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1、第十章微生物分类与鉴定本讲稿第一页，共十二页概念概念:微微生生物物分分类类学学：按按微微生生物物亲亲缘缘关关系系将将其其排排成成多多种种分分类类单单位或分类群的科学。位或分类群的科学。分分类类：将将有有关关个个体体的的大大量量资资料料经经科科学学的的归归纳纳整整理理或或反反映映生物进化规律的自然分类系统。生物进化规律的自然分类系统。鉴鉴定定：检检测测未未知知纯纯种种微微生生物物的的多多种种性性状状特特征征，查查找找分分类类系统进行归类命名。系统进行归类命名。命名：命名：为新发现的微生物按国际命名法给出一个学名。为新发现的微生物按国际命名法给出一个学名。本讲稿第二页，共十二页一、微生物的命名法
2、（一）分类单位：（一）分类单位：界、门、纲、目、科、属、种界、门、纲、目、科、属、种种是最基本的分类单位，种是最基本的分类单位，每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科.1.种：种是一个基本分类单位，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌株的总称。这里的种仅仅是指种的模式种或典型种 本讲稿第三页，共十二页2新种：新种：发表文章时，确定为新种，在学名后加发表文章时，确定为新种，在学名后加sp.nov(speciesnova)或或nov.sp。微生物的命名法指某一明显而稳定的特征与模式种不同的指某一明显而稳定的特征与模式
3、种不同的种，有时称种，有时称小种小种。如：如：E.colik12模式种（野生型）是不需要特模式种（野生型）是不需要特殊殊aa的，而实验室变异后，可从的，而实验室变异后，可从k12获获得某得某aa的缺陷型，此即称为的缺陷型，此即称为E.colik12的亚种或的亚种或小种。小种。3.亚种：（亚种：（subspecies,subsp,ssp）：本讲稿第四页，共十二页4.型（型（form）:同种微生物的各种类型。同种微生物的各种类型。如：血清型、抗原型如：血清型、抗原型5菌株（菌株（strain）:又称品系：一种微生物的不同来源又称品系：一种微生物的不同来源的纯培养物。的纯培养物。微生物的命名法本讲稿
4、第五页，共十二页（二）命名（二）命名 1.1.双名法：双名法：林奈创立。此为国际命名法规，即：每一微生物的学名都依属林奈创立。此为国际命名法规，即：每一微生物的学名都依属与种而命名与种而命名属名属名+种名种名+（首次定名人）（首次定名人）+现定名人现定名人+定名年份定名年份属属名名：拉拉丁丁文文的的名名词词或或用用作作名名词词的的形形容容词词，字字首首大大写写，表表示示微生物的主要特点，由微生物构造，形状或由科学家命名微生物的主要特点，由微生物构造，形状或由科学家命名种种名名：为为拉拉丁丁文文形形容容词词，为为微微生生物物次次要要特特征征，字字首首小小写写，为微生物色素、形状、来源或科学家姓名
5、等。为微生物色素、形状、来源或科学家姓名等。如：如：Escherichia coli 当文章中前面已出现学名时，后面可将属名缩写成一至三个当文章中前面已出现学名时，后面可将属名缩写成一至三个字母。字母。如如:E.coli微生物的命名法本讲稿第六页，共十二页2 2三名法：三名法：种名后面加亚种，亚种可用正体种名后面加亚种，亚种可用正体如：如：Staphylococcus aureussubsp3 3属名属名+sp(ssp)sp(ssp)，表示种名未定。表示种名未定。微生物的命名法本讲稿第七页，共十二页二、分类依据二、分类依据（一）（一）形态特征：形态特征：大小，排列，分化，结构，染色等大小，排列
6、，分化，结构，染色等（二二）培培 养养 特特 征征：营营 养养 要要 求求，生生 长长 的的 物物 理理 环环 境境（酸酸 碱碱度度，温温 湿湿 度度），菌菌 落落，菌菌 苔苔，液液 体体培养特征。培养特征。（三）（三）代谢特征：代谢特征：微生物生命活动的方式。微生物生命活动的方式。（四）（四）化学组成特征：化学组成特征：细胞主要特征性化学成分的鉴定细胞主要特征性化学成分的鉴定如：如：细胞壁成分、细胞内含物细胞壁成分、细胞内含物（五五）抗抗原原特特征征：抗抗原原成成为为化化学学组组成成的的一一个个特特殊殊方方面面，微微生生物具有许多不同类型的抗原。物具有许多不同类型的抗原。（六六）生生 态态
7、特特 征征：与与 其其 他他 生生 物物 的的 关关 系系、自自 然然 界界 的的 分分 布布、致致病性等病性等本讲稿第八页，共十二页现代分类依据还需补充：现代分类依据还需补充：（七）细胞壁成分：（七）细胞壁成分：（八）（八）GC含量含量某一特定种的某一特定种的DNA碱基组成是恒定的。碱基组成是恒定的。GC含量以碱基全含量以碱基全部克分子中部克分子中G和和C的摩尔百分数表示：的摩尔百分数表示：G+CG+C+A+T100%=（G+C）mol%种内各株可差2.54.0%;若相差 10%为不同属。分类依据所得数值范围从2375本讲稿第九页，共十二页（九）（九）DNADNA杂交法：杂交法：原理：根据原
8、理：根据DNA解链的可逆性和碱基配对的专一性。解链的可逆性和碱基配对的专一性。若同源性若同源性70%以上为种的水平以上为种的水平，20%以上可能是属的水平以上可能是属的水平。分类依据本讲稿第十页，共十二页(十）十）16SrRNA在在30多亿年生物进化的漫长历史中始终多亿年生物进化的漫长历史中始终执行着相同的生理功能，所以碱基顺序执行着相同的生理功能，所以碱基顺序变化很少，所以称其为保守结构。变化很少，所以称其为保守结构。分类依据本讲稿第十一页，共十二页三、常用分类方法：三、常用分类方法：1.经典分类法：经典分类法：将形态、结构特征作为初步将形态、结构特征作为初步特征，再比较生理、生化特征，采用双歧特征，再比较生理、生化特征，采用双歧法整理结果，进行分类。法整理结果，进行分类。2.数值分类法：数值分类法：根据数量特征进行分类，可根据数量特征进行分类，可根据根据5060个或个或100以上，用电脑进行计算以上，用电脑进行计算统计。统计。3.遗传分类法：遗传分类法：主要依据主要依据GC含量及含量及DNA杂交杂交试样为依据试样为依据本讲稿第十二页，共十二页