中山大学医学图书馆数据库检索指南.doc

\ 中山大学医学图书馆数据库检索指南 Sun Yat-sen University Library Guide SciFinder Scholar (CA) 化学文摘网络数据库(学术版) 一、数据库介绍 《化学文摘》是化学和生命科学研究领域中不可或缺的参考和研究工具，也是资料量最大，最具权威的出版物。网络版化学文摘SciFinder Scholar，更整合了Medline医学数据库、欧洲和美国等30几家专利机构的全文专利资料、以及化学文摘1907年至今的所有内容。它涵盖的学科包括应用化学、化学工程、普通化学、物理、生物学、生命科学、医学、聚合体学、材料学、地质学、食品科学和农学等诸多领域。SciFinder Scholar可检索数据库包括： 数据库 内容 ① Reference Databases （文献数据库） CAPLUSSM 包含来自150 多个国家、9000 多种期刊的文献，覆盖1907 年到现在的所有文献以及部分1907 年以前的文献，包括有期刊、专利、会议录、论文、技术报告、书等，涵盖化学、生化、化学工程以及相关学科，还有尚未完全编目收录的最新文献。（目前＞2,430 万条参考书目记录，每天更新3000 条以上） MEDLINE 包含来自70 多个国家、3900 多种期刊的生物医学文献，覆盖1951 到现在的所有文献，以及尚未完全编目收录的最新文献。（目前＞1300 万参考书目记录，每周更新4 次） ② Structure Database （结构数据库） REGISTRYSM 涵盖从1957 年到现在的特定的化学物质。REGISTRY 包括了在CASM中引用的物质以及特定的注册。（目前＞7400 万条物质记录，每天更新约7 万条，每种化学物质有唯一对应的CAS 注册号） ③ Reaction Database （反应数据库） CASREACT 包括从1907 年到现在的单步或多步反应信息。CASREACT 中的反应包括CAS 编目的反应以及下列来源：ZIC/VINITI 数据库，INPI1986 年以前的数据，以及由教授Klaus Kieslich 博士指导编辑的生物转化数据库。（目前＞800 万条反应记录和403,000 条文献记录 ，每周更新约700-1300 条） ④ Commercial Sources Database （商业来源数据库） CHEMCATS 化学品的来源信息，包括化学品目录手册以及图书馆等内的供应商的地址、价格等信息。（目前＞740 万条商业化学物质记录，来自655 家供应商的793 种目录） ⑤ Regulatory Database ( 管制数据库) CHEMLIST 1979 年到现在的管制化学品的信息，包括物质的特征、详细目录、来源以及许可信息等。（＞22.8 万种化合物的详细清单，来自13 个国家和国际性组织，每周更新＞50 条新记录） 我校也购有CA光盘版，包括1997年至2003年5月的数据。 二、SciFinder Scholar (CA)客户端程序的安装和运行 SciFinder Scholar （CA）数据库初次使用需要运行安装客户端程序，其安装步骤如下： （一）安装客户端程序 (1) 客户端程序地址：ftp://202.116.69.14/sfs-new.rar，对文件 sfs-new.rar 进行解压缩，可看到ViewerLite5_04.exe, SFS2004-2.exe和site.prf三个文件 * 对于曾下载并安装sfs旧版本的用户：sfs2004-2.exe文件为原来的sfs2004.exe的更新版本，用户只需在卸载原程序sfs2004.exe程序后安装程序更新版本sfs2004-2.exe到原安装目录文件夹内。 * 对于未曾下载sfs旧版本的用户：可按照接下来的步骤进行安装； 1. 关闭其他应用程序。 2. 运行SFS2004-2.exe，按照系统的提示安装客户端软件。建议选用典型安装。 3. 安装过程中系统提问“Do you have a disk labeled custom site files?”时，请选择“否”。其它选择项默认，完成客户端软件SFS2004-2.exe的安装。 （二）配置客户端软件 将解压缩后得到的文件site.prf复制到客户端软件安装的目录区内（默认路径为C:\SFSCHLR）。如果用户在安装过程中选择了其他路径，请注意路径和目录。 （三）安装ViewerLite ViewerLite是一个观看三维结构的工具，在SciFinder Scholar检索出的物质结果中，有很多都是提供3D视图的，如果安装了ViewerLite,直接点击物质名上的三维图像按钮即可查看。用户可自行选择是否安装：运行解压缩后得到的文件ViewerLite5_04.exe，按系统提示完成安装。 （四）访问SciFinder Scholar数据库 (1) 专线访问。 (2) 运行SciFinder Scholar客户端程序：开始>程序>SciFinder Scholar 2004 Edition>SciFinder Scholar (3)开始检索。 （五）需经由代理访问的IP使用 SciFinder Scholar 方法 凡非正式IP，需经由代理服务器访问校外网络的用户，经与学校网络中心的老师沟通，目前只能通过架设代理层访问SciFinder Scholar。步骤如下： (1) 下载 SocksCap 软件并安装，SocksCap 需要定期更新，请留意更新时间。目前提供其一下载地址：SocksCaP（ftp://202.116.69.14/sc32r237.exe） (2) 启动 SocksCap 软件，File中选择“Setting”，在 SOCKS Server 中填写所使用的代理服务器，如proxy2.zsu.edu.cn；在Port中填写端口，如1080。（因各校区代理服务器地址和端口各不相同，请用户查阅网络中心发的校园网用户管理手册）。 Protocol选择 SOCKS 5，其他默认。 (3) 启动 SocksCap 软件，点击“New”，出现“新运行程序”对话框后，点击“Browse...”，在弹出选择框内选择在客户端软件所安装的目录区（默认路径为C:\SFSCHLR），然后在其中选择 sfschlr.exe 程序，然后确定即可。在 SocksCap 内运行 sfschlr 即进行连接。 注意：本数据库并发用户为5人，北校区等通过代理访问的用户连接速度较慢，如果暂时连接不上，请耐心等候。 三、SciFinder Scholar™ 使用的简单介绍： (一) 进入数据库 双击SciFinder Scholar图标，在License Agreement的弹出窗口中，用户选择Accept按钮， 关掉Message of day的弹出窗口，就进入了Science Finder Scholar的Explore主检索界面，见图2。点击工具条的第一个图标New task，也可以得到Explore界面，见图1。工具条包括常用的一些功能：新任务，后退，向前，打印，保存，全文获取，参数设置，数据库，历史纪录，网址，帮助，退出程序。 参数设置 新任务 数据库 网址 图1 公司名称和研究机构 浏览目录 研究主题 文献情报 著者姓名 化学物质或化学反应 图2 (二) SciFinder Scholar的检索方法 SciFinder Scholar提供六种基本检索途径(见图二)，下面简要介绍各种途径的使用： 1、 化学物质或化学反应（Chemical Substance or Reaction） 用户可以选择三种途径检索： ☉ 化学结构式（Chemical Structure） 您可以在CAS的2200万种有机和无机物质的注册中，查找结构匹配项。 要按结构检索，只需使用结构绘图窗口绘制、导入或者“粘贴”您要检索的化学结构。如图3，画出Ibuprofen 的结构，单击“Get Substances（获取化学物质）”，然后选择确切的匹配项或相关结构，单击OK。 图3 您可单击CAS注册号上方显示的任何按钮，查看相关物质的更多信息。点击A→B，弹出窗口，选择该物质在反应中的位置，如选择Product，则将Ibuprofen作为产物的反应检索出来。如下图4： 获取反应 管制化学品 商业来源信息 物质的引文 物质的3D 模型 图4 图5 也可以点击反应式中的任何物质获取更多信息，如果点击Reactions，则弹出选项，这里我们选择了Substance Detail，提供CAS Registry 记录，点击其中的超链接，可以查看得到此结果的参考文献内容。图5、6。 Get References 可以获取相关文献，Analyze/Refine 可以对结果进行分析或二次检索。 图6 您可以通过绘制化学结构，限定反应中的作用，从700多万种反应中查找相匹配的信息。 使用结构绘图板绘制您的反应查询。添加反应箭头，制定反应参与项的作用。请单击“Get Reaction（获取反应）”。单击任何反应参与项，获得该物质的更多详情。要确认该物质是否已投入市场、购买地点、销售价格，请单击“Commercial Sources（商业资源）”。您将看到供应商列表。单击“显微镜”图标，屏幕将提供有关供应商的详细信息，包括地址、电话、传真号码、电子邮件地址等连连信息。 如果您选择部分结构检索功能，SciFinder Scholar为您提供新的结构检索可能性。 使用机构绘图板绘制相关子结构。定义立体结合、环状构造、链锁结构、替换和取待基团。单击“Get Substances（获取物质）”并指定子结构。单击OK。如果结构绘图包含立体结构。SciFinder Scholar将通过与您的查询进行比较自动分析您的答案。选择所需的组要进一步精确查明答案，单击“Analyze/Refine（分析/精调）”。“Analyze”为您提供若干选项。例如可选择“Ring Skeletons（环状构造）”。单击OK。SciFinder Scholar将根据同一环状构造中特定的原子和结合，对答案集中的物质进行分析和分组。 ☉ 物质标识符 （Substance Identifier） 您可以从2200万种有机和无机的物质中按化学名称或CAS注册号查找相关物质。 通过物质标识符进行检索，输入一个或多个通用名称、物质别名或CAS注册号,例如：50-00-0；Acetaminophen，单击OK。SciFinder Scholar将检索与您的物质标识符相对应的CAS注册记录。 ☉ 分子式 （Molecular Formula） 通过分子式进行检索，SciFinder Scholar 会分析您所输入的分子式，并重新编排原子，使之成为能被计算机识别的Hill System Order，搜索CAS Registry 数据库，并显示匹配结果；如果输入的原子是模糊的，则弹出窗口提示修改，如元素符号的上标、下表，元素符号之间以空格隔开等（多数情况下会自动修正）；如果是多组分的物质如聚合物，盐类等，则各个组分之间以英文的句号 . 隔开。如Component1.Component2。 2、 研究主题（Research Topic） 您可以使用描述相关主题的词句或词语，查找CAS数据库中的2300万参考文献和MEDLINE中的1340万种参考文献。 在“Explore by Research Topic”框中输入描述您的研究主题的单词或短语，例如：the effect of antibiotic residues on dairy products。选择Additional Options按钮可以从出版年、文献类型、语种、著者、公司名称五个方面进行限制。Remove Options按钮可以回到原来的简单主题检索。得到若干候选主题——主题词之间的逻辑组配，见图7。可进行多选。选择合适主题，单击Get Reference以检索全部参考文献。 图7 图8截取了部分相关文献结果，单击右边有“显微镜”的图标，可以查看完整的书目详情及相关参考文献的摘要。单击“电脑”图标，可以查看全文。SciFinder Scholar通过ChemPort连接杂志和专利原文。如果是已经订阅或开放的电子文献，就可以直接查看全文，当然也有可能出现要求付费才能查看的页面。Chemport提供了SciFinder收录的100多年来的许多期刊的全文链接，其中核心期刊1870余种（即每一期每篇文章都有链接，最新的核心期刊列表请访问http://www.cas.org/sent.html 查看）SciFinder Scholar 是每天更新的数据库，所以很多最新的全文链接也一直被添加进来。SciFinder Scholar中包含了近五百万条专利记录，其涵盖范围请参看http://www.cas.org/EO/caspat.html 。大部分专利全文都可以在网上免费获得，Chemport也提供了相应的链接。 文摘 全文 图8 Analyze/Refine按钮，可以Analyze——对所选文献按照年、机构来源、著者等进行分析得到直方图（histogram）；或者Refine——从研究主题、机构名称、著者名称、出版年、文献类型、语种、数据库、是否可获取全文八个方面对已有的结果进行二次检索。 Get Related可以查看关联信息：所选文献引用的文献（Cited Reference），引用所选文献的文献（Citing Reference）， 所选文献中的物质（Substance）， 所选文献中的反应（Reactions），eScience —— 可以将您的检索扩展到整个网络。 3、 著者姓名（Author Name） 1907年至今化学和相关领域内任何作者出版的研究文献，均可通过SciFinder Scholar检索。 输入作者姓名时，请记住一定要输入姓氏（Last Name），名字或中间名是可选项。SciFinder Scholar将提供您所需作者姓名的所有姓氏，包括其它拼写。对于复姓如OSullivan, Chace-Scott, or Johnson Taylor可直接输入；如果带有元音变音的，输入字母即可，或在后面接一个e，会同时搜索名、姓以及姓、名；对于不确认的名，可以输入首字母。 4、 文件标识（Document Identifier） 如果您可提供专利号，SciFinder Scholar能够将您连接到其电子版本。 用专利号进行检索，单击“Document Identifier（文献情报）”，在检索框中键入专利号，一次可输入多个，分行输入。也可以按单击“Read from file”按钮从文件中导入专利号。单击“显微镜”图标，可以查看专利的详情。单击“电脑”图标，可以通过ChemPort Connection SM链接至网站中的电子版专利。下表列出了一些常用的文件标识： Number Examples CA Accession Number 120:15297 1994:15297 Patent number CA 2107100 Patent application number JP 1992-502228 Priority application number IT 1998-BO661 PubMed ID(National Library of Medicine) 2004123 5、 公司名称和研究机构（Company Name/Organization） SciFinder Scholar让您可轻易地寻找所在研究领域的竞争对手或同事。 要按公司或组织进行检索，单击“Company Name/Organization”，输入您要检索的组织名称。要查找该组织是否针对相关主题进行了研究，请使用SciFinder Scholar地“Refine（精调）工具，图9。单击“Research Topic”输入您的主题。 SciFinder Scholar的“Analyze（分析）”工具，可进一步确定该组织中是否已有人拥有相关主题的专利。选择“Document Type（文档类型）”，单击OK。SciFinder Scholar将提供与相关组织关联的所有文档类型。要查看专利参考信息的详情，请选“Patent（专利）”，然后单击“Get Reference（获取参考文献）”。您可使用任何SciFinder Scholar选项，查看不同类型参考文献。 图9 6、 浏览目录（Browse Table of Contents） 使用SciFinder Scholar，您可查看1700多种流行科学期刊的目录，了解已出版的杂志文献。 从1700多种杂志按字母顺序的列表中查找选择您喜爱的杂志，单击“View”。也可通过Edit 菜单→Find，查找所需期刊，注意名称必须完全匹配，一次只能查看一种期刊。默认结果显示的是最新一期的目录，Previouse、Next、Select 可以浏览其他期的目录内容。单击“Select Issue（选择期刊）”，可选择卷册和期刊号。浏览期刊的标题，查找相关文章。要查看书目详情和文章摘要，请单击“显微镜”图标。查看文章全文的电子版，单击“电脑”图标。 以上对SciFinder Scholar 的使用作一个简单介绍，更多的内容可以参见SciFinder Scholar的帮助文件，菜单中的Help，或F1。 中山大学医学图书馆参考咨询部 联系电话:020-87330445，87330804 电子邮件: fmlr@gzsums.edu.cn