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1、精品学习资源人肌红蛋白基因外显子一的生物信息学分析一Introduction： Myoglobin,the articleis composed of a peptide chains and a binding protein of heme prosthetic group, is within the muscle oxygen storage protein, its oxygen saturationof the elliptic curve.Myoglobin is the main protein of skeletal muscle and cardiac muscle, wh
2、en muscle damage, leakage to the circulating in the blood in muscle tissue, increase the serum concentration of myoglobin, the index is used to determine whether muscle damage.二Purpose：对人肌红蛋白基因外显子一基因序列使用“ Bioed和it DNAMAN 、anthe5.0 及”相关网站进行 GC含量统计、电子酶切、引物设计、基因在人类基因组中的定位、电子克隆及蛋 白在细胞内的定位、氨基酸组成统计、分子量、等电
3、点、亲疏水 性、信号肽分析 跨膜区域）、二级结构 含保守结构域）及三维结构分析， miR 分析，启动子分析等；其中抗原表位分析、多序列比对和进化分析等 ；三The nature and function of myoglobin ：Nature: myoglobin= a polypeptide chain +a prosthetic group polypeptide chain, composed of 153 amino acid residuesProsthetic group: heme prosthetic groupMolecular weight: 16, 700Functio
4、n: transport of oxygen and oxygen storage function in muscle欢迎下载精品学习资源tertiary structure of myoglobin四Key word: 肌红蛋白 myoglobin ）五 Implements and methods：采纳 Bioedit和 DNAMA分N 析软件工具和在线有关蛋白质和核酸方面的分析软件，分别进行核酸和蛋白质两个方面的分析；核酸分析第一从 pubmed核酸数据库中搜寻到人的Myoglobin 核酸序列，分别进行序列的基本性质分析，限制性酶谱分析及其基因在染色体上的定位分析；详细操作方法将依据
5、上述各个软件上“Help文”件进行，基因在染色体上的定位分析依据网页上的操作说明进行；从pubmed蛋白质数据库中搜索到 人的Myoglobin 和整个前体 Myoglobin 蛋白质序列，分别进行蛋白序列的基本性质分析 ORGANISM Homo sapiens欢迎下载精品学习资源Eukaryota； Metazoa； Chordata； Craniata； Vertebrata；Euteleostomi；Mammalia； Eutheria； Euarchontoglires； Primates；Haplorrhini；Catarrhini； Hominidae； Homo.REFEREN
6、CE1 bases 1 to 2552AUTHORSAkaboshi,E.TITLECloning of the human myoglobin gene JOURNALGene 33 3, 241-249 1985PUBMED2989088COMMENTOriginal source text: Human: fetal liver DNA library of Lawn etal., clone lambda-HMB151； delta-thalassemia leukocyte DNA libraryof Kimura et al., clone lambda-HMB159.Draft
7、entry and computer-readable copy of sequence 1欢迎下载精品学习资源kindlyprovided by E.Akaboshi, 22-OCT-1985.A tandem repeat sequence is found at position 142-794.欢迎下载精品学习资源Position ofthe mRNA cap site was deduced from that of the seal myoglobin geneBlanchetot et al. 1983.FEATURESLocation/Qualifiers source1.25
8、52/organism=Homo sapiens/mol_type=genomic DNA/db_xref=taxon:9606/map=22q11.2-qter repeat_region1100.1750/note=Fok family repetitive element prim_transcript 1895.2552/note=myoglobin mRNA and introngenejoin1965.2552,M14602.1:1.2671,M14603.1:1.501/gene=MBCDS join1965.2059,M14602.1:1415.1637,M14603.1:35
9、5.501/gene=MB/note=myoglobin/codon_start=1/protein_id=AAA59595.1/db_xref=GI:386872/translation=MGLSDGEWQLVLNVWGKVEADIPGHGQEVLIRLFKGHPETLEKF欢迎下载精品学习资源DKFKHLKSEDEMKASEDLKKHGATVLTALGGILKKKGHHEAEIKPLAQSHATKHKIPVKYLEFISECIIQVLQSKHPGDFGADAEGAMNKALELFRKDMASNYKELGFQG exon2552/gene=MB/note=myoglobin intron A
10、 ORIGIN2 bp upstream of RsaI site.1 gtactgtatt ttcattcctc ttagttatct ccctaaaaag actctgagtt ccttgaacac61 aggaaggtgt tttatttgat tttgttatcc tcagcatgta gcagtgtctgacacacagta121 ggtgctctat cactgtgaga gggatggatg gatgggtgga gttacagatg gatagaagga181 tagatggagg gatgggtgga tgatggatgg atagatggat ggagggggga tgat
11、gaatgg241 agggataatg agtggatgaa tgagggaatg ggtggatgga tggatggagg gatggaggaa301 cagatagata gatggaggga tgggtgggtg atggatggat agatggatgg agggagggat361 gatgaatgga gggataatga atggatgaat gaggggatgg gtggatggatgaatggaggg421 atgatgggtg gatgaatgaa ttgagggatg gatggatgaa cacatggatg gatggataga481 tggatagatg gagg
12、aactgg tggattttgg atggatgggt ggatggatag atgaatgaat541 gcctggatag acaaagagat gatggataga tgaatagatg aattaaggga tgtcggatag601 atggagggat tgatagatgt tggatggatg ggtggtggat ggatagatga gtgaatgcat661 ggatagacaa agagatgatg gatggatgaa ttaagggatg acagatggatggatggatga721 gtaactggat ggacaagtgg ataaatggat agatggt
13、tga atacctgaat ggattgaagg781 aggatgcatg gatgtaagat aaggctaatc atcctccact ctctttcttt gcaaaaccat841 ccacccattt actcaataaa catttattca gttcaaactt ggcacaaagc accatgtgag901 gcccaagaga tacgtgggtt aataaaacag agctcctgcc ctcctgaaaa ctgcaaagaa欢迎下载精品学习资源961 aggggcgtgg cttcctgagt tcaaatccca actctgccag cgactagctg
14、 tacatcagtg1021 atgtttccct actttctctc aattaaatag ggataatgtc agtacctatc acattgggag1081 gtcttgcggg gattaaatga gttaccaaat gccaagtgtt tgggacagggcctggcaccc1141 agcaaagtct cttgtgagtg ctggctgcta ttatcctaat ggagaagatg gcatgaaaac1201 caggaaatag gatgcccttt gggaagcaat gcaacaggaa cttacacaaa gaaaggaaag1261 gagga
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16、ttagaa acatgacagg tcctcttggg agggctgacc1561 gcagggagcg ttgggtttca ggctgctggc gtcggcttct gtggtgccct ttctgtcggc1621 tatgagagtc cagacagtgc ccaacctcct ccccttcttt ccacacgcac aaccacccca1681 ccccctgtgg cctgagctgt cctgcctcgc cacaatggca cctgccctaaaatagcttcc1741 catgtgaggg ctagagaaag gaaaagatta gaccctccct gga
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18、1 ggcaggaagt cctcatcagg taaaaggaag agattccatt gcccctgcca cccacaccct2101 aagatcaagg gtgttcagct gcaaggtgga aagtttgcac gtggggtagg tcagttggct2161 gcattagtta agggtgttag aacggtcact tgctttttct ttgcttttaa gtgtcaggga2221 ttggactcag gagagggaaa ggagccattt caggctgatg tcagcagctg gaggaagcat欢迎下载精品学习资源2281 gagaatca
19、aa cctaggatgc tcagagtcca ccaggaagaa ttttagaatt atagacagtc2341 agagttaaca agggtcctga gagattttgt acagccacct ctcttacagg atgaggacaa2401 aaagcgactg agaaggggag gacatttcca gagtcacagc tcattaaatgctcttaaagt2461 gtcaaggtta agacatgctc ttcaagggga gacagatctg gttctagact tggctctgcc2521 actgagccac tgggtgacct ttgggaa
20、ggt acOfficial SymbolMBprovided by HGNCOfficial Full Namemyoglobinprovided by HGNC Primary source :HGNC:6915Locus tag :RP4-569D19.7Seerelated：Ensembl:ENSG00000198125； HPRD:01170 ； MIM:160000 ； Vega:OT THUMG00000150606Gene type:protein coding Refsep status:REVIEWED Organism ：Homo sapiensLineage ： Euk
21、aryota ； Metazoa ； Chordata ； Craniata ； Vertebrata ；Euteleostomi ； Mammalia ； Eutheria ； Euarchontoglires ； Primates ；Haplorrhini ； Catarrhini ； Hominidae ； Homo Also known as ： PVALBGenomic contextLocation:22q13.1Sequence:Chromosome: 22 ； NC_000022.10 36002811.36019401,complementSee MB in Epigenom
22、ics, MapViewerChromosome 22 - NC_000022.10Genomic regions, transcripts, and productsGenomicSequenceNC_000022 chromosome 22 reference GRCh37.p13 Primary Assembly欢迎下载精品学习资源Go to nucleotideGraphics FASTA GenBank欢迎下载精品学习资源欢迎下载精品学习资源欢迎下载精品学习资源欢迎下载精品学习资源欢迎下载精品学习资源欢迎下载精品学习资源欢迎下载精品学习资源欢迎下载精品学习资源欢迎下载精品学习资源欢迎下载精品学习资源2. 利用 Primer premier5.0软件对 myoglobin核酸序列进行引物设计其结果如下：Sense primer:5 TACTCGTGCCTTTCGTACTAGGCTC 3欢迎下载精品学习资源Anti-sense primer:5 ATGAGCACGGAAAGCATGATCCGAG 33.蛋白质序列分析利用 ExPASy 软件包对该基因进行氨基酸组成统计、分子量、等电点等分析及磷酸化分析欢迎下载