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1、【精品文档】如有侵权，请联系网站删除，仅供学习与交流扬州大学农学院生物化学期末复习试题资料.精品文档.必需氨基酸（essential amino acids）指人（或其它脊椎动物）自己不能合成，需要从饮食中获得的氨基酸，例如赖氨酸、苏氨酸等氨基酸。非必需氨基酸（nonessential amino acids）指人（或其它脊椎动物）自己能由简单的前体合成的，不需要由饮食供给的氨基酸，例如甘氨酸、丙氨酸等氨基酸。 等电点（pI，isoelectric point）使分子处于兼性分子状态，在电场中不迁移（分子的净电荷为零）的pH值。肽键（peptide bond）一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨
2、基缩合，除去一分子水形成的酰胺键。肽（peptides）两个或两个以上氨基酸通过肽键共价连接形成的聚合物。 蛋白质一级结构(primary structure)指蛋白质中共价连接的氨基酸残基的排列顺序。同源蛋白质（homologous proteins）来自不同种类生物、而序列和功能类似的蛋白质。例如血红蛋白。组成蛋白质常见的20种氨基酸中，除半胱氨酸和胱氨酸外，含硫的氨基酸还有？除苏氨酸和酪氨酸外，含羟基的氨基酸还有？ 什么氨基酸是一种亚氨基酸；什么氨基酸不含不对称碳原子。PRPP，5-磷酸核糖-1-焦磷酸脂肪酸-氧化的步骤有哪些？大肠杆菌DNA聚合酶I是多功能酶，它具有的酶活性有哪些？DN
3、A的损伤修复有哪些？蛋白质二级结构（protein secondary structure）在蛋白质分子中的局部区域内氨基酸残基的有规则的排列，常见的二级结构有-螺旋和-折叠 及无规则卷曲。二级结构是通过骨架上的羰基和酰胺基团之间形成的氢键维持的。蛋白质三级结构（protein tertiary structure）蛋白质分子处于它的天然折叠状态的三维构象。三级结构是在二级结构的基础上进一步盘绕、折叠形成的。三级结构主要是靠氨基酸侧链之间的疏水相互作用、氢键范德华力和盐键（静电作用力）维持的。蛋白质四级结构（quaternary structure）多亚基蛋白质的三维结构。实际上是具有三级结构
4、的多肽链（亚基）以适当方式聚合所呈现出的三维结构。-螺旋(-helix)蛋白质中常见的一种二级结构，肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状，一般都是右手螺旋结构，螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基（第n个）的羰基氧与多肽链C端方向的第4个残基（第n4个）的酰胺氮形成氢键。在典型的右手-螺旋结构中，螺距为0.54nm，每一圈含有3.6个氨基酸残基，每个残基沿着螺旋的长轴上升0.15nm。-折叠(-sheet)是蛋白质中的常见的二级结构，是由伸展的多肽链组成的。折叠片的构象是通过一个肽键的羰基氧和位于同一个肽链或相邻肽链的另一个酰胺氢之间形成的氢键维持的。氢键几乎都垂直伸展的肽链，这些肽链可以是平
5、行排列（走向都是由N到C方向）；或者是反平行排列（肽链反向排列）。-转角（-turn）也是多肽链中常见的二级结构，连接蛋白质分子中的二级结构（-螺旋和-折叠），使肽链走向改变的一种非重复多肽区，一般含有216个氨基酸残基。含有5个氨基酸残基以上的转角又常称之环（loops）。常见的转角含有4个氨基酸残基，有两种类型。转角I的特点是：第1个氨基酸残基羰基氧与第4个残基的酰胺氮之间形成氢键；转角II的第3个残基往往是甘氨酸。这两种转角中的第2个残基大都是脯氨酸。超二级结构（super-secondary structure）也称之基元（motif）。在蛋白质中，特别是球蛋白中，经常可以看到由若干相
6、邻的二级结构单元组合在一起，彼此相互作用，形成的有规则、在空间上能辨认的二级结构组合体。结构域(domain)在蛋白质三级结构内的独立折叠单元。结构域通常都是几个超二级结构单元的组合。蛋白质变性（denaturation）生物大分子的天然构象遭到破坏导致其生物活性丧失的现象。蛋白质在受到光照、热、有机溶剂以及一些变性剂的作用时，次级键受到破坏，导致天然构象的破坏，使蛋白质的生物活性丧失。复性（renaturation）在一定的条件下，变性的生物大分子恢复成具有生物活性的天然构象的现象。别构效应（allosteric effect）又称之变构效应。是寡聚蛋白与配基结合改变蛋白质的构象，导致蛋白质
7、生物活性改变的现全酶（holoenzyme）具有催化活性的酶，包括所有的必需的亚基、辅基和其它的辅助因子。酶活力单位（U，active unit）酶活力的度量单位。1961年国际酶学会议规定：1个酶活力单位是指在特定条件（25，其它为最适条件）下，在1分钟内能转化1微摩尔底物的酶量，或是转化底物中1微摩尔的有关基团的酶量。比活(specific activity)每分钟每毫克酶蛋白在25下转化的底物的微摩尔数（m）。比活是酶纯度的测量。米氏方程（Michaelis-Menten equation）表示一个酶促反应的起始速度（v）与底物浓度（S）关系的速度方程，vVmaxS/（Km+S）。米氏常
8、数（Michaelis constant,）（Km）对于一个给定反应，导致酶促反应速度的起始速度（v0）达到最大反应速度（Vmax）一半时的底物浓度。氧化作用 指脂肪酸活化为脂酰CoA，脂酰CoA进入线粒体基质后，在脂肪酸-氧化多酶复合体的催化下，依次进行脱氢、水化、再脱氢和硫解四步连续反应，释放出一分子乙酰CoA和一分子比原来少两个碳原子的脂酰CoA。联合脱氨基作用转氨基与谷氨酸氧化脱氨或是嘌呤核苷酸循环联合脱氨，以满足机体排泄含氮废物的需求。竞争性抑制作用（competitive inhibition）通过增加底物浓度可以逆转的一种酶抑制类型。一个竞争性抑制剂通常与正常的底物或配体竞争同一
9、个蛋白质的结合部位。这种抑制使得Km增大，而Vmax不变。非竞争性抑制作用（noncompetitive inhibition）抑制剂不仅与游离酶结合，也可以与酶-底物复合物结合的一种酶促反应抑制作用。这种抑制使得Vmax变小，但Km不变。反竞争性抑制作用（uncompetitive inhibition）抑制剂只与酶-底物复合物结合，而不与游离酶结合的一种酶促反应抑制作用。这种抑制作用使得Vmax，Km都变小，但Vmax/Km比值不变。溶解温度DNA双螺旋变性一半时候的温度成为溶解温度别构酶（allosteric enzyme）一种其活性受到结合在活性部位以外部位的其它分子调节的酶。别构调节
10、剂（allosteric modulator）结合在别构酶的调节部位调节该酶催化活性的生物分子，别构调节剂可以是激活剂，也可以是抑制剂。同功酶(isoenzyme或isozyme)催化同一化学反应而化学组成不同的一组酶。它们彼此在氨基酸序列、底物的亲和性等方面都存在着差异。辅酶（coenzyme）某些酶在发挥催化作用时所需要的一类辅助因子，其成分中往往含有维生素。酶的分类有哪些？辅基(prosthetic group)是与酶蛋白共价结合的金属离子或一类有机化合物，用透析法不能除去。辅基在整个酶促反应过程中始终与酶的特定部位结合。尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸（NADP，ni
11、cotinamide adenine dinucleotide phosphate）含有尼克酰胺的辅酶，在某些氧化还原反应中起着氢原子和电子载体的作用，常常作为脱氢酶的辅酶。黄素单核苷酸（FMN, flavin mononucleotide）核黄素磷酸，是某些氧化还原酶的辅酶。黄素腺嘌呤二核苷酸（FAD, flavin adenine dinucleotide）是某些氧化还原酶的辅酶，含有核黄素。硫胺素焦磷酸（thiamine pyrophosphate）是维生素B1的辅酶形式，参与转醛基反应。磷酸吡哆醛（pyidoxal phosphate）是维生素B6（吡哆醇）的衍生物，是转氨酶、脱羧酶和
12、消旋酶的辅酶。生物素（biotin）参与脱羧反应的一种酶的辅助因子。辅酶A（coenzyme A）一种含有泛酸的辅酶，在某些酶促反应中作为酰基的载体。类胡萝卜素（carotenoids）由异戊二烯组成的脂溶性光合色素。转氨酶（transaminases） 也称之氨基转移酶（aminotransferases），在该酶的催化下一个-氨基酸的氨基转可移给另一个-酮酸。必需脂肪酸（ossential fatty acids）维持哺乳动物正常生长所需的，而动物又不能合成的脂肪酸，例如亚油酸和亚麻酸。核糖体核糖核酸（rRNA, ribosomal robonucleic acid）作为核糖体组成成分的一
13、类RNA，rRNA是细胞内最丰富的RNA。信使核糖核酸（mRNA, messenger ribonucleic acid）一类用作蛋白质合成模板的RNA。转移核糖核酸（tRNA, transfer ribonucleic acid）一类携带激活氨基酸，将它带到蛋白质合成部位并将氨基酸整合到生长着的肽链上的RNA。tRNA含有能识别模板mRNA上互补密码的反密码。酶原激活某些酶在细胞内合成或初分泌时没有活性，这些没有活性的酶的前身称为酶原(zymogen),使酶原转变为有活性酶的作用称为酶原激活(zymogen activation)。碱基对（base pair）通过碱基之间氢键配对的核酸链中的
14、两个核苷酸，例如A与T或U，以及G与C配对。DNA双螺旋(DNA double helix)一种核酸的构象，在该构象中，两条反向平行的多核苷酸链围绕彼此缠绕形成一个右手的双螺旋结构。碱基位于双螺旋内侧,磷酸与糖基在外侧，通过磷酸二酯键相连,形成核酸的骨架。碱基平面与假想的中心轴垂直,糖环平面则与轴平行。两条链皆为右手螺旋。双螺旋的直径为2nm，碱基堆积距离为0.34nm，两核苷酸之间的夹角是36，每对螺旋由10对碱基组成，碱基按A-T, G-C配对互补，彼此以氢键相连系。维持DNA双螺旋结构稳定的力主要是碱基堆积力。双螺旋表面有两条宽窄、深浅不一的一个大沟和一个小沟。DNA变性(DNA den
15、aturation)DNA双链解链分离成两条单链的现象。退火（annealing）即DNA由单链复性变成双链结构的过程。来源相同的DNA单链经退火后完全恢复双链结构，同源DNA之间、DNA和RNA之间退火后形成杂交分子。融解温度(melting temperature, Tm)双链DNA融解彻底变成单链DNA的温度范围的中点温度。增色效应（hyperchromic effect）当双螺旋DNA融解（解链）时，260nm处紫外吸收增加的现象。减色效应（hypochromic effect）随着核酸复性，紫外吸收降低的现象。核酸内切酶(endonuclease)核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶中能够水解
16、核酸分子内磷酸二酯键的酶。核酸外切酶(exonuclease)从核酸链的一端逐个水解下核苷酸的酶。重组DNA技术（recombination DNA technology）也称之基因工程(genomic engineering)。利用限制性内切酶和载体，按照预先设计的要求，将一种生物的某种目的基因和载体DNA重组后转人另一生物细胞中进行复制、转录和表达的技术。基因（gene） 也称之顺反子（cistron）。泛指被转录的一个DNA片段。在某些情况下，基因常用来指编码一个功能蛋白或RNA分子的DNA片段。标准自由能变化（G）（standard free-energy change）在一系列标准条
17、件（温度：298K；压力：1个大气压；所有溶质的浓度都是1M）下发生的反应的自由能变化。G表示pH7.0条件下的标准自由能变化。酵解(glycolysis)一个由10步酶促反应组成的糖分解代谢途径，通过该途径，一分子葡萄糖转换为两分子丙酮酸，同时净生成两分子ATP和两分子NADH。场所在：发酵(fermentation)营养分子（例如葡萄糖）产能的厌氧降解，在乙醇发酵中，丙酮酸转化为乙醇和CO2。底物水平磷酸化(substrate phosphorylation)ADP或某些其它的核苷-5-二磷酸的磷酸化是通过来自一个非核苷酸底物的磷酰基的转移实现的。这种磷酸化与电子传递链无关。柠檬酸循环（c
18、itric acid cycle）也称为三羧酸循环(tricarboxylic acid cycle)，Krebs 循环（Krebs cycle）。是用于乙酰CoA中的乙酰基氧化生成CO2的酶促反应的循环系统，该循环的第一步反应是由乙酰CoA和草酰乙酸缩合形成柠檬酸。回补反应（anaplerotic reaction）酶催化的补充柠檬酸循环中间代谢物的供给的反应，例如由丙酮酸羧化生成草酰乙酸的反应。乙醛酸循环（glyoxylate cycle） 是某些植物、细菌和酵母中柠檬酸循环的修改形式，通过该循环可以由乙酰CoA经草酰乙酸净生成葡萄糖。乙醛酸循环绕过了柠檬酸循环中生成两个CO2的步骤。戊糖
19、磷酸途径（pentose phosphate pathway）也称之磷酸己糖支路（hexose monophosphate shunt）。是一个葡萄糖-6-磷酸经代谢产生NADPH和核糖-5-磷酸的途径。该途径包括氧化和非氧化两个阶段，在氧化阶段，葡萄糖-6-磷酸转化为核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成两分子的NADPH；在非氧化阶段，核酮糖-5-磷酸异构化生成核糖-5-磷酸或转化为酵解中的两个中间代谢物果糖-6-磷酸和甘油醛-3-磷酸。无效循环（futile cycle）也称之底物循环（substrate cycle）。一对催化两个途径的中间代谢物之间循环的方向相反、代谢上不可逆的反应。有时该
20、循环通过ATP的水解导致热能的释放。例如，葡萄糖ATP葡萄糖-6-磷酸ADP与葡萄糖-6-磷酸H2O葡萄糖Pi反应组成的循环反应，其净反应实际上是ATPH2OADPPi。糖异生作用(gluconeogenesis) 由简单的非糖前体转变为糖的过程。糖异生不是糖酵解的简单逆转。虽然由丙酮酸开始的糖异生利用了糖酵解中的7步近似平衡反应的逆反应，但还必须利用另外4步酵解中不曾出现的酶促反应绕过酵解中的三个不可逆反应。呼吸电子传递链（respiratory electron-transport chain）由一系列可作为电子载体的酶复合体和辅助因子构成，可将来自还原型辅酶或底物的电子传递给有氧代谢的最
21、终电子受体分子氧（O2）。氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)电子从一个底物传递给分子氧的氧化与酶催化的由ADP和Pi生成ATP的磷酸化相偶联的过程。化学渗透理论(chemiosmotic theory)一种学说，主要论点是底物氧化期间建立的质子浓度梯度提供了驱动由ADP和Pi形成ATP的能量。解偶联剂（uncoupling agent）一种使电子传递与ADP磷酸化之间的紧密偶联关系解除的化合物，例如2,4-二硝基苯酚。P/O比(P/O ratio)在氧化磷酸化中，每1/2O2被还原时形成的ATP的摩尔数。电子从NADH传递给O2时，P/O比为3，而电子从FADH2
22、传递给O2时，P/O比为2。高能化合物(high energy compound) 在标准条件下水解时自由能大幅度减少的化合物。一般是指水解释放的能量能驱动ADP磷酸化合成ATP的化合物氧化途径(oxidation pathway)是脂肪酸氧化分解的主要途径，脂肪酸被连续地在碳氧化降解生成乙酰CoA，同时生成NADH和FADH2，因此可产生大量的ATP。该途径因脱氢和裂解均发生在位碳原子而得名。每一轮脂肪酸氧化都是由4步反应组成：氧化、水化、再氧化和硫解。肉毒碱穿梭系统（carnitine shuttle system）脂酰CoA通过形成脂酰肉毒碱从细胞质转运到线粒体的一个穿梭循环途径。酮体(
23、acetone body)在肝脏中由乙酰CoA合成的燃料分子（羟基丁酸、乙酰乙酸和丙酮）。在饥饿期间酮体是包括脑在内的许多组织的燃料，酮体过多将导致中毒。柠檬酸转运系统（citrate transport system）将乙酰CoA从线粒体转运到细胞质的穿梭循环途径。在转运乙酰CoA的同时，细胞质中的NADH氧化成NAD、NADP还原为NADPH。每循环一次消耗2分子ATP。尿素循环（urea cycle）是一个由4步酶促反应组成的可以将来自氨和天冬氨酸的氮转化为尿素的代谢循环。该循环是发生在脊椎动物肝脏中的一个代谢循环。脱氨(deamination)在酶的催化下从生物分子（氨基酸或核苷酸分子
24、）中除去氨基的过程。氧化脱氨（oxidative deamination）-氨基酸在酶的催化下脱氨生成相应-酮酸的过程。氧化脱氨过程实际上包括脱氢和水解两个步骤。转氨(transamination)一个-氨基酸的-氨基借助转氨酶的催化作用转移到一个-酮酸的过程。生糖氨基酸(glucogenic amino acids)那些降解能生成可作为糖异生前体分子，例如丙酮酸或柠檬酸循环中间代谢物的氨基酸。生酮氨基酸(acetonegenic amino acid)那些降解可生成乙酰CoA或酮体的氨基酸。从头合成(de novo synthesis )生物体内用简单的前体物质合成生物分子的途径，例如核苷酸
25、的从头合成。补救途径(salvage pathway)与从头合成途径不同，生物分子的合成，例如核苷酸可以由该类分子降解形成的中间代谢物，如碱基等来合成，该途径是一个再循环途径。半保留复制(semiconservative replication)DNA复制的一种方式。每条链都可用作合成互补链的模板，合成出两分子的双链DNA，每个分子都是由一条亲代链和一条新合成的链组成。复制叉（replication forks）Y字型结构，在复制叉处作为模板的双链DNA解旋，同时合成新的DNA链。DNA聚合酶（DNA polymerase）以 DNA为模板催化核苷酸残基加到已存在的聚核苷酸的3末端反应的酶。某
26、些DNA聚合酶具有外切核酸酶的活性，可用来校正新合成的核苷酸序列。前导链（leading strand）与复制叉移动的方向一致，通过连续地53聚合合成的新的DNA链。滞后链（lagging strand）与复制叉移动的方向相反，通过不连续地53聚合合成的新的DNA链。 冈崎片段(Okazaki fragments)相对比较短的DNA链（大约1000核苷酸残基），是在DNA的滞后链的不连续合成期间生成的片段，这是Reiji Okazaki 在DNA合成实验中添加放射性的脱氧核苷酸前体观察到的。引发体（primosome）一种多蛋白复合体，E.coli中的引发体包括催化滞后链不连续DNA合成所需要
27、的短的RNA引物合成的引发酶、解旋酶。复制体(replisome)一种多蛋白复合体，包含DNA聚合酶、引发酶、解旋酶、单链结合蛋白和其它辅助因子。复制体位于每个复制叉处执行着细菌染色体DNA复制的聚合反应。单链结合蛋白（SSB，single-strand binding protein）一种与单链DNA结合紧密的蛋白质，它的结合可以防止复制叉处的单链DNA本身重新折叠回双链区。互补DNA (cDNA , complementary DNA)通过逆转录酶由mRNA模板合成的双链DNA。 聚合酶链式反应（PCR, polymerase chain reaction）扩增样品中的DNA量和富集众多D
28、NA分子中的一个特定DNA序列的一种技术。在该反应中，使用与目的DNA序列互补的寡核苷酸作为引物，进行多轮的DNA合成。其中包括DNA变性、引物退火和在Taq DNA聚合酶催化下的DNA合成。直接修复（direct repair）是通过一种可连续扫描DNA，识别出损伤部位的蛋白质将损伤部位直接修复的方法。该修复方法不用切断DNA或切除碱基。 切除修复（excision repair）通过切除-修复内切酶使DNA损伤消除的修复方法。一般是切去损伤区，然后在DNA聚合酶的作用下以露出的单链为模板合成新的互补链，最后用连接酶将缺口连接起来。 错配修复（mismatch repair） 在含有错配碱基
29、的DNA分子中使正常核苷酸序列恢复的修复方式。这种修复方式的特点是：识别出正确的链，切除掉不正确链的部分，然后通过DNA聚合酶和DNA连接酶的作用合成正确配对的双链DNA。转录（transcription）在由RNA聚合酶和辅助因子组成的转录复合体的催化下，从双链DNA分子中拷贝生物信息生成单一一条RNA链的过程。转录与复制的区别？模板链(template strand)可作为模板转录为RNA的那条链，该链与转录的RNA碱基互补（A-U, G-C）。在转录过程中，RNA聚合酶与模板链结合，并沿着模板链的35方向移动，按照53方向催化RNA的合成。编码链（coding strand）双链DNA中
30、，不能进行转录的那条DNA链,该链的核苷酸序列与转录生成的RNA的序列一致（在RNA中是以U取代了DNA中的T）。核心酶(core enzyme)大肠杆菌的RNA聚合酶全酶由五个亚基（2）组成，没有亚基的酶叫核心酶。核心酶只能使已开始合成的RNA链延长，但不具有起始合成RNA的能力，必需加入亚基才表现出全部聚合酶的活性。RNA聚合酶(RNA polymerase)以一条DNA链或RNA为模板催化由核苷-5-三磷酸合成RNA的酶。启动子（promoter）DNA分子中RNA聚合酶能够结合并导致转录起始的序列。 内含子（introns）在转录后的加工中，从最初的转录产物除去的内部的核苷酸序列。术语
31、内含子也指编码相应RNA内含子的DNA中的区域。外显子（exons）既存在于最初的转录产物中，也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。术语外显子也指编码相应RNA外显子的DNA中的区域。终止因子(termination factors)协助RNA 聚合酶识别终止信号的辅助因子（蛋白质）。核酶（ribozymes）具有象酶那样催化功能的RNA分子。剪接体（spliceosome）大的蛋白质-RNA复合体，它催化内含子从mRNA前体中除去的反应。 翻译（translation）在蛋白质合成期间将存在于mRNA上代表一个多肽链的核苷酸残基序列转换为多肽链氨基酸残基序列的过程。遗传密码（genetic
32、 code）核酸中的核苷酸残基序列与蛋白质中的氨基酸残基序列之间的对应关系。连续的3个核苷酸残基序列为一个密码，特指一个氨基酸。标准的遗传密码是由64个密码组成的，几乎为所有生物通用。起始密码（iniation codon）指定蛋白质合成起始位点的密码。最常见的起始密码是蛋氨酸密码：AUG。终止密码（termination codon）任何tRNA分子都不能正常识别的、但可被特殊蛋白结合并引起新合成的肽链从翻译机器上释放的密码。存在三个终止密码：UAG，UAA和UGA。密码子(codon)mRNA（或DNA）上的三联体核苷酸残基序列，该序列编码着一个指定的氨基酸，tRNA的反密码子与mRNA的
33、密码子互补。反密码子（anticodon）tRNA分子的反密码环上的三联体核苷酸残基序列。在翻译期间，反密码与mRNA中的互补密码结合。简并密码子(degenerate codon)也称之同义密码子（synonymous codon）。是指编码相同氨基酸的几个不同的密码子。氨基酸臂（amino arm）也称之接纳茎（acceptor stem）。tRNA分子中靠近3端的核苷酸序列和5端的序列碱基配对，形成的可接收氨基酸的臂（茎）。TC臂（TC arm）tRNA中含有胸腺嘧啶核苷酸-假尿嘧啶核苷酸-胞嘧啶核苷酸残基序列的茎环结构。氨酰-tRNA（aminoacyl-tRNA）在氨基酸臂的3端的腺
34、苷酸残基共价连接了氨基酸的tRNA分子。同工tRNA（isoacceptor tRNA）结合相同氨基酸的不同的tRNA分子。摆动(wobble) 处于密码子3端的碱基和与之互补的反密码的5端的碱基之间的碱基配对有一定的宽容性，即处于反密码的5端的碱基（也称之摆动位置），例如I可以与密码子上3端的U、C和A配对。由于存在摆动现象所以使得一个tRNA反密码子可以和一个以上的mRNA密码子结合。密码子的特点有哪些？氨酰-tRNA合成酶（aminoacyl-tRNA synthetase）催化特定氨基酸激活并共价结合在相应的tRNA分子3端的酶。翻译起始复合体（translation initiati
35、on complex）由核糖体亚基、一个mRNA模板、一个起始的tRNA分子和起始因子组成并组装在蛋白质合成起始点的复合体。读码框( reading frame)代表一个氨基酸序列的mRNA分子的非重叠密码序列。一个mRNA的读码框是由转录起始位置（通常是AUG密码）确定的。SD序列（Shine-Dalgarno sequence）mRNA中用于结合原核生物核糖体的序列。 肽酰转移酶（peptidyl transferase）蛋白质合成期间负责转移肽酰基和催化肽键形成的酶。开放读码框(open reading frame)DNA 或RNA序列中一段不含终止密码的连续的非重叠核苷酸密码。信号肽（
36、signal peptide） 常指新合成多肽链中用于指导蛋白质跨膜转移（定位）的N-末端的氨基酸序列（有时不一定在N端）。转录因子（transcription factor）在转录起始复合体的组装过程中，与启动子区结合并与RNA聚合酶相互作用的一种蛋白质。某些转录因子在RNA延伸时一直维持着结合状态。操纵子（operons）是由一个或多个相关基因以及调控它们转录的操纵基因和启动子序列组成的基因表达单位。操纵基因（operator）与特定阻遏蛋白相互作用调控一个基因或一组基因表达的DNA区。结构基因（structural gene）编码一个蛋白质或一个RNA的基因。转录激活剂（transcriptional activator）通过增加RNA聚合酶的活性来加快转录速度的一种调节DNA结合蛋白。 阻遏物（repressor）与一个基因的调控序列或操纵基因结合以阻止该基因转录的一类蛋白质。