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1、化学信息学课程总结姓名：段小娜 学号： 化学信息学是一门应用信息学的方法解决化学问题的学科，最主要的是就化学问题来获取相关的、高质量的信息。它涵盖不同的领域，就目前而言还没有很深的体会。在学习这门课程之前就已经想到这门课会教授一些关于检索文献的方法，因为文献检索是科研工作者获取信息的重要来源，也是重要的依据，同时文献检索有一定的可学性。因此，可以狭义地认为化学信息学是一门“文献学”。 21世纪是信息的时代，就文献而言，每年的文献数量迅猛增加，文献的形式也是伴随着多样化的过程，并且电子文献与网络检索的普及，使得一个科研工作者获取信息的途径越来越多，可选择的信息量也越来越大，但同时也面对着信息的泛
2、滥所引起的一系列的问题。据美国科学基金会统计，一个科学研究人员花费在查找和消化学术资料上的时间需占全部科研时间的51%，计划思考占8%，实验研究占32%，书面总结占9%，可见从事科研工作获取高效的信息并且对信息的消化的重要性。就信息方面的问题，对于一个科研工作者，需要有几方面的能力：1、快速获取相关的高质量信息的能力。2、确定一个好的研究方向的能力。3、及时跟踪特定研究方向的能力。4、管理信息即所检索到的文献的能力。5、整理研究结果，论文写作的能力。6、发表论文，选择合适的期刊。在这门课中对这几方面都有所涉及，其中重点还是对于信息的获取，即文献的检索，同时也一直贯穿着一个科研工作者的工作概况。
3、所以在这门课中，除了获得了一些关于化学信息学和文献的基础知识外，我主要的收获是如何快速获取相关的信息（文献检索的方法）以及获取信息的常用渠道（常用的期刊、数据库等），同时对一个科研工作者的工作有了更深刻地了解。化学信息学更多的是为科研服务，因此，对于在这门课中学习到的东西，我也将从一个科研工作者应该具备什么样的能力出发来一一阐述并对几种常用的检索工具进行进一步的分析和比较。一、 如何获取相关的高质量的信息所谓“相关的”，就是与研究的主题相对应的信息或文献。“高质量的”就是具有参考价值的，对研究有指导意义的文献，这其中涉及到文献本身的影响力（可参考文献被引用的情况）、作者的影响力、出版期刊的影响
4、力等。（一)关于获取信息的渠道。（1） 科技图书 除了翻阅纸质版的书籍，如辞典、手册、工具书及参考书之外，还可以阅览电子版的图书以及在电子图书馆上查阅相关的信息。具体的一些电子图书馆的网址见PPT，如美国国会图书馆http:/www.loc.gov 。（2） 期刊 根据内容可以将期刊分为原始性、检索性、评述性、消息性和科普性期刊。在化学化工领域常用的期刊有：1.综述性自然科学期刊,英国Nature,美国Science,美国科学院院刊PNAS，中国科学B (Science in China B)，科学通报 (Chinese Science Bulletin)2. 综合性化学期刊，美国化学会志(J
5、ournal of American Chemical society，)，（德国）应用化学(Angewande Chemie Internatinal Edition)，自然化学(Nature Chemistry)，化学科学(Chemical Science)，化学通讯(Chemical Communications）3.我国综合性的化学期刊,化学学报 （Acta Chemical Sinica）,化学通报 （Chemistry）,高等学校化学学报 （Chemical Journal of Chinese University）。另外还有一些可以利用的全文数据库：美国化学会期刊全文数据库(h
6、ttp:/pubs.acs.org/)、英国皇家化学会(RSC)期刊全文数据库（http:/www.rsc.org/）、爱思维尔出版社期刊全文数据库 Elsevier ScienceDirect（ InterScience全文数据库（对于这些信息获取的渠道，因为没有真正的用到过，所以，对于各自的适用领域以及使用的具体细节不是特别清楚，比较熟悉的还是具体讲解过的几种检索工具：Scifinder、Resxys、Web of Science。(二） 检索方法（1） 直接法：就是根据研究的课题通过浏览原始文献的方式直接查询原始文献。（2） 追溯法：依据文献所附的参考文献为线索查找文献的方法。（3） 工
7、具法：利用文摘和索引等检索工具进行检索。 在这门课程中主要是通过具体讲解三种检索工具（Scifinder，Reaxys，Web of Science）的使用，即第三种方法的使用，同时也强调了第二种方法的重要性。 通过追溯法来进行检索，也就是根据一篇文章的参考文献来检索该文献所引用的文献，通过此方式可以了解某个课题或与之相关的理论等的发展历程，也可以检索引用该文章的文献，据此也可以了解该文章的影响力以及该课题发展的现状。在我们所介绍的三中检索工具中，Scifinder和Web of Science都可以检索到一篇文章被引用的情况以及其本身引用的情况。 使用工具检索时，常使用主题、作者、日期名称、
8、结构式等进行检索。使用Scifinder进行检索可以使用主题、作者、单位、物质及结构式等方式，并且兼并二次检索的功能，通过Analyze ， Refine， Categorize功能对不同的杂志、文献类型、出版机构、数据库以及不同领域等进行进一步筛选。在Reaxys中主要是使用关键字、结构式或者二者的结合进行检索，并且也具有二次筛选的功能。使用Web of science也可以使用主题、作者、日期等进行检索，也可以根据被引用的情况进行检索，它的另外一个特点是可以使用多个关键词，同时使用排除的方式进行检索，也同时可以使用不同的限定条件如不同的领域进行筛选。（三） 对于信息质量的评估 对于一篇文章
9、的质量除了与是否与所研究的课题相关有关外，还主要与该文章的引用率、书写作者以及论文发表期刊的位置等有关，为了获得一篇高质量的文章，除了考虑主题外，还可以通过引用率、作者和发表期刊的位置进行检索。所以，对于检索到的文献可以对其质量进行评估，其引用率在Web of science和Reaxys中都可以得到。在某个领域比较权威的科学家以及某期刊对某个领域的偏好都可以通过检索得到。如使用Web of science可以分析在某个领域某个科研工作者或出版物发表和出版论文的情况。二、 确定一个好的研究方向对于科研工作者来讲，其选题应该符合几项原则：1.要具有创新性和先进性。2.要注意实际性。3.要考虑科学
10、上的可行性。4.要抓住关键性的时机。 在常用的检索工具中，Web of science对于科研工作者的选题以及获得一个良好的idea是非常有价值的。因为它可以使科研工作者对于研究动态以及不同学科间的联系有很好地把握。三、及时跟踪特定的研究方向可以通过确定跟踪浏览一些重要期刊来跟踪自己的研究方向，时刻关注研究动态，如：权威性刊物，如J. Am. Chem. Soc.有关专业刊物，如J. Org. Chem.消息性刊物，如C&E News, Science News，科普性刊物，如Scientific American。四、 管理文献的能力可以有条不紊地管理所检索到的文献有利于之后的查找以及对信息
11、的把握。五、 整理研究结果，论文写作的能力一篇科技论文主要包括：1、标题2、摘要3、引言4、实验方法5、结果与讨论6、结论7、致谢8、参考文献9、附加信息材料。在进行科技论文写作时，除了需要一个漂亮的实验结果外，还需要比较规范的格式。而在参考文献引证时也需要注意：1、引证原则（及时性；珍贵性；准确、相关性）2、引用格式（不同杂志要求不同，关注每种杂志的投稿须知）。六、 论文的发表论文的发表除了要求论文的质量外，同时投稿期刊的选择也非常重要。确定投稿期刊时一方面可以请教同行，也可以查阅所引用参考文献的来源出版物，对该领域出版期刊有大体上的了解，另一方面也可以通过检索，如在Web of scien
12、ce中某个课题发表的文章的出版物进行分析，就可以大致了解出版期刊对该领域的偏好。关于具体讲解的三种检索工具它们使用的特点以及优势的比较：Scifinder是来源于CA的检索工具。CA，1907年创刊，以化学化工为主，涉及生物、医学、轻工、冶金、物理等领域，是最常用的大型文献检索工具。主要包括期刊论文、学位论文、会议论文、技术报告、新书及视听报告、专利文献、参见。除了一般的检索工具能做到的，个人尤其喜欢的是Scifinder具有非常清晰的检索逻辑和非常细致的二次筛选功能，可以通过Analyze ， Refine， Categorize功能对所检索到的文献进行非常细致的筛选，并且很容易得到引用与被
13、引用的情况以及所涉及的物质反应等。Web of science主要贡献于科研工作者的选题以及获得非常好的想法，对于科研的创新有很大的帮助。个人在学习的过程中对该检索工具有很深的印象，一方面可能是因为接触过该检索工具的检索界面，相对比较熟悉，另一方面就是对于所讲的东西有更深的体会，切实的感受到了这门课程在科研工作中的应用，同时也是对知识选择性吸收的过程。该检索工具有利于科研的选题，可以通过一篇高质量的论文或者某个主题，通过引用与被引用情况的检索，准确检索到相关课题的综述性文献、学科内高影响力论文、最新论文等，从而掌握领域内研究现状、热点和最新信息，从而有利于科研工作者的选题。利用相关文献（rel
14、ated records）可以拓展课题的研究思路，了解课题跨学科发展和应用，从而有利于创新。另外多角度的分析，对出版年、作者和机构、来源出版物、基金资助机构等进行深入分析 ，从而了解课题的发展趋势以及判断课题的发展阶段，发现潜在合作者和合作机构，了解那些出版物对该课题感兴趣，发现哪些基金重视该领域等等。也可以创建“定题跟踪”，可实时跟踪某课题、某作者、 某机构等的最新研究进展。Reaxys是Crossfire的升级产品，由三部分组成：Beilstein、Patent、Chemistry Gmelin，分别对应于有机、专利、无机和金属有机。该检索工具对于化学物质及反应的检索非常方便，检索方式也很
15、多样，如对物质的检索可以通过结构式或者子结构式进行检索，也可以使用CAS号进行检索等。该检索工具的另一个主要的用途就是反应途径的智能合成，可以针对给定的产物逆向寻找容易获得的反应物。关于专利:专利分为发明专利、实用新型专利、外观设计专利三种。关于专利的一些基本知识在PPT上都有详述，而我更关注的是如何检索专利，专利的检索有一些数据库：中国国家知识产权局数据库美国专利商标局网站专利数据库http:/www.uspto.gov/欧洲专利局espcenet网络数据库 http:/www.epo.org/searching.html日本特许厅网站专利数据库http:/www.jpo.go.jp/世界知识产权组织网站数据库http:/patentscope.wipo.int/search/en/search.jsf德温特世界专利索引数据库(DII) 专利的检索其他文献的检索大同小异，相对比较简单，可以根据名称、专利号等进行检索，在此不再详细叙述检索方式。除了专门进行专利检索的数据库外，还可以在万方数据库，Web of knowledge中进行专利的检索。