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1、有机化学自由讲座蛋白质与核酸 化学01 强伟 张楠蛋白质部分l蛋白质简介l蛋白质的结构l蛋白质的合成蛋白质简介1.蛋白质的组成蛋白质多肽-氨基酸甘氨酸苯丙氨酸20种必需氨基酸1.蛋白质在生命现象中起着决定作用 蛋白质是生命体一切组织的基本成分细胞内除水外,其余80%的物质均为蛋白质。蛋白质,碳水化合物和脂肪是人类营养的三要素,是维持生命所不可缺少的物质。蛋白质(多肽)的结构测定蛋白质的结构,初一看几乎是不可能的。因为即便是不很复杂的蛋白质,如最小的胰岛素,就有51个17种不同的氨基酸,可能的排列有2*1751之多。随着生物化学的进步和分离分析方法的发展,将这一极为困难的问题全部解决。1953年
2、 F.Sanger等 测定出牛胰岛素的氨基酸顺序并于1958年获诺贝尔化学奖。1.蛋白质的一级结构蛋白质一级结构就是氨基酸的连接顺序。测定蛋白质或肽链一级结构需要进行下列几项工作:a.对二硫键的处理(用过酸氧化为-SO3H)b.测定氨基酸的组成 水解16-72小时(真空,110,6mol/l HCL)柱层析进行分离 定量 现在这一过程在氨基酸自动仪内进行。C.氨基酸序列的测定通常使用P.Edman降解法主要涉及,耦联水解,萃取和转移等四个过程12313212345545422435354标记脱落标记脱落通常使用异硫氰酸酯(PITC)氨基酸序列的改变会产生异常功能和疾病例如,致命的镰刀形红细胞贫
3、血病。2.蛋白质的二级结构 蛋白质二级结构指的是多肽链中互相靠近的氨基酸的构象关系。维持二级结构的主要化学键是氢键。蛋白质的二级结构通常用X-射线衍射法测定。常见的二级结构有三种构象:1951年,Plauling&Corey根据对一些简单化合物,如二肽及三肽的射线晶体图的研究数据,提出了两个周期性的多肽结构 螺旋 和 折叠片羊毛,头发,指甲的主要蛋白质是螺旋 蚕丝中的蛋白质是折叠片形的3.蛋白质的三级结构 蛋白质三级结构是指多肽链的折叠状况。通常用X-射线衍射法测定。肌红蛋白是第一个被确定有三级结构的蛋白质.蛋白质的变性受到物理或化学处理后,蛋白质的三级结构遭到破坏破坏级键),它的生理活性会丧
4、失,这一现象称为蛋白质的变性。蛋白质的合成基团保护接肽提纯 容易离去不影响其他基团固相接肽(Merrifield)Noble Prize核酸部分l核酸的组成l核酸的分类及其性质差异l脱氧核糖核酸(DNA)l核糖核酸(RNA)核酸的组成核酸(DNA或RNA)核苷酸磷酸五碳糖(核糖或脱氧核糖)碱基(嘌呤或嘧啶)脱氧核糖核糖核酸的组成一、组成核酸的碱基类型(嘌呤或嘧啶)碱基嘌呤嘧啶腺嘌呤(C)鸟嘌呤(G)胞嘧啶(A)尿嘧啶(U)胸腺嘧啶(T)核酸的组成二、核苷酸的连接顺序(以胸腺核苷酸为例)1.脱氧核糖1位上的羟基与胸腺嘧啶上的氢脱水核酸的组成二、核苷酸的连接顺序(以胸腺核苷酸为例)2.生成的脱氧核
5、糖5位上的羟基与磷酸脱水实际上,对于核糖核苷,糖环上有三个自由羟基,因此磷酸有2、3和5三种脱水选择。其中5位上的核糖核苷酸可用HIO4氧化的方法与其余二者鉴别。而对脱氧核糖核苷,上述方法无法使用,因为其2位上无羟基。核酸的分类及其差异一、核酸的分类即结构上的差异1.核酸可以分为核糖核酸(核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(脱氧核糖核酸(DNA)2.DNA与RNA在结构上存在以下几点差异:(1)核糖的2位上有羟基;而脱氧核糖的2位上为一氢原子。(2)在五种组成核苷酸的碱基中,嘌呤均为DNA和RNA共有;而尿嘧啶(U)取代了胸腺嘧啶(T)为RNA所特有。核酸的分类及其差异二、核酸化学性质的差异RN
6、A由于其分子的2位上有羟基,在碱性条件下可发生水解反应;而DNA分子则不可发生,RNA在碱性条件下水解生成两种异构体。脱氧核糖核酸(DNA)一、脱氧核糖核酸的碱基配对原则在DNA分子中,嘌呤分子的总数总是大致等与嘧啶分子的总数,这是因为,四种碱基的配对符合一定的规则:A与T配对,G与C配对。这种现象可能与碱基之间所能形成的氢键数有关。脱氧核糖核酸(DNA)二、脱氧核糖核酸的双螺旋结构1953年,25岁的沃森和 35岁的 克里克发现DNA的双螺旋结构。他 们的发现照亮了整个遗传学领域,指 引着人们去探究生命本质的奥秘。脱氧核糖核酸(DNA)三、DNA的复制“冈崎片断”理论的提出1.DNA的半保留
7、复制以为Meselson和Stahl的大肠杆菌同位素实验所验证。2.”冈崎片断”假说是建立在大量实验的基础上:(1)DNA聚合酶都把脱氧核糖核苷5磷酸加到生长的DNA链上,基因物的3OH基上。(2)没有发现一种酶能够作用于脱氧核糖核苷3磷酸。脱氧核糖核酸(DNA)四、重组DNA技术【定义】:把一个生物体中有用的目的基因转入另一个生物体中,使后者获得新的遗传性状或表达新的遗传产物。【步骤】1.目的基因的获得(PCR技术 聚合酶链式反应)变性(95C)双螺旋解旋退火(55C)单链与引物配对延伸(72C)逐个连接核苷酸此过程重复近30遍2.构建重组质粒3.基因克隆:即重组质粒中的目的基因随细胞的繁殖
8、而复制。4.重组质粒用凝胶电泳的方法进行筛选和鉴定。5.用重组质粒转化受体细胞,并筛选和鉴定转化子。6.获得外源基因表达的性状和产物。脱氧核糖核酸(DNA)四、重组DNA技术内切酶连接酶核糖核酸(RNA)一、核糖核酸的碱基配对原则在核糖核酸中,由于胸腺嘧啶(T)被尿嘧啶(U)所取代,故配对时,在尿嘧啶和腺嘌呤之间形成两个氢键。核糖核酸(RNA)二、核糖核酸的结构1.RNA的一级结构与DNA相似,均是由核苷酸连接而成,且位置均由5到3。2.RNA的二级结构中存在着部分区域的碱基配对现象,在这些碱基配对区域,RNA呈螺旋状;而碱基未配对区域称为螺旋突环部分。碱基配对部分突环部分核糖核酸(RNA)3.RNA由于其结构和功能的不同可分为tRNA、rRNA、mRNA三类。4.tRNA的二级结构是各种RNA中研究较为清楚的一种,其结构呈“三叶草形”。包括:氨基酸臂:含3端及7个配对的碱基,用以携带氨基酸分子。反密码子:位于tRNA末端的突环部分上,用以与mRNA上的三联密码子配对。参考书目:1.生物化学 王希成 著 清华大学出版社()2.核酸结构、功能与合成(上、下册)科学出版社(1986)3.核酸的生物化学(英)达维生 著 科学出版社(1983)