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1、附件9“烟草ccDNAA文库构构建及重重要基因因表达谱谱研究”项目评评标情况况一、招标标要求1项目目意义建立烟草草cDNNA文库库，获得得大量的的ESTT和全长长cDNNA序列列是开展展烟草功功能基因因研究的的重要前前提，是实施施烟草基基因组计计划重大大专项的的基础性性工作，将为烟烟草分子子育种奠奠定基础础。今年针针对“烟草ccDNAA文库构构建及重重要基因因表达谱谱研究”项目进进行招标标攻关，一一是先期期开展相相关技术术研究，为为全面启启动烟草草基因组组计划重重大专项项积累必必要的技技术、人人才基础础，二是是通过项项目招标标，引导导行业内内外科研研院所加加大烟草草遗传育育种基础础研究力力度，
2、推推动烟草草育种工工程的顺顺利实施施。目前美国国、欧盟盟等先后后开展了了不同烟烟草品种种的ESST测序序，并已已获得了了一定数数量的烟烟草ESST数据据，但我我国在烟烟草重要要功能基基因表达达调控、代代谢网络络等分子子水平的的基础还还相当薄薄弱。因因此，充充分利用用我国的的种质资资源，建建立不同同种质在在逆境诱诱导、不不同发育育时期以以及不同同组织器器官的ccDNAA文库，分分离克隆隆与烟草草生长、发发育、抗抗逆、抗抗病、品品质等有有关基因因的全长长序列、调调控因子子以及特特异启动动子，研研究其表表达模式式，进行行基因表表达产物物分析、转转基因功功能验证证及生理理遗传学学分析，对对于确定定基因
3、功功能，进进而分析析这些基基因在烟烟草遗传传改良中中的利用用价值和和途径具具有重要要意义。2研究究内容（1）烟烟草cDDNA文文库的构构建及测测序。构构建普通通烟草不不同组织织、不同同时期的的全长ccDNAA文库；构建逆逆境诱导导的特异异组织的的全长ccDNAA文库；构建特特定烟草草品种（品品系）特特定组织织的全长长cDNNA文库库；挑选选克隆并并进行测测序。（2）基基因挖掘掘与生物物信息学学分析。对对测序数数据进行行拼接，对对非重复复全长ccDNAA序列进进行功能能注释和和功能分分类及代代谢网络络分析；建立烟烟草不同同时期的的基因表表达谱以以及全长长cDNNA序列列的检索索和比对对数据库库。
4、（3）重重要功能能基因研研究。利利用生物物信息学学分析得得到的相相关基因因的表达达谱信息息，鉴定定重要的的功能基基因并开开展关键键基因的的详细表表达谱研研究和功功能分析析。3经济济技术指指标（1）完完成覆盖盖烟草重重要发育育时期根根、茎、叶叶、花等等不同组组织器官官和特殊殊烟草种种质特异异组织的的全长ccDNAA文库330个左左右。通通过全长长文库构构建、全全长克隆隆完全测测序和数数据拼接接等，分分离鉴定定烟草的的全长ccDNAA序列22万条左左右。（2）建建立烟草草基因表表达、检检索及分分析的基基础数据据库。（3）分分离与烟烟草香气气、烟碱碱和有害害物质代代谢作用用网络以以及氮磷磷钾营养养高
5、效、抗抗病、抗抗旱、耐耐盐碱等等性状相相关的基基因及调调控因子子3000个以上上，其中中鉴定关关键基因因5个以以上，同同时进一一步分析析表达谱谱并验证证其功能能，获得得5个以以上重要要基因功功能验证证的烟草草材料。本项目的的创新点点在于，一一是建立立一批覆覆盖烟草草重要发发育时期期、不同同组织器器官和特特殊烟草草种质的的全长ccDNAA文库，建建成国际际上规模模最大、种种类最多多的烟草草cDNNA文库库，并测测序获得得基因全全长序列列；二是分析析基因表表达特征征谱，探探索在特特定材料料、特定定时期、特特定组织织活跃表表达且起起重要作作用的基基因，以以确定重重点研究究分析并并具有应应用前景景的烟
6、草草功能基基因，将将使我国国在烟草草功能基基因组研研究领域域在国际际上占有有一席之之地。本项目的的关键技技术在于于，一是是通过全全长cDDNA文文库的构构建及均均一化，获得高质量的全长cDNA；二是通过烟草表达基因数据库的开发，建成比较完善的烟草基因相关信息的检索平台；三是分离与烟草品质、营养性状相关的基因，并进行功能验证。二、应标标情况标书序号应标单位位综合评估分评标排序评标结论论1主标单位位：中国国农业科科学院烟烟草研究究所参标单位位：西南南大学贵州省烟烟草科学学研究所所89.771中标候选人2主标单位位：河南南农业大大学国家家烟草栽栽培生理理生化研究究基地参标单位位：中科科院上海海生命科
7、科学研究究院植物物生理生态态研究所所国家基因因研究中中心中科科院遗传传与发育学研研究所86.772中标候选人3主标单位位：武汉汉大学参标单位位：上海海联众科科技研究究院司64.7710/4主标单位位：上海海人类基基因组研研究中心心参标单位位：河南南省农业业科学院院烟草研研究中心心72.885/5主标单位位：广州州大学参标单位位：中国国烟草中中南农业业试验站站76.004/6主标单位位：中国国烟草总总公司郑郑州烟草草研究院院参标单位位：中国国农业科科学院生生物技术术研究所所中科院武武汉病毒毒研究所所72.776/7主标单位位：黑龙龙江省烟烟草科学学研究所所参标单位位：上海海市农业业科学院院 中国
8、农农业科学学院生物物技术研研究所黑龙江八八一农恳恳大学70.337/8主标单位位：北京京华大烟烟草基因因研究开开发中心心参标单位位：北京京华大基基因研究究中心中科院北北京基因因组研究究所山东省烟烟草专卖卖局82.223中标候选人9主标单位位：福建建农林大大学参标单位位： 64.999/10主标单位位：山东东农业大大学参标单位位：678/本招标项项目及内内容在行行业内外外产生了了巨大反反响，行行业内外外科研院院所对标标书响应应非常踊踊跃，通通过烟草草全长ccDNAA文库的的构建、基因表达数据库的建立和重要性状功能基因的鉴定，有助于从分子水平解析烟草生长发育、品质形成、抗逆、抗病及物质代谢的机制，
9、为烟草品种遗传改良鉴定坚实的理论基础。因此共有10家单位主标应标，行业内4家、行业外6家，加上参标单位，共有23家单位参加了这次投标活动。三、评标标标准鉴于本项项目是全全面启动动烟草基基因组计计划重大大专项的的基础研研究工作作，攻关关任务要要求较高高，投标标单位必必须具有有较好的的研发能能力、切切实可行行的技术术路线和和较好的的组织运运作模式式。评标标标准是是基于以以上考虑虑制定的。评标标准准（附后后）由三三部分内内容组成成：1研发发能力。包括工作基础、技术力量和设备条件。2技术术方案。包包括现状状分析、研研究内容容、技术术路线、技技术指标标和创新新程度。3组织织运作。包包括运行行机制、进进度
10、安排排和经费费预算。三部分的的权重设设定为3304030。四、评标标意见第一名：中国农农业科学学院烟草草研究所所，综合合评分：89.7分。第二名：河南农农业大学学国家烟烟草栽培培生理生生化研究究基地，综综合评分分：866.7分分。第三名：北京华华大烟草草基因研研究开发发中心，综综合评分分：822.2分分。3家中标标候选人人均对项项目提出出的主要要研究内内容和经经济技术术指标进进行了较较好的响响应，技术方方案较好好的把握握了招标标项目的的技术要要求，提出的的技术路路线基本本合理，并并有一定定创新性性。3家家中标候候选人均均采用行行业内外外联合攻攻关的模模式，充充分利用用各方的的技术力力量和设设备
11、条件件，优势势互补。中国农业业科学院院烟草研研究所（青青州烟草草研究所所）有良良好的烟烟草育种种工作经经历，有有丰富的的烟草遗遗传资源源和较好好的技术术储备，但还需加加强cDDNA序序列分析析、cDNNA文库库构建及及生物信信息学方方面研究究力量。国家烟草栽培生理生化基地在烟草腺毛cDNA文库构建、烟草遗传转化、烟碱合成、品质改良等方面有较好的研究基础，参标单位在cDNA序列分析及生物信息学方面具有一定优势。北京华大烟草基因研究开发中心曾参与过其他作物的基因组计划，基因测序方面实力雄厚，但投标内容相对简单，对cDNA文库利用等后续工作需要加强。为确保该该项目的的顺利实实施，评评标委员员会建议议
12、第一名名与第二二、三名名联合攻攻关。9烟草ccDNAA文库构构建及重重要基因因表达谱谱研究项项目评标标细则标书序号招标单位位研发能力力(30分)技术方案案(40分)组织运作作(30分)总分排名工作基础（10分分）技术力量（10分分）设备条件（10分分）现状分析（10分分）研究内容（5分）技术路线（10分分）技术指标（10分分）创新程度（5分）运行机制（10分分）进度安排（10分分）经费预算（10分分）说明：1、研发发能力（330分）（1）工工作基础础（100分）。投投标单位位（包括括联合投投标单位位）以前前应完成成过相关关研究工工作；具具备研究究所需要要的材料料基础；已建立立起较完完整的技技术
13、平台台。（2）技技术力量量（100分）。项项目负责责人须具具有较高高的专业业技术水水平，业业绩突出出，有较较强的组组织协调调能力；项目参参加人员员技术研研究水平平高，专专业配置置合理，技技术力量量能够保保证项目目实施的的需要。（3）设设备条件件（100分）。投投标单位位应具备备项目研研究开发发需要的的仪器设设备，具具有良好好的研发发条件和和基础设设施。2、技术术方案（440分）（1）现现状分析析（100分）。A.准确、全面地了解和分析国内外该项目技术领域的研究现状和发展趋势，对存在的问题有较深刻的了解（5分）。B.项目的研究内容符合行业的可持续发展方向，符合产业发展的需求重点、热点和难点，利于
14、全面提升产业技术水平，有非常好的应用前景或市场前景，研究结果对烟草基因组计划后续研究具有较好的支撑作用（5分）。（2）研研究内容容（5分分）。涵涵盖攻关关内容，重重点突出出，关键键问题选选择准确确。（3）技技术路线线（100分）。技技术路线线具有科科学性、可可行性，方方案可靠靠，又具具有先进进性和创创新性。（4）技技术指标标（100分）。技技术指标标合理，达达到国内内或国际际先进水水平。符符合攻关关目标，构构建cDDNA文文库300个左右右，分离离鉴定全全长cDDNA序序列2万万条左右右，鉴定定关键基基因5个个以上。（5）创创新程度度（5分分）。总总体技术术水平填填补国内内空白或或重点突突破。3、组织织运作（330分）（1）运运行机制制（100分）。投投标单位位须具有有良好的的运行机机制，明明确项目目实施的的组织、管管理、方方法、步步骤，与与联合投投标单位位有联合合协作的的基础，项项目参加加人员工工作职责责明确，责责任到位位。（2）进进度安排排（100分）。项项目进度度安排合合理，可可信程度度高、科科学性强强，考核核指标合合理。（3）经经费预算算（100分）。计计划经费费结构合合理，投投标单位位能够提供供足够的的配套资资金或政政策保障障，保证证项目实实施。