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1、第九章第九章 微生物分类鉴定微生物分类鉴定什么是微生物分类学什么是微生物分类学(microbialtaxonomy):按照微生物的亲缘关系将按照微生物的亲缘关系将其安排成条理清楚的各种其安排成条理清楚的各种分类单元和分类群的科学分类单元和分类群的科学 微生物分类的目的微生物分类的目的把各种微生物按照它把各种微生物按照它们的亲缘关系分群归们的亲缘关系分群归类,排成系统,以便类,排成系统,以便于人们对微生物进行于人们对微生物进行鉴定和交流鉴定和交流微生物分类微生物分类学的主要学的主要任务任务分类分类(classification)即根据相似性或亲即根据相似性或亲缘关系缘关系,将一个有机将一个有机体
2、放在一个单元中体放在一个单元中命名命名(nomenclature)鉴定鉴定(identification)确定一个新的分类物确定一个新的分类物是否归属于已经命名是否归属于已经命名的分类单元的过程的分类单元的过程第一节第一节 微生物分类的单位微生物分类的单位第二节第二节 微生物的命名微生物的命名第三节第三节 微生物在生物界中的地位微生物在生物界中的地位第四节第四节 微生物的分类鉴定方法微生物的分类鉴定方法一、微生物的分类单位一、微生物的分类单位界界门门纲纲目目科科属属种种常用的几种分类概念常用的几种分类概念种种:亲缘关系较近的微生物有机体的集合,它们在进:亲缘关系较近的微生物有机体的集合,它们在
3、进化发育阶段上有一定的共同形态和生理特征。现代分化发育阶段上有一定的共同形态和生理特征。现代分类学上规定种内菌株的类学上规定种内菌株的DNADNA同源性同源性70%70%小种(亚种)小种(亚种):实验室中获得的微生物变异型称:实验室中获得的微生物变异型称为小种或亚种。为小种或亚种。菌株(品系)菌株(品系):来源不同的同种微生物的纯培:来源不同的同种微生物的纯培养,均可称为菌株。养,均可称为菌株。大肠杆菌的分类地位大肠杆菌的分类地位命名的方法:国际法规命名,即命名的方法:国际法规命名,即林奈所创立的林奈所创立的双名法双名法。双名法的规则:微生物的学名依双名法的规则:微生物的学名依属和种属和种而命
4、名,而命名,由两个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字由两个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成,属名在前,为名词,开头字母大写,是组成,属名在前,为名词,开头字母大写,是该微生物的主要特征。种名在后,为形容词。该微生物的主要特征。种名在后,为形容词。如:如:Stapylococcus aureus,Streptomyces albosporeus(Krainsky)Waksman et Henrici,Micrococcus sp.(spp.),Bacillus subtilis 二、微生物的命名二、微生物的命名需要牢记的一些微生物学名需要牢记的一些微生物学名大肠杆菌大肠杆菌:Escheri
5、chia coli枯草杆菌枯草杆菌 Bacillus subtilis金黄色葡萄球菌金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus酿酒酵母酿酒酵母:Saccharomyces cerevisiae灰色链霉菌灰色链霉菌 Streptomyces griseus粗糙链孢霉:粗糙链孢霉:neurospora crassa产黄青霉产黄青霉:penicillium chrysogenum三、微生物在生物界中的地位三、微生物在生物界中的地位 三三域域学学说说 四、微生物的分类鉴定方法四、微生物的分类鉴定方法 1.经典鉴定分类法经典鉴定分类法 2.数值分类法数值分类法 3.化学分类法化学分类法
6、4.遗传分类法遗传分类法 经经典典鉴鉴定定分分类类法法个体个体:细胞形态细胞形态,大小大小,排列方式排列方式,染色染色,运动等运动等形态特征形态特征:菌落形态菌落形态营养要求营养要求:碳源碳源,氮源氮源,矿质元素矿质元素生理生化特征生理生化特征:代谢产物种类代谢产物种类,产量产量,现色反应现色反应酶酶:产酶种类和反应特征产酶种类和反应特征生态学特征生态学特征:生长温度生长温度,氧需求氧需求,酸碱度酸碱度,宿主种宿主种类类血清学反应血清学反应噬菌体的敏感性噬菌体的敏感性其他其他:全细胞蛋白的分析等全细胞蛋白的分析等数数值值分分类类法法测定测定100100项以上的各种性状,利项以上的各种性状,利用
7、计算机进行菌株的相互比较,用计算机进行菌株的相互比较,并得出总的相似值。并得出总的相似值。一般认为同种微生物菌株之间一般认为同种微生物菌株之间的相似值的相似值80%80%。化化学学分分类类法法细胞成分细胞成分 分析内容分析内容 在分类水平上的作用在分类水平上的作用 细胞壁细胞壁 肽聚糖结构肽聚糖结构 多糖多糖 种和属种和属 胞壁酸胞壁酸 脂肪酸脂肪酸 膜膜 极性类脂极性类脂 种和属种和属 霉菌酸霉菌酸 蛋白质蛋白质 氨基酸序列分析氨基酸序列分析 血清学比较血清学比较 属和属以上单位属和属以上单位 电泳图电泳图 酶谱酶谱 代谢产物代谢产物 脂肪酸脂肪酸 种和属种和属 全细胞成分分析全细胞成分分析
8、 热解热解-气液色谱分析气液色谱分析 种和亚种种和亚种 热解热解-质谱分析质谱分析遗遗传传分分类类法法1.DNA碱基比例的测定碱基比例的测定每一个微生物物种的每一个微生物物种的DNA中的中的(G+C)mol%的数值的数值是恒定的是恒定的,不会随着环境及培养条件等的变化而不会随着环境及培养条件等的变化而变化变化,而且在同一个属不同种之间而且在同一个属不同种之间,GC含量不会差含量不会差异太大异太大,具有一定的范围具有一定的范围,因此可以作为判定的微因此可以作为判定的微生物间亲缘关系的依据生物间亲缘关系的依据2.核酸分子杂交法核酸分子杂交法遗遗传传分分类类法法寡核苷酸编目分析寡核苷酸编目分析遗遗传传分分类类法法一种通过分析原核或真核细胞中最稳定的一种通过分析原核或真核细胞中最稳定的rRNA寡核苷酸序列同源行程度寡核苷酸序列同源行程度,乙确定不同生物间的乙确定不同生物间的亲缘关系和进化谱系的方法亲缘关系和进化谱系的方法五、微生物的快速分类鉴定方法五、微生物的快速分类鉴定方法