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1、医学文献检索与利用医学文献检索与利用yjsyjs 文献基本知识 文献检索基本知识 Pubmed检索 中文文献检索 全文数据库检索 网络资源检索与利用 文献(documents,literature):是记录有知识的一切载体 文献组成四要素: 记录知识的具体内容 记录知识的手段:如文字、图像、符号、声频、视频等 记录知识的物质载体:纸张、光盘、录像带等 记录知识的表现形态:图书、期刊、专利说明书等 积累、继承和交流作用 科学研究的依据 评价医学科技人员造诣的依据 评价一个国家、单位的医学科技发展水平的依据 领导决策的依据 优先权作用 文献类型及其特点 1.按载体划分: 印刷型:book, ser
2、ials, proceedings, thesis, patent, tech. Reports 非印刷型:microfilm, A-V materials, e-j 2. 按加工深度: 一次文献, 二次文献,三次文献 3.获取难易程度: 白色文献、灰色文献、黑色文献 教材(textbook) 根据各专业的教学需要,阐述某一学科或专业的基本知识的教学用书,基本按教学大纲编写 只介绍基础知识和公认的见解,内容相对稳定,阐述系统完整,表达 概括清楚,能使人获得有关学科领域的一般知识 专著(monograph) 针对某一专门题目分章节做出系统深入全面叙述的一种著作 参考工具书(Reference b
3、ooks) 根据一定需要收集有关资料并按特定的方法编排起来供人查考的文献 字典、词典(dictionary) 百科全书(encyclopedia) 年鉴(yearbook, manual, almanac) 手册(handbook) 指南(directory) 药学工具书:药典Martindale: Extra pharmacopiea, 手册Merck Index, 字典中药大辞典 特点:查考性、概括性、易检性 特点: 连续出版发行 有固定的名称(刊名) 相对固定的版式、篇幅和内容范围 按一定的卷期号或年月顺序号连续出版 内容: 每期发表多个作者的多篇文章,内容不重复 作者众多 内容新颖、出
4、版周期短,通报速度快 信息量大,约占整个信息量的70% 按出版周期划分 按内容功能划分:学术、检索、综述 按学科类别划分 按出版机构划分 按载体形态划分 论著(original article, journal article) 综述(review) 短篇报道(short report, brief communication) 来信(letter) 编者述评(editorial) 更正(comment) 摘要(abstract) 消息(news) 讲座(lecture, guide) 书评(book review) 核心期刊研究 中文核心期刊要目总览 中国科学引文数据库(CSCD) 中国科技
5、论文引文数据库(CSTPC) 中国社会科学引文数据库(CSSCI) 期刊评价 影响因子(IF)、主办单位、学会背景、检索工具收录 出版机构 学术背景 编辑部及编委组成 作者组成 基金论文比例 出版频率 发行量 国内外检索工具收录情况(Indexed) 总被引频次(cited times) 影响因子(IF) 载文量(source item) 文摘率 阅览利用率 文摘法 引文法 专家调查法 流通统计法 其它 学科分类: 中国图书馆分类法R1 预防医学、卫生学 R2 中国医学 R3 基础医学R4 临床医学 R5 内科学 R6 外科学 R7 妇产科学 R72 儿科学 R73 肿瘤学 R74 神经病学与
6、精神病学 R75 皮肤病学与性病学 R76 耳鼻咽喉科学 R77 眼科R78 口腔科学 R8 特种医学 R9 药学R 医药、卫生 . (第一级类目)R5 内科学 .(第二级类目)R56 呼吸系及胸部系统疾病. (第三级类目)R563 肺疾病 .(第四级类目)R563.1 肺炎.(第五级类目)R563.1+1 大叶性肺炎.(第六级类目) 标识词组织法 keyword:同义词、近义词 subject headings:唯一性 text word: checktags: animal, human 内容评价: 新颖性、创造性、科学性、实用性、表述性RCT, double blind, sample,
7、 indicator 学科评价:发表期刊IF (impact factor) 定量分析:被引频次,被引期刊IF (Journal Citation Report) IF5 264 IF4 383 IF3 676 专家评议 确定完整的题目:(综述原始研究) aspirin的药理学研究肝纤维化患者血清或肝组织内转移生长因子的检测及其临床意义 分析检索目的、要求:了解背景、现状、基本知识 提炼名词术语: 选择检索工具: 确定检索途径: 制定检索策略: 检索文献: 获取全文: 根据文献修正检索策略并重新检索文献: 检索工具:印刷型(手工检索工具):文摘:BA, CA, 中国药学文摘索引:IM, IST
8、P, EI 目录: OPAC, Bibliography非印刷型(计算机检索):数据库:数值型:CDC 事实型:PDQ 文献型:全文(fulltext): OVID, Springer 检索(书目):pubmed, CBM 多媒体: 知识库: 查全率:(recall):指系统在进行某一检索时,检出的相关文献量占系统文献库中相关文献量的比率,它反映该系统文献库中实有的相关文献量在多大程度上被检索出来。 R(检出相关文献量/系统中相关文献总量)100% 查准率(precision):指系统在进行某一检索时,检出的相关文献量占检出的文献总量的比率,它反映每次从该系统文献库中实际检出的全部文献中有多少
9、是相关的。 P=(检出相关文献量/检出文献总量) 100% 查全率和查准率之间存在互逆关系。如果一检索工具的查全率较高,则其查准率将相对下降;反之查准率高,则查全率低。查全率和查准率只能相对提高,二者永远不可能同时达到100%。 目录:目录:bibliography 题录:题录:title 摘要:摘要:abstract 索引:索引:index 全文:全文:Full-text检索方法工具法:优点:查全、查准缺点:收录范围、时差、检索途径浏览法:优点:获得最新文献缺点:遗漏文献追溯法:利用参考文献查找资料优点:扩大查找范围缺点:片面、遗漏文献 分类途径:分类途径: 主题途径:主题途径:主题索引、单
10、元词索引、关键词索引、叙词索引、主题轮排索引等 著者途径:著者途径:著者索引(个人著者索引和团体著者索引) 号码途径:号码途径:号码索引(报告号、合同号、专利号、标准号、化学物质登记号等) 其它途径:其它途径:特定形式的索引,如分子式索引、动植物名称索引、药物名称索引、基因符号索引等 Author name:姓在前全称,名首字母缩写 Title: Address: Keyword: Mesh(Medical Subject Headings): Abstract: Grant: Publication year: Volume, issue: 文献检索/Qualifiers%20-%20200
11、5.htm83个 Source: 内部特征:内部特征: 分类检索语言:学科分类(类号、类名)分类检索语言:学科分类(类号、类名) 主题检索语言:主题词、关键词主题检索语言:主题词、关键词 代码检索语言:分子式代码检索语言:分子式 外部特征:外部特征:著者、题名、书名、序号、刊名、引文著者、题名、书名、序号、刊名、引文 数据库类型及其构成databasefilerecordfield 计算机检索技术逻辑运算: NOT, AND, OR, () 字符运算:通配符:? (colo?r, wom?n, rat?) 截词符:(transplant*, pregnan*) 字段限定:,IN 其它:出版年、
12、标识词 检索词提炼与转换:怀孕妊娠,子宫纤维瘤活性、降解、吸收普查、防治 逻辑组织:因果关系:阿司匹林致胃溃疡眼结核致失明相关关系:眼弓形体病并发青光眼幽门螺旋杆菌与胃溃疡应用关系:维生素C对哮喘的治疗作用阿司匹林致胃溃疡阿司匹林副作用AND 胃溃疡病因学,化学诱导眼结核致失明眼结核并发症AND 盲病因学眼弓形体病并发青光眼弓形体病并发症AND青光眼并发症幽门螺旋杆菌与胃溃疡幽门螺旋杆菌微生物学AND 胃溃疡病因学,病理学维生素C对哮喘的治疗作用维生素C治疗应用 AND哮喘药物疗法 多个检索词逐个分步检索,最后用逻辑运算组合 肺纤维化细胞因子肺泡灌洗液#1 AND #2 AND #3 选择检索
13、字段并利用二次检索功能 充分利用各种限定功能 注意检索结果的存储与打印处理格式 http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ http:/www.pubmed.gov/ 文献来源: medline:有mesh premedline:无mesh oldmedline:有mesh publisher supplied:无mesh 一般检索:术语,作者姓名 自动匹配功能:mesh-journal-phrase-author-拆分术语用AND组合 截词运算:不包括空格词组,关闭自动匹配功能,不能主题扩展 词组:“”,包括主题但不扩展,拆分组合 辅助命令:limit, previ
14、ew/index, history, clipboard, detail, display, send 结果处理格式 结构组成:字顺表、树状结构表 检索词组成:主题词、副主题词、标识词 应用:点击mesh database或选中mesh库输入检索词挑选、点击合适的主题词从提供的全部匹配的副主题词中选择send to search box 点击search pubmed 工具:CBM, PUBMED 近五年有关高血压遗传学研究的综述文献 心功衰竭的体外反博疗法临床研究文献 肝纤维化患者肝组织或血清中转移生长因子的检测方法及其临床意义研究文献 肺动脉高压药物治疗现状 慢性乙型肝炎的免疫治疗进展 C
15、反应蛋白与糖尿病血管并发症的关系 骨髓干细胞治疗心肌梗死的研究与展望 Entrez: www.ncbi.nlm.nih.gov/ SRS: www.lionbio.co.uk/publicsrs/ 序列数据库 结构数据库 基因组数据库 文献数据库 其他二次数据库文献来源:国内出版生物医学刊物数据库类型:检索型,可链接全文数据库主要特点:同pubmed, 有分类检索检索链接:作者、期刊、关键词、特征词、主题词和副主题词、相关文献 主题词:医学主题词表、中国中医药学主题词表分类:中国图书馆分类法医学专业分类表缺省:题目、主题词、关键词、文摘、刊名 按学科分专辑: 全文型数据库 检索方法:简单、标准
16、、高级、引文、学者、科研基金、句子、元数据 检索途径:主题、篇名、关键词、摘要、作者、第一责任人、单位、刊名、参考文献、全文、年、期、基金、中图分类号、ISSN、统一刊号 主题途径:中英文篇名、中英文关键词、中英文摘要 关键词:中文关键词、英文关键词、机标关键词 简单检索: 标准检索:控制条件:时间、来源、基金、作者 内容特征:全文、主题、篇名、摘要、参考文献 精确与模糊检索:精确匹配与含有 专业检索:使用逻辑运算符、关键词 引文索引:被引作者、被引频次、被引来源等 工具书及知识元搜索: 链接:文献、机构、人名、内容关键词 常用工具:pubmed,BA(BIOSIS),CA,SCI CBM 全
17、文数据库 收录范围: 检索途径: 结果处理方式: 检索辅助命令:检索型数据库:如PUBMED、SCI、BA 特点: 收录某一学科的全部或大部分各语种文献,文献类型和数量多 文献格式规范,著录标准 文献标引全面、深入,揭示完整、规范 检索途径多,检索策略规范,可应用多种技术检索文献 检索结果多为题录或摘要,几乎不提供全文 收录特定某一出版集团出版或代理商代理的全部或部分期刊,收录文献的数量和范围都有限 文献格式不规范,著录标准不严格 文献标引不全面、深入 检索途径少,可应用的检索技术少,一般仅有二次检索功能 检索结果为全文,可提供全文文献 收录文献范围 检索途径 是否提供二次检索或相应手段 浏览
18、器类型 选词:主次-词性(主题词、关键词、自由词-相关词(同义词、近义词)-词义转换 组合:逻辑运算、字符运算、限定 检索实施 策略修订:重新选择合适的词及检索途径 OR组配 主题词扩展 去掉副主题词 减少限制 使用自由词 字符运算(* 、 ?) AND组配 加权检索,使用主要主题词 增加副主题词 增加限制 使用专指主题词 使用文中词 本馆馆藏 网络数据库 馆际互借(NSTL) 网络免费资源 与作者联系 其它 Endnote Refviz 参考资源:资源导航;辞典与百科全书;文摘与索引;统计资料;其他参考资料 全文资源:数据库;电子期刊;研究报告;政府出版物 教学资源:教学资料 多媒体资源:图
19、像资料;音频资料;视频资料 黄页资源:协会学会;大学院系;研究机构中心;其他组织机构;专家学者 交互资源:邮件列表;论坛讨论组;新闻组;搜索引擎 事件:会议;研究项目;学术动态 其他:网站;服务;软件;杂类 简单单一词搜索 多词搜索:空格(缺省运算AND), “ -”=NOT, OR 通配符:“*”,如“以*治国” 词组:“ ” 强制搜索:“ ”或者“+” 网站限制:全文数据库 Site: 文件类型限制:文献检索 filetype:ppt OR filetye:doc 网页链接限制:inurl:midi “甜蜜蜜” 网页标题限制:intitle:藤原纪香 “写真集” 网址链接:link: 相似页面:related: 查新题目委托:立题、立项、成果、论文 项目申报级别:国家、省、市、校 查新材料汇总:论文、报告、总结 查新要点:突出成果 查新范围:文献类型、语言、时间 文献检索以及相关文献分析 查新报告