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1、-PK法提全血DNA(蛋白酶K法)一、试验原理:苯酚/氯仿提取DNA是利用酚是蛋白质的变性剂,反复抽提,使蛋白质变性,SDS(十二烷基磺酸钠)将细胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA 的存在下消化蛋白质或多肽或小肽分子,核蛋白变性降解,使DNA从核蛋白中游离出来。DNA易溶于水,不溶于有机溶剂。蛋白质分子表面带有亲水基团,也容易进行水合作用,并在表面形成一层水化层,使蛋白质分子能顺利地进入到水溶液中形成稳定的胶体溶液。当有机溶液存在时,蛋白质的这种胶体稳定性遭到破坏,变性沉淀。离心后有机溶剂在试管底层(有机相),DNA存在于上层水相中,蛋白质则沉淀于两相之间。酚-氯仿抽提的作用是除去未消化的蛋白质。
2、氯仿的作用是有助于水相与有机相分离和除去DNA溶液中的酚。抽提后的DNA溶液用2倍体积的无水乙醇在1/10 3mol/LNaCl存在下沉淀DNA,回收DNA用70%乙醇洗去DNA沉淀中的盐,真空干燥,用TE缓冲液溶解DNA备用。二、步骤: 1、1ml EDTANa2抗凝血于10ml离心管中,加3体积1RBC裂解液混匀,冰浴30min.2、4度10000 rpm离心10min,弃上清,加入1ml 1细胞核裂解液(混匀,把沉淀摇起来),再加2ml 1细胞核裂解液和150l 20%SDS摇匀,直至出现粘稠透明状,加20l 16mg/mlPK,摇匀,37度消化6h以上或者过夜(摇床160r/min).
3、3、加等体积饱和酚,轻摇混匀,室温10000rpm 10min.4、用去头的吸头小心将上清液移至另一离心管中(宁少勿多),加等体积(吸下层)酚/氯仿(1:1 V/V)混匀,4度10000rpm 10min.5、小心移上清液,若上清液不清亮透明,则用等体积氯仿再抽提一次。6、将上清液移入另一离心管中,加入2倍体积无水乙醇,摇匀,见白色絮状DNA,10000rpm 10min.7、去掉大部分上清,摇匀,将DNA转到EP管中,12000rpm 10min.8、去上清,用70%乙醇洗(加1ml, 12000rpm 10min)2次.9、室温干燥5min,再将DNA溶于50l 1TE中。(TE溶解4度可
4、存放一年,若需长期保存,则需加2倍体积无水乙醇70度保存)注:1、20%SDS用之前应先放到水溶锅溶解沉淀2、饱和酚是用Tris饱和的,Tris碱和HCL混合得TrisHCL,pH在8.0左右,可用来调pH.3、酚/氯仿(1:1 V/V)混合液分两层,应吸下层氯仿。试剂配方:10RBC裂解液: NH4Cl 8.29g KHCO3 1.0g EDTA 0.037g 加ddH2O至100ml高压灭菌,4度保存1细胞核裂解液: 2Mol TrisHCL Ph 8.2 0.5ml 4Mol NaCl 10ml 2mMol EDTA 0.4ml 加ddH2O至100ml高压灭菌,4度保存10TE(Tris-HCl-EDTA): Tris-HCl(pH 8.0) 1mol/L 100mlEDTA 1mmol 500mmol/L 20ml加蒸馏水至1L,高压灭菌,室温保存第 4 页-