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1、第九章生物进化与分子系统发育分析,1.生物进化,1.1现代的生物分类,进化观点的被接受,现代的生物分类：古细菌、细菌、真核生物,1.2几种生物类群的进化,1.2.1生命的起源,http:/nitro.biosci.arizona.edu/courses/EEB105/lectures/Origins_of_Life/origins.html,化石证据:探索生命起源化石证据的几处地方,http:/nitro.biosci.arizona.edu/courses/EEB105/lectures/Origins_of_Life/origins.html,化石证据:SharkBay的生命起源化石,ht
2、tp:/nitro.biosci.arizona.edu/courses/EEB105/lectures/Origins_of_Life/origins.html,化石证据:探索生命起源化石证据-细菌的分裂,http:/nitro.biosci.arizona.edu/courses/EEB105/lectures/Origins_of_Life/origins.html,化石证据:探索生命起源化石证据-藻类丝状体的分裂,http:/nitro.biosci.arizona.edu/courses/EEB105/lectures/Origins_of_Life/origins.html,实验室
3、的证据:探索生命起源的实验,出现的具膜有机物,1.2.2生物细胞的进化,细菌的内共生,动物细胞与植物细胞,http:/evolution.berkeley.edu/evosite/lines/IIDmolecular.shtml,1.2.3鸟类的起源,恐龙,始祖鸟的骨骼化石,现代的鸟类,1.2.4狗、马的进化,狗的起源于狼,http:/evolution.berkeley.edu/evosite/lines/IVAartselection.shtml,马脚趾的进化,1.2.5人类的进化,人头骨的进化,*,*,*,*,*,*,*,*,*,灵长目动物的亲缘关系,1.3进化的证据,化石考古,比较解剖
4、学：前肢,http:/evolution.berkeley.edu/evosite/lines/IIhomologies.shtml,比较解剖学：鲸(左)与蛇(右)的后肢,比较胚胎学：几种动物及人的胚胎发育,AGCGGTGCAGGTTACTGCGCGTAGTAC|ACGGTGCGGTTACTGCGGCGTAGTAC,AGCGGTGCAGGTTACTGCGCGTAGTAC|A_CGGTGCGGTTACTGCGGCGTAGTAC,AGCGGTGCAGGTTACTGCGCGTAGTAC|A_CGGTGC_GGTTACTGCGGCGTAGTAC,AGCGGTGCAGGTTACTGC_GCGTAGTAC
5、|A_CGGTGC_GGTTACTGCGGCGTAGTAC,序列一sequence1,序列二sequence2,生物大分子的变化：DNA序列的改变,1.4进化的原因1.4.1环境的选择1.4.2自身的变异,1.6.1环境的选择,环境与鸟嘴,http:/evolution.berkeley.edu/evosite/relevance/IA1antibiotics2.shtml,红色的正常菌与其他颜色的变异菌在一起生长。,加抗生素后就只剩下变异的抗药菌在生长。,1.6.2自身的变异,核酸分子的变化,分子并不稳定,2.分子系统发育分析,分子系统发育分析是根据生物大分子序列差异来评估物种或分子间的进化
6、。分子系统发育分析的直观结果是获得进化树。目前用得最多的进化树构建方法有三种：距离法、最大简约法、最大似然法。,距离法是首先算出序列间的进化距离，再根据这些距离将序列分别依次合并的聚类分析方法，并最后用进化树表示结果。距离法构建进化树的算法过程见教材例9.2。,最大简约法是根据信息位点提供的各序列间的替换情况，在所有可能的树中寻找含最小替换数的树的方法。最大简约法构建进化树的算法过程见教材例9.3。,构建进化树的最大似然法是在所有可能的树及所有的可能字符替换数方式中，选择可能性最大的一种作为结果。最大似然法构建进化树的算法过程见教材例9.4。,Presentations,Presentations,生技第五组：用实例演示最大简约法构建系统发生树生制第五组：用实例演示最大似然法构建系统发生树生科第五组：用实例演示Phylip软件构建系统发生树,