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1、第四章第四章 微生物的基因突变（微生物的基因突变（Microbial Mutation）4.1 4.1 突变的分子机制突变的分子机制4.2 4.2 突变引起遗传性状改变突变引起遗传性状改变4.3 4.3 突变体的形成突变体的形成什么是基因突变？什么是基因突变？1 是指DNA特定部位上核苷酸顺序的变化，致使蛋白质的结构改变，通常会导致个体表型发生变化。2 基因突变形成新的基因型在一定环境条件下表现出来的个体性状称为表型，突变结构产生新表型的个体，称为突变体或突变型。3 基因突变包括遗传物质的改变过程和突变体的形成。4 从广义上讲，除了转化、转导、接合等遗传物质的传递和重组引起生物变异外，任何表型
2、上可遗传的突变都属突变范围。基因突变是生物遗传性状改变的依据，能在生活周期的任何阶段发生，如在有性二倍体生物的生殖细胞和体细胞中都可能发生。生殖细胞中发生突变可遗传给后代，而体细胞中突变是不能遗传给后代的，只在当代个体的形态或生理上反应出某种改变。生殖细胞突变的结果，等位基因是显性的，后代将表现出新的表型。反之，突变后的等位基因是隐性的，则后代不会出现新的表型。如果突变发生在单倍体细胞中，其突变的等位基因不管是显性还是隐性的，都能呈现出新的表型。微生物的基因突变微生物的基因突变表型、遗传型表型、遗传型/基因型（基因型（genotypegenotype）：）：表型（表型（phenotypephe
3、notype）：个体性状表现，）：个体性状表现，基因型（基因型（genotypegenotype）：生物个体全部遗传因子（基因）的总和。）：生物个体全部遗传因子（基因）的总和。突变与突变体：突变与突变体：突变（突变（mutationmutation）：几率）：几率极低极低与与较小较小范围内范围内遗传遗传型的改变。型的改变。突变体（突变体（mutantmutant）：突变产生的新表型的个体）：突变产生的新表型的个体自发突变与诱发突变自发突变与诱发突变自发突变：自发突变：无人为参与、即生物体在自然环境条件作用下所产生的各种变异：原因：原因：（1）由背景辐射和环境因素的综合（2）生物体自身有害代谢物
4、的致变作用（3）在生物体内外环境下DNA互变异构效应（4）DNA复制过程中发生错误，如：环出效应等诱发突变：诱发突变：人为用化学、物理诱变剂处理微生物而引起的突变。特点：特点：速度快、时间短、频率低。突变的特点突变的特点不对应：致突性状与诱突因子无对应性不对应：致突性状与诱突因子无对应性自发性：性状突变可与人为诱变无关系自发性：性状突变可与人为诱变无关系罕见性：突变虽自发，但却突变率极低罕见性：突变虽自发，但却突变率极低独立性：任何性状突变各自独立发生的独立性：任何性状突变各自独立发生的稳定性：突变子一旦形成是可以遗传的稳定性：突变子一旦形成是可以遗传的可诱性：突变率可加大诱因而得以堤高可诱性
5、：突变率可加大诱因而得以堤高可逆性：既可正向突变又能回复变异之可逆性：既可正向突变又能回复变异之基因突变的具体类型基因突变的具体类型对染色体基因组来说，碱基置换仅是对染色体基因组来说，碱基置换仅是DNA结构的小损结构的小损伤伤microlesion与微改变与微改变，故称，故称点突变点突变point mutation。碱基置换只涉及碱基置换只涉及一对碱基被另一对碱基所替代一对碱基被另一对碱基所替代。以嘌呤类或嘧啶类碱基间的转换可称谓以嘌呤类或嘧啶类碱基间的转换可称谓碱基转换与碱基碱基转换与碱基颠换两类颠换两类碱基置换碱基置换substitutionsubstitution定义：定义：DNA分子中
6、的一个或几个核苷酸的分子中的一个或几个核苷酸的增加或缺失增加或缺失,从而使其后的密码子发生转录和转译错误而突变。从而使其后的密码子发生转录和转译错误而突变。移码突变移码突变frame-shift mutationframe-shift mutation定义：定义：DNA链上一个密码子的某个碱基和邻近密码子链上一个密码子的某个碱基和邻近密码子中的一个碱基对换。中的一个碱基对换。易位突变易位突变frame-shift mutationframe-shift mutationABC ABC ABC ABCABC ABB ACC ABCABC A C ABCB ABC易位易位丢失、加入丢失、加入染色体
7、畸变是染色体结构的变化，和其他突变一样可以引起遗传信息的改变，具有遗传效应。染色体结构改变多是染色体或染色单体遭到巨大损失，使它们断裂。断裂点是随机的也可能是多个。根据断裂的数目、位置、断裂连接方式等可以造成各种不同的突变，包括：包括：缺失缺失 deletion、重复、重复 duplication、插入、插入 insertion、易位、易位 translocation、倒位、倒位 invertion；染色体数目的变化染色体数目的变化。染色体畸变高等生物中常染色体畸变高等生物中常见见、原核中、原核中少见少见染色体畸变染色体畸变chromosomal abrrationchromosomal ab
8、rration缺失和重复缺失和重复缺失和重复主要在DNA复制和修复系统进行修饰过程中产生错误造成的。当DNA进行复制时，发生染色体断裂，前面链上的多聚酶掉落下来加到后面尚未复制的DNA上而加以复制，结果前面的链缺失了一个或几个基因的DNA节段，后面的链，由于多加了一段DNA，相同部分出现两次，结果造成突变。缺失损伤是不可逆的，对生物体而言也是有害的，会造成遗传平衡失调。重复突变，从微生物育种角度而言，可能获得具有人们需要的优良性状的新个体，如大幅度提高产量。缺失和重复缺失和重复倒位倒位倒位是指染色体部分节段的位置顺序颠倒而形成的一段不正常的染色体。倒位分臂内倒位和臂间倒位。前者染色体外形不会改
9、变，后者形状会发生改变，但两者表型基本一致。易位易位易位指同源染色体之间部分连接而交换。一种情况是两条同源染色体相互间进行部分交换，这种染色体交换节段长短有时可能不等，当长短不同时，会影响到染色体的外形；另一种是一条染色体的部分节段连接到另一非同源染色体上，也称单向易位。染色体组变染色体组变一般生物含有各种形态、大小、遗传功能不同的染色体各一条，称为染色体组，具有这样一套染色体组的生物叫单倍体生物，有两套染色体组的生物叫二倍体生物，有两套以上染色体组的生物叫多倍体生物，多倍体一般是由变异或异常形成的。（整倍体）染色体组变：指染色体数目的变化。它可分为整倍体和非整倍体，前者分为单倍体、三倍体、同
10、源多倍体和异源多倍体等。后者有超二倍体（2n+1）和亚二倍体（2n1）。遗传物质的改变是突变的基础，微生遗传物质的改变是突变的基础，微生物突变中以基因突变较常见。物突变中以基因突变较常见。1.1.同义突变和无义突变；同义突变和无义突变；2.2.错义突变；错义突变；3.3.移码突变移码突变DNA碱基置换的同义突变同义突变,same sense mutation,指DNA分子上的遗传密码由于置换而形成新的密码子，但是这种密码子构成的氨基酸与原密码子所构成的氨基酸相同。这是由于遗传密码具有简并性。CUA和CUG都翻译成亮氨酸mRNA碱基置换的无义突变无义突变,non sense mutation,指
11、DNA分子上的密码子中的碱基被置换后，形成了终止密码子（UAG），使转译工作中途停止，难以完成多肽链的合成，这种肽链没有活性。碱基置换的错义突变错义突变,mis-sense mutation,指DNA分子上的密码子的碱基被置换，形成新的密码子，它编写的氨基酸与原氨基酸不同，使多肽链上的氨基酸排序发生变化，生物表型因此会发生变化。此处亮氨酸变成缬氨酸。碱基置换的移码突变移码突变是在DNA分子上的密码子中添加或丢失一或几个碱基，其结构造成从改变的碱基开始所有其后的密码子碱基都往后移动，使多肽链上的氨基酸序列发生很大的变化，将出现明显的遗传性状变异。突变型的种类突变型的种类选择性突变选择性突变:在选
12、择性培养基上能快速鉴别与区分的突变。在选择性培养基上能快速鉴别与区分的突变。非选择性突变：非选择性突变：无法用选择性或鉴别性培养基来鉴别与区分的无法用选择性或鉴别性培养基来鉴别与区分的微生物突变。微生物突变。由由野生型菌株野生型菌株（wild type strain）通过通过基因突变基因突变而而丧失合成一种丧失合成一种或或几种生长因子的几种生长因子的能力。能力。在培养野生型菌株的在培养野生型菌株的基本培养基不能生长基本培养基不能生长，但可在，但可在加加入对应的生长因子入对应的生长因子后能从基本培养基中后能从基本培养基中筛选出筛选出。营养缺陷型（营养缺陷型（auxotrophauxotroph）
13、原始或原始或出发菌株出发菌株对某种对某种化学或物理因子无抗性化学或物理因子无抗性经基因经基因突变突变后成为具有后成为具有抗性抗性可在可在加有相应理化因子加有相应理化因子的平板中的平板中选择选择之之抗性突变型（抗性突变型（resistant mutantresistant mutant）出发菌株经突变出发菌株经突变在在某种条件某种条件下可下可生长生长，而在，而在另一种条件另一种条件下下不能生长繁殖不能生长繁殖。例：例：E.Coli Ts突变株突变株，即温度敏感突变株，即温度敏感突变株,有些菌株在有些菌株在37 oC下生长正常下生长正常,却不能在却不能在42 oC下生长下生长;T4噬菌体的某些突变
14、噬菌体的某些突变株在株在25 oC下下具有感染性具有感染性,而而37 oC下下丧失丧失条件致死突变型条件致死突变型即由突变而产生即由突变而产生个体或菌落形态个体或菌落形态所发生的所发生的非选择性突变非选择性突变例例:孢子有无孢子有无或或颜色变化颜色变化、鞭毛有无鞭毛有无或或荚膜有无荚膜有无的的突变，有时可引起菌落表观改变而具有选择性。突变，有时可引起菌落表观改变而具有选择性。形态突变型形态突变型(morphological mutant)(morphological mutant)基因突变基因突变导致导致菌体抗原结构菌体抗原结构发生变化发生变化类型多类型多：细胞壁：细胞壁成份改变成份改变或或丧
15、失、荚膜改变丧失、荚膜改变或或丧失丧失及及鞭毛的有无鞭毛的有无等。等。抗原性突变型抗原性突变型antigenic mutantantigenic mutant由基因突变所致的获得代谢产物的由基因突变所致的获得代谢产物的产量高于出发菌株产量高于出发菌株之变之变异株，常称异株，常称产量突变产量突变株或株或高产菌株高产菌株（high producing mutant）。）。产量性状产量性状是是多基因与复杂因素多基因与复杂因素的综合结果，的综合结果，故获取高产菌故获取高产菌株是一个逐步累积、变异机理十分复杂探索过程。株是一个逐步累积、变异机理十分复杂探索过程。分为：分为：正变株正变株（plus mut
16、ant）、）、负负变株变株（minus mutant）产量变异型产量变异型关于关于基因自发与不对应性基因自发与不对应性突变突变的的争论曾十分激烈争论曾十分激烈。而。而巧妙巧妙的构思的构思与与精密的实验精密的实验证明：证明：抗性突变体的产生是因为细菌和抗性因子长期接触得到“驯化”而产生相应性状吗？还是细菌本来就有这种抗性突变基因？波动试验波动试验（fluctuation test，1943）；）；涂布试验涂布试验（newcombe experiment 1949）；）；影印平板试验影印平板试验（replica plating，1952）基因自发与不对应性突变证明基因自发与不对应性突变证明波动试验
17、（fluctuation）1943年年Luria等设等设计并试验的计并试验的实验材料是大肠杆实验材料是大肠杆菌和噬菌体菌和噬菌体N代dilutionphageN代波动试验说明大肠杆菌对噬菌体的抗性突变体是在接触噬菌体之前的生长繁殖过程中自发形成，并稳定地进行传代，随着生长繁殖到一定的培养阶段，在培养物中就有大量的抗性个体产生。影印平板试验影印平板试验简便高效筛简便高效筛选突变选突变 方法。方法。影印培养法说明链霉素的抗性突变体是大肠杆菌在没有接触到药物之前就已经在的，是自发产生的，与周围环境中的链霉素毫无关系，它仅仅起着筛选检出的作用。第三节第三节 突变体的形成突变体的形成突变体是基因突变的结
18、果，它会影响或改变微生物某一形态或生化性状，通过细胞繁殖、分裂，由这种突变形成的性状遗传给后代，发育成的新遗传型个体。为什么基因突变却不一定能形成突变体？突变体形成的过程突变体形成的过程诱变剂与诱变剂与DNADNA接触接触突变发生突变发生突变体形成突变体形成亚硝酸所致的碱基转换过程亚硝酸所致的碱基转换过程A A氧化脱氨氧化脱氨为烯醇式为烯醇式次黄嘌呤次黄嘌呤后互变为后互变为酮式酮式,因酮式只能因酮式只能与与胞嘧啶配对胞嘧啶配对而第二次复制中转换成而第二次复制中转换成CGCG碱基碱基对。对。突变修复突变修复1 1 诱变剂与诱变剂与DNADNA接触前过程接触前过程诱变剂主要通过扩散作用穿过细胞壁、
19、细胞膜、细胞质到达核质体，其扩散速度、诱变效果与细胞壁的结构组成和细胞的生理状态有关，细胞质中的很多化学成分可能改变诱变剂的效应。2 2 突变发生过程突变发生过程诱变剂与DNA接触后能否发生基因突变，与DNA是否处在复制状态有密切关系。而DNA复制活跃程度与某些营养条件和细胞生理状态有关，DNA复制需要蛋白质合成作基础。例如：一个氨基酸营养缺陷型的大肠杆菌菌株，如果在培养基中除去它需要补给的氨基酸，培养12个小时后，用亚硝基胍进行诱发回复突变，其诱变效应显著下降。反之，则诱变频率提高。一般诱变剂进入细胞后，还会受到多种酶的影响。很多实验证实：在酶的作用下，有的诱变剂的作用加强了，有的却减弱了，
20、有的甚至完全变成了另外一种物质。因此有两个因素影响突变发生过程：一个是细胞内物质（特别是酶）和诱变剂的相互作用；另一个是培养条件对诱变效应的影响。3 3 突变的修复突变的修复突变的修复也是遗传信息稳定性的体现。在诱变剂的作用下基因会发生突变。而突变和修复形成一对矛盾。这就象革命过程中传统旧势力和新生势力之间的较量。突变的修复突变的修复正常体正常体突变体突变体突变突变修复修复突变的修复作用：突变的修复作用：（1 1）光修复）光修复（2 2）切补修复（暗修复）切补修复（暗修复）（3 3）重组修复）重组修复（4 4）SOSSOS修复系统修复系统（5 5）DNADNA聚合酶校正作用聚合酶校正作用光复活
21、作用光复活作用：微生物微生物 uv 死亡死亡 可见光可见光微生物微生物死亡死亡率下降率下降。E.coli实验（实验（1949年，A Kelner）:试验组试验组8x106个个/ml UV 100个个/ml E.Coli对照组对照组8x106个个/ml uv 可见光可见光 2x106个个/ml 原因：原因：紫外线诱发微生物紫外线诱发微生物DNADNA突变的机制主要是形突变的机制主要是形成嘧啶二聚体，使成嘧啶二聚体，使DNADNA链的结构发生变形，失去正链的结构发生变形，失去正常的碱基配对，影响复制和转录。常的碱基配对，影响复制和转录。光复活是一个酶促反应，光复活酶可与嘧啶二聚体结光复活是一个酶促
22、反应，光复活酶可与嘧啶二聚体结合形成一种复合物，这种复合物暴露在可见光下，酶合形成一种复合物，这种复合物暴露在可见光下，酶即被活化，将嘧啶二聚体重新分解成单体。即被活化，将嘧啶二聚体重新分解成单体。每个每个E.coli细胞约含细胞约含25个光激活酶分子。个光激活酶分子。光修复作用光修复作用photoreactivationphotoreactivation光修复示意图光修复示意图光复活对因紫外线照射损伤的光复活对因紫外线照射损伤的RNARNA没有作用。没有作用。因此我们会见到一种现象，因此我们会见到一种现象，即有些菌株有了一些表型的变化，但是经过生长和繁殖过程后，又恢复即有些菌株有了一些表型的
23、变化，但是经过生长和繁殖过程后，又恢复了野生型的特征。给我们造成一种假性突变的错觉。了野生型的特征。给我们造成一种假性突变的错觉。用于用于修复修复因诱变因诱变受伤的受伤的DNA，与光无关。，与光无关。修复过程修复过程：由四种酶参与。：由四种酶参与。即即:内内切核酸酶；切核酸酶；外外切核酸酶；切核酸酶；DNA聚聚合酶；合酶；DNA连连接酶。接酶。方式方式：先切后补：先切后补 先补后切先补后切切补修复切补修复excision repairexcision repair先切后补示意图先切后补示意图先补后切示意图先补后切示意图复制后修复（重组修复）复制后修复（重组修复）重组修复是指损伤的重组修复是指损
24、伤的DNADNA经过复制后完成修复的过程。即复制经过复制后完成修复的过程。即复制后修复，将另一母链上的正确序列转移到子代链的空缺处，后修复，将另一母链上的正确序列转移到子代链的空缺处，另一母链的空缺再合成。另一母链的空缺再合成。结果：虽并不消除原来的错误和损伤，但避免了新合成链出结果：虽并不消除原来的错误和损伤，但避免了新合成链出现损伤，使损伤稀释现损伤，使损伤稀释。经过复制后二聚体虽然还存在，但随着复制代数的增多，带经过复制后二聚体虽然还存在，但随着复制代数的增多，带有二聚体的有二聚体的DNADNA成分在新合成的成分在新合成的DNADNA分子总数中比例越来越分子总数中比例越来越少，最后被少，
25、最后被稀释稀释成不足以影响生物细胞的正常生理功能。成不足以影响生物细胞的正常生理功能。重组修复重组修复SOS修复系统（自学）DNA聚合酶的校正作用（自学）修复系统是否能够引起基因突变？修复系统是否能够引起基因突变？修复机制的意义修复机制的意义上述几种修复系统是生物体普遍存在的生理现象。上述几种修复系统是生物体普遍存在的生理现象。它是为了使遗传性状稳定地保存下来，在长期进化过它是为了使遗传性状稳定地保存下来，在长期进化过程中建立的一套自我保护的修复系统。程中建立的一套自我保护的修复系统。生物体内的这些修复机制对化学试剂诱导突变的损伤生物体内的这些修复机制对化学试剂诱导突变的损伤也有修复作用。也有
26、修复作用。修复机制与微生物育种修复机制与微生物育种修复机制和微生物诱变育种是一对矛盾修复机制和微生物诱变育种是一对矛盾 。因此如何采取措施消除校正错误的修复途径成为因此如何采取措施消除校正错误的修复途径成为微生物育种的一个重要课题。微生物育种的一个重要课题。4 4 突变体的形成突变体的形成当一个突变发生后，只有经过复制，把发生改当一个突变发生后，只有经过复制，把发生改变的遗传信息确定下来，并能传递给下一代，变的遗传信息确定下来，并能传递给下一代，才能成为突变体。才能成为突变体。突变的表型效应突变引起基因型的改变，通常也引起表型上的改变。表型效应有的可以直接辨认出来，如各种形态突变。有的表型改变
27、是属于生理生化类型的改变，只能凭借遗传学方法和生理化学技术及其他方法才能检测出来。有的突变不一定产生遗传效应（碱基置换）中的同义突变和无义突变在二倍体细胞中显性基因的存在会掩盖隐性突变基因的表型。表型与环境：表型与环境：基因型是内因，环境条件是外基因型是内因，环境条件是外因，表型是基因型和环境综合作用的结果。因，表型是基因型和环境综合作用的结果。影响表型效应的因素基因突变引起部分氨基酸的变化，如果变化的氨基酸是决定多肽链功能的主要氨基酸，电荷上的变化对多肽链的折叠结构和活性也有明显的影响，那么这种突变将使微生物产生明显的遗传效应；相反，如果氨基酸种类的更改，并不改变多肽链的正常功能，这种突变对
28、遗传性状没有影响。影响表型效应的因素在二倍体细胞中，突变发生在显性基因或隐性基因上，其表型效应不同。在纯合体中无论是显性基因还是隐性基因突变都有表型效应。在杂合体中显性基因突变使微生物产生一定的表型，而隐性基因突变其表型和野生型相同。在单倍体微生物中，如细菌、噬菌体，不管显性基因突变还是隐性基因突变都出现突变型的表型。影响表型效应的因素基因存在于细胞里，也存在于一定的环境中，因此基因的作用既受其他同在一个细胞内的基因的影响，也受环境条件的制约。环境虽然并不引起突变，但由于选择的结果，突变基因不一定能保留下来，对不适应的个体进行淘汰。还有很多微生物，突变后的表型是随着环境条件的变化而改变，如红色
29、面包霉生长在有光的环境中菌落颜色为红色，当移到黑暗处就变成白色。具有鞭毛的细菌，在含石炭酸培养基中培养时鞭毛消失。红色面包霉小 结前面讲述的影响表型效应的各个因素告诉我们：具有突变基因的生物，其表型必须在相应的环境中才能表现出来。因此从微生物育种的角度说，要选育一个高产的菌株，不仅要具备一个高产突变基因，还必须有适合的培养基和培养条件来充分发挥突变基因的高产性能。基因型是个体特性的内因，而环境条件是外因，表型是基因型和环境综合作用的结果。关于表型延迟关于表型延迟表型延迟现象是指微生物通过自发突变或人工诱表型延迟现象是指微生物通过自发突变或人工诱变而产生新的基因型所表现出来的遗传特性不能变而产生
30、新的基因型所表现出来的遗传特性不能在当代出现，其表型的出现必须经过在当代出现，其表型的出现必须经过2 2代以上的繁代以上的繁殖复制。殖复制。一般说表型的改变总是落后于基因型的改变。一般说表型的改变总是落后于基因型的改变。表型延迟：表型延迟：（1 1）接触延迟：诱变剂进入细胞速率较慢；）接触延迟：诱变剂进入细胞速率较慢；（2 2）杂核细胞到纯核突变细胞：）杂核细胞到纯核突变细胞：（3 3）原有基因产物的影响：原有产物仍能支配野生型细胞作）原有基因产物的影响：原有产物仍能支配野生型细胞作用，经几代繁殖后，原有基因产物浓度降低，出现突变型。用，经几代繁殖后，原有基因产物浓度降低，出现突变型。产生表型
31、延迟的原因产生表型延迟的原因1 1 与诱变剂性质和细胞壁结构组成有关。这种影响可能与诱变剂性质和细胞壁结构组成有关。这种影响可能延迟到一代以后，因此表型不可能在当代出现。延迟到一代以后，因此表型不可能在当代出现。2 2 当突变发生在多核细胞中的某一个核时，如果该基因当突变发生在多核细胞中的某一个核时，如果该基因是唯一控制突变表型的基因，那么突变是隐性的，微生是唯一控制突变表型的基因，那么突变是隐性的，微生物仍然会出现野生型的表型，只有通过几代的繁殖分裂，物仍然会出现野生型的表型，只有通过几代的繁殖分裂，才能出现纯核突变体。才能出现纯核突变体。3 3 原有基因产物的影响，原来已产生的功能产物仍然
32、支原有基因产物的影响，原来已产生的功能产物仍然支配野生型细胞的作用。配野生型细胞的作用。小 结突变的概念突变的类型和分离方法*自发突变的分子机制*诱发突变的分子机制*DNA损伤的修复68思考题1.设计一个实验，获得大肠杆菌赖氨酸营养缺陷型菌株。2.诱发突变的分子机制有哪些？3.引起自发突变的原因有哪些？人工诱变和自发突变相比有哪些优点？69微生物的抗性来源1 抗性基因突变2 抗药性质粒3 生理适应抗药性质粒质粒的分子组成是DNA，抗药性质粒就是具有抗性基因的一片段DNA，分子较小。抗药性质粒是通过细菌之间的接触而传递的，即敏感细菌只有和携带抗性质粒的细菌相互接触并转移才能有这种质粒，未经突变的
33、细菌没有抗药性质粒。生理适应生理适应是由于细菌长期接触某种抗性因子而具有暂时的抗药性能，但其基因没有发生突变。当这种细菌离开抗性因子时抗性也就消失，和其他细胞保持同一特性。讨论：抗生素的抗性超级病菌是一种耐药性细菌 这种超级病菌能在人身上造成浓疮和毒疱，甚至逐渐让人的肌肉坏死。更可怕的是，抗生素药物对它不起作用，病人会因为感染而引起可怕的炎症，高烧、痉挛、昏迷直到最后死亡。“超级细菌”泛指临床上出现的多种耐药菌，如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）、抗万古霉素肠球菌（VRE）、耐多药肺炎链球菌（MDRSP）、多重抗药性结核杆菌（MDR-TB），以及碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌（KPC）等。每年在全世界大约有50%的抗生素被滥用，而中国这一比例甚至接近80%。在上世纪60年代，全世界每年死于感染性疾病的人数约为700万，而这一数字到了本世纪初上升到2000万。死于败血症的人数上升了89%，大部分人死于超级病菌带来的用药困难。“超级细菌”更为科学的称谓应该是“产NDM-1耐药细菌引”，即携带有NDM-1基因，能够编码型新德里金属-内酰胺酶，对绝大多数抗生素（替加环素、多粘菌素除外）不再敏感的细菌。