2022年生物化学知识点梳理.docx

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1、精选学习资料 - - - - - - - - - 蛋白质水解学习必备欢迎下载生化学问点梳理(1)酸水解:破坏色胺酸,但不会引起消旋,得到的是 简单引起消旋,得到无旋光性的氨基酸混合物;L-氨基酸;(2)碱水解:(3)酶水解:不产生消旋,不破坏氨基酸,但水解不完全,得到的是蛋白质片 断;(P16)酸性氨基酸: Asp(天冬氨酸)、Glu(谷氨酸)碱性氨基酸: Lys(赖氨酸)、Arg精氨酸)、His(组氨酸 极性非解离氨基酸:Gly(甘氨酸)、Ser丝氨酸)、Thr(苏氨酸)、Cys(半胱 Tyr(酪氨酸)、Asn(天冬酰胺)、Gln(谷氨酰胺)氨酸),非极性氨基酸: Ala(丙氨酸)、Val(

2、缬氨酸)、Leu(亮氨酸)、Ile(异亮氨酸)、Pro(脯氨酸)、Phe(苯丙氨酸)、Trp(色氨酸)、Met(甲硫氨酸)氨基酸的等电点 调整环境的 pH,可以使氨基酸所带的正电荷和负电荷相等,这时氨基酸所带的净电荷为零; 在电场中既不向阳极也不向阴极移动,这时的环 境 pH 称为氨基酸的等电点( pI);酸性氨基酸: pI= 1/2 ( pK1+pKR)碱性氨基酸: pI=1/2 (pK2+pKR )中性氨基酸: pI= 1/2 ( pK1+pK2)当环境的 pH 比氨基酸的等电点大,氨基酸处于碱性环境中,带负电荷,在电场中向正极移动;当环境的pH 比氨基酸的等电点小,氨基酸处于酸性环境中,

3、带正电荷,在电场中向负极移动;除了 甘氨酸 外,全部的蛋白质氨基酸的 -碳都是手性碳,都有旋光异构体,但组成蛋白质的都是L-构型;带有苯环氨基酸(色氨酸)在紫外区280nm 波长由最大吸取 蛋白质的等离子点 :当蛋白质在某一 pH 环境中,酸性基团所带的正电荷预见性 基团所带的负电荷相等; 蛋白质的净电荷为零, 在电场中既不向阳极也不向阴极移动;这是环境的 pH 称为蛋白质的等电点;盐溶 :低浓度的中性盐可以促进蛋白质的溶解;盐析 :加入高浓度的中性盐可以有效的破坏蛋白质颗粒的水化层,同时又中和了蛋白质分子电荷,从而使蛋白质沉淀下来;分段盐析: 不同蛋白质对盐浓度要求不同,蛋白质沉淀出来;因此

4、通过不同的盐浓度可以将不同种变性的本质 : 破坏非共价键(次级键)和二硫键,不转变蛋白质的一级结构;蛋白质的二级结构: 多肽链在一级结构的基础上借助氢键等次级键叠成有规章的 空间结构;组成了 -螺旋、 -折叠、 -转角和无规章卷曲等二级结构构象单元; -螺旋 -螺旋一圈有 3.6 个氨基酸,沿着螺旋轴上升0.54nm,每一个氨基酸残基上升 0.15nm,螺旋的直径为2nm;当有脯氨酸存在时,由于氨基上没有余外的氢形成氢键,所以不能形成 -螺旋; -折叠 是一种相当舒展的肽链结构, 由两条或多条多肽链侧向集合形成的锯齿状结构;有同向平行式和反向平行式两种;以反向平行比较稳固; -转角广泛存在于球

5、状蛋白中,是由于多肽链中第n 个残基羰基和第n+3个氨基酸残基的氨基形成氢键,使得多肽链急剧扭转走向而致超二级结构 :指多肽链上如干个相邻的二级结构单元(转角)彼此相互作用,进一步组成有规章的结构组合体( -螺旋、 -折叠、 -p63 );主要有 ,名师归纳总结 - - - - - - -第 1 页,共 7 页精选学习资料 - - - - - - - - - 学习必备欢迎下载空间上能够辨认 , 三种;结构域:是存在于球状蛋白质分子中的两个或多个相对独立的、的三维实体,每个由二级结构组成,充当三级结构的元件,其间由单肽键连接(p64);蛋白质测序的常用方法 N-末端分析:常用 DNP 法 C-末

6、端分析:胰蛋白酶( Lys, Arg凝乳蛋白酶( Trp,Phe , Tyr)溴化氢(只断裂 Met 羧基端形成的肽键)酶多酶复合体 :由几个酶聚合而成的复合体; 它有利于系列反应的正常发生,有利于提高催化的效率,便利机体进行调控;酶的分类:(1)氧化仍原酶类:氧化仍原反应(2)转移酶类:基团转移,从一个分子到另一个分子(3) 水解酶: 催化底物的加水分解反应;(4)裂合酶类 :向双键加入基团,或其逆反应(5)异构酶类 :分子内重排,形成异构体(6)连接酶类 :通过与 ATP 裂解相偶合的缩合反应katal酶的专一性一种酶只能作用于某一种或一类结构、性质相像的物质相对专一性:一种 E 能催化一

7、类 S (一种化学键 /水解酶类)肯定专一性:一种 E 只能催化一种 S (脲酶)酶活力单位:指 1 秒钟转化 1 摩尔底物所需要的酶量;.酶的比活力 :指每单位质量样品中的酶活力,即每毫克蛋白质中所含有的 数;核酶 :指具有催化功能的RNA ;米氏方程 :Vo=Vmax.S/Km+S Km 值的意义 :Km 值在数值上等于当Vo=1/2Vmax 时的底物浓度,这是米氏常数的实际意义; Km 有时被用作酶对底物亲和力指标;Km 值的真实意义打算于 酶促反应机制的特定方面,如反应步骤数目和各步的速率常数;非竞争抑制存在时 , Vmax 不变, Km 变大 非竞争抑制存在时 , Vmax 变小,

8、Km 不变 反竞争抑制存在时 ,表现为 Vmax 和 Km 都变小;通常将酶酶分子中,直接与底物结合并且和催化作用直接相关的部位称为酶的 活性部位或活性中心;酶高效催化的有关因素1.酶和底物的接近与定向;2.张力与形变;3.酸碱催化;4.共价催化; 5.金属离子催化 别构效应: 调剂物(效应物)与别构酶分子中的别构中心(调剂中心)结合后,诱导产生或稳固住酶分子的某种构象,影响,从而调剂酶促反应的速度;使酶活性中心对底物的结合催化作用受到同工酶: 能催化同一种化学反应, 但其酶蛋白本身的分子结构不同的一组酶,存在于生物的同一种属或同一个体的不同组织中,甚至同一组织、同一细胞中;简述 pH 对酶的

9、活性有什么影响,缘由是什么?在肯定的 pH 下, 酶具有最大的催化活性 这一 pH 酶的活力都会下降;但酶的最适 物浓度、种类的影响较大;,通常称此 pH 为最适 pH;高于或低于 pH 并不是固定的常数受酶的浓度、底名师归纳总结 - - - - - - -第 2 页,共 7 页精选学习资料 - - - - - - - - - 学习必备 欢迎下载缘由:引起酶的构象转变,酶活性丢失影响底物的解离状态;影响了酶的活性部位的构象影响活性中心的构响酶的专一性;维生素 A 是一个不饱和的一元醇;缺乏时会得夜盲症和干眼病;维生素 D 是一种固醇类维生素,有利于帮忙钙的吸取,缺乏时会得佝偻病;维生素 E 是

10、一种仍原剂,可以爱护巯基不被氧化;有抗衰老作用;维生素 K 是一种抗凝血维生素,缺乏时易使血液不简单凝固,缺乏时会使血液 凝固时间延长;B3泛酸;辅酶 A 是生物体内代谢反应中乙酰化酶的辅酶,它的前体是维生素核酸化学 DNA 双螺旋模型要点 1.两条链反向平行,右手螺旋 ; 2.碱基位于双螺旋结构的内侧,彼此通过磷酸二酯键相连接;3.两条链配对偏向一侧,形成一条大沟和一条小沟;4.两条链通过氢键连接在一起,AT,GC 5.碱基在一条链上的排列次序不受任何限制,但当一条链上的 核苷酸序列被确定后,即可打算另一条互补序列;tRNA 的高级结构: 呈三叶草模型; 主要由氨基酸臂, 二氢脲嘧啶环 (D

11、HU 环),反密码子, 额外环,胸苷-假脲苷 -胞苷环等五部分组成; 氨基酸臂含有 7 对碱基,5端为磷酸基, 3端为 CCA-OH ;DHU 环由 8-12 个核苷酸组成;反密码子由7 个核苷酸组成,中间三个为反密码子,可以识别 mRNA 上的密码子;额外环 大小不等; 胸苷 -假脲苷 -胞苷环由 7 个核苷酸组成, 反密码子和 T 环分别由 4-5 对碱基的双螺旋区与 tRNA 的其他部位相连;核酸的变性 稳固核酸双螺旋次级键断裂, 空间结构破坏, 变成单链结构的过程;核酸的的一级结构 碱基次序 保持不变;核酸的复性 变性核酸的互补链在适当的条件下,重新缔合成为双螺旋结构的过程称为复性;(

12、将热变性的 DNA 突然冷却至低温时, DNA 不行能复性;变性的 DNA 缓慢冷却时可复性,因此又称为“ 退火”;)分子杂交 DNA 单链与在某些区域有互补序列的异源 DNA 单链或 RNA 链形成 双螺旋结构的过程;这样形成的新分子称为杂交 DNA 分子;什么是 Tm 值,与哪些因素有关? P250 作业本上也有)核酸内切酶: 能识别和切割 DNA 的特定序列, 是 DNA 重组技术的重要工具酶;生物体内的能量代谢 糖酵解的 9 步反应:葡萄糖 +ATP 葡萄糖 -6-磷酸 +ADP (葡萄糖激酶);G-6-磷酸 果糖 -6-磷酸(磷酸葡萄糖异构酶)果糖 -6-磷酸 +ATP 果糖-1,6

13、-二磷酸 +ADP(果糖磷酸激酶)果糖 -1,6-二磷酸 二羟丙酮磷酸 +甘油醛 -3-磷酸 (醛缩酶)二羟丙酮磷酸 甘油醛 -3-磷酸 (丙糖异构酶)甘油醛 -3-磷酸+NAD 甘油酸 -1,3-二磷酸 +NADH 甘油醛磷酸脱氢酶)甘油酸 -1,3-二磷酸 +ADP甘油酸 -3-磷酸+ATP 甘油酸磷酸激酶)甘油酸 -3-磷酸 甘油酸 -2-磷酸 (甘油酸磷酸变位酶)名师归纳总结 甘油酸 -2-磷酸 磷酸烯醇丙酮酸(烯醇化酶)第 3 页,共 7 页- - - - - - -精选学习资料 - - - - - - - - - 学习必备 欢迎下载磷酸烯醇丙酮酸 +ADP 丙酮酸 +ATP(丙酮酸

14、脱氢酶)在酵解过程中有三个不行逆反应,也就是说有三个调控步骤, 分别被三个酶多点调剂: 己糖激酶、磷酸果糖激酶和丙酮酸激酶;三羧酸循环 P316 乙酰辅酶 +草酰乙酸 - 柠檬酸(柠檬酸合酶)柠檬酸 -异柠檬酸(顺乌头酸酶)异柠檬酸 - 酮戊二酸 +NADH (异柠檬酸脱氢酶)-酮戊二酸 - 琥珀酰 -CoA +NADH 琥珀酰 -CoA- 琥珀酸 +GTP (-酮戊二酸脱氢酶)(琥珀酸 -CoA 硫激酶)琥珀酸 - 延胡索酸+FADH2 (琥珀酸脱氢酶)延胡索酸 - 苹果酸+NADH 延胡索酸酶 苹果酸 - 草酰乙酸(苹果酸脱氢酶)在三羧酸循环过程中有三个不行逆反应,也就是说有三个调控步骤,

15、 分别被三个酶多点调剂: 柠檬酸合酶、异柠檬酸脱氢酶和 a-酮戊二酸脱氢酶;三羧酸循环的生物学意义1.普遍存在 2.生物体获得能量的最有效方式 3.是糖类、蛋白质、脂肪三大物质转化的枢纽 4.获得微生物发酵产品的途径糖异生的生理意义 糖异生作用是一个非常重要的生物合成葡萄糖的途径;在饥饿或猛烈运动造成糖原下降后, 糖异生能使酵解产生的乳酸、 脂肪分解产生的甘油以及生糖氨基酸等中间产物重新生成糖;需要是非常重要的;糖异生可以促进脂肪氧化分解供应能量,这对维护血糖浓度, 满意组织对糖的 当体内糖供应不足时, 机体会大量动员脂肪分解,此时会产生过多的酮体(乙酰乙酸、 -羟丁酸、丙酮),而酮体就必须经

16、过三羧酸循环才能完全氧化, 此时糖异生对维护三羧酸循环的正常进行起主要作用;细胞质中的 NADH 是如何进入线粒体的?(P358)答:通过两种穿梭途径 1.甘油 -3-磷酸 穿梭途径 在细胞溶胶中,由甘油-3-磷酸脱氢酶催化,将 NADH 的电子转移到二羟丙酮磷酸,形成甘油-3-磷酸,在线粒体内膜外侧结合着一种甘油-3-磷酸脱氢酶的一种同工酶,通过此酶将内膜间隙中甘油 -3-磷酸的一对电子转移给 羟丙酮磷酸,形成穿梭现象;CoQ,再到复合体 III ,甘油 -3-磷酸又转变成二2.苹果酸 -天冬氨酸穿梭途径细胞溶胶中NADH的电子在苹果酸脱氢酶的催-酮戊二酸转运蛋白跨化下先转移到草酰乙酸上形成

17、苹果酸,后者通过苹果酸过线粒体内膜;在基质中苹果酸上的电子又通过基质中的苹果酸脱氢酶传递给NAD+ ,使其仍原成 NADH ;苹果酸就又变成了草酰乙酸脂肪酸的 氧化 脂肪酸 氧化最终的产物为乙酰 CoA、NADH 和 FADH2;假如碳原子数为 Cn 的脂肪酸进行 氧化,就需要作( n/21)次循环才能完全分解为 n/2 个乙酰 CoA,产生( n-1)/2 个 NADH 和(n-1)/2 个 FADH2;生成的乙酰 CoA 通过 TCA 循环完全氧化成二氧化碳和水并释放能量,而 NADH 和FADH2 就通过呼吸链传递电子生成 ATP;脂肪酸活化是需要消耗两个 ATP;至此可以生成的 ATP

18、 数量为: n/2 10+(n-1)/2 ( 1.5+2.5)-2 乙酰 CoA 不能直接穿过线粒体内膜, 需要三羧酸载体 才能将乙酰 CoA 运出线粒体,在细胞质溶胶内合成脂肪酸;脂肪酸 -氧化与从头合成的区分与联系名师归纳总结 - - - - - - -第 4 页,共 7 页精选学习资料 - - - - - - - - - 学习必备 欢迎下载1.两条途径发生的场所不同, 脂肪酸的 -氧化发生在线粒体, 合成发生在细胞质溶胶 ;2.两者的载体不同,脂肪酸 -氧化载体为 -CoA,合成载体为 ACP ;3.两个都有四步反应,表面上看二者是一个逆过程,但所用的酶和辅因子不同;4.两条途径转运机制

19、不同, 脂肪酸的 -氧化由肉碱将脂酰辅酶运进线粒体,合成就由三羧酸载体将乙酰辅酶运出线粒体;5.两条途径都是以二碳单位进行反应;6.脂肪酸合成从甲基端开头,脂肪酸的 -氧从羧基端开头;7.羟脂基中间体的构型不同;脂肪酸的 -氧化为 L-型,合成时就为 D-型 ;8.脂肪酸的氧化需要 NAD+ 和 FAD 参加,而脂肪酸的从头合成就需要 NADPH参加;肝脏能合成酮体但不能分解酮体;必需脂肪酸有:亚油酸,亚麻酸转氨基作用: 在酶促作用下,氨基酸之间进行的氨基移换作用,广泛进行尤其在肝 , 但只转氨而没有真正脱氨;氧化脱氨基作用 :在酶促作用下,伴有脱氢(氧化)的脱氨基作用;真正脱氨,且为氨基酸产

20、能方式之一(3ATP),但只限于谷氨酸,(反应可逆);联合脱氨基作用 :为转氨基和氧化脱氨基两种作用的协同效应;是体内氨基酸 脱氨基的主要途径;反应可逆,其逆过程是合成非必需氨基酸的主要途径; 为氨基酸氧化产能方式之一(3ATP );有重要的临床诊断意义;氨的命运: 合成氨基酸;合成酰胺;合成尿素尿素循环:尿素的两个N 原子来自一个氨分子和一个天冬氨酸分子,其C 原子来源于 HCO3-;(Gln)(Asp)(Asp)(嘧啶环原子的来源 )(CO2)DNA 聚合酶 53聚合酶及外切酶作用,3 5外切酶酶作用,可校正/修复 DNA 链,仍可切除引物DNA 聚合酶 53聚合酶及 35外切酶酶作用,可

21、校正 /修复 DNA链 DNA 聚合酶 5 与酶作用类似, 酶活高,是主要的链延长酶 (聚合酶)DNA 半保留复制:在 DNA 复制过程中,第一碱基间的氢键需破裂并使双链解开,然后每条连作为模板在其上合成新的互补链;在此过程中每个子代分子的一条链来自亲本,另一条链就是新合成的,这种方式称为半保留复制;DNA 半不连续复制: DNA 的两条链,其中走向是5-3的链在合成时是连续的,而 3-5走向的链在合成的过程中是由很多5-3方向的 DNA 冈崎片段连接起来的,是不连续的;这一过程称为 DNA 损耗修复方式:DNA 的半不连续复制;1.光复活 :可见光(最有效波长 400nm)激活生物界广泛分布

22、(高等哺乳动物除 外)的光复活酶,该酶分解嘧啶二聚体;是一种高度专一的修复形式,只分解由 于 UV 照耀而形成的嘧啶二聚体;2.切除修复: 即在一系列酶的作用下,将 DNA 分子中受损耗的部分切除掉,并 以完整的那一段为模板,合成出切去的部分,从而使 DNA 复原正常;3.重组修复 :受损耗的 DNA 在进行复制时, 跳过损耗部位, 在子代 DNA 链与损 伤相对应部位显现缺口; 通过分子间重组, 从完整的母链上将相应的碱基次序片名师归纳总结 - - - - - - -第 5 页,共 7 页精选学习资料 - - - - - - - - - 学习必备 欢迎下载段移至子链的缺口处, 然后再用合成的

23、多核苷酸来补上母链的空缺,此过程即重复修复;并非完全校正;4.SOS 修复 :指 DNA 受到严峻损耗、细胞处于危险状态时所诱导的一种 DNA修复方式, 修复结果只是能维护基因组的完整性,提高细胞的生成率, 但留下的错误较多,又称倾错性修复;原核生物 RNA 聚合酶 1 种,真核生物 RNA 聚合酶至少三种启动子: RNA 聚合酶识别,结合和开头转录的一段 DNA 序列;转录因子: RNA 聚合酶在特定启动子上开头转录时所需要的作用因子;RNA 的转录和加工 :在细胞内, RNA 聚合酶合成的原始转录物往往需要一系列名师归纳总结 的变化,包括链的裂解,5端和 3端的切除,末端特别结构的形成,核苷的第 6 页,共 7 页修饰和糖苷键的转变以及剪切和编辑等信息加工过程,使其转变成成熟的RNA. - - - - - - -精选学习资料 - - - - - - - - - 名师归纳总结 学习必备欢迎下载第 7 页,共 7 页- - - - - - -

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