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1、Four short words sum up what has lifted most successful individuals above the crowd: a little bit more.-author-date计算机在生物学上的应用计算机在生物学上的应用计算机在生物学上的应用实验项目设置及要求一、 实验项目序号实 验 项 目 名 称实验学时每组人数实验类型开出要求1主要生物信息网站资源32综合必做2生物实验数据的计算机辅助处理32综合必做3蛋白质结构分析基础42综合必做4生物文献检索42综合必做合 计14二、 每项实验的内容和要求1.绪论及主要生物信息网站资源：了解相关生物
2、信息学网站资源和主要应用软件。熟悉生物数据的分类，了解相关生物信息学网站资源和主要应用。通过上机，学习和了解生物信息学主流门户和网站资源上机实习作业：列出5个主要的中文或英文生物门户网站（包括网址、服务对象、提供的服务、主要功能、你的评价）。实验报告应包含以下表格所列出的内容。门户网址服务对象提供的服务主要功能你的评价2.生物实验数据的计算机辅助处理：生物实验数据的获取；Excel，Origin辅助生物数据处理；电泳图谱分析。了解通过计算机获取生物实验数据的过程和特点；掌握Excel，Origin辅助生物数据处理的基本技能；掌握利用相关软件处理和分析蛋白质和DNA电泳图谱的基本技巧。通过上机，
3、学习和掌握Excel，Origin软件辅助生物数据处理。上机实习作业：利用Excel计算本课Slide66的数据的Km，Vmax，比较同利用Orgin的计算结果。提示：将公式v=VmaxU/(Km+U)转换成线性表示方式计算。Uridine (uM)Uptake MeanControl Mean00053.95 2.17 108.24 2.09 2015.87 3.08 3018.37 2.55 5018.59 2.57 7519.69 2.83 12519.78 3.15 3.蛋白质结构分析基础：模拟蛋白质结构，显示和修改分子结构。熟悉通过蛋白质序列获取蛋白质一级结构的特点，预测二级结构，并
4、结合同源分析的数据构建蛋白质拓扑学模型。利用专业软件显示和修改蛋白质分子结构。通过上机，学习利用专业软件RasMol软件显示和修改蛋白质分子结构。 上机实习作业：（1）下载和安装RasMol软件；（2）从PDB数据库查找和下载蛋白质的结构数据；（3）利用RasMol显示结构；（4）完成实验报告。4.生物文献检索：中文文献的检索-中国期刊网等；英文文献的检索-PubMed等；如何利用搜索引擎google和百度检索文献。掌握利用中国期刊网等进行中文文献检索的技巧；熟悉和利用PubMed等检索英文文献；利用搜索引擎google和百度检索文献。通过上机，搜索指定专题生物文献。上机实习作业：（1）设计和确定有关 “膜蛋白跨膜螺旋的研究”或有关“生物活性肽的研究和应用”的检索策略；（2）利用至少两种检索工具或文献库完成检索。-