《动物育种学第6-个体遗传评定之选择指数法3学习教案.ppt》由会员分享，可在线阅读，更多相关《动物育种学第6-个体遗传评定之选择指数法3学习教案.ppt（30页珍藏版）》请在taowenge.com淘文阁网|工程机械CAD图纸|机械工程制图|CAD装配图下载|SolidWorks_CaTia_CAD_UG_PROE_设计图分享下载上搜索。
1、第三节第三节 多性状多性状(xngzhung)(xngzhung)综综合遗传评定合遗传评定第1页/共29页第一页，共30页。v多性状(xngzhung)选择概述v综合选择指数的估计v选择指数应用的注意事项第2页/共29页第二页，共30页。多性状选择多性状选择(xunz)概述概述 育种工作中，不仅希望育种工作中，不仅希望(xwng)单个性状得单个性状得到改进，更追求在多个性状上同时获得进展到改进，更追求在多个性状上同时获得进展 畜禽的育种目标涉及多个性状：畜禽的育种目标涉及多个性状： 奶牛：产奶量、乳脂率、乳蛋白率奶牛：产奶量、乳脂率、乳蛋白率 猪：日增重、瘦肉率和产仔数猪：日增重、瘦肉率和产仔
2、数 蛋鸡：产蛋数和蛋重蛋鸡：产蛋数和蛋重 绵羊：剪毛量、毛长和细度绵羊：剪毛量、毛长和细度第3页/共29页第三页，共30页。多性状选择(xunz)概述多性状选择(xunz)方法顺序选择法独立淘汰法综合选择法综合选择指数综合选择指数综合遗传评定综合遗传评定第4页/共29页第四页，共30页。 顺序选择法（tandem selection） 指对育种目标中待选择的几个性状逐一进行选择 例如奶牛的育种目标：产奶量、乳脂率、乳蛋白(dnbi)率 缺点：花时太长、性状的选择顾此失彼，已不使用多性状选择(xunz)概述产奶量产奶量乳脂乳脂(r zh)率率乳蛋白率乳蛋白率2-3个世代个世代2-3个世代个世代2
3、-3个世代个世代第5页/共29页第五页，共30页。 独立淘汰法（independent culling） 指育种(y zhng)目标中包含的每个性状都有一个最低选择标准，各性状都超过相应标准的个体留作种畜 改进：同时考虑多个性状，优于顺序淘汰法 缺点：选择的个体可能在各性状上都表现平平多性状选择(xunz)概述第6页/共29页第六页，共30页。 综合选择法（index selection，I ） 根据育种目标中各性状(xngzhung)的遗传基础和经济重要性，分别给予各性状(xngzhung)一个适当的加权系数，综合到一个指数中，根据指数的大小进行选择 选择效果优于独立淘汰法和顺序选择法多性状
4、选择(xunz)概述独立独立(dl)淘汰法淘汰法顺序选择法顺序选择法综合选择法综合选择法第7页/共29页第七页，共30页。综合选择指数的特征反映的个体种用价值较为全面不仅考虑性状的遗传基础和经济(jngj)重要性，而且还考虑性状间的遗传相关选择效率较高，在BLUP之前被广泛应用综合(zngh)选择指数第8页/共29页第八页，共30页。v多性状选择概述v综合(zngh)选择指数的估计v选择指数应用的注意事项第9页/共29页第九页，共30页。 综合选择指数的基本( jbn)公式：综合综合(zngh)选择指数的估计选择指数的估计iniiTAWAII、AT：综合选择指数：综合选择指数Wi：第：第 i
5、个性状个性状(xngzhung)的经的经济加权值济加权值Ai：第：第 i 个性状个性状(xngzhung)的育的育种值种值根据各性状在根据各性状在育种和育种和经济上经济上的重要性，的重要性，给予相应的给予相应的经济加经济加权值权值第10页/共29页第十页，共30页。 I 的计算公式:综合综合(zngh)选择指数的估计选择指数的估计)(iiiiniiTppbAWAI 矩阵(j zhn)形式：)p(pbIb: 含遗传基础和经济意义的偏回归系数向量含遗传基础和经济意义的偏回归系数向量p : 为不同为不同(b tn)来源的信息性状表型值来源的信息性状表型值p多元回归方法多元回归方法：与：与p对应的均数
6、对应的均数第11页/共29页第十一页，共30页。综合综合(zngh)选择指数的估计选择指数的估计 综合选择指数计算(j sun)的关键步骤： 偏回归系数b的计算(j sun) 计算(j sun)偏回归系数的正规方程组（求极大值方法）DAwVbDAwVb1则： V：信息性状表型值之间的方差：信息性状表型值之间的方差(fn ch)协方差协方差(fn ch)矩阵矩阵D：被估个体与信息来源个体间的亲缘系数对角矩阵：被估个体与信息来源个体间的亲缘系数对角矩阵A：信息性状与目标性状间的遗传方差：信息性状与目标性状间的遗传方差(fn ch)协方协方 差矩阵差矩阵w：经济加权值向量：经济加权值向量（6-16）
7、第12页/共29页第十二页，共30页。目标性状与信息性状目标性状：综合育种值所包含的性状，即育种目标中待改进的性状（如：产奶量、乳脂(r zh)量）信息性状：育种值估计中提供信息资料的性状 （如：产奶量、乳脂(r zh)率）信息性状与目标性状一般为相同性状，信息性状与目标性状一般为相同性状，也可以不同，但必须有较高的遗传相关也可以不同，但必须有较高的遗传相关第13页/共29页第十三页，共30页。 估计综合(zngh)选择指数的步骤：综合综合(zngh)选择指数的估计选择指数的估计DAwVb1)(ppbIwADVV1、)(第14页/共29页第十四页，共30页。 例： 对某奶牛场的青年公牛进行综合
8、选择指数计算，目标性状为乳脂(r zh)量和日增重。 已知一公牛现有如下信息性状记录： 母亲乳脂(r zh)量PD1=170kg, 对应均数为140kg 父亲日增重PS2=1180g, 对应均数为1290g 本身日增重PE2=1350g, 对应均数为1300g 综合综合(zngh)选择指数的估计选择指数的估计第15页/共29页第十五页，共30页。综合综合(zngh)选择指数的估计选择指数的估计性状性状wPA乳脂量（乳脂量（1） 25元元25kg12.5kg0.10日增重（日增重（2） 1.3元元80g51g两性状的经济加权值和有关两性状的经济加权值和有关(yugun)遗传参数为：遗传参数为：2
9、, 1Ar两性状间的遗传两性状间的遗传(ychun)相关相关第16页/共29页第十六页，共30页。 解：先求矩阵(j zhn) ， 结果如下： 综合(zngh)选择指数的估计222222221211),(),(),(PESPEDSDPsymPPCovPPCovPPCovV75.63515 .121 . 0),(212, 121AAArAACov0),(21SDPPCov5 .1300515 . 0),(),(22)(2222222APPAESESEsrAACovPPCov222, 1222, 12, 12)()()(1AAAAACovAACovAACovAwADV、88.3175.635 .
10、0),(),(21)(2121AACovrPPCovEDPPAED两性状间的遗传相关两性状间的遗传相关信息个体间的亲缘相关信息个体间的亲缘相关第17页/共29页第十七页，共30页。综合(zngh)选择指数的估计于是于是(ysh)，222808 .1300808 .318025symV2225175.635175.6375.635 .12A15 . 05 . 0)()()(221IPAIPAIPAESDrrrD3 . 12521www第18页/共29页第十八页，共30页。综合(zngh)选择指数的估计712. 0244. 0115. 33 . 1255175.635175.6375.635 .1
11、215 . 05 . 0808 .1300808 .3180252221222symDAwVb1偏回归系数为：第19页/共29页第十九页，共30页。综合(zngh)选择指数的估计综合(zngh)选择指数为：41.1831300135012901180140170712. 0244. 0115. 3)(yybI第20页/共29页第二十页，共30页。 评价综合选择指数准确度的指标(zhbio)：真实育种值与选择指数间的相关系数rAI综合综合(zngh)选择指数的估计选择指数的估计GwwDAwbcb2TAAIrGww2TA其中，其中，G：各目标性状间的遗传方差协方差矩阵各目标性状间的遗传方差协方差矩
12、阵22121221),(),(AAAACovAACovG第21页/共29页第二十一页，共30页。综合(zngh)选择指数的估计本例的综合(zngh)选择指数准确度为：69.1061953 . 1255175.6375.635 .123 . 125222GwwTA8 .10442497524871995712. 0244. 0115. 3DAwbcb31. 088.32519.102AIrGwwDAwbcb2TAAIr第22页/共29页第二十二页，共30页。v多性状选择(xunz)概述v综合选择(xunz)指数的估计v应用选择(xunz)指数法的注意事项第23页/共29页第二十三页，共30页。
13、应用选择指数法的前提 不存在系统环境效应 被估个体与表型观测值来源于同一总体(zngt) 遗传参数已估计出来选择指数应用选择指数应用(yngyng)的注意事项的注意事项满足满足(mnz)(mnz)上述条件时，估计育种值为最佳线上述条件时，估计育种值为最佳线性无偏估计。性无偏估计。I I 的应用受到上述条件的制约的应用受到上述条件的制约第24页/共29页第二十四页，共30页。 制定选择指数的注意事项 1) 目标性状(xngzhung) 要突出。一个选择指数包括24个最重要的性状(xngzhung) 例如：种公猪包括达100kg体重日龄和活体背膘 种母猪再增加总产仔数性状(xngzhung) 避免
14、有高的负遗传相关性状(xngzhung)。必须考虑时，可合并为一个性状(xngzhung)，如产奶量与乳脂率合并为4标准奶综合综合(zngh)选择指数应用的注意事项选择指数应用的注意事项第25页/共29页第二十五页，共30页。 2) 信息性状易于度量：日增重、活体(hu t)背膘、饲料利用率早期性状：头胎产奶量第26页/共29页第二十六页，共30页。育种育种(y zhng)值估计方法值估计方法选择指数法BLUP法法MBLUP法育种(y zhng)值估计的初级阶段目前广为应用的育种值估计(gj)方法未来未来的育种值估计方法数量遗传学分子遗传学分子数量遗传学第27页/共29页第二十七页，共30页。
15、第28页/共29页第二十八页，共30页。感谢您的观看(gunkn)！第29页/共29页第二十九页，共30页。NoImage内容(nirng)总结第三节 多性状综合遗传评定。指对育种目标中待选择(xunz)的几个性状逐一进行选择(xunz)。综合选择(xunz)法（index selection，I ）。选择(xunz)效果优于独立淘汰法和顺序选择(xunz)法。Wi：第 i 个性状的经济加权值。Ai：第 i 个性状的育种值。b: 含遗传基础和经济意义的偏回归系数向量。D：被估个体与信息来源个体间的亲缘系数对角矩阵。例： 对某奶牛场的青年公牛进行综合选择(xunz)指数计算，目标性状为乳脂量和日增重。第28页/共29页第三十页，共30页。