同点相同点:(1)、都需模板指导,以四种脱氧核苷三磷酸为底物,且需具有3-羟基的引物存在,聚合反应
27、沿53方向进行。(2)、都兼有35核酸外切酶活力,在聚合中起校对作用。不同点:(1)、酶具有53核酸外切酶活力,酶和没有这种活力。(2)、酶和最适合作用于有小段缺口的双链DNA;酶最适合作用于具有大段单链区的双链DNA。(3)、酶为单体酶,而酶和则为寡聚酶。(4)、酶催化聚合速度最快,酶其次,酶最慢。5、DNA复制的特点半保留复制:在每个子代分子中,都有一条链来自亲代DNA,另一条链则是新合成的。这种复制方式称“半保留复制”。半不连续复制:前导链连续复制、滞后链不连续复制的现象,称“DNA的半不连续复制”。6、DNA损伤修复种类及其定义细胞内已知主要的修复系统:错配修复、直接修复、切除修复、重
28、组修复和易错修复。(一)错配修复:DNA复制中可能发生错配,若能及时校正,则新链上基因编码的信息可得到恢复,即进行错配修复。(二)直接修复:包含光修复和暗修复。(三)切除修复:在酶的作用下,将DNA分子中受损部分切除,再以完整的那条链为模板,合成被切掉的部分,使DNA恢复正常结构。包括切开、切除受损部分、修补及封口4步。(四)重组修复:DNA复制后修复。必须通过DNA复制过程中两条DNA链的重组交换而完成DNA的修复。(五)易错修复:在DNA损伤时,缺乏校对功能的DNA聚合酶常在受损部位进行DNA复制以避免细胞死亡,但同时又导致较高的差错率的修复方式。 第36章 RNA的生物合成和加工1、为什
29、么RNA转录为不对称转录染色体上各基因的负链并不一定在同一条DNA单链上,转录时仅以DNA一条链的某一区段作为模板,因此称“不对称转录” 。2、大肠杆菌RNA聚合酶各亚基组成及各亚基功能组成:原核生物大肠杆菌的RNA聚合酶全酶由5个亚基(2)构成。功能:亚基上有亚基结合位点,功能是进行全酶装配及与DNA模板上的启动子区结合。亚基上有底物NTP结合部位,功能是结合NTP底物、引发RNA新链合成及催化延长。亚基可与DNA模板结合,且与转录的终止有关。亚基上有DNA启动子识别位点,可进行启动子识别,促进转录起始,又称“起始亚基”。3、大肠杆菌RNA转录终止子的类型其DNA上有2类终止子。一类是不依赖
30、于因子的终止子,又称简单终止子。简单终止子除能形成发夹结构外,在终点前还有寡聚U系列,可能提供信号使RNA聚合酶脱离模板DNA。此外,其回文对称区常有一段富含G-C的序列。另一类为依赖于因子的终止子。因子先结合到RNA新链上,位置在RNA聚合酶后。然后借助水解NTP释放的能量推动自身在RNA链上移动。当RNA聚合酶遇到终止子而转录暂停时,因子追上RNA聚合酶并将RNA新链从模板DNA上释放。4、大肠杆菌tRNA及真核生物mRNA前提加工主要内容大肠杆菌tRNA前体的转录后加工包括:由核酸内切酶或外切酶切除前体链5-和3-末端的多余核苷酸序列;由核苷酰转移酶催化,在前体链的3-末端添加CCA三核
31、苷酸序列,作为翻译时氨基酸的结合部位;在一系列专一性酶促反应中对碱基、核糖等进行特征性修饰;等等。真核生物mRNA前提加工:真核生物mRNA前体的加工其实主要指hnRNA的加工。加工过程包括:在5-端形成特殊的帽子结构,在3-端添加多聚腺苷酸(即polyA)尾巴,剪除内含子并将外显子拼接起来,对链内特定核苷酸进行甲基化修饰;等等。 第 37 章 遗传密码1、遗传密码字典(起始密码子、终止密码子)共有64个密码子,其中有3个终止密码子,1个起始密码子兼甲硫氨酸密码子。终止密码子:UAA、UAG、UGA起始密码子兼甲硫氨酸密码子:AUG2、遗传密码的基本特征(1)、方向性:密码子的阅读方向和mRN
32、A上从起始信号到终止信号的方向一样,均为从5-端到3-端。(2)、简并性:密码表的64组密码子中,61组密码子分别代表20种氨基酸。(3)、通用性:病毒、原核生物或真核生物都共同使用同一套密码字典。(4)、读码的连续性:在mRNA链上,从起始信号到终止信号,密码子的排列一般是连续的。(5)、起始密码子和终止密码子:AUG除编码甲硫氨酸外,还是肽链合成的起始密码子。少数情况下,也有以GUG作为起始密码子的。一般由UAA、UAG和UGA这三组密码子作为多终止密码子。(6)、变偶性:密码子的专一性主要取决于前2位碱基,而第三位碱基重要性相对较低,可以有一定程度的变动。称“变偶性”。 第38章 蛋白质
33、合成及转运1、tRNA结构中的重要位点 必考tRNA上与多肽合成相关的位点有: 、tRNA上3-端CCA序列上的氨基酸接受位点, 、识别氨酰-tRNA合成酶位点, 、核糖体识别位点, 、反密码子位点。2、蛋白质生物合成的五大阶段蛋白质生物合成分5个阶段:氨基酸的活化、肽链合成的起始、肽链的延伸、肽链合成的终止与释放、翻译后加工。 第39章 细胞代谢与基因表达调控 除1题,其余必考1、基因选择性调控的各级水平基因表达的调节可在转录水平(包括转录前、转录中和转录后)或在翻译水平(包括翻译中和翻译后)上进行。2、以乳糖操纵子为例,介绍操纵子的定义以及其上各基因的功能定义:在细菌基因组中,编码一组在功
34、能上相关的蛋白质的几个结构基因,和共同的控制位点所组成的一个基因表达的协同单位,合称操纵子。操纵子是DNA上控制蛋白质合成的一个功能单位。功能:启动基因P提供转录起始信号,同时也是RNA聚合酶的结合位点。 操纵基因O和其下游的结构基因紧密结合,也可和调节基因的表达产物:阻遏蛋白结合。 调节基因R可经转录、翻译产生阻遏蛋白。阻遏蛋白控制着操纵基因的开或关。三个结构基因Z、Y、A可经转录、翻译,产生蛋白质产物,即三种酶:-半乳糖苷酶、-半乳糖苷透性酶和-半乳糖苷转乙酰酶。 终止基因t提供转录的终止信号。3、酶合成诱导及阻遏作用机理,以及两者的异同点乳糖操纵子中的三个结构基因Z、Y、A是作为一个单位
35、,同时进行转录和翻译。转录时,由RNA聚合酶结合到启动基因上,然后右行经过操纵基因,同时开始转录三个结构基因,最后,转录过程终止于终止基因。酶合成的诱导作用过程机理:调节基因经转录、翻译,生成阻遏蛋白,有活性的阻遏蛋白会结合到操纵基因上,使RNA聚合酶不能再结合到启动基因上,从而阻止下游三个结构基因的转录。当培养基中有乳糖存在时,乳糖作为诱导物,可与阻遏蛋白优先结合,生成二者复合物,使阻遏蛋白变构,失去活性,无法再与操纵基因结合,则阻遏作用消失。RNA聚合酶可以结合到启动基因上并右行,正常转录三个结构基因,并翻译产生三种酶蛋白分子。酶合成的阻遏作用机理:单独存在的阻遏蛋白无活性,不能与操纵基因
36、结合,即不能阻遏结构基因合成各种酶蛋白。当有辅阻遏物存在时,阻遏蛋白可与辅阻遏物结合,使阻遏蛋白被活化而变构。该复合物反而可与操纵基因相结合,使之被封闭,RNA聚合酶无法右行,导致结构基因不能合成相应的酶蛋白。异同点:不同点: 诱导作用是在各种分解酶中的通则,阻遏作用则是在合成酶中的通则。 诱导物一般是代谢过程中的底物,辅阻遏物一般是代谢过程中的产物。二者都作为阻遏蛋白的拮抗物,但拮抗作用的最终结果刚好相反。相同点: 目的都是控制酶合成的速度。 作用都具高度特异性。4、降解物阻遏作用机理降解物阻遏的机制:当有葡萄糖存在时,葡萄糖的降解物可抑制腺苷酸环化酶活性,激活磷酸二酯酶活性,这两个反应的综
37、合结果都是使得cAMP浓度下降,从而抑制除葡萄糖外的其他糖类代谢酶的转录。反之,当培养基中葡萄糖含量极少时,cAMP浓度上升,则可使除葡萄糖外的其他糖类代谢酶的转录加强。cAMP可与降解物基因活化蛋白CAP相结合。CAP是一种基因表达调节蛋白,它在乳糖操纵子上结合的CAP位点是启动子的一部分,位于RNA聚合酶结合位点上游。当CAP单独存在时,不能与CAP位点结合;当CAP与cAMP结合成复合物时,才能被活化,从而再与CAP位点结合。其结合到CAP位点上后,可引起启动子中RNA聚合酶结合位点处的DNA片段构象发生变化,从而促进RNA聚合酶与启动子结合,使转录起始更频繁。所以,cAMP浓度的升高可促进其他糖类代谢酶的转录活性。5、衰减作用机理衰减作用的机理:当培养基中无任何氨基酸时,前导肽不能形成,前导序列以A图样结构存在。此结构中1和2、3和4互相配对而形成特殊茎环构象及mRNA链末端的PolyU区都提供了终止信号,促使转录停止。当培养基中色氨酸丰富时,前导序列翻译产生前导肽。这时核糖体占据1和2位置,但3和4互补配对了,即形成终止信号,故转录也被终止。当培养基中有其他种类氨基酸但色氨酸量不足时,核糖体被阻滞在区域1的Trp密码子处,导致2和3配对,而3和4不能配对形成终止信号。这样转录可继续进行。