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1、生物化学和分子生物学 名词解释 麻醉学院09级3班 王芷 1 第二章 蛋白质 1、GSH 即谷胱甘肽,是由谷氨酸,半胱氨酸和甘氨酸通过肽键缩合而成的三肽。 2、蛋白质变性(protein denaturation) 蛋白质在某些物理和化学因素作用下其特定的空间构象被改变,从而导致其理化性质的改变和生物活性 的丧失,这种现象称为蛋白质变性。 3、-螺旋(-helix) 蛋白质中常见的一种二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋 是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基(第 n 个)的羰基氧与多肽链 C 端方向的第 3 个残基(第 n3 个)的酰胺氮形成氢键。在典型的右手
2、 -螺旋结构中,螺距为 0.54nm,每一圈含有 3.6 个氨基酸残基, 每个残基沿着螺旋的长轴上升 0.15nm。 4、-折叠片层(-sheet) 是蛋白质中的常见的二级结构,是由伸展的多肽链组成的。折叠片的构象是通过一个肽键的羰基氧和位 于同一个肽链或相邻肽链的另一个酰胺氢之间形成的氢键维持的。氢键几乎都垂直伸展的肽链,这些肽 链可以是平行排列(走向都是由 N 到 C 方向) ;或者是反平行排列(肽链反向排列) 。 5、-转角(-turn) 也是多肽链中常见的二级结构,连接蛋白质分子中的二级结构(-螺旋和 -折叠) ,使肽链走向改变的一 种非重复多肽区,一般含有 216 个氨基酸残基。含有
3、 5 个氨基酸残基以上的转角又常称之环(loops) 。 常见的转角含有 4 个氨基酸残基,有两种类型。转角 I 的特点是:第 1 个氨基酸残基羰基氧与第 4 个残 基的酰胺氮之间形成氢键;转角 II 的第 3 个残基往往是甘氨酸。这两种转角中的第 2 个残基大都是脯氨 酸。 6、功能蛋白质组(functional proteome) 指的是特定时间、特定环境和实验各种下,基因组活跃表达的蛋白质。 7、肽键(peptide bond ) 在蛋白质分子中,一分子氨基酸的 -羧基与另一分子氨基酸的 -氨基脱水缩合后而形成的酰胺键称为肽 键。 8、基序/模体(motif) 模体属于蛋白质的超二级结构
4、,由 2 个或 2 个以上具有二级结构的的肽段,在空间上相互接近,形成一 个特殊的空间构象,并发挥专一的功能。一种类型的模体总有其特征性的氨基酸序列。 9、结构域(domain) 在蛋白质三级结构内的独立折叠单元。结构域通常都是几个超二级结构单元的组合。 10、氨基酸残基 在多肽链中的氨基酸,由于其部分基团参与了肽键的形成,剩余的结构部分则称氨基酸残基。它是一个分子的一 部分,而不是一个分子。 11、蛋白质二级结构(secondary structure of protein) 指某段多肽链中主链骨架在局部空间有规律的盘绕和折叠,即蛋白质分子中某段肽链主链原子的相对空 间位置,不包括与其他链段
5、的相互关系及侧链构象的内容。 12、蛋白质三级结构(Tertiary structure of protein) 指在二级结构、模体的基础上,由于侧链 R 基团的相互作用,整条肽链进一步折叠和盘曲成球状分子,即整条 肽链所有原子在三维空间的排布位置。 生物化学和分子生物学 名词解释 麻醉学院09级3班 王芷 2 13、蛋白质四级结构(Quaternary structure of protein) 由两条或两条以上具有独立三级结构的多肽链以非共价键连接的空间排布和接触部位的布局称蛋白质的四级结 构。 14、别构效应(allosteric effect) 当蛋白质(酶)与它的配体(某种小分子物质
6、)结合后,引起蛋白质(酶)的空间结构(构象)发生改变,使其 适合功能的需要,这种变化称别构效应或变构效应。 15、盐析(Salting out) 向某些蛋白质溶液中加入某些无机盐溶液后,可以使蛋白质凝聚而从溶液中析出,这种作用叫作盐析, 可复原。 16、亚基(subunit) 有四级结构的蛋白质的每条具有独立三级结构的多肽链称为亚基或亚单位。 17、蛋白质的等电点(pI) 溶液处于某一 PH 时,氨基酸解离成正负离子的趋势相等,即成为两性离子,净电荷为零,在电场中不向阳极也 不向阴极移动,此时溶液的 pH 称为氨基酸的等电点。 第三章 核酸 1、DNA 变性 在某些理化因素作用下, DNA 分
7、子互补碱基对之间的氢键断裂, 使 DNA 双螺旋结构松散, 变为单链, 即为 DNA 变性。 2、核酶(ribozyme) 具有催化活性的 RNA, 即化学本质是核糖核酸 RNA, 却具有酶的催化功能。 3、增色效应 变性的 DNA,分子两条互补链可完全解开成为两条单链,使得碱基暴露,260nm 处外吸收增强,这种现象称为 增色效应。 4、Tm 值 即解链温度,DNA 的变性从开始解链到完全解链,是在一个相当窄的温度内完成,在这一范围内,紫外光吸收 值达到最大值 50%时的温度称为 DNA 的解链温度,这一现象和结晶的融解过程类似,又称融解温度(Tm) 。 5、DNA 超螺旋(DNA supe
8、rcoil) DNA 双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋。超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与 DNA 双螺旋 方向相同时,其超螺旋结构为正超螺旋,反之则为负超螺旋,负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要 的。 6、hnDNA 即核不均一 RNA,是 mRNA 的前体。 7、DNA 复性 DNA 的复性指变性 DNA 在适当条件下,二条互补链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象,它是变 性的一种逆转过程。 第四、五章 酶 1、同工酶(isoenzyme) 能够催化相同的化学反应,而酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。 2、酶活性中心(active center) 酶分子中必需
9、基团在一级结构上可能相距很远, 但在空间结构上彼此靠近, 构成具有特定动态构象的局部空间结 生物化学和分子生物学 名词解释 麻醉学院09级3班 王芷 3 构,直接参与酶促反应,与外部的底物特异地结合并使底物转变为产物的区域称为酶的活性中心或活性部位。 3、Km 值 是当酶反应速度达到最大反应速度一半时的底物浓度的大小。 4、共价修饰(covalent modification) 酶分子上某些特殊基团在其他酶作用下, 发生可逆的共价结合而被修饰, 并快速改变的活性称共价修饰调节或化 学修饰。 5、酶原(zymogen) 在细胞内合成及初分泌时处于无活性状态的酶的前体。 6、全酶(holoenzy
10、me) 酶蛋白和辅助因子结合形成的具有催化作用的复合物称为全酶。 7、米氏方程(Michaelis-Menten equation) 表示酶促反应的起始速度与底物浓度关系的速度方程,VVmaxS/(Km+S)。 8、别构酶(allosteric enzyme) 别构酶一种其活性受到结合在活性部位以外部位的其它分子调节的酶。 9、辅酶(coenzyme) 辅酶是一类可以将化学基团从一个酶转移到另一个酶上的有机小分子, 与酶较为松散地结合,对于特定酶 的活性发挥是必要的。 10、辅基(prosthetic group) 酶的辅助因子或结合蛋白质的非蛋白部分,其中较小的非蛋白质部分称辅基,与酶或蛋白
11、质结合的非常 紧密,用透析法不能除去。 第六章 糖代谢 1、糖酵解(glycolysis) 糖无氧分解即糖酵解,是指葡萄糖在无氧条件下分解生成乳酸并释放出能量的过程。 2、糖异生(gluconeogenesis) 由非糖物质转变为葡萄糖或糖原的过程称为糖异生。 3、糖原(glycogen) 是由许多葡萄糖分子聚合而成的带有分支的高分子多糖类化合物。 4、底物水平磷酸化(substrate level phosophoryltion) 底物在氧化过程中直接将高能磷酸键转移给 ADP 生成 ATP 的过程。 5、巴斯德效应(Pasteur effect) 有氧氧化抑制糖酵解的现象。 6、磷酸戊糖途
12、径(pentose phosphate pathway) 指从 G-6-P 脱氢反应开始,经一系列代谢反应生成磷酸戊糖等中间代谢物,然后再重新进入糖氧化分解代谢途径 的一条旁路代谢途径。 7、三羧酸循环(TriCarboxylic Acid cycle,TCA) 三羧酸循环(柠檬酸循环或 Krebs 循环)是指在线粒体中,乙酰 CoA 首先与草酰乙酸缩合生成柠檬酸,然后经 过一系列的代谢反应,乙酰基被氧化分解,而草酰乙酸再生的循环反应过程。 第七章 脂类代谢 1、脂肪酸 -氧化 脂肪酸在体内氧化时在羧基端的 -碳原子上进行氧化,碳链逐次断裂,每次断下一个二碳单位,即乙酰 CoA, 生物化学和分
13、子生物学 名词解释 麻醉学院09级3班 王芷 4 该过程称作 -氧化。 2、酮体(ketone body) 脂肪酸在肝脏中氧化分解所生成的乙酰乙酸、-羟丁酸和丙酮三种中间代谢产物统称为酮体。 3、血浆脂蛋白(lipoprotein) 血脂与血浆中的蛋白质结合,以血浆脂蛋白的形式存在及运输。 4、脂肪动员(fat mobilization) 贮存于脂肪组织中的脂肪被一系列脂肪酶水解为甘油和游离脂肪酸并释放入血供全身各组织利用的过程。 5、初级胆汁酸(primary bile acid) 有肝细胞直接合成的胆汁酸成为初级胆汁酸。 6、载脂蛋白(apolipoprotein,Apo) 血浆脂蛋白中的
14、蛋白质部分。 7、必需脂肪酸(essential fatty acid,EFA) 多数脂肪酸在人体内能合成,只有不饱和脂肪酸的亚油酸、亚麻酸和花生四烯酸在体内不能合成,必须从植物油 摄取,称为人体必需脂肪酸。 8、脂类(lipid) 脂类是脂肪、类脂及其衍生物的总称,是一类不溶于水而易溶于有机溶剂,并能为机体利用的有机化合物。 第八章 生物氧化 1、氧化磷酸化(oxidative phosphorylation) 在线粒体中,底物分子脱下的氢原子经呼吸链传递给氧,在此过程中释放能量使 ADP 磷酸化生成 ATP,这种能 量的生成方式就称为氧化磷酸化。 2、呼吸链(respiratory cha
15、in) 存在于线粒体内膜上,按一定顺序排列的一系列酶或辅酶。其作用是以传递电子和 H+的形式传递代谢物氧化脱 下的氢原子,最后使活化的氢与活化的氧结合生成水。该传递链与细胞呼吸过程有关,故称为呼吸链,又称电子 传递链。 3、P/O 比值 物质氧化时,每消耗一摩尔氧原子所消耗的无机磷的摩尔数称为 P/O 比值,即 ATP 生成的摩尔数。 4、高能化合物 指体内氧化分解中,一些化合物通过能量转移得到了部分能量,把这类储存了较高能量的化合物,如三磷酸腺苷 (ATP),磷酸肌酸,称为高能化合物。它们是生物释放,储存和利用能量的媒介,是生物界直接的供能物质。 5、解偶联剂(uncoupler) 使氧化与
16、磷酸化偶联过程脱离的物质称为解偶联剂。 第九章 氨基酸代谢 1、必需氨基酸(essential amino acid) 指体内需要而又不能自身合成,必须由食物供给的氨基酸,共有 8 种。 2、一碳单位(one carbon unit) 某些氨基酸代谢过程中产生的只含有一个碳原子的基团,称为一碳单位。 3、生酮氨基酸(ketogenic amino acid) 分解代谢过程中能转变成乙酰乙酰辅酶 A 的氨基酸,共有亮氨酸、赖氨酸、色氨酸、苯丙氨酸和酪氨酸 5 种。 生物化学和分子生物学 名词解释 麻醉学院09级3班 王芷 5 4、生糖氨基酸(glucogenic amino acid) 能通过糖
17、异生转变成葡萄糖的氨基酸。 5、鸟氨酸循环(orinithine cycle) 尿素生成的过程由 Hans Krebs 和 Kurt Henseleit 提出,称为鸟氨酸循环,又称尿素循环(urea cycle)或 Krebs- Henseleit 循环。 6、苯酮尿症(phenylketonurics,PKU) 是一种常见的氨基酸代谢病,是由于苯丙氨酸代谢途径中的酶缺陷,使得苯丙氨酸不能转变成为酪氨酸,导致苯 丙氨酸及其酮酸蓄积并从尿中大量排出。 7、联合脱氨基作用(transdeamination) 转氨与脱氨相偶联而脱出氨基的作用称联合脱氨基作用,亦称转氨脱氨基作用。 8、丙氨酸-葡萄糖
18、循环(alanine-glucose cycle) 丙氨酸和葡萄糖反复的在肌和肝之间进行氨的转运,故将这一途径称为丙氨酸-葡萄糖循环。 9、氧化脱氨基(oxidative deamination) 氨基酸先经过脱氢生成不稳定的亚氨基酸,然后水解产生 -酮酸和氨,此反应成为氧化脱氨基作用。 10、转氨基作用(transamination) 在转氨酶作用下,某一氨基酸的 -氨基转移到另一种 -酮酸的酮基上,生成相应的氨基酸,原来的氨基酸则转 变成 -酮酸的过程。 11、尿素的肠肝循环 血液中的尿素渗入肠道,受肠菌尿素酶水解而生成氨的过程。 12、-谷氨酰基循环(-glutamyl cycle) 指
19、通过谷胱甘肽的代谢作用将氨基酸吸收和转运的过程。 13、蛋氨酸循环 SAM 通过转甲基作用,将甲基转移给甲基接受体后,其本身转变为 S-腺苷同型半胱氨酸,进而又转变成同型半 胱氨酸,同型半胱氨酸可接受 N5-CH3-FH4分子中的甲基再生成蛋氨酸。从蛋氨酸活化为 SAM 到转出甲基以及 再生成蛋氨酸的全过程称为蛋氨酸循环。 第十章 核苷酸代谢 1、从头合成(de novo synthesis) 利用一些简单的前体物,如 5-磷酸核糖,氨基酸,一碳单位及 CO2等,逐步合成嘌呤核苷酸的过程称为从头合 成途径。 2、补救途径(salvage pathway) 指利用分解代谢产生的游离碱基或核苷合成
20、相应核苷酸的过程,又称再利用合成途径。 3、痛风(metabolic arthritis) 嘌呤核苷酸分解代谢异常使血尿酸升高,尿酸钠晶体沉积于软骨、关节、软组织及肾脏引起皮下结节,关节疼痛 的症状。 4、自杀抑制作用(suicide substrate) 底物类似物经酶催化生成的产物变成了该酶的抑制剂,例如别嘌呤醇对黄嘌呤氧化酶的抑制。 5、Lesch-Nyhan 综合征(Lesch-Nyhan syndrome) 也称为自毁容貌症,是先天性嘌呤代谢缺陷病,源于次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶(HGPRT)的缺失。 生物化学和分子生物学 名词解释 麻醉学院09级3班 王芷 6 第十一章 血红素
21、与胆色素代谢 1、结合胆红素(conjugated bilirubin) 在肝细胞滑面内质网中,胆红素 Y-蛋白或胆红素 Z-蛋白,在 UDP-葡萄糖醛酸转移酶(UGT)催化下,由 UDP- 葡萄糖醛酸提供葡萄糖醛酸基,胆红素和葡萄糖醛酸基结合转变生成结合胆红素,即葡萄糖醛酸胆红素。 2、游离胆红素(free bilirubin) 胆红素-清蛋白复合物中的胆红素与清蛋白以非共价结合,不牢固、易解离,故称游离胆红素或未结合胆红素、 血胆红素。 3、胆色素(bilin) 是血红素的降解产物,血红素游离出金属离子,剩下的卟啉环代谢分解,生成胆色素。 4、范登堡试验(Van den Bergh rea
22、ction) 用重氮试剂(重氮苯磺酸)与胆红素吡咯环上亚氨基反应,形成偶氮化合物,其在中性介质中呈紫红色,用来鉴 别结合胆红素和未结合胆红素。 第十二章 DNA 的生物合成 1、半保留复制(semiconservative replication) DNA 的复制方式,亲代双链分离后,每条单链均作为新链合成的模板。因此,复制完成时将有两个子代 DNA 分子,且每个分子的核苷酸序列均与亲代分子相同。 2、拓扑异构酶 DNA 拓扑异构酶是存在于细胞核内的一类酶,能够催化 DNA 链的断裂和结合,从而控制 DNA 的拓扑状 态,以克服 DNA 复制过程中解链时产生的扭结现象。 3、冈崎片段(Okaz
23、aki fragment) DNA 双链进行半保留复制时,在 DNA 后随链的不连续合成期间生成的片段。 4、复制叉(replication fork) DNA 复制时在 DNA 链上通过解旋、 解链和 SSB 蛋白的结合等过程形成的 Y 字型结构称为复制叉。 在复制叉处, 作为模板的双链 DNA 解旋,同时合成新的 DNA 链。 5、端粒酶(telomerase) 是基本的核蛋白逆转录酶,可将端粒 DNA 加至真核细胞染色体末端。 6、前导链(leading strand) 与复制叉移动的方向一致,通过连续的 5-3聚合合成的新的 DNA 链。 7、后随链(lagging strand) 与
24、复制叉移动的方向相反,通过不连续的 5-3聚合合成的新的 DNA 链。 8、半不连续复制(Semi-ondisctinuousreplication) DNA 复制的基本过程,指 DNA 复制时,前导链上 DNA 的合成是连续的,后随链上是不连续的,故称为 半不连续复制。 9、Klenow 片段(Klenow fragment) E.coli(大肠杆菌)DNA 聚合酶 I 经部分水解生成的 C 末端 605 个氨基酸残基片段。该片段保留了 DNA 聚合酶 的 5-3聚合酶和 3-5外切酶活性,但缺少完整酶的 5-3外切酶活性。 10、引发体(primosome) 蛋白复合体,主要成份是引物酶和
25、 DNA 解旋酶,是在合成用于 DNA 复制的 RNA 引物时装配的。引发 体与 DNA 结合后随即由引物酶合成 RNA 引物。 11、反转录(reverse transcription) 反转录是以反义 RNA 为模板通过反转录酶合成 DNA 的过程,也称逆转录,是 DNA 生物合成的一种特 生物化学和分子生物学 名词解释 麻醉学院09级3班 王芷 7 殊方式。 12、滚环复制(rolling-circle replication) 噬菌体中常见的 DNA 复制方式。 亲代 DNA 的一条链在复制起点处被切开, 其 5端游离出来。 这样, DNA 聚合酶便可以将脱氧核糖核苷酸聚合在 3-OH
26、 端。当复制向前进行时,亲代 DNA 上被切断的 5端继 续游离下来,并且很快被单链结合蛋白所结合。因为 5端从环上向下解链的同时伴有环状双链 DNA 环 绕其轴不断的旋转,而且以 3-OH 端为引物的 DNA 生长链则不断地以另一条环状 DNA 链为模板向前延 伸,因而称为滚环复制。 13、双向复制(bidirectional replication) DNA 合成时从一个单独的复制起始点上形成两个复制叉,然后相背而行,这种复制方式称为双向复制。 第十三章 RNA 的生物合成 1、启动子(Promoters) RNA 聚合酶特异性识别和结合的 DNA 序列,指导着 RNA 复制,控制基因表达
27、(转录)的起始时间和表达的程 度。 2、核心酶(core enzyme) 大肠杆菌的RNA聚合酶全酶由5个亚基组成、 、 和两个亚基, 可写作2, 失去亚基的叫核心酶 (2) 。 3、RNA 聚合酶(RNA polymerase) 以一条 DNA 链或 RNA 为模板催化由核苷-5-三磷酸合成 RNA 的酶,是催化以 DNA 为模板、三磷酸核糖核苷为 底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成 RNA 的酶,也称转录酶。 4、内含子(introns) 基因内的间隔序列,不出现在成熟的 RNA 分子中,在转录后通过加工被切除。大多数真核生物的基因都有内含 子。 5、外显子(expressed region
28、) 真核生物基因的一部分,它在剪接后仍会被保存下来,所有的外显子一同组成了遗传信息,并可在蛋白质生物合 成过程中被表达为蛋白质。 6、RNA 剪接(RNA splicing) 从 DNA 模板链转录出的最初转录产物中除去内含子,并将外显子连接起来形成一个连续的 RNA 分子的 过程。 7、不对称转录(Asymmetric transcription) 有两方面含义:一是 DNA 分子双链上的某一区段,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录;其二是 模版链并非永远在同一单链上。 8、转录(transcription) 是遗传信息从 DNA 到 RNA 的转移。即以双链 DNA 中的一条链为模板,
29、以 4 种核苷三磷酸为原料,在 RNA 聚合酶催化下合成 RNA 的过程。 9、转录因子(transcription factor) 一些蛋白质因子可以直接或间接结合 RNA 聚合酶,通过识别 DNA 序列中的顺式作用元件而调节启动转 录,这类蛋白质因子称为转录因子。 10、核酶(ribozyme) 是具有催化功能的 RNA 分子,是生物催化剂,又称核酸类酶、酶 RNA、 核酶类酶 RNA。 11、剪接体(splicesome) 进行 RNA 剪接时形成的多组分复合物,其大小为 60S,主要是由小分子的核 RNA 和蛋白质组成,具有 识别 mRNA 前体的 5剪接位点、3剪接位点和分支点的功能
30、。 生物化学和分子生物学 名词解释 麻醉学院09级3班 王芷 8 12、RNA 复制(RNA replication) 以 RNA 作为基因组的病毒称为 RNA 病毒,这类病毒除逆转录病毒外,在宿主细胞都是以病毒的单链 RNA 为模 板合成 RNA,这种 RNA 依赖的 RNA 合成称为 RNA 复制。 第十四章 蛋白质的生物合成 1、遗传密码(genetic codon) mRNA 上每三个相邻的核苷酸的特定排列顺序, 在蛋白质合成中体现为某种氨基酸或其合成的起始和终止信号, 统称为遗传密码,或三联体密码。 2、SD 序列(Shine-Dalgarno) mRNA 上起始密码子 AUG 上游
31、的 5端处大约有 10 个核苷酸,为富含嘌呤碱基的序列,称为 SD 序列,又称为核 糖体结合位点(RBS) 。 3、起始密码子(initiator codon) 为 AUG,它除作为起始信号外,还代表蛋氨酸密码(原核生物在起始位代表甲酰蛋氨酸) 。 4、终止密码子(terminator codon) 为 UAA、UAG 和 UGA,不代表任何氨基酸,又称无义密码。 5、翻译(translation) mRNA 核苷酸排列顺序和蛋白质氨基酸排列顺序存在一种特殊关系,就好象从一种语言翻译成另一种语言的情 形相似,故把 mRNA 到蛋白质过程称为翻译,即蛋白质的生物合成。 6、反密码子(antico
32、don) tRNA 看上去像三叶草形,其一端是携带氨基酸的部位,另一端有 3 个碱基,这 3 个碱基可以与 mRNA 上的密码 子互补配对,因而叫反密码子。 7、氨酰-tRNA 活化氨基酸转移到 tRNA 分子上,与 tRNA 的-CCA 中腺苷酸所含的核糖 3位的游离羟基以酯键结合,形成相应 的氨酰-tRNA。 8、信号肽(signal peptide) N-端的一段疏水氨基酸组成的肽,约由 1530 个氨基酸残基构成。 9、核蛋白体循环(ribosomal cycle) 狭义:肽链的延长。包括进位、转肽、移位、脱落的连续循环过程,每循环一次肽链延长一 个氨基酸,此过程也称核糖体循环。 广义
33、:以氨基酰 tRNA 形式存在的活化氨基酸,即可投入氨基酸缩合成肽的过程,此过程称为核糖体循环或核蛋 白循环。 10、分子伴侣(molecular chaperones) 一类在序列上没有相关性但有共同功能的蛋白质, 它们在细胞内帮助其他含多肽的结构完成正确的组装, 而且在组装完毕后与之分离,不构成这些蛋白质结构执行功能时的组份。 11、干扰素(interferon,IF) 病毒感染真核细胞后由宿主细胞释放的蛋白质因子。能作用于邻近细胞,诱导产生抗病毒蛋白,从而抑制病毒的 繁殖。 12、开放阅读框架(open reading frame,ORF) 按 5至 3方向,从 mRNA 上起始密码子
34、AUG 开始,连续读取密码子,一直到终止密码子,即为编码区域。如 果这一段密码子序列编码有功能的多肽链,可称为一个开放阅读框架。 生物化学和分子生物学 名词解释 麻醉学院09级3班 王芷 9 第十五章 基因表达调控 1、顺式作用元件(cis-acting element) 位于基因旁侧调节(激活或阻遏)基因转录的 DNA 序列。 2、反式作用因子(trans-acting factor) 直接或间接与顺式作用元件相互作用并影响基因表达的蛋白质,统称为反式作用因子。 3、转录因子(transcription factor) 与顺势作用元件特异结合并启动转录的调节蛋白。 4、阻遏物(repress
35、or) 基于某种调节基因所制成的一种控制蛋白质,具有抑制特定基因、产生特征蛋白质的作用。 5、操纵子(Operon) 原核生物结构基因及其表达调控序列共同组成的基因表达调控单元。 6、结构基因(Structural gene) 是决定合成某一种蛋白质分子结构相应的一段 DNA。 结构基因的功能是把携带的遗传信息转录给 mRNA, 再以 mRNA 为模板合成具有特定氨基酸序列的蛋白质。 7、亮氨酸拉链(leucine zipper) 以同二聚体和(或)异二聚体形成的卷曲螺旋或纤维状的蛋白质。 8、锌指基序(zinc finger) 由 2530 个保守的组氨酸-半胱氨酸残基与 Zn2+配位结合并
36、形成稳定紧凑的小结构域。 9、增强子(enhancer) 、端增强子元件(distant enhancer element) 能加强上游或下游基因转录的效率的 DNA 序列,又称远端增强子元件。 10、沉默子(slilencer) 与增强子的作用相反,能一直上游或下游基因转录的 DNA 序列。 11、结构域(domain) 许多大分子蛋白质中,其三级结构通常被分割为一个或数个球形或纤维状的区域,它们折叠得较为紧密,各行其 功能。 12、羧基末端结构域(CTD) RNAP最大亚基的羧基末端有一共有序列(Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser)的重复序列片段,这是一段由羧基氨 基酸
37、为主组成的重复序列,称为羧基末端结构域。 13、单顺反子(monocistron) 真核基因转录产物为单顺反子, 即一种基因编码一种多肽链或 RNA 链, 每个基因转录有各自的调节元件。 14、多顺反子(polycistronic) 在原核细胞中,通常是几种不同的 mRNA 连在一起,相互之间由一段短的不编码蛋白质的间隔序列所隔 开,这种 mRNA 叫做多顺反子 mRNA。 15、RNA 编辑(RNA editing) 指在 mRNA 水平上改变遗传信息的过程。具体指基因转录产生的 mRNA 分子中,由于核苷酸的缺失,插 入或置换,基因转录物的序列不与基因编码序列互补,使翻译生成的蛋白质的氨基
38、酸组成,不同于基因 序列中的编码信息现象。 16、断裂基因(split gene) 真核生物结构基因, 由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成, 去除非编码区再连接后, 可翻译出连续氨基酸组成的完整蛋白质,这些基因称为断裂基因。 生物化学和分子生物学 名词解释 麻醉学院09级3班 王芷 10 第十七章 细胞信号转导 1、受体(receptor) 细胞膜或细胞内的一些天然分子,能够识别和结合有生物活性的化学信号物质(配体) ,从而启动一系列信号转 导,最后产生相应的生物效应,多为糖蛋白。 2、G 蛋白(GTP binding protein) 具有 GTP 酶活性,在细胞信号通路中起
39、信号转换器或分子开关作用的蛋白质。 3、MAPK (mitogen-activated protein kinases) 即促分裂原活化蛋白激酶,一种丝氨酸/苏氨酸激酶,是真核生物信号传递网络中的重要途径之一,在基因表 达调控和细胞质功能活动中发挥关键作用。 4、第二信使(second messenger) 是细胞外信号分子作用于细胞膜后产生的细胞内信号分子。 5、PTK (phosphotyrosine kinase) 酪氨酸激酶,可以催化酪氨酸残基自身磷酸化的蛋白激酶,分为受体酪氨酸蛋白激酶和非受体酪氨酸蛋白激酶。 6、RTK(receptor protein tyrosine kinas
40、es) 受体型蛋白酪氨酸激酶,受体本身具有 PTK 的活性,发生二聚体后自身具备活性并催化胞内区酪氨酸残 基自身磷酸化。 7、跨膜信号转导 蛋白质多肽激素及神经递质等信号分子不能通过细胞膜, 它们携带的信息被细胞表面受体接受后转导至细胞内的 过程。 8、钙调素(calmodulin) 一种能与 Ca2+结合的蛋白质。Ca2+被称为细胞内的第二信使,其浓度变化可调节细胞的功能,这种调节 作用主要是通过钙调素而实现的。 9、催化型受体(catalytic receptor) 受体本身是一种具有跨膜结构的酶蛋白的一类受体。 10、CaMKs Ca2+-CaM 依赖的蛋白激酶,为 Ca2+-CaM 作
41、用的靶酶。 11、Ras 蛋白(Ras protein) 原癌基因产物,类似于 G 蛋白的 Ga 亚基,因其分子量小而被称为小 G 蛋白。 12、核受体(nuclear receptor) 位于细胞核内的受体。主要由 C 端的激素结合区,N 端的受体调节区和中部的 DNA 结合区组成。 第二十章 基因重组与基因工程 1、基因工程(genetic engineering) 指将一种生物的基因与载体分子在体外进行拼接重组,转入另一生物体内,使之扩增并表达出新的性状。 2、PCR 技术 即聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction) ,在体外由引导物介导的 DNA 序列的酶促
42、合成反应,又 称基因扩增技术。 3、限制性核酸内切酶(restriction endonuclease) 细菌体内能够识别 DNA 的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链 DNA 的一类内切酶,与相伴存在的甲基 化酶共同存在构成限制-修饰体系,限制外源 DNA,保护自身 DNA,维持遗传性状的稳定性。 4、基因工程载体(genetic engineering vector) 是供插入目的基因并将其导入宿主细胞内表达或复制的运载工具,常见的有质粒、噬菌体和病毒。 生物化学和分子生物学 名词解释 麻醉学院09级3班 王芷 11 5、重组 DNA 技术(recombinant DNA technique) 又称遗传工程,在体外重新组合 DNA 分子,并使它们在适当的细胞中增殖的遗传操作,这种操作可把特定的基 因组合到载体上,并使之在受体细胞中增殖和表达。 6、互补 DNA (complementary DNA) 由 mRNA 逆转录出来的 DNA 链。