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1、黄瓜总 DNA 的提取及鉴定黄瓜总 DNA 的提取及鉴定摘要:植物 DNA 首先要在液氮或干冰中将新鲜或冷冻的植物组织研磨成粉,使细胞壁破碎,再用含有去污剂、螯合 EDTA 等成分的提取缓冲液处理组织匀浆。用氯仿-异戊醇把组织匀浆中变性的蛋白质除去,将 DNA 与细胞中的蛋白质、碳水化合物等分开;再用 RNaseA 去除核酸中的 RNA,剩下的便是 DNA。DNA 可用乙醇或异丙醇沉淀,沉淀的DNA 可用挑取或离心方法收集。DNA 的纯度可用紫外分光光度计做初略测量。核酸、蛋白质、盐与小分子的最大吸收峰值分别为 260nm、280nm 及 230nm。顺序测定一个样品在这三种波长下的 OD 值
2、,如果提取的样品较纯,蛋白质及小分子的污染较小,则 OD260/OD2801.8,OD260/OD2302.0。通过测定 OD260,根据公式50OD260 DNA(双链)的浓度(ug/mL)。DNA 的完整性可用凝胶电泳来测定。常用的凝胶有聚丙烯酰胺与琼脂糖。琼脂糖电泳可分理相差 100bp 的 DNA 片段,但分离范围大,制备简单。方法:植物组织(削皮的黄瓜)在液氮中研磨,磨好的组织溶于 65CTAB 提取缓冲液中,保温一段时间后用酚-氯仿抽取 2 次,除去变性的蛋白及大部分碳水化合物。再用乙醇将 DNA 沉淀下来。获得的 DNA 用紫外分光光度计测定浓度及纯度,再用琼脂糖凝胶电泳检测完整
3、性。1.关键词:DNA,提取及鉴定2.实验材料与方法1/7黄瓜总 DNA 的提取及鉴定1.1 实验材料黄瓜1.1.1 试剂液氮;CTAB提取缓冲液;TE 缓冲液或重蒸水;酚:氯仿:异戊醇=25:24:1;异丙醇或无水乙醇;TE 缓冲液,重蒸水;0.3%(m/V)标准琼脂糖;0.5TBE 缓冲液,上样缓冲液;EB;1.1.2 器具研钵,小药勺;1.5mL 小离心管若干;定量移液器及枪头;离心机;恒温水浴锅;紫外分光光度计;水平电泳槽;2/7黄瓜总 DNA 的提取及鉴定三角瓶(500 或 1000mL);微波炉或沸水浴,透射紫外灯3/7黄瓜总 DNA 的提取及鉴定1.1.3 生物材料黄瓜1.2 试
4、验方法1.2.1 提取 DNA1.CTAB于 65,水浴 30min。2.称取 8g(黄瓜去皮)研磨破碎细胞壁。3.加 20molCTAB于研磨中混匀酚浆,2 支离心管于 65水浴 15min,3500Hpm,5min 去除残渣。4.取上清液 5mL 于离心管中,加入 5mL 氯仿-异戊醇上下颠倒混合2min5.上清液转移至小烧杯中加 2 倍体积预冷的乙醇,观察纤维状沉淀。转移 10mol 离心管中,4水箱保存备用1.2.2DNA 浓度及纯度的测定1.将提取的 DNA 粗产物离心 3500rmp,10min。2.弃上清液,加约 5mL70%乙醇吹打洗涤,使沉淀悬浮。3.3500rmp,10mi
5、n 使 DNA 沉淀。4.弃上清,2 支离心管:一支加 5mL 氯化钠水溶液溶解;另一支 4保存下次备用5.用氯化钠作对照基线校正后沉淀 220-350nm 的光谱图。6.用氯化钠作空白对照,测定 OD260、OD280、OD230。3/7黄瓜总 DNA 的提取及鉴定1.2.3 琼脂糖凝胶电泳1.制胶:称取 0.25g 琼脂糖溶解在 25mL1TBE 中微波炉加热,微沸 3次冷却至 60倒胶。2.点样:待胶冷却凝固后,将DNA 样品加 2mlddH2O 溶解,取 10ml与 3mlloadingbuffe 混合,并用移液枪小心加入至样品槽中3.电泳:点样端放在负极。120V,40min凝胶成像
6、,EB 染胶 10min,流水 5min,凝胶成像在系统下观察。2.结果与分析2.1 提取 DNA提取出黄瓜的 DNA。2.2DNA 浓度及纯度的测定1.记录 220-350nm 时的光谱图2.计算OD260/OD280,OD260/OD230,分析 DNA 的纯度OD260=DNA 的浓度=50OD260稀释倍数=波长换成 280nm 及 230nm,用同一样品再次测 OD 的值:OD280=;OD230=OD260/OD280=;OD260/OD230=则提取 DNA 的纯度2.3 琼脂糖凝胶电泳4/7黄瓜总 DNA 的提取及鉴定观察并分析 DNA 的电泳图像从图中可以看出,如果基因组 D
7、NA 完整,应该仅出现一条主带;如果很多条深浅不一的带,则说明 DNA 已经降解;如果背景模糊,说明在 DNA 样品中混杂有 RNA;3.1 提取 DNACTAB提取液中各试剂分别的作用?1.细胞膜裂解,使 DNA 释放到提取缓冲液中,同时使组织匀浆中的蛋白质变性;缓冲液中的-疏基乙醇,-疏基乙醇抑制从组织匀浆释放的多酚氧化,防止植物组织黄褐变。3.3 琼脂糖凝胶电泳影响 DNA 电泳速率有哪些因素?5/7黄瓜总 DNA 的提取及鉴定1.DNA 片段的长度;2.DNA 的构象;3.琼脂糖的浓度;4.电压电泳的原理:带电物质在电场中向着与共电荷相反的电极移动 DNA分子在高于 PI 的溶液中带负电荷在电场中向阳极移动。琼脂糖的作用:使 DNA 分离开琼脂糖凝胶的口径越大,能被分离的DNA 越大。6/7