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1、基因的表达与调控ppt现在学习的是第1页，共51页2.5.1 基本概念与原理基本概念与原理Basic Conceptions and Principle现在学习的是第2页，共51页一、基因表达的概念一、基因表达的概念*基因组基因组(genome)一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套基因。基因。基因经过转录、翻译，产生具有特异生物学功能的基因经过转录、翻译，产生具有特异生物学功能的蛋白质分子的过程。蛋白质分子的过程。*基因表达基因表达(gene expression)基因表达是受调控的基因表达是受调控的现在学习的是第3页，共51页二、基因表达的时间性及
2、空间性二、基因表达的时间性及空间性（一）时间特异性（一）时间特异性按功能需要，某一特定基因的表达严格按按功能需要，某一特定基因的表达严格按特定的时间顺序发生，称之为基因表达的特定的时间顺序发生，称之为基因表达的时间时间特异性特异性(temporal specificity)。多细胞生物基因表达的时间特异性又称多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶阶段特异性段特异性(stage specificity)。现在学习的是第4页，共51页（二）空间特异性（二）空间特异性基因表达伴随时间顺序所表现出的这种分布差异，基因表达伴随时间顺序所表现出的这种分布差异，实际上是由细胞在器官的分布决定的，所以空间特异性
3、实际上是由细胞在器官的分布决定的，所以空间特异性又称又称细胞或组织特异性细胞或组织特异性(cell or tissue specificity)。在个体生长全过程，某种基因产物在个体按不同组在个体生长全过程，某种基因产物在个体按不同组织空间顺序出现，称之为基因表达的织空间顺序出现，称之为基因表达的空间特异性空间特异性(spatial specificity)。现在学习的是第5页，共51页三、基因表达的方式三、基因表达的方式按对刺激的反应性，基因表达的方式分为：按对刺激的反应性，基因表达的方式分为：（一）组成性表达（一）组成性表达某些基因在一个个体的几乎所有细胞中持续表达某些基因在一个个体的几乎
4、所有细胞中持续表达，通常被称为，通常被称为管家基因管家基因(housekeeping gene)。现在学习的是第6页，共51页无论表达水平高低，管家基因较少受环境无论表达水平高低，管家基因较少受环境因素影响，而是在个体各个生长阶段的大多数或因素影响，而是在个体各个生长阶段的大多数或几乎全部组织中持续表达，或变化很小。区别于几乎全部组织中持续表达，或变化很小。区别于其他基因，这类基因表达被视为其他基因，这类基因表达被视为组成性基因表达组成性基因表达(constitutive gene expression)。现在学习的是第7页，共51页（二）诱导和阻遏表达（二）诱导和阻遏表达在特定环境信号刺激下
5、，相应的基因被激活在特定环境信号刺激下，相应的基因被激活，基因表达产物增加，这种基因称为，基因表达产物增加，这种基因称为可诱导基因可诱导基因。可诱导基因在特定环境中表达增强的过程，称为可诱导基因在特定环境中表达增强的过程，称为诱导诱导(induction)。如果基因对环境信号应答是被抑制，这种基如果基因对环境信号应答是被抑制，这种基因是因是可阻遏基因可阻遏基因。可阻遏基因表达产物水平降低的可阻遏基因表达产物水平降低的过程称为过程称为阻遏阻遏(repression)。现在学习的是第8页，共51页在一定机制控制下，功能上相关的一组基因，在一定机制控制下，功能上相关的一组基因，无论其为何种表达方式，
6、均需协调一致、共同表达无论其为何种表达方式，均需协调一致、共同表达，即为，即为协调表达协调表达(coordinate expression)，这种这种调节称为协调调节调节称为协调调节(coordinate regulation)。现在学习的是第9页，共51页四、基因表达调控的生物学意义四、基因表达调控的生物学意义（一）适应环境、维持生长和增殖（一）适应环境、维持生长和增殖（二）维持个体发育与分化（二）维持个体发育与分化现在学习的是第10页，共51页五、基因表达调控的基本原理五、基因表达调控的基本原理（一）基因表达的多级调控（一）基因表达的多级调控基因激基因激活活转录起始转录起始 转录后加工转录
7、后加工mRNA降解降解蛋白质降解等蛋白质降解等蛋白质翻译蛋白质翻译翻译后加工修饰翻译后加工修饰转录起始转录起始现在学习的是第11页，共51页（二）基因转录激活调节基本要素（二）基因转录激活调节基本要素基因表达的调节与基因表达的调节与基因基因的结构、性质，生物的结构、性质，生物个体或细胞所处的内、外个体或细胞所处的内、外环境环境，以及细胞内所，以及细胞内所存在的转录存在的转录调节蛋白调节蛋白有关。有关。1.特异特异DNA序列和调节蛋白质序列和调节蛋白质现在学习的是第12页，共51页原核生物原核生物 蛋白质因子蛋白质因子 操纵子操纵子(operon)机制机制特异特异DNA序列序列编码序列编码序列
8、启动序列启动序列 操纵序列操纵序列 其他调节序列其他调节序列(promoter)(operator)现在学习的是第13页，共51页是是RNA聚合酶结合并启动转录聚合酶结合并启动转录的特异的特异DNA序列。序列。1)启动序列启动序列RNA转录起始转录起始-35区区-10区区TTGACATTAACTTTTACATATGATTTTACATATGTTTTGATATATAATCTGACGTACTGTN17N16N17N16N16N7N7N6N7N6AAAAAtrp tRNATyrlacrecAAra BAD TTGACA TATAAT共有序列共有序列现在学习的是第14页，共51页共有序列共有序列(con
9、sensus sequence)决定启动决定启动序列的转录活性大小。序列的转录活性大小。某些特异因子（蛋白质）某些特异因子（蛋白质）决定决定RNA聚合酶聚合酶对一个或一套启动序列的特异性识别和结合能力对一个或一套启动序列的特异性识别和结合能力。现在学习的是第15页，共51页2 操纵序列操纵序列 阻遏蛋白阻遏蛋白(repressor)的结合位点的结合位点当操纵序列结合有当操纵序列结合有阻遏蛋白阻遏蛋白时，会阻碍时，会阻碍RNA聚合酶与启动序列的结合，或是聚合酶与启动序列的结合，或是RNA聚合酶不能聚合酶不能沿沿DNA向前移动向前移动，阻碍转录。，阻碍转录。启动序列启动序列编码序列编码序列操纵序列
10、操纵序列pol阻遏蛋白阻遏蛋白现在学习的是第16页，共51页3)其他调节序列、调节蛋白其他调节序列、调节蛋白例如例如激活蛋白激活蛋白(activator)可结合启动序列邻近的可结合启动序列邻近的DNA序列，促进序列，促进RNA聚合酶与启动序列的结合，聚合酶与启动序列的结合，增强增强RNA聚合酶活性。聚合酶活性。有些基因在没有激活蛋白存在时，有些基因在没有激活蛋白存在时，RNA聚合酶聚合酶很少或完全不能结合启动序列。很少或完全不能结合启动序列。现在学习的是第17页，共51页真核生物真核生物1)顺式作用元件顺式作用元件(cis-acting element)可影响自身基因表达活性的可影响自身基因表
11、达活性的DNA序列序列BADNA编码序列编码序列转录起始点转录起始点不同真核生物的顺式作用元件中也会发现不同真核生物的顺式作用元件中也会发现一些共有序列一些共有序列，如，如TATA盒、盒、CAAT盒等，这些共盒等，这些共有序列是有序列是RNA聚合酶或特异转录因子的结合位点。聚合酶或特异转录因子的结合位点。现在学习的是第18页，共51页2)真核基因的调节蛋白真核基因的调节蛋白还有蛋白质因子可特异识别、结合自身还有蛋白质因子可特异识别、结合自身基因的调节序列，调节自身基因的表达，称基因的调节序列，调节自身基因的表达，称顺式作用顺式作用。由某一基因表达产生的蛋白质因子，通过与由某一基因表达产生的蛋白
12、质因子，通过与另一基因的特异的顺式作用元件相互作用，调节另一基因的特异的顺式作用元件相互作用，调节其表达。其表达。反式作用因子反式作用因子(trans-acting factor)这种调节作用称为这种调节作用称为反式作用反式作用。现在学习的是第19页，共51页cDNAaDNA反式调节反式调节C顺式调节顺式调节 mRNA C蛋白质蛋白质CBA mRNA蛋白质蛋白质AA现在学习的是第20页，共51页指的是反式作用因子与顺式作用元件之间的指的是反式作用因子与顺式作用元件之间的特异识别及结合。通常是非共价结合，被识别的特异识别及结合。通常是非共价结合，被识别的DNA结合位点通常呈对称、或不完全对称结构
13、。结合位点通常呈对称、或不完全对称结构。绝大多数调节蛋白质结合绝大多数调节蛋白质结合DNA前，需通过前，需通过蛋白质蛋白质-蛋白质相互作用，形成蛋白质相互作用，形成二聚体二聚体(dimer)或或多聚体多聚体(polymer)。2.DNA-蛋白质蛋白质蛋白质蛋白质-蛋白质蛋白质的相互作用的相互作用现在学习的是第21页，共51页3.RNA聚合酶聚合酶 原核启动序列原核启动序列/真核启动子与真核启动子与RNA聚合酶活性聚合酶活性 RNA聚合酶与其的亲和力，影响转录。聚合酶与其的亲和力，影响转录。调节蛋白与调节蛋白与RNA聚合酶活性聚合酶活性一些特异调节蛋白在适当环境信号刺激下表达一些特异调节蛋白在适
14、当环境信号刺激下表达，然后通过，然后通过DNA-蛋白质、蛋白质蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用影蛋白质相互作用影响响RNA聚合酶活性。聚合酶活性。现在学习的是第22页，共51页2.5.2原核基因转录调节原核基因转录调节Regulation of Prokaryotic Gene Transcription现在学习的是第23页，共51页调节的主要环节在调节的主要环节在转录起始转录起始一、原核基因转录调节特点一、原核基因转录调节特点（一）（一）因子决定因子决定RNA聚合酶识别特异性聚合酶识别特异性（二）操纵子模型的普遍性（二）操纵子模型的普遍性（三）阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性（三）阻遏蛋白与阻遏机制
15、的普遍性现在学习的是第24页，共51页二、乳糖操纵子调节机制二、乳糖操纵子调节机制（一）乳糖操纵子（一）乳糖操纵子(lac operon)的结构的结构 调控区调控区CAP结合位点结合位点启动序列启动序列操纵序列操纵序列 结构基因结构基因Z：-半乳糖苷酶半乳糖苷酶Y：透酶透酶A：乙酰基转移酶：乙酰基转移酶ZYAOPDNA现在学习的是第25页，共51页mRNA阻遏蛋白阻遏蛋白IDNAZYAOPpol没有乳糖存在时没有乳糖存在时（二）阻遏蛋白的负性调节（二）阻遏蛋白的负性调节阻遏基因阻遏基因现在学习的是第26页，共51页mRNA阻遏蛋白阻遏蛋白有乳糖存在时有乳糖存在时IDNAZYAOPpol启动转录
16、启动转录mRNA乳糖乳糖半乳糖半乳糖-半乳糖苷酶半乳糖苷酶现在学习的是第27页，共51页+转录转录无葡萄糖，无葡萄糖，cAMP浓度高时浓度高时有葡萄糖，有葡萄糖，cAMP浓度低时浓度低时（三）（三）CAP的正性调节的正性调节ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAP现在学习的是第28页，共51页（四）协调调节（四）协调调节当阻遏蛋白封闭转录时，当阻遏蛋白封闭转录时，CAP对该系统不能发挥对该系统不能发挥作用；作用；如无如无CAP存在，即使没有阻遏蛋白与操纵序列存在，即使没有阻遏蛋白与操纵序列结合，操纵子仍无转录活性。结合，操纵子仍无转录活性。单纯乳糖存在时，细菌利用乳糖作碳源；单纯乳
17、糖存在时，细菌利用乳糖作碳源；若有葡萄糖或葡萄糖若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在时，细菌乳糖共同存在时，细菌首先利用葡萄糖。首先利用葡萄糖。葡萄糖对葡萄糖对 lac 操纵子的阻遏作用称操纵子的阻遏作用称分解代谢阻分解代谢阻遏遏(catabolic repression)。现在学习的是第29页，共51页mRNA低半乳糖时低半乳糖时高半乳糖时高半乳糖时 葡萄糖低葡萄糖低 cAMP浓度高浓度高 葡萄糖高葡萄糖高cAMP浓度低浓度低RNA-polOOOO现在学习的是第30页，共51页Trp Trp 高时高时 Trp 低时低时 mRNA OPtrpR调节区调节区 结构基因结构基因 RNA聚合酶聚合酶 R
18、NA聚合酶聚合酶 三、其他转录调节机制三、其他转录调节机制（一）转录衰减（一）转录衰减色氨酸操纵子色氨酸操纵子现在学习的是第31页，共51页UUUUUUUU调节区调节区 结构基因结构基因 trpROP前导序列前导序列 衰减子区域衰减子区域 UUUU前导前导mRNA1234衰减子结构衰减子结构 第第1010、1111密码子为密码子为trptrp密码子密码子 终止密码子终止密码子 14aa14aa前导肽编码区前导肽编码区:包含序列包含序列1 1 形成发夹结构能力强弱：形成发夹结构能力强弱：序列序列1/21/2序列序列2/32/3序列序列3/4 3/4 trp 密码子密码子 UUUU现在学习的是第3
19、2页，共51页UUUU34UUUU 334核糖体核糖体 前导肽前导肽 前导前导mRNA1.1.当色氨酸浓度高时当色氨酸浓度高时 转录衰减机制转录衰减机制 125 trp 密码子密码子 衰减子结构衰减子结构就是终止子就是终止子可使转录可使转录前导前导DNA UUUU 3 RNA RNA聚合酶聚合酶 终止终止现在学习的是第33页，共51页UUUU342423UUUU核糖体核糖体 前导肽前导肽 前导前导mRNA 15 trp 密码子密码子 结构基因结构基因前导前导DNA RNA RNA聚合酶聚合酶 2.2.当色氨酸浓度低时当色氨酸浓度低时 Trp合成酶系相关合成酶系相关结构基因被转录结构基因被转录
20、序列序列3 3、4 4不能不能形成衰减子结构形成衰减子结构 现在学习的是第34页，共51页（二）基因重组（二）基因重组沙沙门门菌菌鞭鞭毛毛素素基基因因的的调调节节 H2鞭毛素鞭毛素 阻遏蛋白阻遏蛋白 Hin重组酶重组酶转位片段转位片段hinH2IH1 H1鞭毛素鞭毛素hinH2IDNA启动序列启动序列H1启动序列启动序列现在学习的是第35页，共51页（三）（三）SOS反应反应 SOS基因基因紫外线紫外线激活激活Rec ALex A阻遏蛋白阻遏蛋白 与与DNA 损伤修复有关损伤修复有关的酶和蛋白质的酶和蛋白质基因基因表达表达Lex A阻遏蛋白阻遏蛋白操纵序列操纵序列DNA现在学习的是第36页，共
21、51页 2.5.3真核基因转录调节真核基因转录调节Regulation of Eukaryotic Gene Transcription现在学习的是第37页，共51页一、真核基因组结构特点一、真核基因组结构特点（一）真核基因组结构庞大（一）真核基因组结构庞大哺乳类动哺乳类动物基因组物基因组DNA 约约 3 10 9 碱基对碱基对编码基因编码基因约约 有有 40000 个，占总长的个，占总长的6%rDNA等重复基因等重复基因约约 占占 5%10%现在学习的是第38页，共51页（二）单顺反子（二）单顺反子单顺反子单顺反子(monocistron)即一个编码基因转录生成一个即一个编码基因转录生成一个
22、mRNA分分子，经翻译生成一条多肽链。子，经翻译生成一条多肽链。（三）重复序列（三）重复序列单拷贝序列（一次或数次）单拷贝序列（一次或数次）高度重复序列（高度重复序列（106 次）次）中度重复序列（中度重复序列（103 104次）次）多拷贝序列多拷贝序列（四）基因不连续性（四）基因不连续性现在学习的是第39页，共51页二、真核基因表达调控特点二、真核基因表达调控特点（一）（一）RNA聚合酶聚合酶（二）活性染色体结构变化（二）活性染色体结构变化1.对核酸酶敏感对核酸酶敏感活化基因常有超敏位点，位于调节蛋白活化基因常有超敏位点，位于调节蛋白结合位点附近。结合位点附近。现在学习的是第40页，共51页
23、2.DNA拓扑结构变化拓扑结构变化天然双链天然双链DNA均以负性超螺旋构象存在；均以负性超螺旋构象存在；基因活化后基因活化后RNA-pol正超螺旋正超螺旋负超螺旋负超螺旋转录方向转录方向3.DNA碱基修饰变化碱基修饰变化真核真核DNA约有约有5%的胞嘧啶被甲基化，的胞嘧啶被甲基化，甲基化范围与基因表达程度呈反比。甲基化范围与基因表达程度呈反比。现在学习的是第41页，共51页4.组蛋白变化组蛋白变化 富含富含Lys组蛋白水平降低组蛋白水平降低 H2A,H2B二聚体不稳定性增加二聚体不稳定性增加 组蛋白修饰组蛋白修饰 H3组蛋白巯基暴露组蛋白巯基暴露（三）正性调节占主导（三）正性调节占主导（四）转
24、录与翻译分隔进行（四）转录与翻译分隔进行（五）转录后修饰、加工（五）转录后修饰、加工现在学习的是第42页，共51页三、真核基因转录激活调节三、真核基因转录激活调节（一）顺式作用元件（一）顺式作用元件1.启动子启动子真核基因启动子是真核基因启动子是RNA聚合酶结合位聚合酶结合位点周围的一组转录控制组件，至少包括一个点周围的一组转录控制组件，至少包括一个转录起始点转录起始点以及一个以上的以及一个以上的功能组件功能组件。TATA盒盒GC盒盒CAAT盒盒现在学习的是第43页，共51页现在学习的是第44页，共51页2.增强子增强子(enhancer)指远离转录起始点、决定基因的时间、指远离转录起始点、决
25、定基因的时间、空间特异性、增强启动子转录活性的空间特异性、增强启动子转录活性的DNA序序列。列。3.沉默子沉默子(silencer)某些基因的负性调节元件，当其结合特异某些基因的负性调节元件，当其结合特异蛋白因子时，对基因转录起阻遏作用。蛋白因子时，对基因转录起阻遏作用。现在学习的是第45页，共51页（二）反式作用因子（二）反式作用因子 1.转录调节因子分类（按功能特性）转录调节因子分类（按功能特性）*基本转录因子基本转录因子(general transcription factors)是是RNA聚合酶结合启动子所必需的一组蛋白因子聚合酶结合启动子所必需的一组蛋白因子，决定三种，决定三种RNA
26、(mRNA、tRNA及及rRNA)转录的类转录的类别。别。现在学习的是第46页，共51页*特异转录因子特异转录因子(special transcription factors)为个别基因转录所必需，决定该基因的时间为个别基因转录所必需，决定该基因的时间、空间特异性表达。、空间特异性表达。转录激活因子转录激活因子转录抑制因子转录抑制因子现在学习的是第47页，共51页2.转录调节因子结构转录调节因子结构DNA结合域结合域转录激活域转录激活域TF蛋白质蛋白质-蛋白质结合域蛋白质结合域（二聚化结构域）（二聚化结构域）谷氨酰胺富含域谷氨酰胺富含域酸性激活域酸性激活域脯氨酸富含域脯氨酸富含域现在学习的是第48页，共51页最常见的最常见的DNA结合域结合域 1.锌指锌指(zinc finger)C CysH His常结合常结合GC盒盒现在学习的是第49页，共51页ZnCysHis现在学习的是第50页，共51页 2.-螺旋螺旋常结合常结合CAAT盒盒现在学习的是第51页，共51页